CellRep：用CRISPR／Cas誘導基因組結構變異
2月10日，德國馬克斯普朗克分子遺傳學研究所的研究人員在《Cell Reports》發表一項最新研究成果，題為“Deletions, Inversions, Duplications: Engineering of Structural Variants using CRISPR/Cas in Mice”。在這項研究中，他們創新性地使用CRISPR/Cas技術，在小鼠中快速而有效地產生基因組結構變異（SVs）。 基因組結構變異（SVs）是基因組DNA中大范圍的結構差異，大小從幾個kb到整個染色體。SVs在很大程度上引起了我們的基因組變異，它們往往與疾病有關。當發生在基因的編碼序列中時，它們可能會影響蛋白質序列，從而影響蛋白質功能和穩定性。當包含一個或幾個編碼單元時，缺失或重復可導致基因拷貝數的變化。此外，有研究表明，SVs可能通過破壞適當增強子-啟動子相互所有所必需的基因組結構，而干擾基因調控。這種重排可能導致WT相互作用......閱讀全文
植物誘導染色體結構變異
實驗概要了解染色體結構發生變異后，在有絲分裂的細胞中，可以觀察到在后期出現染色體橋或染色體斷片，在間期的細胞可以觀察到微核。實驗原理染色體結構變異主要有缺失、重復、倒位、易位四種。其發生過程是由于同源染色體或非同源染色體之間發生斷裂，然后發生錯誤重接的結果。各種結構變異的雜合體，在細胞分裂過程中常常
染色體水平冬瓜參考基因組發布
近日，廣東省農業科學院蔬菜研究所發布了染色體水平冬瓜參考基因組。相關研究發表于Scientific Data，廣東省農業科學院蔬菜研究所副研究員羅文龍和副研究員閆晉強為該論文共同第一作者，廣東省農業科學院蔬菜研究所研究員江彪為通訊作者。廣東省農業科學院蔬菜研究所于2019年對黑皮大冬瓜B227進行基
Cell－Rep：用CRISPR/Cas誘導基因組結構變異
2月10日，德國馬克斯普朗克分子遺傳學研究所的研究人員在《Cell Reports》發表一項最新研究成果，題為“Deletions, Inversions, Duplications: Engineering of Structural Variants using CRISPR/Cas in
研究發布碧鳳蝶染色體水平基因組
蝴蝶因其豐富的形態多樣性，自達爾文時代就作為研究物種適應性進化的重要類群之一，近幾年更被認為是研究形態遺傳、進化和發育的理想模型，已成為發育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態學等研究領域的重要模式生物之一。鳳蝶科是具有重要進化地位的蝴蝶支系，其豐富的色彩和形態等多樣性是昆蟲生態與進
染色體級別的銀杏參考基因組公開
銀杏果實 曹福亮供圖 作為裸子植物銀杏綱唯一的孑遺物種，銀杏不僅具有特殊的科學研究價值，而且具有重要的應用價值。 近日，南京林業大學聯合中國農業科學院農業基因組研究所在《自然—植物》在線發表了染色體級別的銀杏參考基因組，是目前已發表的組裝質量最高的裸子植物參考基因組。 論文共同通訊作者、中國工
“蠶姑娘”性染色體基因組密碼破解
7月8日，記者從西南大學獲悉，該校教授代方銀團隊首次獲得了家蠶W染色體完整基因組序列，并揭示了鱗翅目昆蟲W染色體起源與進化新機制。相關研究成果近日發表于期刊《科學進展》。家蠶性別的決定機制一直受到科學界關注。以家蠶為代表的鱗翅目昆蟲性染色體在昆蟲界獨樹一幟。不同于大多數昆蟲性染色體組為XX/XY系統
上海師大團隊破解染色體級別基因組密碼
中新網上海12月16日電 (記者 許婧)上海師范大學16日發布消息稱，該校王全華研究團隊在菠菜基因組研究領域又取得一項重大標志性研究成果。團隊聯合康奈爾大學Boyce Thompson研究所(BTI)費章君教授課題組等多家科研機構完成了新一代菠菜基因組精細圖譜繪制、重要農藝性狀遺傳基礎和菠菜馴化
龍井茶樹染色體級別基因組組裝成功
? ?龍井43 ?? 中國農科院供圖 近日，《自然—通訊》在線發表了我國科學家在茶樹全基因組組裝和茶樹起源演化研究上取得的重要突破。該項研究由中國農業科學院茶葉研究所（以下簡稱茶葉所）和中國農業科學院深圳農業基因組研究所（以下簡稱基因組所）主導并攜手中國科學院昆明動物研究所（以下簡稱昆
染色體級別的鐵線蕨基因組首次繪制
