基因編輯技術給植物基因結構變異研究帶來新機遇
植物基因組結構變異（Structural variations, SVs）包括基因插入/缺失變異和拷貝數變異，與單核苷酸多態性和表觀遺傳差異一起構成種內和種間可遺傳表型的多樣性。了解SVs在植物表型變異中的作用對于植物育種工作者生產改良品種具有重要意義。但早期基因技術的低分辨率和低效的方法限制了研究人員對植物SVs的理解。隨著基因組檢測技術的迅速發展，使得以更高的分辨率和準確性評估SVs成為可能。 近日，澳大利亞科研人員在國際學術期刊Plant Biotechnology Journal上在線發表了題為“Current status of structural variation studies in plants”的綜述。該綜述總結了植物SVs的研究現狀，探討了SVs在表型性狀中的作用，比較目前技術在SVs研究中的優勢，并對SVs研究的未來挑戰進行了評估。 在早期的植物基因組研究中，由于技術的限制和高質量參考基因組......閱讀全文
基因編輯技術給植物基因結構變異研究帶來新機遇
植物基因組結構變異（Structural variations, SVs）包括基因插入/缺失變異和拷貝數變異，與單核苷酸多態性和表觀遺傳差異一起構成種內和種間可遺傳表型的多樣性。了解SVs在植物表型變異中的作用對于植物育種工作者生產改良品種具有重要意義。但早期基因技術的低分辨率和低效的方法限制了
科學家提出深度學習框架用于發現癌癥中的新突變
全基因組染色質構象捕獲技術（Hi-C技術）已被證明是檢測人類基因組中結構變異（SVs）的一種有效方法。然而，目前能夠使用Hi-C數據進行全范圍檢測SVs的算法一直缺乏。目前的方法只能在不太理想的分辨率下，識別染色體間易位和長距離染色體內SVs（>1 Mb）。美國西北大學范伯格醫學院研究人員基于深
Cell－Rep：用CRISPR/Cas誘導基因組結構變異
2月10日，德國馬克斯普朗克分子遺傳學研究所的研究人員在《Cell Reports》發表一項最新研究成果，題為“Deletions, Inversions, Duplications: Engineering of Structural Variants using CRISPR/Cas in
西藏大學等在線發布了第一個藏族人群高質量參考基因組
10月23日，《國家科學評論》雜志在線發布了第一個藏族人群高質量參考基因組。該成果是中國科學院昆明動物研究所宿兵課題組、西藏大學歐珠羅布與崔超英課題組、中國科學院上海營養與健康研究所徐書華課題組、青海省高原醫學科學研究院吳天一課題組等，經過兩年多聯合攻關完成的藏族人群高原適應研究的又一階段性成果
山西醫科大學Cell子刊發表最新癌癥成果
來自山西醫科大學、中國醫學科學院北京協和醫院、深圳華大基因研究所等機構的研究人員，采用全基因組測序（WGS）揭示出了食管鱗狀細胞癌多樣的結構變異模式。研究論文發表在Cell出版社旗下的子刊《AJHG》雜志上。 山西醫科大學的崔永萍（Yongping Cui）教授和中國醫學科學院副院長詹啟敏（Q
SageHLS靶向捕獲大片段DNA在測序解析神經精神疾病CNVs結...
