發現未知！水稻基因變異的秘密被揭曉！
5月28日，全球頂尖學術期刊Cell在線發布了我校國家重點實驗室、水稻研究所李仕貴與欽鵬教授團隊聯合中科院遺傳與發育生物學研究所梁承志研究員團隊完成的題為“Pan-genome analysis of 33 genetically diverse rice accessions reveals hidden genomic variations”（基于33個水稻遺傳多樣性材料的泛基因組分析揭示“隱藏”的基因組變異）的研究論文。這是四川農業大學繼陳學偉教授團隊之后，再次在Cell上發表論文，也是我校第3篇CNS（Cell Nature Science）頂級學術期刊論文。 我校李仕貴教授為論文通訊作者，中科院遺傳與發育生物學研究所梁承志研究員和我校欽鵬教授為論文共同通訊作者。欽鵬教授、博士研究生王淏、陳薇蘭博士、中科院遺傳所魯宏偉博士、陳倬博士以及河北大學杜會龍教授為論文第一作者。該研究得到了國家重點研發計劃、自然科學基金重大......閱讀全文
水稻基因組學與農業應用研討會召開
由華大基因研究院舉辦的“水稻基因組學與農業應用研討會”近日在深圳召開。 作為世界上最早種植水稻的國家，水稻一直在我國糧食生產中起著舉足輕重的作用。華大基因等國內多家單位曾于2002年率先合作完成秈稻基因組框架圖與精細圖的繪制工作，并在美國《科學》雜志發表科學專論。
美國科學家開發全基因組測序水稻變體
水稻不僅是全球一半人口的主食，也為研究能源作物提供了模型。為優化生物燃料作物，科學家正尋找決定水稻產量、抗病性和灌溉效率等性狀的基因。 最近在《植物細胞》雜志刊登的一篇論文中，美國加州大學戴維斯分校的研究團隊與來自能源部聯合基因組研究所的合作者，宣布開發出粳稻Kitaake的第一個全基因組測
中國科學家完成水稻5個“近親”基因組測序
中國科學家３日說，他們完成了亞洲栽培稻（一般稱為水稻）５個“近親”的全基因組測序，獲得了高質量的基因組參考序列。這有望進一步推動水稻品種的改良。 中國科學家在美國《國家科學院學報》上報告說，他們從２００７年至今，自主完成了尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展穎野生稻和南方野生
日媒：日本首次收獲運用基因組編輯技術的水稻
據日媒報道，本月31日，日本農業和食品產業技術綜合研究機構（茨城縣筑波市）公開了運用“基因組編輯”技術改變基因并在室外栽培的水稻的收獲情形。 據該機構稱，室外栽培經基因組編輯的植物在日本國內尚屬首次。改變了控制水稻穗數和顆粒大小的基因，預計可以增加產量。 該機構將對收獲的水稻進行分析，確認
研究構建藏族人群全基因組水平的適應性遺傳變異圖譜
8月7日，《國家科學評論》（National Science Review）在線發表了中國科學院上海營養與健康研究所——馬普計算生物學研究所徐書華團隊的研究成果“Prioritizing natural selection signals from the deep-sequencing gen
我科學家預測出影響水稻稻曲病真菌致病基因
近日，中國農業大學植物病理學系孫文獻教授和彭友良教授的團隊聯合國內外多家科研機構描繪出水稻稻曲病菌的基因組序列草圖。通過比較基因組學與表達譜分析預測出影響該致病真菌致病力的關鍵基因，同時針對該真菌侵染機制與進化提出了相關見解。該研究成果發表在近日的《自然·通訊》上。 稻曲病是一種由稻曲病菌引起
稻田稗草基因組及水稻—草競爭分子機制獲揭示
中國水稻研究所和浙江大學共同開展研究并取得重要進展，獲得了稻田稗草基因組，揭示了稗草通過基因簇合成防御性次生代謝化合物，用于與水稻競爭和抵御稻田病菌的遺傳機制，并為水稻C4育種提供了一個重要基因遺傳資源。近日，相關研究成果在線發表于《自然—通訊》。 該研究表明，稗草可以合成異羥肟酸類次生代謝產
新研究可大幅提高雜交水稻全基因組選擇預測精度
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505572.shtm水稻是人類重要的糧食作物之一，水稻雜交種的產量高于常規自交系品種，但由于雜交稻存在顯性等非加性效應，稻米品質的遺傳改良比自交稻更具挑戰性。湖南農業大學植物保護學院副教授李蘭芝團隊聯合美
遺傳發育所開發水稻分子育種整合組學知識庫
