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    RNA甲基化測序

    1、NSUN2影響m5C在HEK293細胞中整體分布情況NSUN2被報道是RNA甲基轉移酶,能使tRNAs和mRNA發生m5C甲基化修飾。為了探究NSUN2對HEK293細胞mRNA m5C甲基化修飾的影響。作者利用CRISP/Cas9技術敲減NSUN2(NSUN2-/-HEK293細胞)后進行RNA-BisSeq。經過生信分析,發現在HEK293細胞有12442個m5C位點,在NSUN2-/-HEK293細胞中有3270個m5C位點,在注釋mRNA中分別有1142個和376個m5C甲基化位點(A)。且NSUN2下調能夠降低m5C甲基化程度(B)和部分染色體上m5C位點數目(C)。但是,NSUN2下調并不改變m5C位點的motif偏好性,HEK293細胞中,CG含有22%,CHG含有33%,CHH含有45%;NSUN2-/-HEK293細胞中,CG含有24%,CHG含有33%,CHH含有43%(C、D)。這些數據顯示,NSU......閱讀全文

    RNA甲基化測序

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    一次RNA甲基化測序的多項成果云序RNA甲基化測序技術...2

    (二)云序客戶m6A RNA甲基化修飾表達譜,一次測序兩篇文章疾病:胃癌樣品:胃癌組織vs癌旁組織(6 vs 6)研究方法:m6A-MeRIP-Seq,RNA-seq4. m6A修飾對其修飾基因在胃癌中的異常表達及預后的潛在影響發表雜志:Frontiers in Genetics影響因子:3.258

    一次RNA甲基化測序的多項成果云序RNA甲基化測序技術...1

    一次RNA甲基化測序的多項成果-云序RNA甲基化測序技術大公開文章導讀RNA修飾是表觀遺傳學中調控轉錄后基因表達的關鍵過程,目前對m6A RNA修飾的研究已進行的如火如荼,而除了m6A以外仍有多種RNA修飾類型參與調控轉錄后的基因表達,其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修飾以及ac

    m5C-RNA甲基化測序介紹

    m5C RNA甲基化簡介通過分析近幾年的國自然立項,可以發現RNA甲基化這兩年的基金項目呈指數級增長的趨勢:特別是從2015年的5項到2017年的25項,項目增長尤為顯著。僅2018年1月的RNA甲基化文獻就達到25篇,可以說RNA甲基化的發展已經到了井噴階段,多篇文章榮登CNS級別期刊。RNA甲基

    云序生物獨家首發m5C-RNA甲基化測序

      m5C RNA甲基化簡介   通過分析近幾年的國自然立項,可以發現RNA甲基化這兩年的基金項目呈指數級增長的趨勢:特別是從2015年的5項到2017年的25項,項目增長尤為顯著。僅2018年1月的RNA甲基化文獻就達到25篇,可以說RNA甲基化的發展已經到了井噴階段,多篇文章榮登CNS級別期刊

    云序生物獨家首發m5C-RNA甲基化測序

      m5C RNA甲基化簡介   通過分析近幾年的國自然立項,可以發現RNA甲基化這兩年的基金項目呈指數級增長的趨勢:特別是從2015年的5項到2017年的25項,項目增長尤為顯著。僅2018年1月的RNA甲基化文獻就達到25篇,可以說RNA甲基化的發展已經到了井噴階段,多篇文章榮登CNS級別期刊

    RNA甲基化研究

    近期華人科學家辛辛那提大學陳建軍教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修飾在正常和惡性造血過程中的重要作用,表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信號軸在髓系分化以及白血病發生過程中的作用。該研究于2018年1月發表在干細胞頂級期刊《Cell Steam Cell》(影響因子:

