發現未知！水稻基因變異的秘密被揭曉！
5月28日，全球頂尖學術期刊Cell在線發布了我校國家重點實驗室、水稻研究所李仕貴與欽鵬教授團隊聯合中科院遺傳與發育生物學研究所梁承志研究員團隊完成的題為“Pan-genome analysis of 33 genetically diverse rice accessions reveals hidden genomic variations”（基于33個水稻遺傳多樣性材料的泛基因組分析揭示“隱藏”的基因組變異）的研究論文。這是四川農業大學繼陳學偉教授團隊之后，再次在Cell上發表論文，也是我校第3篇CNS（Cell Nature Science）頂級學術期刊論文。 我校李仕貴教授為論文通訊作者，中科院遺傳與發育生物學研究所梁承志研究員和我校欽鵬教授為論文共同通訊作者。欽鵬教授、博士研究生王淏、陳薇蘭博士、中科院遺傳所魯宏偉博士、陳倬博士以及河北大學杜會龍教授為論文第一作者。該研究得到了國家重點研發計劃、自然科學基金重大......閱讀全文
超級泛基因組助水稻種質資源遺傳變異挖掘利用
?水稻泛NLRs家族基因的共線性位點（左）；基于全基因組SNPs的水稻系統發生樹（右）。中國農科院供圖 近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所與國內多家高校、科研單位合作，組裝了251份高質量的水稻基因組，構建了目前植物中群體規模最大、基因組充分注釋、稻屬中最為系統的超級泛基因組。該圖譜
科學家揭示水稻“編碼基因集”－有助提升產量
北京時間1月16日，《自然-遺傳學》雜志在線發表了中國科學家題為“泛基因組分析揭示栽培稻和野生稻中基因組變異”的研究論文，該研究首次繪制了栽培稻-野生稻的泛基因組圖譜，有助于育種家充分利用各類群水稻豐富的遺傳變異，進一步提升中國水稻的產量潛力等。 這項研究由中科院分子植物科學卓越創新中心/植物
煙草和水稻cpDNA基因組成及特點
煙草和水稻（Oryza sativa）葉綠體全序列分析表明cpDNA基因組成有以下特點：1.基因組由兩個反向重復序列（IR）和一個短單拷貝序列（short single copy sequence, SSC）及一個長單拷貝序列（long single copy sequence, LSC）組成；2.
煙草和水稻葉綠體cpDNA基因組成特點
1.基因組由兩個反向重復序列（IR）和一個短單拷貝序列（short single copy sequence, SSC）及一個長單拷貝序列（long single copy sequence, LSC）組成；2.IRA和IRB長各10-24Kb，編碼相同，方向相反。3.cpDNA啟動子和原核生物的相
中科院，上海師范大學Nature－Genetics發文：
來自中科院植物生理生態研究所，上海師范大學生命與環境科學學院等處的研究人員發表了題為“Pan-genome analysis highlights the extent of genomic variation in cultivated and wild rice”的文章，通過泛基因組分析揭示
新研究構建出小麥屬全基因組遺傳變異圖譜
小麥是人類歷史上最成功的作物之一，它起源于新月沃地一個狹小的核心區域，一萬年間，從地區性的野生植物迅速轉變成為全球種植面積最廣的作物之一，在多種多樣的環境下為人類提供大量的碳水化合物和蛋白質。然而，小麥對自然環境和人類糧食需求兩方面同時適應的遺傳機制尚不清楚，理解小麥適應性進化對氣候變化條件下小
基因組研究讓水稻育種走向精準設計
由中國主導的國際間科研大協作項目“3000份水稻基因組研究”26日結出碩果——北京時間當日凌晨1時，國際頂級學術期刊《自然》正式發表《3010份亞洲栽培稻基因組研究》。該研究針對水稻起源、分類和馴化規律進行了深入探討，揭示了亞洲栽培稻的起源和群體基因組變異結構，剖析了水稻核心種質資源的基因組遺傳
水稻LEA基因組規模的鑒定與分析
實驗概要本實驗鑒定了OsLEA基因，將基因定位到水稻染色上，進行了序列對比和基因轉變分析，LEA基因的表達分析及啟動子基序分析。實驗材料基因組及蛋白質序列的來源：分別從TIGR (http://www.tigr.org)和BGI (http://rise.genomics.org.cn/rice
無缺口組裝！水稻完整參考基因組發布