SageHLS靶向捕獲大片段DNA在測序解析神經精神疾病CNVs結構研究的應用在2020年的美國AGBT（基因組生物學與技術進展）大會上，由斯坦福大學實驗室的Alexander Urban和Hanlee Ji主導的一項國際合作項目中，研究人員使用SageHLS超大片段核酸回收系統在結構復雜的人類染色
我科學家在人類個體基因組研究領域又取得一項重要成果
我科學家采用新一代測序技術為人類基因組結構變異檢測提供新方法 我國科學家在人類個體基因組研究領域又取得一項重要成果。7月25日，由深圳華大基因研究院主導完成的“基于全基因組組裝數據檢測人類基因組結構變異(SVs)”的研究成果在國際著名學術雜志《自然·生物技術》上在線發表。 近年來，人類基因組
Frontiers－in－Genetics首個非性逆轉黃鱔高質量基因組參考圖譜
中國水產科學研究院長江水產研究所水產養殖與遺傳育種研究室科研人員在國際期刊《遺傳學前沿》（Frontiers in Genetics）發表題為《Chromosome-Scale, Haplotype-Resolved Genome Assembly of Non-Sex-Reversal Fem
水生所發布高質量AB品系斑馬魚參考基因組
斑馬魚是生命科學、健康科學和環境科學等研究領域的重要模式生物之一。常見的兩種實驗室斑馬魚品系分別是Tubingen品系和AB品系。其中，AB品系斑馬魚被國內外很多實驗室作為研究對象。然而，卻缺乏一個高質量的AB品系斑馬魚參考基因組。 由于不同品系斑馬魚來源不同，各品系之間存在著大量基因序列上的
新篇章：單細胞基因組從頭組裝
隨著單堿基精度和讀取長度的提高，利用批量樣本的單分子長讀測序技術已廣泛應用于基因組組裝。通常，長讀測序組裝需要大量的DNA(通常來自數百萬個細胞的幾微克)，因此大多數人類基因組組裝被限制在批量基因組測序數據集，而沒有保持單個細胞之間潛在的遺傳異質性。然而，這在許多情況下是不切實際的。相比之下，單細胞
漢字首登Nature－農科院等完成亞洲栽培稻基因組變異研究
水稻是全世界最重要的糧食作物之一，對水稻全球品種進行基因組研究，對于挖掘有利等位基因和指導基于全基因組信息的分子育種具有重大的理論和實踐意義，是關系著國家乃至全球糧食安全的重大戰略問題。 2011年9月，全球3000份水稻核心種質資源基因組項目（3K Rice Project）正式啟動，該項目
一篇就夠了，帶你了解高通量測序！
說到近十年來發展最迅猛的生物技術，首先想到了高通量測序,我們研究基因組學都離不開它。目前，高通量測序已經深入到生命科學的各個領域，不僅有力地推動了基礎研究的發展，也在逐漸征服臨床應用。所謂的高通量測序技術，又名大規模平行測序，是將 DNA（或者 cDNA）隨機片段化、加接頭，制備測序文庫，通過對文庫
轉錄、降解組技術對毛白楊次生維管系統再生microRNA的鑒定
木材的形成是一個復雜的發展過程，主要由轉錄網絡調控。microRNA (miRNA)通過mRNA降解和翻譯抑制，調節植物生長發育過程中靶基因的表達。 這項研究中，中國林業科學院盧孟柱課題組使用小RNA測序和降解組測序技術，研究不同剝皮時間后，毛白楊miRNAs參與SVS再生的表達情況。實驗中取
昆明動物所發布中國恒河猴基因組并解析猿類結構變異
恒河猴（Macaca mulatta）是生物科學研究和新藥研發廣泛應用的非人靈長類實驗動物。構建一個高質量的恒河猴基因組是開展相關研究的重要基礎。當前國際上廣泛使用的是印度恒河猴的參考基因組，但這個主要基于二代測序的恒河猴參考基因組組裝質量較差，序列碎片化和缺失嚴重，極大地限制了它的應用，特別是
鄭果所解析桃高質量基因組及果實香氣遺傳進化機制
桃汁多、味美，受到全世界廣大消費者的喜愛。然而，隨著長期以來育種家培育出大果、高糖和耐貯藏品種，消費者反映果實香氣變淡、桃沒桃味。利用基因組是研究果實重要農藝性狀的有力工具。7月26日，Plant Journal在線發表了中國農科院鄭州果樹所王力榮和曹珂研究員為通訊作者的題為“New high-
一文讀懂高通量測序技術與研究（套路和實例分析）
導語 高通量測序技術和普通基因測序最大的不同在于，高通量測序能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定，也就是基因測序里的“批處理”。 高通量測序經過近十年來的迅猛發展，已經深入到生命科學的各個領域，不僅有力地推動了基礎研究的發展，也在逐漸征服臨床應用。所謂的高通量測序技術，又名大規模平
Illumina測序技術，4000年前埃及人就吃西瓜了
時下正是吃西瓜的好時節。一項發表在美國《國家科學院院刊》的新研究改寫了栽培西瓜的起源。 作物的野生近親或祖先是育種和了解馴化歷史的重要資源。然而，由于滅絕、雜交以及將栽培種與野生種區分開來的挑戰，導致鑒定困難。 美國華盛頓大學的研究人員利用基于集合的系統學、圖像學，重新測序了溫室種植植物的代
研究揭示牦牛適應青藏高原極端環境新機制