日前，中國農業科學院深圳農業基因組研究所聯合國內外8家科研院所首次繪制了染色體級別的鐵線蕨基因組，揭示了蕨類植物孢子發育、真葉植物起源和種子演化、茉莉素信號通路進化等分子機制。相關研究成果發表在《自然—植物（Nature Plants）》。 真蕨植物以孢子體和配子體均具有光合自養能力為主要特
昆明動物所發布碧鳳蝶染色體水平基因組
蝴蝶因其豐富的形態多樣性，自達爾文時代就作為研究物種適應性進化的重要類群之一，近幾年更被認為是研究形態遺傳、進化和發育的理想模型，已成為發育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態學等研究領域的重要模式生物之一。鳳蝶科是具有重要進化地位的蝴蝶支系，其豐富的色彩和形態等多樣性是昆蟲生態與進
染色體級別橡膠基因組研究揭秘乳膠生物合成
橡膠樹是大戟科植物。在植物界大約2500種產膠植物中，橡膠樹產生的以聚異戊二烯為主要功能成分的天然膠乳約占全球天然橡膠的98% 以上。圖片來源于網絡 比起可能造成巨大環境污染的人工合成橡膠產業，天然橡膠因其良好的彈性、伸展性、耐老化等綜合理化性能而具有不可替代性，是任何國家必須具備的重要戰略
用比較基因組雜交描述染色體結構異常實驗
實驗方法原理比較基因組雜交（CGH)是一種能夠在一步全基因組篩查程序，描述G帶不能發現的細胞遺傳物質增加或減少的分子細胞遺傳學技術。CGH優于進行全染色體涂染（wcp)的常規熒光原位雜交（FISH)和多色FISH之處，是它不僅能夠識別增加的未知片段的染色體來源，而且還可將該片段定位于特定的染色體區帶
微陣列—比較基因組雜交技術檢測染色體異常
【摘要】近年微陣列一比較基因組雜交(microarraycomparativegenomichybirdization，microarray．CGH)技術被應用到臨床細胞遺傳學領域。該技術是選擇DNA特殊片段作為靶，固化在載體上，形成密集、有序的分子微陣列。然后，從測試標本中提取DNA，將測試DNA
用比較基因組雜交描述染色體結構異常實驗（三）
六、中期染色體標本的變性1.在染色缸中加入大約50mL變性液，將染色缸放于75?76℃水浴中。預熱變性液使其溫度達到（73±2)℃。2.從-20℃冰箱中取出實驗所需的標本，室溫下系列乙醇脫水，各2min。3.室溫干燥片子（5min)，或在實驗室抽風櫥中微風吹過標本使標本干燥。4.在37?40℃電熱板
用比較基因組雜交描述染色體結構異常實驗（一）
實驗方法原理 比較基因組雜交（CGH)是一種能夠在一步全基因組篩查程序，描述G帶不能發現的細胞遺傳物質增加或減少的分子細胞遺傳學技術。CGH優于進行全染色體涂染（wcp)的常規熒光原位雜交（FISH)和多色FISH之處，是它不僅能夠識別增加的未知片段的染色體來源，而且還可將該片段定位于特定的染色體區
研究從基因組水平揭示食肉目染色體進化規律
染色體進化是物種形成和演化的重要驅動因素。具有顯著核型差異的食肉目動物為染色體進化研究提供了很好的研究素材。雖然前人通過比較染色體涂色法建立了食肉目內許多物種的染色體比較圖譜，但這些研究的分辨率比較低，尚沒有深入到精細的核苷酸水平，也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物種間的共線性區塊、染色體重排以
象腿蕉染色體級別基因組組裝研究獲進展
象腿蕉（Ensete glaucum）是芭蕉科中耐寒的蕉類植物，原產于中國云南和東南亞地區，具有觀賞、飼用和藥用價值。中國科學院華南植物園教授John Seymour Heslop Harrison帶領的研究團隊，采用單分子納米孔、Illumina測序策略，結合染色體構像捕獲技術，發表了首個象腿蕉染
“六谷”豐登？——首個染色體水平基因組組裝完成
中國菰? ? 中國農科院供圖? ? ? ??中國菰 （Zizania latifolia） 原產于中國，屬于禾本科稻族菰屬，主要分布于中國、韓國、日本和印度等國家。中國菰的穎果為菰米，在我國古代是重要的“六谷”之一。? ? 近日，中國農業科學院煙草研究所煙草功能成分與綜合利用創新團隊與中國水稻研
象腿蕉染色體級別基因組組裝研究獲進展
中國科學院華南植物園海外知名學者John Seymour Heslop Harrison教授領導的研究團隊，在象腿蕉染色體級別基因組組裝研究方面取得新進展。相關研究發表于Gigascience。王梓維為該文第一作者，John Seymour Heslop Harrison和劉青副研究員為通訊作者，華
鴨嘴獸基因組圖譜揭秘獨特的性染色體