近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所聯合海南崖州灣實驗室、中國水稻研究所、中國農科院作物科學研究所和揚州大學等多個單位發布完整的水稻參考基因組，實現了全基因組所有染色體端粒到端粒無缺口組裝，為水稻育種研究提供了新的有力工具和重要大數據基礎。相關研究成果發表在《分子植物》（Molecular
水稻RGA基因組規模的鑒定與分析
實驗概要本實驗對粳稻蛋白質數據庫進行BLASTP，獲得所有粳稻的RGA序列，對RGA進行分類，分別統計了各類RGA在不同染色體上的分布情況，對兩個亞種間RGA多態性進行了鑒定和開發。實驗步驟1. 水稻RGA的搜索搜集已報道的45個R基因，然后用它們對粳稻蛋白質數據庫進行BLASTP (參數取E
研究揭示水稻基因組－“垃圾－DNA”－的真相
對于動植物的 DNA 來說，僅有不到 5% 能夠翻譯成蛋白質，進行生命活動。而大部分 DNA 轉錄成 RNA 之后，便不再繼續翻譯，這些非編碼 RNA 一度被認為是轉錄中的 “噪音”“暗物質”， 甚至有人認為這是 “垃圾 DNA”。 近十年來，隨著探索未知的技術的進步，這些所謂 “垃圾 DNA
研究揭示水稻基因組“垃圾DNA”的真相
對于動植物的DNA來說，僅有不到5%能夠翻譯成蛋白質，進行生命活動。而大部分DNA轉錄成RNA之后，便不再繼續翻譯，這些非編碼RNA一度被認為是轉錄中的“噪音”“暗物質”， 甚至有人認為這是“垃圾DNA”。 近十年來，隨著探索未知的技術的進步，這些所謂“垃圾DNA”的重要性才開始為人們所了解。
我國科研團隊發布水稻完整參考基因組
水稻是重要的糧食作物，其基因組組裝對水稻育種意義重大。23日，記者從中國農業科學院深圳農業基因組研究所獲悉，該所聯合崖州灣實驗室、中國水稻研究所、中國農科院作物科學研究所和揚州大學等多個單位發布完整的水稻參考基因組，實現了全基因組所有染色體端粒到端粒無缺口組裝，為水稻育種研究提供了新的有力工具和重要
發現未知！水稻基因變異的秘密被揭曉！
5月28日，全球頂尖學術期刊Cell在線發布了我校國家重點實驗室、水稻研究所李仕貴與欽鵬教授團隊聯合中科院遺傳與發育生物學研究所梁承志研究員團隊完成的題為“Pan-genome analysis of 33 genetically diverse rice accessions reveals
水稻基因組編輯工具盒再添新成員
近日，中國農業科學院植物保護研究所周煥斌課題組、周雪平課題組和四川大學生命科學學院林宏輝課題組合作開發了一系列基于Cas9-NG的各種水稻基因組定點編輯工具，并成功用于水稻單基因敲除、多基因敲除、單堿基編輯（堿基對G·C和A·T的互換）以及靶基因轉錄激活調控。相關研究成果在線發表于《分子植物》（
構建水稻基因組倒位變異圖譜
近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所聯合國內多家單位發布了迄今為止最大的水稻群體水平倒位變異圖譜，并挖掘獲得了新的水稻耐熱優異等位基因，該研究對水稻育種改良具有重要意義。相關研究成果發表在《科學通報（Science Bulletin）》上。 水稻中的基因組倒位變異是指染色體上的DNA序列發
水稻基因組編輯工具盒再添新成員
據中國農科院最新消息，該院植物保護研究所周煥斌課題組、周雪平課題組和四川大學生命科學學院林宏輝課題組合作開發了一系列基于Cas9-NG的各種水稻基因組定點編輯工具，并成功用于水稻單基因敲除、多基因敲除、單堿基編輯（堿基對G·C和A·T的互換）以及靶基因轉錄激活調控。該成果對于水稻基因功能解析和
我國完成桑蠶大規模基因組重測序和遺傳變異圖譜構建
北京時間8月28日凌晨2時，由深圳華大基因研究院與西南大學合作的研究成果“40個基因組的重測序揭示了蠶的馴化事件及馴化相關基因”在國際權威學術刊物《科學》上發表，這是科學家繼2003年在家蠶基因組研究領域取得進展后的又一重要成果。 據悉，科學家共獲得了40個家蠶突變品系和中國野桑蠶的全基因
植物中首個多物種參考面板的綜合數據庫構建成功
11月2日，華中農業大學信息學院生物信息團隊在《核酸研究》發表研究成果，通過收集包括水稻，玉米、小麥、油菜和棉花等12個重要農作物的遺傳變異信息，構建了植物中首個多物種的高質量遺傳參考變異庫，為植物遺傳育種研究提供了寶貴資源。 基因型填充是根據參考面板（又譯參考集）中的單體型和基因型對目標樣
Lancet子刊最新全基因組分析－額顳葉變性與遺傳變異有關
