透過大規模基因組分析推出泛癌癥圖譜開啟癌癥治療
【Technews科技新報】美國國立衛生研究院(NIH)資助的研究團隊已經完成了一份詳細的基因組分析,這個被稱為泛癌癥圖譜(PanCancer Atlas)的研究結果收錄了 27 篇論文,并包含了 33 種癌癥、1 萬多個種不同腫瘤分子和臨床訊息的數據資料。 泛癌癥圖譜主要是針對癌癥基因組圖譜(TCGA)項目過去十多年的研究進行補充并延伸;TCGA 是美國國家癌癥研究所(NCI)和國家人類基因組研究所(NHGRI)共同執行的項目,自 2006 年開始已經持續了 10 多年的時間,NIH 投入的資金超過了 3 億美元,范圍涉及 20 個機構、近 150 名研究人員共同參與。 NHGRI 團隊負責人 Carolyn Hutter 強調,TCGA 是第一個在分子層面上針對廣泛類型癌癥研究的項目,而在近 10 年前 TCGA 項目的草創階段,這些內容甚至是不可能做到的,更別提是在如此廣大的范圍進行此類型的特征和類型分析,......閱讀全文
透過大規模基因組分析推出-泛癌癥圖譜-開啟癌癥治療
【Technews科技新報】美國國立衛生研究院(NIH)資助的研究團隊已經完成了一份詳細的基因組分析,這個被稱為泛癌癥圖譜(PanCancer Atlas)的研究結果收錄了 27 篇論文,并包含了 33 種癌癥、1 萬多個種不同腫瘤分子和臨床訊息的數據資料。 泛癌癥圖譜主要是針對癌癥基因組
泛癌癥T細胞單細胞圖譜-相關成果發表
北京大學生物醫學前沿創新中心(BIOPIC)、生命科學學院、北京未來基因診斷高精尖創新中心(ICG)張澤民課題組聯合北京大學腫瘤醫院季加孚、步召德課題組以及北京大學第三醫院,在國際期刊Science上發表了題為“Pan-Cancer Single Cell Landscape of Tumor-
《Cell》:如何根據癌癥基因組圖譜分析腫瘤
時至今日,這一計劃已經取得了許多成果,最新Cell雜志公布了泛癌癥圖譜(Pan-Cancer Atlas),這也是癌癥基因組圖譜(TCGA)的收官項目,同期Cell雜志介紹了根據癌癥基因組圖譜分類的腫瘤類型列表,以及相關的一些主要發現(每種腫瘤類型的標記論文)。 生物通報道:2005年美國國立
Nature對兒童癌癥基因組分析,有望實現兒童癌癥精準治療
在一項新的研究中,來自美國圣猶大兒童研究醫院等研究機構的研究人員證實患有癌癥的兒童和成年人通常具有不同的發生突變的基因來促進疾病產生,這提示著這些患者可能受益于不同的療法。這一發現強調了對兒童癌癥進行精準醫療的必要性。相關研究結果于2018年2月28日在線發表在Nature期刊上,論文標題為“P
大規模癌癥基因組研究發表《Nature》文章
髓母細胞瘤是兒童最常見的惡性腦瘤。大多數患者年齡在16歲以下。主要有4個亞組:Wnt、Sonic Hedgehog (SHH)、3組和4組。這些亞群由不同基因變化驅動,起始于不同細胞,常常表現出不同臨床狀況。Wnt組中,約95%患者可以成為長期存活者,3組患者只有50%。目前,尚無針對3組和4組
《科學》:北大團隊發表泛癌癥T細胞單細胞圖譜
北京大學生物醫學前沿創新中心(BIOPIC)、生命科學學院、北京未來基因診斷高精尖創新中心(ICG)張澤民課題組聯合北京大學腫瘤醫院季加孚、步召德課題組以及北京大學第三醫院,在國際期刊Science上發表了題為“Pan-Cancer Single Cell Landscape of Tumor-
中國科學家發表泛癌癥T細胞單細胞圖譜
T細胞單細胞圖譜的研究框架和主要發現。(張澤民供圖) 12月17日,北京大學生物醫學前沿創新中心教授張澤民課題組聯合北京大學腫瘤醫院季加孚、步召德課題組以及北京大學第三醫院,在《科學》上發表了泛癌癥T細胞圖譜。結合基因表達譜和T細胞受體序列,研究者系統刻畫了腫瘤浸潤性T細胞的異質性和動態變化,并系
泛癌癥分析工具新版本推出-為藥物開發提供差異性方案
近日,生物技術公司Strata Oncology宣布,推出針對實體腫瘤的泛癌癥分析工具StrataNGS 3.0版,為醫藥公司的藥物開發提供差異化解決方案。 Strata Oncology是由哈佛醫學院和密歇根大學癌癥基因組學、分子病理學和臨床腫瘤學領域的領軍人物創立,總部位于美國密歇根州。該
最全癌癥基因圖譜公布-有望提前數十年識別出腫瘤突變