    科研人員研發RNA甲基化7甲基鳥嘌呤測序技術

      7-甲基鳥嘌呤(m7G)修飾是轉錄后調控中最常見的堿基修飾形式之一,廣泛分布于tRNA、rRNA以及真核生物mRNA的5’帽子區,對維持RNA的加工代謝、穩定、出核以及蛋白質翻譯具有重要作用。近期研究表明高等真核生物mRNA內部也含有m7G修飾,然而對其分布特征和調控作用目前尚不清楚。  中國科

    檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平(下)

      又到了一周云序生物課堂開講時間!你,準備好了嗎?   上一期文章當中,云序通過引用這樣一張表格給大家傳遞了一個重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且這些酶在不同疾病當中意義有所不同,例如METTL3在AML、B

    檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平(上)

      云序生物解析如何做到快速同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶&RNA甲基化水平(上)   RNA甲基化作為云序生物的主打科研產品,已經幫助多個研究團隊展開了RNA甲基化研究。作為國內RNA甲基化研究的領跑者,云序生物是國內RNA甲基化10分文章發表的成熟服務商,首發推出了非編碼RNA甲基化測

    快速檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平

      占領C位!云序生物解析如何做到快速同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶&RNA甲基化水平   RNA甲基化作為云序生物的主打科研產品,已經幫助多個研究團隊展開了RNA甲基化研究。作為國內RNA甲基化研究的領跑者,云序生物是國內RNA甲基化10分文章發表的成熟服務商,首發推出了非編碼RNA

    同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平

      RNA甲基化作為云序生物的主打科研產品,已經幫助多個研究團隊展開了RNA甲基化研究。作為國內RNA甲基化研究的領跑者,云序生物是國內RNA甲基化10分文章發表的成熟服務商,首發推出了非編碼RNA甲基化測序研究,首發推出了超微量RNA甲基化測序技術,首發推出RNA甲基化研究一站式系統性解決方案,云

    dna甲基化與rna甲基化的區別

    DNA甲基化和組蛋白修飾的相同點:都有包含甲基化修飾;不同點:修飾對象不同,一個是對DNA修飾,一個是對蛋白:組蛋白修飾。而RNA干擾是對RNA的降解,與前兩者差異較大。

    雙RNA測序技術

    在發表于《自然》(Nature)雜志上的一篇研究論文中, 由來自德國、奧地利和美國的研究人員組成的一個研究小組發現,采用一種允許在感染過程中同時研究細菌與宿主小RNA的新技術,可以揭示出兩者轉錄譜的改變。該研究小組描繪了他們的技術、該技術如何更多地幫助了解細菌感染機制,以及在研究中獲得的重要發現

    快速檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平(下)

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    解析檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平(上)

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    同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平(下)

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    RNA甲基化促進草莓成熟

      果實中富含的營養成分是人類膳食結構的重要組成部分,對人體健康不可或缺。果實品質在成熟過程中逐漸形成,受到精確調控。解析果實成熟調控機制,將為果實品質改良和新品種選育提供理論基礎。根據成熟機制的不同,果實可分為兩種類型:呼吸躍變型(如番茄、蘋果、香蕉)和非呼吸躍變型(如草莓、葡萄、柑橘)。植物激素

    RNA甲基化研究深度剖析

      一、聽說最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣?   1、高分文章頻現   說起近來的科研熱點,RNA甲基化修飾的相關研究可以說是當前整個生命科學領域最熱門的方向之一,亮點文章頻出,著實讓人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月發表的文章影響因子為10分以上的,就有高達 17 篇。

    DNA-甲基化測序常用方法

    隨著高通量測序技術(NGS)技術的發展,使我們能夠從全基因組水平來分析 5’甲基胞嘧啶及組蛋白修飾等事件,由此能夠發現很多傳統的基因組學研究所不能發現的東西,這就是所謂的“DNA 甲基化測序”!DNA 甲基化測序方法按原理可以分成三大類:?1、重亞硫酸鹽測序;?2、基于限制性內切酶的測序;?3、靶向

