ctDNA較常規循環DNA更短，助力液體活檢技術

　　理解循環腫瘤DNA和正常游離DNA在其長度上的區別或許會促進能從患者血液中檢測出腫瘤DNA的液體活檢技術。

　　能夠從血液中發現和診斷癌癥，并且可以監測癌癥復發性或是評估治療效果的反饋——液體活檢，這項技術一直以來因受監測靈敏性而被制約它的發展。7月18日，來自猶他大學和華盛頓大學的研究人員在《PLOS Genetics》上發表的報告稱，對比源于腫瘤細胞和正常細胞的DNA片段，前者趨向于較短的長度，這一個特點若能夠善加運用則可以促進液體活檢技術的開發。

　　“這個性質使我們可以通過血液樣本中的極低劑量的腫瘤源循環DNA，檢測到實體瘤的存在，”文章第一作者，來自猶他大學的Hunter Underhill稱。

　　Underhill及其同事在多形性成膠質細胞瘤（glioblastoma multiforme, GBM）的動物模型實驗中注意到循環腫瘤細胞和常規細胞在DNA上的不同。在研究過程中，將人類GBM干細胞樣系植入小鼠腦部后，在小鼠體內發現了人類ctDNA；研究人員注意到人類腫瘤和正常小鼠DNA在型態上的區別：人類ctDNA的長度一般為134個堿基對，而小鼠游離DNA（cfDNA）長度為167個堿基對。

　　要確定這個特性，需要進行后續其他類型細胞的植入實驗。類似地，研究人員從植入人類肝癌（hepatocellular carcinoma）細胞的小鼠體內發現了人類ctDNA與小鼠cfDNA片段大小的不同。這個實驗證明了腫瘤細胞DNA的特性不僅僅局限于惡性膠質瘤，而是ctDNA的共同特性。

　　為了確認該特性是否是僅僅局限于動物模型中，Underhill團隊大量調研并對比了黑色素瘤患者和健康成人體內的循環DNA。通過顯微測密術，他們發現黑色素瘤患者的DNA片段普遍地更加短小。

　　對比健康人群，來自黑色素瘤患者的DNA片段較短，約20個堿基對；不僅如此，黑色素瘤患者血液中的cfDNA水平更高。在進一步的研究中，研究者還在黑色素瘤患者中發現其cfDNA的BRAF V600E等位基因呈現的周期性有所提高。

　　在一個由15位肺癌患者和9位健康成人組成的群組中，不論是通過顯微測密術還是測序，來自肺癌患者的cfDNA較正常對照更短。例如，研究人員使用基因捕獲法結合測序，發現含有EGFR T790M突變的基因片段更短。

　　為了確認短DNA片段的發現是否能等同于腫瘤DNA的發現。Underhill團隊對比了來自于EGFR T790M突變肺癌患者和健康人群的游離DNA測序文庫。在3/4的肺癌患者樣本中發現，當某個DNA片段比全樣本片段的平均長度短20到50個堿基對時，該片段中等位基因的突變率提升了2.5倍到9.1倍。

　　調研人員認為，準確篩查短cfDNA技術的出現能幫助相關的檢測工作，如部分等位基因突變、腫瘤早期篩查等。

　　Underhill補充，“檢測的精度十分重要，這關乎癌癥可被成功地檢測與否。”但是，他同時也提及，該特性的形成機制至今依舊還未清晰。