癌癥是一種基因病,由體細胞癌基因突變引起。早在2001年對首個人類基因組進行測序后,腫瘤的全面基因組表征就成為癌癥研究人員的一個主要目標。從那時起,測序技術和分析工具取得的進展使得這個研究領域蓬勃發展。 2月5日,Nature雜志及其子刊同期發表了20余篇關于癌癥研究的文章,由來自37個國家、
Nature-Genetics公布又一大規模癌癥基因組分析結果
超過20個研究機構的63位研究人員公布了一項包括30,000多人血液樣本的大規模研究成果,通過這項分析,研究人員確定了13種膠質瘤新遺傳危險因素,這揭示了增加膠質瘤易感性的個體DNA的特殊差異,同時也首次為臨床醫師提供了一種能區分成膠質細胞瘤和非膠質母細胞瘤等膠質瘤類型的新方法。 這一研究成果
全球癌癥基因組圖譜計劃又一研究突破
最近,發表在國際雜志the New England Journal of Medicine上的一篇研究論文中,來自從事癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas)研究計劃的科學家通過進行研究,對第二種常見類型的腎癌的兩種類型進行了分子特性的分析,并且對這種常見類型的腎癌進行了
Nature發布大規模癌癥表觀基因組研究成果
科學家們鑒別出了有可能生成第4亞型髓母細胞瘤的細胞。新研究發現為這種最常見的腦腫瘤亞型開發出更有效的靶向療法清除了一個障礙。他們的研究結果發布在1月27日的《自然》(Nature)雜志上。 圣猶大兒童研究醫院發育神經生物學系的Paul Northcott,德國癌癥研究中心(DKFZ)的Stef
《科學》:基因組大規模篩選新技術助力癌癥研究
3000種基因經初次篩選后,大約24個符合要求 ?多年來生物學家一直在搜尋癌細胞的弱點,以期找到對付癌癥的線索。美國科學家近日研究出了一種基因組大規模篩選技術,有望提供一種強大的經濟有效的方法以挑選出對付癌癥的新藥靶。相關論文發表在2月1日的《科學》(Science)上。?2005年,美國國立衛
利用DNA圖譜診斷癌癥
作為無創產前診斷等相關領域技術的首創者,來自香港中文大學的盧煜明(DennisLo)教授最早就曾發現孕婦外周血中存在“漂流”的胎兒DNA,也就是說,假設每毫升母親樣品相當于1000個基因組,則總共含有1900條母親的21號染色體,100條整倍體胎兒的21號染色體或150條21三體胎兒的21號染色
美大規模評估癌癥病人臨床和基因組數據
英國《自然·遺傳學》雜志1月15日在線發表的一項大型研究稱,美國癌癥中心展開了大規模癌癥晚期患者臨床數據和基因組數據評估,結果顯示癌細胞的突變水平與患者接受檢查點抑制劑治療后的存活率相關。該研究意味著這一現象普遍存在于眾多類型的癌癥中,或有助于預測哪些患者將對這種免疫療法應答良好。 人們一直致
癌癥治療新曙光:癌癥建模
現在科學家們將患者的腫瘤細胞接種到小鼠體內,進而建立腫瘤模型,以用于分析和開展藥物測試。目前研究人員已鑒定了一系列小兒實體腫瘤模型,同時相關數據的允許免費獲取。 罕見癌癥的研究面臨著兩方面的挑戰:可用的腫瘤樣本少;缺乏相應的小鼠模型。最近科學家們非常成功地開發了將人類腫瘤細胞高效移植到免疫缺陷
抗癌樹突狀細胞實現大規模培養-推動癌癥治療
美法兩國研究人員組成的團隊14日在《細胞報告》雜志上發表論文稱,他們開發出一種大規模培養多種類型樹突狀細胞的方法,或將推動多種類型癌癥治療的研究。 樹突狀細胞是一種專職抗原遞呈細胞,能高效攝取、處理和傳遞抗原信息,將感知到的危險信號傳遞給淋巴細胞,誘發免疫反應。因樹突狀細胞處于人體免疫應答
溶瘤病毒療法或將開啟癌癥治療新視野
溶瘤病毒是一類具有復制能力的腫瘤殺傷型病毒,近年來科學家們對溶瘤病毒療法在癌癥治療領域的研究上產生了極大的興趣,當然,他們也取得了很多研究成果,那么溶瘤病毒療法到底是如何幫助有效抵御腫瘤進展呢?科學家們又是如何利用這種新型療法或者同其它療法聯合來治療癌癥患者呢?如今溶瘤病毒療法的研究現狀又是如何
Cell推出四篇癌癥免疫治療精選綜述
盡管利用免疫系統來對抗癌癥這一想法已存在了幾十年,直到近年來才找到一些成功的治療策略。通過操控免疫檢查點和T細胞激活來發揮抗瘤活性,免疫療法由最初在幾種癌癥類型中顯示出治療潛力,到現在已被應用至更廣泛的惡性腫瘤中。近 日Cell雜志以“Harnessing Immunotherapy again