鴨嘴獸可能是世界上長得最奇怪的動物。據說，當歐洲學者第一次見到這種鴨子嘴、海貍尾、水獺足的動物時，他們認為這是一場精心設計的騙局。它看上去既像爬行動物又像哺乳動物，還像鳥類。實際上，它屬于稀有的單孔類動物。 鴨嘴獸不僅有一些奇特的身體特征，其新的基因組版本也強調了它一些不尋常的遺傳特性。在上周
用比較基因組雜交描述染色體結構異常實驗（二）
二、正常男性中期染色體標本的制備1.準備一個封閉環境，其相對濕度約55%(可在50%?60%變化），溫度24?26.5℃。2.將巴斯德吸管置于玻璃載片上方2?4in處，讓一滴細胞懸液滴在玻片的左側。然后迅速將第二滴細胞懸液滴在玻片右側（見注釋7)3.在固定液全部蒸發前，將玻片浸入盛有新鮮固定液的染色
Cell子刊:－人類誘導多能干細胞內在基因組特性
人誘導多能干細胞(Human induced pluripotent stem cells, hipsCs)因其表觀異質性而表現出不同的分化潛能，除了印跡和X染色體等研究充分的成分/染色體外，其分化程度/屬性尚不清楚。在這里，作者展示了7個不同種系潛力的hipsC株系表現出明顯的表觀基因組異質性
類轉錄化學藥物誘導型基因組編輯和轉錄激活系統
生物學變化多受到高度動態的分子事件調控，為了更精確的理解并研究這些過程，應用條件性可誘導的技術手段是十分必要的。此前，得到廣泛應用的藥物誘導技術之一是通過配體結合激發雌激素受體蛋白（ER）從細胞質到細胞核的轉運。在沒有激素配體的情況下，ER與熱激蛋白（hsp90）結合定位于細胞質中；一旦與配體結
破解染色體級別基因組密碼解析栽培菠菜的“前世今生”
上海師范大學16日發布消息稱，該校王全華研究團隊在菠菜基因組研究領域又取得一項重大標志性研究成果。團隊聯合康奈爾大學Boyce Thompson研究所(BTI)費章君教授課題組等多家科研機構完成了新一代菠菜基因組精細圖譜繪制、重要農藝性狀遺傳基礎和菠菜馴化歷史的解析。 該研究成果以“基因組解析
北京基因組所等揭示Y染色體表觀信息遺傳機制
表觀遺傳學是與傳統遺傳學相對應的概念。遺傳學以基于DNA序列的中心法則來傳遞遺傳信息，在人群中，遺傳信息在世代之間穩定遺傳，那么表觀遺傳信息是否像遺傳信息一樣可被子代繼承，尚缺少相關有力證據。DNA甲基化是非常重要的表觀遺傳信息，是表觀遺傳學研究的重要內容。目前，鮮少有DNA甲基化在人群中的繼承
首個豆科綠肥作物染色體水平基因組組裝完成
?紫云英? ? ? ?中國農科院供圖近日，中國農業科學院農業資源與農業區劃研究所肥料及施肥技術團隊完成了首個豆科綠肥作物——紫云英的染色體水平參考基因組組裝，并利用比較基因組學解析了紫云英共生結瘤的遺傳基礎。該研究填補了豆科綠肥作物基因組學研究的空白，為豆科植物與根瘤菌共生提供了新的見解。相關研究成
人類種了6000年的作物有了染色體級別基因組
大麻又名火麻、漢麻、線麻等，籽用大麻在食品、醫藥、紡織、造紙等多個領域被廣泛使用，是一種重要的工業原料。 9月15日，福建農林大學麻類研究室聯合該校基因組與生物技術中心在《植物通訊》（Plant Communications）上發表了首個染色體級別的籽用大麻參考基因組圖譜。他們在此基礎上解析了
小葉茶染色體級別基因組圖譜聯合研究成果首次完成
近日，生物學預印本服務器（www.biorxiv.org）在線發表了中美科學家聯合研究團隊的最新成果，該團隊采用單分子實時測序（SMRT）和 Hi-C技術，在20多個代表性小葉茶品種中選用雜合度較低的小葉茶良種“碧云”，將組裝獲得的約2.85Gb 的基因組序列掛載到了15 條假染色體上，在國際上
利用單拷貝基因組探針及染色體彩繪方法進行熒光原位...
利用單拷貝基因組探針及染色體彩繪方法進行熒光原位雜交（FISH）實驗材料?SSCD-PBSA糖原RNase多聚甲醛甲酰胺試劑、試劑盒?固定液乙醇雜交緩沖液標記探針橡膠乳黏劑封固劑實驗步驟 含有重復序列探針的沉淀：大分子量黏粒探針往往含有重復序列，如果在雜交前不能封閉這些序列，將導致嚴重的非特異性雜交
微陣列中期分裂相染色體的比較基因組雜交（CGH）－實驗
染色體 CGH 的獨特優點在于它的全基因篩查功能，與檢測單一靶 DNA 劑量改變的低通量方法，如 Southern 分析、PCR 和熒光原位雜交（FISH) 相比，速度顯著提高且省力。目前染色體 CGH 是一種比較完善的分子細胞遺傳學方法，但是它的兩個缺陷限制其作為一種綜合性篩查工具的應用。來源：《