金黃色葡萄球菌ClpP水解酶的分子機制
上海藥物所抗菌交叉團隊研究人員針對金黃色葡萄球蛋白水解酶ClpP(SaClpP),開展水解功能的分子機制研究,繼2011年在美國生物化學和分子生物學學會專業期刊《Journal of Biological Chemistry》上發表論文(J Biol Chem, 2011, 286, 37590-601)之后,研究論文再次發表于該雜志(J Biol Chem, 2013, 288, 17643–53)。 ClpP是細菌中關鍵的蛋白水解系統,由上下兩個七聚體自組裝成一個球形腔體,負責維持細菌體內蛋白質的穩態,對維系細菌的致病力起著關鍵作用。現有研究表明ClpP已成為一類針對新機制的抗菌新靶標,目前還沒有靶向調控劑處于臨床研究。 繼該研究團隊獲得的SaClpP的兩種功能構象:Extended和Compressed構象的基礎上,羅成與楊財廣研究員指導博士生葉飛和張婕,以長時間分子動力學模擬為導向,結合生化實驗,......閱讀全文
金黃色葡萄球菌ClpP水解酶的分子機制
上海藥物所抗菌交叉團隊研究人員針對金黃色葡萄球蛋白水解酶ClpP(SaClpP),開展水解功能的分子機制研究,繼2011年在美國生物化學和分子生物學學會專業期刊《Journal of Biological Chemistry》上發表論文(J Biol Chem, 2011, 286, 3
胸腺嘧啶水解酶底物特異性的分子基礎和催化機制
10月1日,國際學術期刊Nucleic Acids Research 在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所國家蛋白質科學中心(上海)丁建平研究組的最新研究成果:Molecular basis for the substrate specificity and cata
蛋白水解酶的特性
蛋白水解酶又稱肽酶,包括內肽酶、外肽酶、寡肽酶和二肽酶。內肽酶有胃蛋白酶、胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶和彈性蛋白酶,對肽鏈內肽鍵的特異性不同。胃蛋白酶對底物特異性較低,主要水解Phe、Try C端的肽鍵;胰蛋白酶水解Lys、Arg C端;胰凝乳蛋白酶作用Phe、Try C端;彈性蛋白酶作用脂肪族氨基酸C端
蛋白水解酶的調控作用
體內很多重要的生理效應與蛋白酶的生物調控有關,如表中所列,當機體受到外界刺激作出相應的生理反應時就動員體內蛋白酶使原來不具有生理活性的某些多肽或蛋白質,迅速成為功能很強的相應產物,從而達到機體的防御、生存與繁殖的目的。有的動員過程較簡單,可通過一次催化反應來完成。如胃腸道中無活性的胰蛋白酶原當其
蛋白水解酶的相關介紹
蛋白水解酶(protease,proteinase)催化多肽或蛋白質水解的酶的統稱,簡稱蛋白酶。廣泛分部于動物、植物以及細菌當中,種類繁多,在動物的消化道以及體內各種細胞的溶酶體內含量尤為豐富。蛋白酶對機體的新陳代謝以及生物調控起重要作用。分子量一般在2--3萬左右。蛋白酶按水解底物的部位可分為
蛋白水解酶的性質分類
根據各種蛋白酶活性部位的性質可分之為四大類: 1、絲氨酸蛋白酶 其活性中心除絲氨酸外還包括組氨酸和天冬氨酸殘基,如胰臟所分泌的各種內肽酶和與凝血、溶血纖維、補體系統有關的各種蛋白酶。 2、巰基蛋白酶 其活性中心除半胱氨酸外還需有組氨酸殘基參與,如植物來源的和細胞溶酶體內的某些組織蛋白酶。
呂雪峰團隊揭示洛伐他汀水解酶催化機制