NIH-340萬美元資助癌癥基因組圖譜研究計劃
美國國立衛生研究院于當地時間7月2日宣布,決定對八個單位(或個人)進行為期兩年、總值340萬美元的資助,以支持癌癥基因組圖譜研究計劃(Cancer Genome Atlas pilot program)。 癌癥基因組圖譜計劃是美國國立癌癥研究所和美國國家人類基因組研究的合作項目,于2005年晚期,
全球首份癌癥病例圖譜發布
日前,《科學》雜志刊登了瑞典科學家的重磅成果——全球首份癌癥病例圖譜“Atlas”,將數千種特定癌癥相關基因與患者生存情況聯系起來,發掘出32種不以癌癥類型分類、但與80%人類癌癥相關的“公共”基因,可作為潛在新藥研發的精準靶點。新圖譜被認為是腫瘤臨床實踐革命性改進的重要推手。 據《麻省理工技
首個棉花泛基因組圖譜助力分子育種
近日,華中農業大學棉花遺傳改良團隊發表了題為“Cotton pan-genome retrieves the lost sequences and genes during domestication and selection”的研究論文,公布了目前為止變異類型最豐富的棉花遺傳變異數據集。文章
1300多名學者合作-迄今最全面癌癥基因組分析完成
英國韋爾科姆基金會桑格研究所5日宣布,一個國際團隊完成了迄今覆蓋面最廣泛的癌癥全基因組分析,這有助于加深研究人員對癌癥的認識,為開發出更高效的治療方案鋪平道路。這個被稱為“泛癌癥計劃”的項目由來自37個國家的1300多名科學家合作開展,旨在研究可導致癌癥的變異基因,繪制出這些基因的全圖譜,桑格研
液體活檢開啟癌癥早期診斷大門
肺部活檢是一個侵入性的痛苦過程,對一位80歲的老太太來說尤其如此。但是通過穿刺性檢查,腫瘤學家Geoffrey Oxnard給患者開出了一種相對應的靶向藥物。經過治療,患者的腫瘤似乎消失了。 然而,一段時間后,這位80歲的老人又帶著病痛再次來到Oxnard的診所。醫療診斷表明,癌癥又回來了,
液體活檢開啟癌癥早期診斷大門
肺部活檢是一個侵入性的痛苦過程,對一位80歲的老太太來說尤其如此。但是通過穿刺性檢查,腫瘤學家Geoffrey Oxnard給患者開出了一種相對應的靶向藥物。經過治療,患者的腫瘤似乎消失了。 然而,一段時間后,這位80歲的老人又帶著病痛再次來到Oxnard的診所。醫療診斷表明,癌癥又回來了,而
最大規模泛癌種脈管系統全息細胞圖譜構建
重慶大學附屬三峽醫院印明柱教授團隊首次構建了最大規模的泛癌種脈管系統全息細胞圖譜,為充分理解腫瘤血管生成的復雜過程提供了全景視角,同時為臨床腫瘤精準治療提供了科學依據。相關成果在線發表于國際學術期刊《自然》上。 “腫瘤的發生與進展和血管的生成息息相關。”印明柱解釋道,血管像人體內的交通系統。腫瘤作
Science推出專刊:癌癥免疫療法
最新一期(4月3日)Science雜志推出了癌癥免疫療法專刊,介紹了近期癌癥免疫療法方面的各種進展,尤其指出一種改變游戲規則的癌癥免疫療法也許能用于治療某些患有特定癌癥類型的患者。 在這一專刊中, 有5篇文章提出了目前這一研究領域保持進展所需的要素,Ton Schumacher等人探討了在同期
Nature子刊:非編碼RNA癌癥藥物基因組圖譜新突破
近日,匹茲堡大學藥物遺傳研究中心的楊達和張敏課題組借力于一種名為彈性網絡回歸(Elastic Net regression)的機器學習模型,從1,001個腫瘤細胞系的高通量長非編碼RNA表達譜(long noncoding RNAs, lncRNAs)與265種抗癌藥物敏感性數據中,挖掘出了27
CollabRx公司:-推出分析工具角逐癌癥基因測序市場
位于舊金山的生物技術公司 CollabRx宣布將要競逐癌癥基因測序市場,公司目前推出了一套Genetic Variant Annotation (GVA)的服務軟件,能幫助研究人員分離定位并鑒定癌癥基因。利用生物信息學確定癌癥基因已經成為癌癥研究人員研究的重要途徑之一,因此也使得這個領域成為
64%中國癌癥患者有可用藥的潛在臨床基因突變
論文截圖研究人員在分析數據(受訪者供圖)近日,《自然-通訊》刊發了一項由中山大學孫逸仙紀念醫院王銘輝教授團隊聯合多家醫院及至本醫療針對亞洲癌癥人群基因組特征的研究成果。該成果從基因層面將中國人群與西方人群突變特征的異同進行了系統分析和全面對比,全面闡述了東西方癌癥患者的不同臨床基因組特征,是截止目前