RNA甲基化促進草莓成熟
果實中富含的營養成分是人類膳食結構的重要組成部分,對人體健康不可或缺。果實品質在成熟過程中逐漸形成,受到精確調控。解析果實成熟調控機制,將為果實品質改良和新品種選育提供理論基礎。根據成熟機制的不同,果實可分為兩種類型:呼吸躍變型(如番茄、蘋果、香蕉)和非呼吸躍變型(如草莓、葡萄、柑橘)。植物激素乙烯(ethylene)在呼吸躍變型果實的成熟調控中發揮關鍵作用,而脫落酸(abscisic acid,ABA)則參與非呼吸躍變型果實成熟調控。 已有研究表明,DNA甲基化在呼吸躍變型果實和非呼吸躍變型果實的成熟調控中均發揮重要作用。與DNA甲基化相對應,RNA甲基化(m6A)是mRNA上含量最豐富的修飾,對于動植物的多個生物學過程至關重要。此前,中國科學院植物研究所秦國政研究組已經發現,m6A修飾參與呼吸躍變型果實番茄的成熟調控。然而,m6A在非呼吸躍變型果實成熟調控中的功能仍不清楚。在不同類型的果實中,m6A的調控機制是否存在進......閱讀全文
RNA甲基化促進草莓成熟
果實中富含的營養成分是人類膳食結構的重要組成部分,對人體健康不可或缺。果實品質在成熟過程中逐漸形成,受到精確調控。解析果實成熟調控機制,將為果實品質改良和新品種選育提供理論基礎。根據成熟機制的不同,果實可分為兩種類型:呼吸躍變型(如番茄、蘋果、香蕉)和非呼吸躍變型(如草莓、葡萄、柑橘)。植物激素
草莓通過調節ABA途徑的方式影響果實成熟
近日,中國科學院植物研究所研究員秦國政團隊發現,RNA甲基化(m6A)修飾在不同類型果實的成熟調控中均發揮重要作用,但是作用機制有所不同。在番茄果實中,m6A修飾主要通過反饋調控DNA甲基化來發揮作用,而在草莓果實中,m6A修飾則通過調節ABA途徑的方式影響果實成熟,這為闡明果實成熟調控網絡提供
植物所解析RNA甲基化調控果實成熟的作用機制
DNA甲基化(5mC)和RNA甲基化(m6A)是兩種重要的核酸修飾,在基因表達調控中發揮重要作用并參與諸多生物學過程。然而,這兩種核酸修飾之間是否存在內在關聯性卻不清楚。近日,中國科學院植物研究所秦國政研究組和田世平研究組合作,揭示了DNA甲基化可通過調節m6A去甲基化酶基因表達的方式影響番茄果
科學家建立草莓果實信號轉導研究新方法
果實發育和成熟調控是園藝學科的熱點和重點問題之一。多年來,人們圍繞果實發育和成熟機理開展了大量研究。然而,這些研究大多集中于果實成熟調控的生理、生化基礎。近年來,果實發育和成熟的分子基礎研究也取得了令人矚目的成就,但有關研究多集中在結構基因或轉錄因子,而對操縱結構基因或轉錄因子的上游信號系統知
m6A“RNA甲基化”研究匯總—病毒篇
RNA甲基化領域是當前最耀眼的國際科研明星,也是國自然申請的大熱點;究其原因,是因為最近一兩年,RNA甲基化的功能與分子機制方面取得了巨大的進展。RNA甲基化已被證實在癌癥發生發展,病毒感染,神經發育,干細胞分化等過程中發揮著關鍵作用。今天,我們承接上一期的癌癥篇,為您帶來病毒領域的RNA甲基化研究
m6A“RNA甲基化”研究匯總—癌癥篇
一個月發表30多篇10分以上的文章,到底是何方神圣?答案:RNA甲基化。今天小編先來介紹一下m6A RNA甲基化。m6A是真核細胞中mRNAs豐度最高的甲基化修飾,在包括組織發育、干細胞自我更新和分化、熱休克以及DNA損傷應答,母本合子(maternal-to-zygotic)轉化等多個重要的生物學
表觀遺傳研究熱點:RNA-甲基化(m6A)研究
隨著表觀遺傳學研究的不斷深入,組蛋白修飾(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和?DNA?甲基化修飾相關的高水平研究成果如雨后春筍般涌現,遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊雜志。在分子生物學的中心法則中,遺傳信息從 DNA、RNA 流向蛋白。基因組 DNA 和組蛋白上都存在可逆的表觀遺
