北京基因組所發布癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM
近日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）國家基因組科學數據中心開發的癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM上線。該研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cancers為題在國際學術期刊Nucleic Acid Research在線發表。 單細胞分辨率的全轉錄組測序技術（scRNA-seq）具有研究細胞異質性的顯著優勢，已成為研究腫瘤微環境、癌癥發病機制、轉移與侵襲以及各類癌癥治療與診斷不可或缺的手段。截至2021年11月，PubMed已有超過1300個癌癥相關的單細胞轉錄組學研究，極大提升了人們對人類癌癥發生發展的理解，推動了癌癥臨床診斷與治療的進程。大規模癌癥scRNA-seq數據在過去十年中呈現爆炸式增長，迫切需要對這些數據進行規范化整合與處理，對各類癌癥的腫瘤微環境進行深入挖掘與比較分......閱讀全文
多物種轉錄圖譜綜合數據庫已對用戶免費開放
隨著高通量測序技術的發展，轉錄組測序（RNA-seq）已成為系統研究基因轉錄及轉錄后水平調控狀態的常規方法，并在多個物種中得到廣泛應用。海量轉錄組數據以前所未有的速度產生，以數據驅動為導向的大規模數據整合、挖掘與解析面臨挑戰。為更充分展現轉錄組數據蘊含的豐富信息，服務生物醫學基礎研究領域需求，構
北京基因組所發布癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM
近日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）國家基因組科學數據中心開發的癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM上線。該研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human can
科研人員開發出分子序列組分動態圖譜數據庫CompoDynamics
生物體的核酸與蛋白質分子的序列組分及相關特征（如GC/AG含量、密碼子使用偏好、蛋白質物理化學性質等）對于研究基因功能和物種演化具有重要意義，是理解不同物種、不同基因家族以及不同功能基因之間差異的數據基礎。 近日，由中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）國家基因組科學數據中心開發的分子
北京基因組所發布癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM
近日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）國家基因組科學數據中心開發的癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM上線。該研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cance
北京基因組所構建出多物種轉錄圖譜綜合數據庫
隨著高通量測序技術的發展，轉錄組測序（RNA-seq）已成為系統研究基因轉錄及轉錄后水平調控狀態的常規方法，并在多個物種中得到廣泛應用。海量轉錄組數據以前所未有的速度產生，以數據驅動為導向的大規模數據整合、挖掘與解析面臨挑戰。為更充分展現轉錄組數據蘊含的豐富信息，服務生物醫學基礎研究領域需求，構
基于八大基因組學數據庫－構建迄今最完整的癌癥eRNA圖譜
增強子RNA（eRNA）是一種從增強子轉錄的非編碼RNA。目前，科學家已經在人類細胞中鑒定出數以萬計的eRNA，其中許多都在RNA轉錄過程中發揮重要作用，以介導靶基因的激活。在人類癌癥中，癌基因或致癌信號通路的激活通常引起增強子的激活和eRNA的產生。例如，ESR1的激活可以整體上增加乳腺癌中e
轉錄圖譜的轉錄圖譜的意義
