lncRNA啟動子DNA甲基化／羥甲基化測序分析
技術優勢：● 專注非編碼RNA領域，完善的lncRNA啟動子分析流程● 可與lncRNA表達譜芯片聯合應用，實現平臺間無縫對接● 可視化數據展示，提供paper級結果圖表● 優化的IP實驗方法，可信賴的檢測平臺及數據結果 介紹： 人類基因組中僅有約2%的DNA序列最終編碼生成蛋白質，其余絕大部分區域轉錄形成長鏈非編碼RNA。隨著lncRNA的生物學功能的發現，這些原先被認為是“junk DNA”的區域的其eferenceseq研究地位上升為“暗物質”。lncRNA的轉錄受到嚴格的調控，其表達譜細胞特異性和組織特異性甚至高于蛋白編碼基因。尋找和發現疾病過程中LncRNA表達變化的原因，了解lncRNA上游調控機制，是lnc......閱讀全文
lncRNA啟動子DNA甲基化/羥甲基化測序分析
技術優勢：●?? 專注非編碼RNA領域，完善的lncRNA啟動子分析流程●???可與lncRNA表達譜芯片聯合應用，實現平臺間無縫對接●???可視化數據展示，提供paper級結果圖表●???優化的IP實驗方法，可信賴的檢測平臺及數據結果?介紹：????? 人類基因組中僅有約2%的DNA序列最
lncRNA啟動子DNA甲基化/羥甲基化測序分析綜述
技術優勢： ● 專注非編碼RNA領域，完善的lncRNA啟動子分析流程 ● 可與lncRNA表達譜芯片聯合應用，實現平臺間無縫對接 ● 可視化數據展示，提供paper級結果圖表 ● 優化的IP實驗方法，可信賴的檢測平臺及數據結果 介紹： 人類基因組中僅有
DNA－甲基化測序常用方法
隨著高通量測序技術（NGS）技術的發展，使我們能夠從全基因組水平來分析 5’甲基胞嘧啶及組蛋白修飾等事件，由此能夠發現很多傳統的基因組學研究所不能發現的東西，這就是所謂的“DNA 甲基化測序”！DNA 甲基化測序方法按原理可以分成三大類：?1、重亞硫酸鹽測序；?2、基于限制性內切酶的測序；?3、靶向
ctDNA（羥）甲基化測序案例分享（二）
案例解析案例1：ctDNA甲基化可作為肝癌診斷和進程的分子標志物原文：Circulating tumour DNA methylation markers for diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma期刊：Nature Materia
?ctDNA（羥）甲基化測序案例分享（一）
新型腫瘤標志物篩選利器-----ctDNA（羥）甲基化測序cfDNA（Cell free DNA）是人體組織排放到血液、尿液或腦脊液等循環體系中降解的DNA小片段，是一種新型的分子標記物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指來源于腫瘤細胞的cfDNA，是液體活檢主流方向。最新
DNA甲基化分析
The influence of methylation on the promoter activity and gene expression and the involvement of DNA methylation in carcinogenesis caused an extensive
lncRNA甲基化如何研究？
lncRNA分子通過海綿機制結合microRNA發揮生物學功能，這個ceRNA機制已經讓大家心生厭倦了。可大牛就是大牛，引入甲基化就能輕松的變廢為寶，竟然能讓lncRNA的ceRNA思路變得瞬間高大上發表10分以上的文章，你一定和小編我一樣很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化，作為最新的國自然熱點受到
最新DNA甲基化測序技術比較研究
在不同疾病中，DNA甲基化具有不同的模式。DNA甲基化的具體模式通常與諸如疾病亞型、疾病預后以及藥物反應等臨床信息具有一一對應的聯系。在多種癌癥的治療過程中，DNA甲基化生物標志物可以幫助臨床醫生選擇恰當的治療方式。 對于擁有成千上萬個樣本的大量病人來說，全基因組映射與DNA甲基化分析是非常合
亞硫酸氫鹽修飾后測序法檢測甲基化——DNA甲基化
亞硫酸氫鹽修飾后測序法主要可用來檢測甲基化。基化實驗方法原理重亞硫酸鹽使DNA中未發生甲基化的胞嘧啶脫氨基轉變成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不變，用PCR擴增（引物設計時盡量避免有CpG，以免受甲基化因素的影響）所需片段，則尿嘧啶全部轉化成胸腺嘧啶。最后對PCR產物進行測序，并且與未經處理的序列比較