高血脂癥是指血液中膽固醇、甘油三酯等脂類物質異常升高,可直接引起一些嚴重危害人體健康的疾病,通過降膽固醇藥物調節血脂是目前預防和治療高血脂癥的有效方法。辛伐他汀(Zocor)是一種重要的降膽固醇藥物,其工業生產包括三個步驟:土曲霉發酵生產洛伐他汀,堿水解洛伐他汀制備中間體monacolin J,
蛋白水解酶的功能分類介紹
自從發現蛋白酶在生物調控過程中的重要作用后,又可按其生理功能及其專一性來分類。 非限制性水解蛋白酶 是指酶的專一性很差,能水解蛋白質中的很多肽鍵,使生成各種小肽甚至游離氨基酸。這類蛋白酶的生理功能主要是參與體內蛋白質的降解作用,例如胃腸道系統所分泌的各種蛋白酶將體外攝入的食物蛋白消化分解;細
稻米蛋白品質形成分子機制獲揭示
近日,《植物細胞》在線發表中國工程院院士、中國農業科學院作物科學研究所研究員萬建民團隊揭示的稻米蛋白品質形成分子機制。該研究克隆了水稻蛋白品質形成新基因GPA5,并從細胞、遺傳和生化層面闡明了GPA5在水稻貯藏蛋白后高爾基體轉運中的關鍵作用,對稻米蛋白品質改良具有重要指導意義。 論文第一作者、
揭秘Piezo蛋白介導機體觸覺的分子機制
我們的身體能夠感知多種機械刺激,我們的觸覺能夠有效區分微風吹過皮膚的感覺和疼痛的按壓感,而其它系統則能夠檢測到肌肉的伸展,甚至血壓;我們感知這些東西的能力需要一種外力,其能夠在遍布機體不同組織的感覺神經元細胞的微小末梢轉化為電信號,其中兩個相關蛋白:Piezo1和Piezo2離子通道就能夠通過允
關于蛋白水解酶的作用特點的介紹
1、生物效應是瞬時的 通過對體內活性蛋白前體的激活而迅速表現出活性。因為無需通過基因復制轉錄及表達等復雜的過程,所以能迅速對外界信號作出反應。此外這種反應又是定向而不可逆的,不同于體內其他一些酶的生物調控機制,例如一些磷酸化激酶,通過對蛋白質的磷酸化及去磷酸化使產生變構效應,從而進行可逆的生物
熊志奇小組揭示智障相關蛋白分子機制
近日,記者從中科院上海生科院神經所獲悉,該所研究員熊志奇小組在最新的研究中,揭示了智障相關蛋白CDKL5在興奮性突觸發育中的重要作用,增進了對CDKL5相關疾病機理的理解。相關研究在美國《國家科學院院刊》在線發表。 智障是一類嚴重危害兒童身心健康的疾患,不僅給患兒帶來痛苦,也給家庭和社會帶
研究揭示特殊蛋白調節腫瘤生長的分子機制
免疫檢查點是癌細胞表面的特殊蛋白,其能被癌細胞用來躲避宿主機體的免疫反應,這些表面蛋白對于癌細胞的生長非常重要,靶向作用這些蛋白的藥物能夠徹底改變多種癌癥患者的治療,而闡明降解這些免疫檢查點的機制或能幫助宿主機體免疫系統來殺滅癌細胞。 圖片來源:CC0 Public Domain 近日,一項
研究揭示蛋白RhsP靶向獵物細胞的分子機制
中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院與澳門大學合作,研究揭示細菌Ⅵ型分泌系統(Type VI secretion system, T6SS)分泌效應蛋白RhsP靶向獵物細胞的分子機制。相關研究在線發表于Cell Reports。 該研究發現,腸炎弧菌效應蛋白RhsP形成一個桶狀結構,通過自水解引發
通過膜蛋白受體NMDARs解析小分子與膜蛋白受體作用機制
近日,中國科學院大連化學物理研究所生物分子結構表征新方法創新特區研究組研究員王方軍團隊與中科院神經科學研究所研究員竺淑佳團隊合作,在N-甲基-D-天冬氨酸受體(NMDARs)-小分子配體相互作用機制分析方面取得新進展,相關結果作為Back Cover在Chemical Communication