在于它能有效地反應在正常或受控條件中表達的全基因的時空圖。通過這張圖可以了解某一基因在不同時間不同組織、不同水平的表達；也可以了解一種組織中不同時間、不同基因中不同水平的表達，還可以了解某一特定時間、不同組織中的不同基因不同水平的表達。人類基因組是一個國際合作項目：表征人類基因組，選擇的模式生物的D
期刊數據庫更新
圖片來源：B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影響因子多年來備受批評，認為其扭曲了學術出版。近日，美國賓夕法尼亞州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用報告（JCR）數據庫的更新版本，并表示它提供了理解期刊特征和受眾的背景信息。 影響因子代表期刊文章的引用次數，除以其兩年間發表的文章數量，
期刊數據庫更新
圖片來源：B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影響因子多年來備受批評，認為其扭曲了學術出版。近日，美國賓夕法尼亞州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用報告（JCR）數據庫的更新版本，并表示它提供了理解期刊特征和受眾的背景信息。 影響因子代表期刊文章的引用次數，除以其兩年間發表
核酸數據庫的概念
中文名稱核酸數據庫英文名稱nucleic acid data bank定 義DNA、RNA序列的資料庫，主要包括已知序列名稱、DNA或RNA全序列及其特性，如啟動區、起始和終止密碼的位置、編碼區、限制酶切位點以及推導的翻譯產物蛋白質序列等。應用學科生物化學與分子生物學（一級學科），方法與技術（二級
GenBank數據庫概述（一）
1. GenBank屬于一個序列數據庫的國際合作組織，包括EMBL和DDBJ。是NIH遺傳序列數據庫，一個所有可以公開獲得的DNA序列的注釋過的收集。GenBank同日本和歐洲分子生物學實驗室的DNA數據庫共同構成了國際核酸序列數據庫合作。唯一人類基因序列集合（UniGene），人類基因組基因圖
GenBank數據庫概述（三）
結構： 1、 結構主頁 — 關于NCBI結構小組的一般信息和他們的研究計劃，另外也可以訪問分子模型數據庫（MMDB）和用來搜索和顯示結構的相關工具。 2、 MMDB：分子模型數據庫 — 一個關于三維生物分子結構的數據庫，結構來自于X-ray晶體衍射和NMR色譜分析。MMDB是來源于Brook
GenBank數據庫概述（四）
NCBI站點地圖---其他基因組數據介紹：1、 小鼠基因組 1) 小鼠基因組資源向導 ：把從各個中心來的各種小鼠相關的資源整合在一起，包括序列，圖譜，和克隆信息以及指向小鼠種系和突變資源的指針。 2) 小鼠基因組測序：小鼠基因組計劃的測序進展，HTG序列contigs（可以用大小和染色體號來瀏覽）由
GenBank數據庫概述（二）
FTP GenBank and Daily Updates：1. GenBank普通文件格式 — 參見GenBank記錄樣本和在GenBank公布通知中的詳細描述，下載大多數最近的完全公告和日常積累或非積累更新數據。 2. ASN.1格式 — 摘要句法記號1，國際標準組織（ISO）數據表示格式，下載
閱讀質粒圖譜
載體主要有病毒和非病毒兩大類,其中質粒DNA是一種新的非病毒轉基因載體。一、一個合格質粒的組成要素???復制起始位點Ori 即控制復制起始的位點。原核生物DNA分子中只有一個復制起始點。而真核生物DNA分子有多個復制起始位點。???抗生素抗性基因 可以便于加以檢測，如Amp+ ,Kan+???多克隆
紅外圖譜口訣
紅外識譜圖看似復雜，其實也有規律可循，試試這個口訣，說不定 也是一種方法。 紅外可分遠中近，中紅特征指紋區， 1300來分界，注意橫軸劃分異。 看圖要知紅外儀，弄清物態液固氣。 樣品來源制樣法，物化性能多聯系。 識圖先學飽和烴，三千以下看峰形。 2960、2870是甲基
XPS圖譜解釋
（1）譜線識別X射線入射在樣品上，樣品原子中各軌道電子被激發出來成為光電子。光電子的能量統計分布（X射線光電子能譜）代表了原子的能級分布情況。不同元素原子的能級分布不同，X射線光電子能譜就不同，能譜的特征峰不同，從而可以鑒別不同的元素。電子能量用E = Enlj 表示。光電子則用被激發前原來所處的能