RNA甲基化測序
1、NSUN2影響m5C在HEK293細胞中整體分布情況NSUN2被報道是RNA甲基轉移酶，能使tRNAs和mRNA發生m5C甲基化修飾。為了探究NSUN2對HEK293細胞mRNA m5C甲基化修飾的影響。作者利用CRISP/Cas9技術敲減NSUN2（NSUN2-/-HEK293細胞）后進行
DNA甲基化預測
實驗概要本實驗分別對DNA片段、基因、啟動子和外顯子進行了甲基化的計算預測，并且隨機選擇了1000甲基化的和1000未甲基化的個體進行預測。用于甲基化預測的特征有：GC相關特征、四聯體頻率、轉錄因子結合位點(TFBSs)。所有預測方法均采用Weka提供的軟件進行。實驗步驟1. DNA甲基化數據本研究
dna甲基化與rna甲基化的區別
DNA甲基化和組蛋白修飾的相同點：都有包含甲基化修飾；不同點：修飾對象不同，一個是對DNA修飾，一個是對蛋白：組蛋白修飾。而RNA干擾是對RNA的降解，與前兩者差異較大。
Cancer－Cell首次揭示lncRNA在20種癌癥中的DNA甲基化改變圖譜
近日，匹茲堡大學楊達課題組在Cancer Cell雜志上發表了最新研究論文，系統地揭示了20種癌癥中長非編碼RNA（lncRNA）的DNA甲基化改變圖譜。 image.png 論文題為“lncRNA Epigenetic landscape analysis identifies E
我是“神藥”——二甲雙胍抑癌機制研究
上海交通大學附屬第一人民醫院張箴波團隊以題為“Metformin sensitizes endometrial cancer cells to chemotherapy through IDH1-induced Nrf2 expression via an epigenetic mechanis
單細胞測序揭示了人類胚胎DNA甲基化動態
2017年12月19日，北京大學北京未來基因診斷高精尖創新中心、生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬研究組和北京大學第三醫院喬杰研究組合作在國際知名學術期刊《自然遺傳學》上在線發表題為“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimpla
基因組直接測序法檢測DNA的甲基化
基因組直接測序法是過去一直沿用的DNA甲基化的研究方法，用Maxam—Gilbert化學裂解法對基因組DNA進行處理，并以連接介導的PCR來放大信號強度，然后進行序列分析。此法是基于5mC在標準的Maxam—Gilbert胞嘧啶化學裂解反應中不被裂解，故5mC可通過在測序膠上缺少對應于胞嘧啶降解反應
外泌體LncRNA幫助免疫細胞“叛變”——乳腺癌惡化新機制－2
5.腫瘤缺氧微環境中乳酸在TAM中上調LncRNA通過生信軟件預測LncRNA HISLA基因啟動子區域與轉錄因子PU.1有典型結合位點。接著，借助ChIP qPCR實驗證實兩者是直接結合的。作者又發現LncRNA HISLA在TAM中的表達量遠高于其他巨噬細胞MDM，已有研究表明MDM“策
關于DNA甲基化檢測的結果分析
在進行甲基化和非甲基化PCR擴增時，均設立空白對照和陽性對照。如果只擴增出非甲基化條帶，判斷為非甲基化；相反，如果只擴增出甲基化條帶，則判斷為甲基化；如果既能擴增出甲基化條帶又能擴增出非甲基化條帶，說明是半甲基化狀態，在統計結果時也計為甲基化陽性。腫瘤細胞DNA總體甲基化的程度越低，癌癥的惡性程
基因組DNA甲基化分析方法
早期的基因組DNA甲基化分析技術，如SssI甲基轉移酶分析法、氯乙醛反應法、免疫學抗體技術等，已經不能滿足現代表觀遺傳學研究的需求。今年來常用的基因組甲基化的方法有以下兩種。1. 甲基化敏感擴增多態性實驗甲基化敏感擴增多態性實驗技術被用于檢測雙向型真菌的DNA甲基化，它是在擴增片段長度多態性技術的基
云序高分文章利器：?ctDNA（羥）甲基化測序案例分享
新型腫瘤標志物篩選利器-----ctDNA（羥）甲基化測序 cfDNA（Cell free DNA）是人體組織排放到血液、尿液或腦脊液等循環體系中降解的DNA小片段，是一種新型的分子標記物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指來源于腫瘤細胞的cfDNA，是液體活檢主
云序高分文章利器：?ctDNA（羥）甲基化測序案例分享