表觀遺傳研究熱點:RNA-甲基化(m6A)研究
隨著表觀遺傳學研究的不斷深入,組蛋白修飾(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和 DNA 甲基化修飾相關的高水平研究成果如雨后春筍般涌現,遍布 Nature, Cell 和 Science 等期刊雜志。在分子生物學的中心法則中,遺傳信息從 DNA、RNA 流向蛋白。基因組 DNA 和組蛋白上都存
研究揭示RNA去甲基化酶的氧化還原修飾調控番茄果實成熟機制
活性氧作為重要的信號分子,在植物抵御病原菌侵染、響應逆境脅迫以及維持正常生長發育的多個生物學過程中發揮重要的調控作用。在多種活性氧分子中,過氧化氫具有較長的半衰期,可調控干細胞分化、花粉管伸長、氣孔發育、果實成熟等植物發育過程,但過氧化氫如何與其他信號途徑協同作用,共同調控植物發育過程卻不甚清楚。中
研究發現RNA甲基化調控果實成熟的作用機制
8月7日,《國家科學評論》(National Science Review)在線發表了中國科學院上海營養與健康研究所——馬普計算生物學研究所徐書華團隊的研究成果“Prioritizing natural selection signals from the deep-sequencing gen
RNA-m6A甲基化修飾研究相關研究的應用
如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行對我們有任何啟發的話,那么要數對RNA修飾的研究了,此時研究病毒RNA以及其甲基化修飾等功能,顯得比以往任何時候都更加重要。 而這是否意味著要研究病毒RNA本身不同的各種突變體或者表觀遺傳變化如何使這些病毒更靈活和感染力?還是研究從細胞和組織中收集的R
m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
RNA甲基化是目前申請國自然項目熱點,也是唯一能在短短3個月內發數十篇nature,cell級別高分文章領域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究熱潮。因mRNA參與蛋白編碼,之前多數文章針對mRNA甲基化進行研究(詳細見云序課堂之前往期回顧)。然而許多研究表明發生m6A甲基化的非編碼RNA在
解鎖5分m6A甲基化譜文章新思路
1.構建OSC細胞模型--MG63/DXR作者選擇人的OS細胞系--MG63,通過阿霉素DXR誘導,建立了多藥耐藥性細胞株--MG63 / DXR。并通過分析其特定的細胞表面標志物CD133和CD117 / STRO-1;干細胞相關基因的表達量;皮下注射對裸鼠的致瘤潛力等多個方面數據證明MG
CHAPIR通過m6A甲基化調控心臟肥大的分子機制
慢性心肌肥大及其相關的心肌重塑是發展心臟功能障礙的主要因素,從而導致嚴重的心力衰竭和死亡。RNA m6A甲基化/去甲基化機制與心臟的生理和病理過程密切相關,然而m6A修飾參與心臟肥大的分子機制尚不清楚。非編碼RNA(ncRNA),尤其是ncRNA的心臟特異性表達,在生理和病理性心臟肥大中均具
朱健康等揭示DNA甲基化對番茄果實成熟作用
近日,中科院上海植物逆境生物學研究中心朱健康研究組和郎曌博研究組利用CRISPR/Cas9技術獲得了番茄sldml2的突變體植株,發現番茄sldml2調節的DNA去甲基化不僅可以激活成熟需要的基因,同時還可以抑制成熟不需要的基因,在調節番茄果實成熟的過程中發揮了重要作用。相關研究成果日前在線發表
全套病毒RNA-m6A甲基化修飾研究工具的使用(二)
? ? ? ?那么,病毒RNA修飾的研究工作流程有哪些呢??? ? ? ?首先,提取病毒RNA?? ? ? ?無論您是從細胞,組織還是病毒等樣品開始實驗,高效而快速的RNA提取通常都是成功進行實驗的第一步。工作流程的這一部分至關重要,因為足夠的純度和產量都是確保下游應用程序平穩準確運行的基本要求。?