QP2010農藥數據庫
Shimadzu氣質聯用的多種農藥庫 QP2010農藥數據庫
生命科學常用數據庫
The NationalCenter for Biotechnology Information.?http://www.ncbi.nlm.nih.gov/National Center for GenomeResources.http://www.ncgr.org/ncgr/ncgr.html?T
全球危險病毒數據庫上線
一個供研究人員共享危險病毒基因組的新數據庫，有望解決許多阻礙現有方法的問題。但前提是，必須說服研究人員使用它。據《自然》報道，這一名為Pathoplexus的數據庫于上個月啟動，數據庫背后的科學家團隊希望有更多研究人員分享已知和新出現的對公共衛生具有重要意義的基因序列。澳大利亞悉尼大學病毒學家Edw
美國更新食品摻假數據庫
9月5日食品安全新聞網消息，美國藥典委員會（USP）更新了食品摻假數據庫（FFD2.0）。食品摻假數據庫主要為行業、監管部門以及消費者預防和應對食品摻假事件發生提供技術支持。最新的FFD2.0涵蓋了科研文獻、媒體信息、食品監管記錄、司法裁決記錄中涉及食品摻假事件的各種信息。新版食品摻假數據庫將于
漢語語言產生數據庫發表
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517976.shtm
拉曼光譜免費數據庫
拉曼數據庫在物質鑒定和化學分析方面具有重要的作用。關于拉曼數據，我們一般會關注兩個峰的位置，分別是D峰和G峰。D峰和G-峰均是C原子晶體的 Raman特征峰，分別在1350cm-1和 1580 cm-1附近，D峰反應的是晶格的碳缺陷，G峰反應的是材料的碳化程度。I(D) / I(G) 是 D峰和G峰
EDS圖譜是什么
色散譜英文全稱:Energy Dispersive Spectroscopy原理:利用不同元素的X射線光子特征能量不同進行成分分析。
怎么分析XRD圖譜
1、XRD圖中有很多信息，如組成（物相）和結構、粒度、應力、結晶度等，其分析方法各不相同。2、比如，若是做物相分析，樣品是已知物質的，你只要將XRD圖譜與標準圖進行比對就可以大致判斷，一般設備中都會提供已知物數據庫，供調用比對。3、當然雜相分析就需要一定的經驗了，不是一兩句話就能說清楚的。4、若是做
怎么分析XRD圖譜
1、XRD圖中有很多信息，如組成（物相）和結構、粒度、應力、結晶度等，其分析方法各不相同。2、比如，若是做物相分析，樣品是已知物質的，你只要將XRD圖譜與標準圖進行比對就可以大致判斷，一般設備中都會提供已知物數據庫，供調用比對。3、當然雜相分析就需要一定的經驗了，不是一兩句話就能說清楚的。4、若是做
質粒圖譜的閱讀
載體主要有病毒和非病毒兩大類,其中質粒DNA是一種新的非病毒轉基因載體。一、一個合格質粒的組成要素???復制起始位點Ori 即控制復制起始的位點。原核生物DNA分子中只有一個復制起始點。而真核生物DNA分子有多個復制起始位點。???抗生素抗性基因 可以便于加以檢測，如Amp+ ,Kan+???多克隆
轉錄圖譜的定義
轉錄圖譜是在識別基因組所包含的蛋白質編碼序列的基礎上繪制的結合有關基因序列、位置及表達模式等信息的圖譜。在人類基因組中鑒別出占具2%~5%長度的全部基因的位置、結構與功能，最主要的方法是通過基因的表達產物mRNA反追到染色體的位置。
轉錄圖譜的原理
所有生物性狀和疾病都是由結構或功能蛋白質決定的，而已知的所有蛋白質都是由mRNA編碼的，這樣可以把mRNA通過反轉錄酶合成cDNA或稱作EST的部分的cDNA片段，也可根據mRNA的信息人工合成cDNA或cDNA片段，然后，再用這種穩定的cDNA或EST作為“探針”進行分子雜交，鑒別出與轉錄有關的基
連鎖圖譜的定義
又稱連鎖圖譜（linkage map），它是以具有遺傳多態性（在一個遺傳位點上具有一個以上的等位基因，在群體中的出現頻率皆高于1%）的遺傳標記為“路標”，以遺傳學距離（在減數分裂事件中兩個位點之間進行交換、重組的百分率，1%的重組率稱為1cM）為圖距的基因組圖。遺傳圖譜的建立為基因識別和完成基因定位