新型腫瘤標志物篩選利器-----ctDNA（羥）甲基化測序 cfDNA（Cell free DNA）是人體組織排放到血液、尿液或腦脊液等循環體系中降解的DNA小片段，是一種新型的分子標記物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指來源于腫瘤細胞的cfDNA，是液體活檢主
Cell－亮點|－反義lncRNA如何調控基因的表達？
反義lncRNA（antisense lncRNA）是指由基因（通常是蛋白編碼基因）的反義鏈轉錄，并與該基因的mRNA存在序列重疊的RNA分子。隨著對非編碼RNA研究的深入，研究發現約70%的基因均有反義lncRNA【1】。更為重要的是，反義lncRNA往往與其正義鏈基因的表達存在相關性，提示反
DNA甲基化技術介紹
DNA 甲基化是表觀遺傳學(Epigenetics)的重要組成部分，在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎發育以及人類腫瘤發生中起著重要作用，是目前新的研究熱點之一。介紹DNA甲基化是最早被發現、也是研究最深入的表觀遺傳調控機制之一。廣義上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的堿基在DNA甲基轉移酶（DN
DNA甲基化的原理
DNA甲基化是最早被發現、也是研究最深入的表觀遺傳調控機制之一。廣義上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的堿基在DNA甲基轉移酶（DNA methyltransferase，DNMT）的催化作用下，以S—腺苷甲硫氨酸（S—adenosyl methionine，SAM）作為甲基供體，通過共價鍵結合的
什么是DNA甲基化？
DNA甲基化（DNA methylation）為DNA化學修飾的一種形式，能夠在不改變DNA序列的前提下，改變遺傳表現。所謂DNA甲基化是指在DNA甲基化轉移酶的作用下，在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5號碳位共價鍵結合一個甲基基團。大量研究表明，DNA甲基化能引起染色質結構、DNA構象、DNA穩定性
什么是DNA甲基化？
DNA甲基化（DNA methylation）為DNA化學修飾的一種形式，能夠在不改變DNA序列的前提下，改變遺傳表現。所謂DNA甲基化是指在DNA甲基化轉移酶的作用下，在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5號碳位共價鍵結合一個甲基基團。大量研究表明，DNA甲基化能引起染色質結構、DNA構象、DNA穩定性
亞硫酸氫鹽測序法檢測DNA的甲基化
亞硫酸氫鹽測序法（Bisulfite sequencing PCR，BSP）用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA，則未發生甲基化的胞嘧啶被轉化為尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶不變。隨后設計BSP引物進行PCR，在擴增過程中尿嘧啶全部轉化為胸腺嘧啶，最后對PCR產物進行測序就可以判斷CpG位點是否發生甲基化稱為BS
單分子測序助力細菌甲基化組的分析
New England Biolabs聯合Pacific Biosciences的研究人員利用PacBio RS系統對6種細菌基因組進行了重測序，不僅鑒定出細菌基因組中新的胞嘧啶和腺嘌呤甲基化位點，還鑒定出介導這些表觀遺傳學標志的甲基轉移酶。該研究成果近日發表在《Nucleic Acid
焦磷酸測序在甲基化分析中的應用
DNA甲基化是近年來研究的熱點，因為越來越多的證據表明，它參與了胚胎發育、基因印跡等過程。同時，它在疾病發展中也起著舉足輕重的作用。甲基化狀態的改變被認為是引起癌癥的一個重要因素，這種變化包括基因組整體甲基化水平的降低和CpG島局部甲基化水平的異常升高，從而導致基因組的不穩定(如染色體的不穩定、
甲基化特異性－PCR－確定－DNA－甲基化的模式
用 PCR 來分析 DNA 甲基化的方法可以運用于：（1）對基因組中任何位置的 CpG 甲基化的分析；（2）檢測腫瘤患者的基因改變以及介人被印的基因的固定遺傳障礙的研究。實驗方法原理DNA甲基化（DNA methylation）是最早發現的修飾途徑之一，大量研究表明，DNA甲基化能引起染色質結構、D