FTLD患者皆存在TAR-DNA結合蛋白43（TDP-43，一種調節轉錄的核蛋白）的異常磷酸化，GRN基因突變是FTLD的常見遺傳因素，但不同患者發病年齡和臨床表現存在差異，因此，近日有研究人員通過全基因組關聯分析對FTLD患者GRN突變外的的遺傳因子進行了考察。 研究人員發現TMEM106B
水稻泛基因組研究方面取得突破性進展
近日，廣東省農業科學院水稻研究所分子育種團隊在水稻泛基因組研究方面取得突破性進展。相關研究發表于基因組學研究知名雜志Genome Biology。該論文第一單位為廣東省農業科學院水稻研究所，王健博士為第一作者，楊武副研究員為共同第一作者，胡海飛博士和趙均良副研究員為通訊作者，澳大利亞莫道克大學教
玉米和水稻基因組引導編輯效率提高3倍
科技日報北京12月29日電 （記者馬愛平）近日，北京市農林科學院玉米DNA指紋及分子育種北京市重點實驗室基因組編輯團隊與北京大學等單位合作，發現了新策略協同效應，在植物引導編輯技術研發方面取得了新突破，實現了玉米和水稻引導編輯效率平均可提高3倍以上，在多個低效靶點上甚至可提高10倍以上，并在人細胞中
中國誕生全球首張水稻全基因組育種芯片
中國中化集團公司下屬中國種子集團有限公司聯合華中農業大學、北京大學近日共同研制出全球首張水稻全基因組育種芯片，將大幅提高種子真實性檢測準確性，有助提高育種效率，杜絕假種子危害。 中種公司生命科技中心喻輝輝博士表示，目前業內判斷水稻種子真實性通常采用國標推薦的24個SSR標記檢測結果，
張啟發院士Nature子刊發表水稻基因組成果
9月13日，在Nature旗下的開放獲取雜志《Scientific Data》發表的一項研究中，來自華中農業大學和美國亞利桑那州大學的研究人員，用PacBio的long read測序數據和Illumina雙末端測序數據，構建了兩個秈稻參考基因組。 我國著名的植物遺傳和分子生物學家，華中農業大學
吃了一輩子的水稻，為何如此多樣？
近日，中國農業科學院作物科學研究所水稻優異種質資源發掘與創新利用創新團隊、作物基因組選擇育種創新團隊和華盛頓圣路易斯大學的肯·奧爾森團隊合作完成了水稻（亞洲栽培稻）及其祖先種（普通野生稻）非編碼區長鏈非編碼RNA（lncRNA）的注釋，研究了水稻lncRNA的進化歷史，并從全基因組水平揭示了ln
Science－Advance|?農科院揭示lncRNAs調控水稻農藝性狀變異機制
2019年12月18日，Science Advances雜志在線發表了來自中國農業科學院作物科學研究所楊慶文團隊、劉君團隊和華盛頓圣路易斯大學的Ken Olsen團隊完成了水稻（亞洲栽培稻）及其祖先種（普通野生稻）非編碼區lncRNA的注釋，結合多重組學方法研究了水稻lncRNA的進化歷史，從全
植生生態所等在水稻馴化起源研究中取得新突破
?????? 最近，中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所國家基因研究中心韓斌課題組與中國水稻研究所及日本國立遺傳所等單位合作，于10月4日在《自然》雜志在線發表了題為“水稻全基因組遺傳變異圖譜的構建及馴化起源”的論文。 水稻、小麥等農作物的馴化、栽培對人類文明的進程產生過重大的影響，
遺傳變異的醫學應用
變異是生物的一般特性。甚至在人類尚未發現病毒以前，就已開始運用變異現象 制造疫苗。例如1884年，巴斯德利用兔腦內連續傳代的方法，將狂犬病的街毒(強毒) 轉變為固定毒。這種固定毒保留了原有的免疫原性，但毒力發生了變異——非腦內接 種時，對人和犬等的毒力明顯降低，因而成功地用作狂犬病的預防制劑。此后，
遺傳變異的分子基礎
遺傳從現象來看是親子代之間的相似的現象，即俗語所說的“種瓜得瓜，種豆得豆”。它的實質是生物按照親代的發育途徑和方式，從環境中獲取物質，產生和親代相似的復本。遺傳是相對穩定的，生物不輕易改變從親代繼承的發育途徑和方式。因此，親代的外貌、以及優良性狀很有可能在子代重現，甚至酷似親代。而親代的缺陷和遺傳病
水稻功能基因組研究：我國要繼續保持領先優勢
以“水稻功能基因組研究的現狀和未來”為主題的第520次香山科學會議學術討論會近日在北京召開。與會專家就水稻基因組測序及注釋、水稻重要性狀的調控網絡、水稻多組學（表觀組、蛋白組、代謝組、表型組等）研究，以及水稻基因組解析等方面展開了深入的討論。 此次會議由中國科學院院士、華中農業大學教授張啟發