10月18日，中國科學院遺傳與發育生物學研究所植物基因組學國家重點實驗室梁承志研究組開發的分子育種整合組學知識庫水稻子庫在線發表于學術期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）。文章題目為MBKbase for rice: an integrated omics knowl
植物所揭示稻米裂紋抗性和整精米率的分子基礎
整精米率是水稻的重要品質性狀，涉及水稻經濟產量。整精米率性狀由遺傳控制，受灌漿、收獲及收獲后期高溫高濕等環境因子影響，其降低主要原因是稻米成熟階段產生的裂紋，導致加工過程稻米斷裂，可造成高達30%的水稻產量損失。全球氣候變化給水稻生產帶來新的挑戰，研究模型預測，在水稻種植季節氣溫異常升高1℃可引起稻
遺傳變異的基本概念
生物的親代能產生與自己相似的后代的現象叫做遺傳。遺傳物質的基礎是脫氧核糖核酸（DNA），親代將自己的遺傳物質DNA傳遞給子代，而且遺傳的性狀和物種保持相對的穩定性。生命之所以能夠一代一代地延續的原因，主要是由于遺傳物質在生物進程之中得以代代相承，從而使后代具有與前代相近的性狀。只是，親代與子代之間、
迄今分辨率最高的野生稻栽培稻泛基因組圖譜繪就
亞洲栽培稻馴化歷史可追溯至一萬年前的普通野生稻。 面對全球人口增長和氣候變化加劇的雙重壓力，如何將野生稻歷經萬年錘煉的“生存智慧”注入現代品種，培育出兼具高產潛力與抗病抗逆特性的“超級水稻”已成為重要研究課題。然而，傳統依賴單一參考基因組的研究模式譬如以管窺天，僅能捕捉水稻遺傳多樣性的冰山一角。
中澳科學家對高粱進行全基因組測序分析
由澳大利亞昆士蘭大學、華大基因等單位的科學家對高粱進行了全基因組測序及分析，發現高粱基因組中存在大量的遺傳變異，為高粱及其它糧食作物的育種改良提供了寶貴的遺傳資源。8月28日，最新研究結果在《自然·通訊》雜志上發表。 中澳兩國的科學家通過對44株不同來源的高粱樣本，包括地方品種、改良品種和
Science－|－全球首次鑒定出水稻除草劑廣譜抗性基因
水稻（Oryza sativa L.）是> 35億人的主食。通過表征Oryza屬的基因組（包括馴養和野生物種）揭示的遺傳變異已經允許鑒定可用于作物育種的基因。大規模農業中生產取決于除草劑的雜草控制，但長期使用這些試劑可導致出現抗性雜草。因此，作物育種需要新的除草劑和除草劑抗性基因組合。粳稻BBC
基因組所合作研究揭開兩種家養水稻起源進化“篇章”
6月9日，在最新一期的PLOS Genetics上，來自中國科學院北京基因組研究所的吳仲義研究員和中山大學施蘇華教授發表了合作研究文章《水稻基因組兩種進化歷史：馴化基因的角色》(Two Evolutionary Histories in the Genome of Rice: the R
我國超級稻基因組數據從“云端”向全球共享
“我們的3000份綠色超級稻基因組原始測序數據，覆蓋了全球25萬份種質基因全部遺傳變異的95％。這份核心數據，將正式通過阿里云平臺，向全球免費開放。”9月15日，中國農業科學院、阿里云計算有限公司、華智水稻生物技術有限公司、北京聚道科技有限公司在長沙共同啟動“云之稻項目”，中國農科院農作物基因資
植物表型研究文章TOP10（三）
TOP 4●?高通量表型和全基因組關聯分析：研究揭示水稻的自然遺傳變異(Nat Commun,2014)通過使用高通量測序技術對植物基因組學的研究迅速發展，傳統的植物表型測試已遠遠落后。此文的作者開發了一個高通量水稻表型測定設施（HRPF），用于監測水稻生育期的13個傳統農藝性狀和2個新定義的性狀。
科學家構建藏族人群全基因組水平的適應性遺傳變異圖譜
8月7日，《國家科學評論》（National Science Review）在線發表了中國科學院上海營養與健康研究所——馬普計算生物學研究所徐書華團隊的研究成果“Prioritizing natural selection signals from the deep-sequencing gen
植物表型研究文章TOP10（一）
雞年接近尾聲，各行各業都已經做了各種年度盤點，小編也不能免俗，以影響因子和引用次數為標準，將近五年跟植物表型研究相關的文章，做了盤點，列出了植物表型研究文章的TOP10 ，從微觀表型到宏觀表型，從實驗室表型到田間表型，從基因型到表型，趕緊一睹為快吧。 TOP 10●?植物表型組學數據中動態數量性狀位
