研究揭示水稻基因組“垃圾DNA”的真相
對于動植物的 DNA 來說,僅有不到 5% 能夠翻譯成蛋白質,進行生命活動。而大部分 DNA 轉錄成 RNA 之后,便不再繼續翻譯,這些非編碼 RNA 一度被認為是轉錄中的 “噪音”“暗物質”, 甚至有人認為這是 “垃圾 DNA”。 近十年來,隨著探索未知的技術的進步,這些所謂 “垃圾 DNA” 的重要性才開始為人們所了解。 近日,來自中國農業科學院作物科學研究所(以下簡稱農科院作科所),水稻優異種質資源發掘與創新利用團隊等研究人員利用全基因組分析的手段,對水稻及其近緣野生種基因組中的 “垃圾 DNA” 進行注釋。結果發現,有些被稱做 “垃圾 DNA” 的變異與水稻淀粉含量、籽粒大小等重要農藝性狀的多樣性相關。其研究結果發表在《科學進展》上。 “垃圾 DNA” 絕非垃圾 分子生物學的中心法則描述了遺傳信息的傳遞方向,即 DNA 轉錄產生 mRNA,mRNA 利用所攜帶的遺傳信息指導蛋白質的合成。中心法則認為,蛋白質是......閱讀全文
研究揭示水稻基因組-“垃圾-DNA”-的真相
對于動植物的 DNA 來說,僅有不到 5% 能夠翻譯成蛋白質,進行生命活動。而大部分 DNA 轉錄成 RNA 之后,便不再繼續翻譯,這些非編碼 RNA 一度被認為是轉錄中的 “噪音”“暗物質”, 甚至有人認為這是 “垃圾 DNA”。 近十年來,隨著探索未知的技術的進步,這些所謂 “垃圾 DNA
研究揭示水稻基因組“垃圾DNA”的真相
對于動植物的DNA來說,僅有不到5%能夠翻譯成蛋白質,進行生命活動。而大部分DNA轉錄成RNA之后,便不再繼續翻譯,這些非編碼RNA一度被認為是轉錄中的“噪音”“暗物質”, 甚至有人認為這是“垃圾DNA”。 近十年來,隨著探索未知的技術的進步,這些所謂“垃圾DNA”的重要性才開始為人們所了解。
種子DNA提取儀研究水稻
?? 過去,生物技術還不成熟,比如要想提取種子的DNA就比較難,得到的DNA不純,含雜質較多。而現在隨著種子DNA提取儀的應用就能很快完成實驗。該儀器又叫中通量組織研磨儀,是實驗室中常用的樣品制備工具,通過它研磨得到的樣品就能提取較高純度的DNA。在很多種子檢驗中都會用到它。?? 隨著水稻研究的深入
“垃圾DNA”不“垃圾”
就像從電影中刪掉的片段一樣,生物基因中的一些序列最終也會被剪掉,細胞不會利用它們制造蛋白質。現在,兩項研究發現,這些被稱為內含子的片段有助于酵母在艱難時期存活。這項研究揭示了DNA的另一種可能的功能,科學家曾認為這種功能是無用的。 未參與該研究的美國加州舊金山州立大學進化分子生物學家Scot
Cell:新方法加速揭示致病“垃圾”DNA
由來自德國、美國和挪威等國家的科學家們組成的一個國際研究小組,在1月16日的《細胞》(Cell)雜志上發表論文描述了他們開展的一項新研究,該研究的目的在于更好地了解遺傳變異使得某些個體易患諸如2型糖尿病等疾病的機制。結合他們的計算方法和實驗,新研究解析并驗證了2型糖尿病的潛在遺傳病因。大體上,這
不是“餓瘦的”,研究揭示癌癥暴瘦不可逆真相
你知道什么是惡病質嗎? “肉體被消耗并成為水,腹部充滿水,腳和腿腫脹,肩、胸和大腿的肌肉逐漸消融……這種疾病是致命的。” 兩千多年前,醫學之父希波克拉底曾這樣寫道,被認為是人們對惡病質的首次描述。 事實上,惡病質是一種由癌癥等嚴重疾病所引起的全身代謝性疾病,嚴重影響患者的生活質量和生存率。
諾貝爾獎得主Cell揭示重要的“垃圾”DNA
來自斯坦福大學、猶他大學和清華大學等處的研究人員,發現了一類豐富的非編碼DNA可以防止線蟲生殖細胞中隨機的基因沉默。他們的研究論文發布在6月30日的《細胞》(Cell)雜志上。 美國著名遺傳學和分子生物學家、2006年諾貝爾生理學或醫學獎得主、斯坦福大學的Andrew Z Fire教授,以及猶
冷泉港科學家揭示促癌“垃圾DNA”
來自冷泉港實驗室(CSHL)的一個研究人員小組,確定了在急性髓細胞性白血病(AML)中,一種白血病特異性的增強子元件促進了癌性血細胞增殖。AML是一種毀滅性的癌癥,70%的患者無法醫治。此外,研究人員還提供了已進入人類臨床試驗的、一類有前景的新藥有效阻止癌細胞生長機制的認識。 在發表于《G
農科院研究揭示水稻全基因組功能單倍型自然變異特征