m6A甲基化的疑難雜癥與治療方法(三)
? ? ?(3)什么情況下的樣本OD值被認為是可用的??? ? ? ?處方:只要樣品的OD高于NC的數值,該數據仍可用于計算m6A水平。?? ? ?(4)重復孔之間差異較大怎么計算??? ? ? ?處方:對于重復孔之間差異較大,我們若是重復孔3個以上的話,我們一般會選擇舍棄其中差異特別特別大的一
m6A甲基化的疑難雜癥與治療方法(二)
? ? ? ?三、p-9005檢測的疑難雜癥和藥方?? ? ? ?1.病癥一:樣本?? ? ? ?對于這個試劑盒,很多人對與樣本方面有很多的疑問,雖然試劑說明書上說可適用任何物種的m6A檢測,但是同學們還是有各種各樣的問題:? ? ?(1)RNA樣本類型?? ? ? ?處方:培養的細胞,新鮮和冷凍的
全套病毒RNA-m6A甲基化修飾研究工具的使用(三)
? ? ? ?隨后, 需要檢測m6A甲基化酶和脫甲基酶活性?? ? ? ?如果您打算研究RNA甲基化酶或去甲基化酶的活性/抑制作用,我們建議您使用上述提到的功能強大的核提取試劑盒(OP-0002),該試劑盒可以快速提取核蛋白,同時可確保提取后的酶活性保持完整。?? ? ? ?收集了核提取物后,進行甲
全套病毒RNA-m6A甲基化修飾研究工具的使用(一)
? ? ? ?如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行對我們有任何啟發的話,那么要數對RNA修飾的研究了,此時研究病毒RNA以及其甲基化修飾等功能,顯得比以往任何時候都更加重要。 而這是否意味著要研究病毒RNA本身不同的各種突變體或者表觀遺傳變化如何使這些病毒更靈活和感染力?還是研究從細胞和
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—病毒篇
RNA甲基化領域是當前最耀眼的國際科研明星,也是國自然申請的大熱點;究其原因,是因為最近一兩年,RNA甲基化的功能與分子機制方面取得了巨大的進展。RNA甲基化已被證實在癌癥發生發展,病毒感染,神經發育,干細胞分化等過程中發揮著關鍵作用。今天,我們承接上一期的癌癥篇,為您帶來病毒領域的RNA甲基化
最新云序生物m6A“RNA甲基化”研究匯總—癌癥篇
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RNA甲基化(m6A)研究:最前沿表觀遺傳研究熱點(二)
那么如何檢測RNA的甲基化水平呢?Epigentek推出市場上唯一一款RNA甲基化定量檢測試劑盒:·EpiQuik M6A RNA Methylation Quantification Kit(比色法)是一組優化的、完整的的試劑組合,可以通過比色的方法定量RNA中N6-甲基腺嘌呤(m6A)。它可以直
RNA甲基化(m6A)研究:最前沿表觀遺傳研究熱點(一)
隨著表觀遺傳學研究的不斷深入,組蛋白修飾(甲基化,乙酰化,磷酸化…)和DNA甲基化修飾相關的高水平研究成果如雨后春筍般涌現,遍布Nature, Cell和Science等期刊雜志。在分子生物學的中心法則中,遺傳信息從DNA、RNA流向蛋白。基因組DNA和組蛋白上都存在可逆的表觀遺傳學修飾,這
m6A甲基化的疑難雜癥與治療方法(一)
? ?? 表觀遺傳相關的研究近年來也是一大研究熱點,我們知道的表觀遺傳修飾有組蛋白修飾,DNA甲基化,RNA甲基化等等。之前的推文也有專門介紹RNA甲基化相關的研究現狀和優勢http://www.bio-review.com/m6a-rna/,以及相關的產品推薦http://www.bio-revi
5篇m6A甲基化文章教你如何使用純測序數據
文章導讀2019年m6A修飾曾創下單月發表100+篇10分影響因子文章佳話。2020年1月17日何川教授團隊最新Science揭示了m6A新功能---調控染色質狀態和轉錄預示m6A等RNA修飾將仍然是目前最為熱門的科研方向。m6A甲基化與mRNA關聯分析案例一:非洲爪蟾睪丸組織中m6A甲基化圖譜發表
m6A-RNA甲基化在發表多篇10+文章的運用
最近小編檢索了關于m6A修飾的文章發表情況,發現目前2020年發表的關于m6A修飾的文章已經達到309篇,已經追平2019年整年度發表篇數,可以預見m6A RNA修飾下半年年發表文章會呈現出爆炸式增長。 圖1. 近6年m6A RNA修飾相關文章發表情況( data from PubMe
上海生科院揭示DNA甲基化對番茄果實成熟的重要作用
5月15日,《美國科學院院刊》(PNAS)在線發表了中國科學院上海生命科學研究院植物逆境生物學研究中心朱健康研究組和郎曌博研究組題為Critical roles of DNA demethylation in the activation of ripening-induced genes an
5篇m6A甲基化文章教你如何使用純測序數據得高分
2019年m6A修飾曾創下單月發表100+篇10分影響因子文章佳話。2020年1月17日何川教授團隊最新Science揭示了m6A新功能---調控染色質狀態和轉錄預示m6A等RNA修飾將仍然是目前最為熱門的科研方向。 云序生物是國內最早提供m6A測序的科研平臺,也是客戶發表文章最多的RNA甲基化測
云序生物最新“RNA-甲基化”研究匯總擬南芥篇
關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上頻頻亮相,并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者,許多學者將它作為研究對象,并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合,證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育期,