    環狀-RNA-測序案例分析

    案例:以結腸癌,卵巢癌,特發性肺纖維化及正常的人組織為例探討 circular RNAs 的富集與增殖的相關性 背景:最新研究表明,circular RNAs 大量存在,是構成生物體 RNA 網絡的一部分,而且研究者們推測 circular RNAs 與 miRNAs 一樣具有生物學功能。 目的

    核糖核酸(RNA)測序

      RNA在細胞中的穩定性較差,在實驗中也更容易受到核酸酶的攻擊。因為RNA是由DNA轉錄產生的,所以信息已經存在于細胞的DNA中。然而,有時也需要對RNA分子進行測序。雖然DNA測序給出了生物體的遺傳圖譜,但RNA測序卻反映了細胞中活躍表達的序列。為了給RNA測序,通常的方法是首先對從樣品中提取的

    RNA甲基化研究深度剖析(一)

    一、聽說最近?RNA甲基化很火,它是何方神圣?1、高分文章頻現 說起近來的科研熱點,RNA甲基化修飾的相關研究可以說是當前整個生命科學領域最熱門的方向之一,亮點文章頻出,著實讓人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月發表的文章影響因子為10分以上的,就有高達?17?篇。 圖:RNA甲基化近期高

    “RNA-甲基化”研究匯總——擬南芥篇

    關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上頻頻亮相,并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者,許多學者將它作為研究對象,并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合,證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育

    lncRNA啟動子DNA甲基化/羥甲基化測序分析

    技術優勢:●?? 專注非編碼RNA領域,完善的lncRNA啟動子分析流程●???可與lncRNA表達譜芯片聯合應用,實現平臺間無縫對接●???可視化數據展示,提供paper級結果圖表●???優化的IP實驗方法,可信賴的檢測平臺及數據結果?介紹:????? 人類基因組中僅有約2%的DNA序列最

    m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇

    RNA甲基化是目前申請國自然項目熱點,也是唯一能在短短3個月內發數十篇nature,cell級別高分文章領域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究熱潮。因mRNA參與蛋白編碼,之前多數文章針對mRNA甲基化進行研究(詳細見云序課堂之前往期回顧)。然而許多研究表明發生m6A甲基化的非編碼RNA在

    “RNA測序”通用模板新突破

      通過檢測血液或尿液中少量的RNA來診斷或治療疾病是一個新興領域。隨著技術的進步,研究人員可以對RNA片段進行測序,但不同的人使用不同的方法來測序RNA,有時會得到不同的結果,這是影響成功的一個重大障礙,使得此領域很難取得進展。近來,密歇根大學Tewari教授的實驗室領導了美國和荷蘭的9個實驗室組

    一文了解RNA甲基化機制

      1. 什么是RNA甲基化修飾?  我們知道DNA的甲基化修飾是發生在胞嘧啶(C)上的,而最常見的RNA的甲基化修飾是m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺嘌呤)和尿苷化修飾(uridylation,U-tail)。  m6A修飾在70年代就發現了,是可以發生在mRNA、lncR

    lncRNA啟動子DNA甲基化/羥甲基化測序分析綜述

      技術優勢:   ● 專注非編碼RNA領域,完善的lncRNA啟動子分析流程   ● 可與lncRNA表達譜芯片聯合應用,實現平臺間無縫對接   ● 可視化數據展示,提供paper級結果圖表   ● 優化的IP實驗方法,可信賴的檢測平臺及數據結果   介紹:    人類基因組中僅有

    最新DNA甲基化測序技術比較研究

      在不同疾病中,DNA甲基化具有不同的模式。DNA甲基化的具體模式通常與諸如疾病亞型、疾病預后以及藥物反應等臨床信息具有一一對應的聯系。在多種癌癥的治療過程中,DNA甲基化生物標志物可以幫助臨床醫生選擇恰當的治療方式。  對于擁有成千上萬個樣本的大量病人來說,全基因組映射與DNA甲基化分析是非常合

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