牦牛是青藏高原的象征，是高海拔地區不可替代的畜種資源，具有重要的生態、經濟和文化價值。我國是世界上擁有牦牛種類和數量最多的國家，全世界約95%的家牦牛（Bos grunniens）和青藏高原特有的野牦牛（Bos mutus）分布在西藏、青海、新疆等省區的高寒牧區及無人區。經長期自然選擇，牦牛被毛
誰在先？“雞基因組”和“雞蛋基因組”
是先有雞還是先有雞蛋？這個問題相當惱人，恐怕很難說清楚。現在，研究人員回答了與這個問題一樣惱人的問題：是人類基因組中的成千上萬的長重復DNA片段中，那個是第一個產生的？那些被復制了？ 這個答案發表在10月7日的《自然·遺傳學》雜志上。該研究給出了人類基因組中DNA重復片段復制的第一個進化證據，這種
葉綠體基因組
葉綠體是地球上綠色植物把光能轉化為化學能的重要細胞器，葉綠體中進行的光合作用是嚴格地受到遺傳控制的。早在20世紀初，人們就已知葉綠體的某些性狀是呈非孟德爾式遺傳的，但直到60年代才發現了葉綠體DNA(chloroplast DNA，ctDNA)。葉綠體基因組是一個裸露的環狀雙鏈DNA分子，其大小在1
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃，那時用的方法叫做雙脫氧終止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中，DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸）來作為原料，但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的，但與普通PCR不同，它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的
全基因組的比較基因組雜交技術介紹
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a
GenomeResearch發表基因組研究新發現基因組
多倫多大學的科學家們發現，作為基因組看門人的C2H2-鋅指蛋白（C2H2-ZF）實際上肩負著更加多樣化的職責。這項發表在Genome Research雜志上的研究，有助于我們更準確地解讀個人基因組。C2H2-ZF有大約七百個成員，是規模最大的一種人類蛋白。然而，人們對這些蛋白一直知之甚少。C2H2-
關于右心室增大的心電圖表現介紹
(1) 右心室增大—反映右室除極的QRS波群電壓增高。①Rv1≥1.0毫伏或V1呈qR型；②RaVR>0.5毫伏；?Rv1+Svs≥1.2毫伏；④V1R/S>1；⑤V5R/S1。 (2) 右心室增大—V1的激動時間(VAT)>0.03秒。 (3) 右心室增大—ST-T改變反映右室面導聯出現S
中國新生兒基因組、胚胎基因組計劃啟動
為從根本上實現新生兒遺傳病的早發現、早診斷、早干預，7日，中國遺傳學會遺傳咨詢分會聯合復旦大學附屬兒科醫院在上海發起中國新生兒基因組計劃。 中國新生兒基因組計劃將在未來的5年內開展10萬例樣本的新生兒基因檢測，旨在構建中國新生兒基因組數據庫，建立新生兒遺傳病基因檢測標準，促進新生兒遺傳病基因檢
《基因組研究》：首張貓基因組草圖繪就
貓是研究人類失明和艾滋病模型之一，因此測序結果大有用處 一只名為“肉桂”（Cinnamon）的4歲雌性阿比西尼亞貓有幸成為第一只完成基因組測序草圖的貓。它也因此加入了包括狗、小鼠、大鼠以及黑猩猩等在內的基因組“俱樂部”。相關論文11月1日在線發表于《基因組研究》（Genome Research）雜
基因組構的定義
中文名稱基因組構英文名稱gene organization定 義(1)單個基因的組成結構。一般包含啟動子、增強子、非翻譯序列、編碼序列等。真核生物和原核生物的一個顯著區別是前者具有內含子。(2)廣義指一個完整的生物個體內基因的組織排列方式。原核和真核生物的一個顯著區別是原核生物的結構基因成串分布，
基因組文庫法
基因組文庫法一）基因組DNA分離、純化和加工[Mbo I酶檢測]1．準備1.5ml小試管4個；每管內含有：基因組DNA（在TE或水中）?????????????10.0μg10×Mbo I緩沖液?????????????????????????2.5μlH2O????????????????????
基因組印記
這是根據我寫的一個PPT摘錄的，希望能有朋友討論這方面的問題。并拓寬這個領域，討論epigenetics更廣泛的問題。畢竟epigenetics是現在動物功能基因組研究的主流和一個重要方向。1. 印跡基因的概念及重要意義概念:基因組印跡是特指來源于親本的等位基因進行不對稱后成修飾后而導致的單等位基因
基因組構的定義
中文名稱基因組構英文名稱gene organization定 ?義(1)單個基因的組成結構。一般包含啟動子、增強子、非翻譯序列、編碼序列等。真核生物和原核生物的一個顯著區別是前者具有內含子。(2)廣義指一個完整的生物個體內基因的組織排列方式。原核和真核生物的一個顯著區別是原核生物的結構基因成串分布,