近日,中國農業科學院作物科學研究所(以下簡稱作科所)水稻分子設計技術與應用創新團隊構建了一個全基因組基因功能單倍型(gcHap)數據集,全面揭示了亞洲栽培稻基因功能單倍型自然變異特征,提出亞洲栽培稻多起源(馴化)假說,并開發了適用于功能單倍型數據全基因組關聯分析和全基因組預測的軟件包“HAPS”
研究揭示水稻中汞、硒的暴露途徑
汞污染區稻米富含甲基汞是一個普遍現象,稻米甲基汞污染對人體健康的影響不容忽視。汞的毒性與其化學結構(分子結構)密切相關,如:二甲基汞衍生物是劇毒物質,硒化汞可在生物體內富集但毒性較小,氯化甲基汞的毒性是半胱氨酸甲基汞的10倍以上。由于甲基汞與巰基(-SH)間具有極強的親和力,因此,游離的甲基汞(
利用CRISPR篩查人類基因組“垃圾”DNA
在幾個研究小組正致力將CRISPR/Cas9系統應用于臨床的同時,另一些研究團隊則在利用這一工具來解決有關生物學的基礎問題。近期,荷蘭癌癥研究所遺傳學教授Reuven Agami與和同事們應用CRISPR搜尋了整個基因組中的調控增強子元件。 他們將Cas9核酸酶靶向了從前鑒別出的兩個轉錄因子p
研究者首次發現“馴化”的水稻“外來DNA”
轉座子是一種可以改變自身基因組位置的DNA序列,其通過轉座事件改變細胞遺傳特性和基因組大小。轉座子通常被認為是外來DNA,“寄生”于宿主基因組中,但它們也可以在基因組中被“馴化”,并進化出有益于宿主的新功能。迄今為止,大多數馴化轉座子都在哺乳動物中發現,只有少數轉座子馴化在植物中被報道。在農作物
基因組研究讓水稻育種走向精準設計
由中國主導的國際間科研大協作項目“3000份水稻基因組研究”26日結出碩果——北京時間當日凌晨1時,國際頂級學術期刊《自然》正式發表《3010份亞洲栽培稻基因組研究》。該研究針對水稻起源、分類和馴化規律進行了深入探討,揭示了亞洲栽培稻的起源和群體基因組變異結構,剖析了水稻核心種質資源的基因組遺傳
“垃圾DNA”或是編碼DNA的“保鏢”
"垃圾DNA"的概念源自上世紀70年代,用來形容基因組中不是編碼蛋白質的DNA序列,在學術上被稱為非編碼DNA序列。 非編碼DNA"開關說"究竟是個啥? 科學家們發現,人類基因組中包含多達400萬個基因開關和功能調節因子,它們的載體便是"垃圾DNA"。這強烈地沖擊了"DNA序列=生物性
“垃圾DNA”或是編碼DNA的“衛士”
“垃圾DNA”的概念是在上世紀70年代提出來的,用來形容那些基因組中不是編碼蛋白質的DNA序列,而在學術上被稱為非編碼DNA序列。 由于當時的科學家普遍認為有生物學意義的蛋白質才是決定生物性狀的關鍵,而且也沒有一種好的理論和技術手段來解釋這些“垃圾”存在的原因,于是“垃圾DNA”這一觀念便形
研究揭示赤霉素對水稻籽粒脫落的影響
近日,中國農業科學院深圳農業基因組研究所超級稻種質創新團隊初步解析了赤霉素影響水稻落粒性的分子機制,相關研究成果發表在《植物細胞(The Plant Cell)》上。 赤霉素被廣泛認為是引起“綠色革命”的激素,在水稻的生長發育中發揮了重要的作用,但對赤霉素是否參與調節種子落粒性的研究尚未有相關
研究揭示水稻開花分子調控新機制
近日,南京農業大學教授、中國工程院院士萬建民團隊與北京大學教授賈桂芳團隊合作,在《分子植物》(Molecular Plant)發表了研究論文。該論文揭示了RNA結合蛋白通過m6A途徑介導的相分離過程調控水稻抽穗期的機制。南京農業大學供圖水稻抽穗期是決定品種地區和季節適應性的關鍵性狀,影響水稻的產量和
新研究揭示乙肝病毒DNA與人基因組互作景觀圖
乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是全球性重大公共衛生健康問題之一,目前,全球乙肝病毒慢性感染者人數較多。HBV屬嗜肝DNA病毒科,在人體肝臟細胞核內可形成cccDNA、整合入人體基因組等病毒DNA形式穩定存在,這是HBV維持長期慢性感染的關鍵。因此,研究乙肝病毒與宿
75%DNA是垃圾
你距離“上帝的完美作品”還很遠。近日,一項新研究顯示,人體內75%的DNA是“垃圾”。 數十年來,生物學家一直認為人類大多數基因都有某些作用。但該研究卻駁斥了這一觀點,指出人類大部分DNA毫無用處。實際上,早在2012年該研究組就猜測人類基因大多無用。 早在上世紀50年代,研究人員發現了DN