我國科學家完成谷子基因組測序
5月14日由深圳華大基因和河北省張家口市農科院等單位完成的谷子基因組研究成果于《自然·生物技術》在線發表。科研人員成功構建了谷子全基因組序列圖譜，為揭示谷子抗旱節水、豐產、耐瘠和高光合作用效率等生理機制的研究提供了新的途徑，并為高產優質、抗逆谷子新品種的培育奠定了堅實的基礎。
遺傳變異影響受教育程度
通過一個全新的近30萬人的全基因組關聯分析（GWAS），研究人員發現了與一個人完成的正式教育年數相關的遺傳變異。這一研究成果11日在線發表于英國《自然》雜志的一篇遺傳學論文上。 雖然由完成的教育年數定義的受教育程度，在很大程度上會受到社會和環境因素的影響，但以前的研究仍然表明，遺傳變異也會對不
JBC：揭秘“吃不胖”人群表觀遺傳變異
有沒有想過為什么有些人可以想吃多少就吃多少，并且從來不會因此而變胖？僅僅是因為遺傳變異？最近一個研究小組指出了另一個重要的因素。相關研究結果發表在最近的《Journal of Biological Chemistry》雜志。 我們都知道：有些人不用為減肥苦惱，而其他一些人似乎一直都在跟贅肉做斗
遺傳變異如何影響蛋白表達變化
蛋白質是生命活動的主要承擔者，其表達調控對于正常發育和疾病的發生發展至關重要。根據中心法則，我們知道信息的傳遞過程：DNA→RNA→蛋白。然而研究表明mRNA水平和蛋白水平并不完全一致，表明其中存在某種未知機制，介導mRNA水平的遺傳變異對蛋白水平的影響。來自哈佛醫學院和Jackson實驗室的研究人
分子生態學詞匯遺傳變異
中文名稱：遺傳變異外文名稱：genetic variation定? ? ? 義：遺傳變異是指生命是在遺傳的基礎上，同一基因庫中不同個體之間在DNA水平上的差異，也稱“分子變異(molecular variation)”，也是對同一物種個體之間遺傳差別的定性或定量描述。遺傳與變異，是生物界不斷地普遍發
中美大豆品種存在大量遺傳變異
美國種植的大豆品種同中國種植的大豆品種有何不同？依據新近完成的中國大豆基因組測序，科學家發現，中美大豆品種在基因組上存在著大量的遺傳變異。中國大豆基因組測序的完成，為優良大豆品種的培育奠定了基礎。相關研究以封面文章形式在線發表于最新一期的《中國科學—生命科學》（英文版）上。作為重要的經濟作物，大豆起
水稻近緣種北美沼生菰首個近完整基因組組裝完成
近日，中國農業科學院煙草研究所煙草功能成分與生物合成創新團隊聯合院華東中心等單位，完成首個北美沼生菰接近完整基因組的組裝，為菰屬作物遺傳改良、功能基因解析和關鍵生物過程研究提供了寶貴的資源。相關研究成果發表在《作物學報》（The Crop Journal）上。作為栽培稻的重要野生近緣種，北美沼生菰是
我科學家參與完成非洲稻基因組測序
最近，美國亞利桑那大學（UA）研究人員帶領的一個國際研究小組，完成了非洲稻（Oryza glaberrima）的全基因組測序。中科院遺傳與發育生物學研究所的陳明生（Mingsheng Chen）和Jinfeng Chen也參與了此項研究工作。相關研究結果，以“The genome sequenc
“未來水稻”：你在多遠的未來？
“未來水稻”時代，是個增加了分子生物學技術“工具”的育種時代，能促使水稻產量、品質、抗性等的全方位、大幅度提升。 不久前，第19屆國際植物學大會活動之一的“2017年國家自然科學基金委員會與國際水稻研究所聯合研討會”，在深圳舉辦。一種基于生物分子育種技術的“未來水稻”，受到廣泛關注。 據稱，
這個遺傳變異與嚴重兒童肥胖相關
科學家報道了與嚴重兒童肥胖有關的一種新的遺傳機制。這是一個與饑餓控制有關的基因異常表達導致的基因重排，而大多數肥胖的常規基因檢測無法檢測到。相關研究近日發表于《自然—代謝》。 黑素皮質素受體4（MC4R）激活基因位于稱為下丘腦的腦區，激發飽足或不餓的感受。干擾MC4R激活或發揮功能的變異，與饑餓
Nature：遺傳變異如何影響蛋白表達變化
蛋白質是生命活動的主要承擔者，其表達調控對于正常發育和疾病的發生發展至關重要。根據中心法則，我們知道信息的傳遞過程：DNA→RNA→蛋白。然而研究表明mRNA水平和蛋白水平并不完全一致，表明其中存在某種未知機制，介導mRNA水平的遺傳變異對蛋白水平的影響。來自哈佛醫學院和Jackson實驗室的研