稻田稗草基因組及水稻—草競爭分子機制獲揭示
中國水稻研究所和浙江大學共同開展研究并取得重要進展,獲得了稻田稗草基因組,揭示了稗草通過基因簇合成防御性次生代謝化合物,用于與水稻競爭和抵御稻田病菌的遺傳機制,并為水稻C4育種提供了一個重要基因遺傳資源。近日,相關研究成果在線發表于《自然—通訊》。 該研究表明,稗草可以合成異羥肟酸類次生代謝產
研究揭示水稻DELLA蛋白的表觀調控新機制
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508456.shtm
新研究揭示過量氮肥導致水稻減產的分子機制
農業生產中過量施用氮肥反而會降低水稻產量和氮素利用效率。南京農業大學教授、中國工程院院士萬建民團隊首次在分子遺傳學層面闡明了過量施用氮肥導致水稻無效分蘗形成的機理,從水稻自然群體中發掘了氮高效優異單倍型轉錄因子OsGATA8-H,同時結合基因編輯和回交育種技術創制了優異氮高效育種材料。6月13日,相
研究團隊揭示水稻花粉育性的新調控因子
作物花粉不育種質材料是雜種優勢利用的基礎。花粉有結構復雜的細胞壁(主要由孢粉素組成,可分為花粉外壁與內壁),花粉壁賦予了花粉抗生物和非生物逆境的能力,并參與了花粉與柱頭細胞的互作與信息交流,是決定花粉活性和功能的重要因素。目前,已發現多個影響孢粉素前體生物合成的基因,但已知的調控因子有限。 中
研究揭示水稻DELLA蛋白的表觀調控新機制
9月11日,華中農業大學作物遺傳改良全國重點實驗室、湖北洪山實驗室水稻團隊教授周道繡和趙毓課題組在國際期刊EMBO Journal在線發表了研究論文,揭示了水稻DELLA蛋白抑制基因表達的表觀調控新機制。 20世紀60年代以來,矮桿作物以其抗倒伏和收獲指數高等優勢,極大地增加了糧食產量。生長抑
新研究揭示過量氮肥導致水稻減產的分子機制
農業生產中過量施用氮肥反而會降低水稻產量和氮素利用效率。南京農業大學教授、中國工程院院士萬建民團隊首次在分子遺傳學層面闡明了過量施用氮肥導致水稻無效分蘗形成的機理,從水稻自然群體中發掘了氮高效優異單倍型轉錄因子OsGATA8-H,同時結合基因編輯和回交育種技術創制了優異氮高效育種材料。6月13日,相
大型基因組研究揭示失眠機理
日前,對人類基因組進行的兩項深入研究揭示,經常被歸咎于壓力或不良睡眠習慣的失眠癥,可能與抑郁癥、心臟病以及其他生理疾病的關系更加密切。 “這兩項研究都做得非常出色。”美國賓夕法尼亞大學佩雷爾曼醫學院研究睡眠行為的心理學家Philip Gehrman表示。但是他強調,在將與失眠有關的基因聯系轉化
大型基因組研究揭示失眠機理
圖片來源:DIMABERLIN 本報訊 日前,對人類基因組進行的兩項深入研究揭示,經常被歸咎于壓力或不良睡眠習慣的失眠癥,可能與抑郁癥、心臟病以及其他生理疾病的關系更加密切。 “這兩項研究都做得非常出色。”美國賓夕法尼亞大學佩雷爾曼醫學院研究睡眠行為的心理學家Philip Gehrman表示。但
Nature子刊:華中農大發現轉座子可抑制mRNA翻譯
來自華中農業大學生命科學學院,作物遺傳改良國家重點實驗室的研究人員發現水稻中的一類DNA轉座子具有翻譯抑制功能,這揭示了微小反向重復轉座元件的新功能,對研究其他重復序列的功能提供了借鑒意義,同時也拓寬了對于轉座子的認識。 這一研究成果公布在3月3日的Nature Communications雜
用國家標準揭示“翡翠真相”
5月13日,國家珠寶玉石質量監督檢驗中心(NGTC)、中國珠寶玉石首飾行業協會珠寶首飾鑒定評估專業委員會、中國質量檢驗協會珠寶玉石飾品專業委員會聯合召開“翡翠的真相”記者見面會。見面會現場展出10套不同種類和成色的翡翠樣品和翡翠相關的各項國家標準。珠寶玉石鑒定專家現場介紹翡翠國家標準,講解翡翠鑒
研究揭示水稻抽穗期調控新機制
近日,中國水稻研究所胡培松院士團隊研究揭示了OsTPR075-OsFTIP1/9-RFT1/Hd3a分子模塊調控水稻抽穗期的新機制,對于水稻分子遺傳改良具有重要的指導意義。相關研究結果在線發表在《植物細胞》(The Plant Cell)。 水稻的抽穗期(開花期)是水稻從營養生長轉換到生殖生長