分子伴侶蛋白作用機制研究獲新進展
近日,華東理工大學生物工程學院全舒教授團隊聯合清華大學薛毅教授團隊與國家蛋白質科學研究(上海)設施吳斌博士,在分子伴侶蛋白的作用機制解析方面取得了重要進展。相關成果以“ATP非依賴型分子伴侶Spy的底物釋放機制研究”為題發表在《自然-通訊》上,首次從動力學與結構層面對分子伴侶Spy的底物
揭示特殊的細胞蛋白控制癌癥擴散的分子機制
深入揭示控制癌癥生長和遷移的細胞信號或能幫助尋找有效的抗癌藥物,近日,一項刊登在雜志Journal of Biological Chemistry上的研究報告中,來自麥吉爾大學等機構的科學家們通過研究發現了或能幫助理解結直腸癌發病機制的關鍵生化過程。文章中,研究人員分析了參與癌細胞擴散的關鍵酶類的行
研究揭示噬菌體蛋白調控宿主轉錄的分子機制
7月11日,國際學術期刊《自然-通訊》(Nature Communications)在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所合成生物學重點實驗室張余研究組與浙江大學醫學院馮鈺研究組合作完成的題為Structural basis for transcription anti
mBio:天然免疫蛋白抑制HIV復制的分子機制
根據喬治華盛頓大學研究人員發表在《mBio》雜志上的一項新研究,人蛋白質載脂蛋白A-1結合蛋白(AIBP)通過靶向脂質筏并減少病毒細胞融合來抑制HIV復制。這些結果提供了第一個證據,表明AIBP是一種先天免疫因子,該因子可通過修飾HIV靶細胞上的脂質筏來限制HIV復制。 “先前的研究表明,AI
相分離調控蛋白翻譯與生物節律的分子機制
清華大學生命科學學院吝易團隊與楊雪瑞團隊合作揭示了細胞利用相分離對蛋白質翻譯進行精細的時空調控,從而維持晝夜節律周期的分子機制。相關成果以“區室化周期性蛋白質翻譯精確調控生物節律(Circadian clocks are modulated by compartmentalized oscill
鋅調蛋白感知鋅離子的分子機制獲得進展
鋅是生物體所必需的微量元素,它對很多重要蛋白的結構穩定性和催化活性至關重要。然而,過量的鋅會抑制呼吸鏈NADH氧化酶的活性,毒害細胞。為了生存,細胞必須準確感知并嚴格調節鋅離子在細胞內的濃度。鋅調蛋白在維持細菌鋅離子穩態和調控致病力過程中發揮極其重要的作用,但其感知鋅離子的分子機制卻一直未被解析
分子伴侶蛋白作用機制研究獲新進展
近日,華東理工大學生物工程學院全舒教授團隊聯合清華大學薛毅教授團隊與國家蛋白質科學研究(上海)設施吳斌博士,在分子伴侶蛋白的作用機制解析方面取得了重要進展。相關成果以“ATP非依賴型分子伴侶Spy的底物釋放機制研究”為題發表在《自然-通訊》上,首次從動力學與結構層面對分子伴侶Spy的底物
水解酶如何分類?
水解酶在EC編號中分類為EC3,并以它分解的鍵再細分為幾個子類:EC3.1:酯鍵(酯酶)EC3.2:糖(糖基酶)EC3.3:醚鍵EC3.4:肽鍵(肽酶)EC3.5:C-N鍵,但不包括肽鍵EC3.6:酸酐EC3.7:C-C鍵EC3.8:鹵鍵EC3.9:P-N鍵EC3.10:S-N鍵EC3.11:S-P
水解酶的概念
水解酶是催化水解反應的一類酶的總稱(如胰蛋白酶就是水解多肽鏈的一種水解酶),也可以說它們是一類特殊的轉移酶,用水作為被轉移基團的受體。
蛋白酶和淀粉酶都屬于水解酶嗎
水解酶是酶6種分類法中的一大類,其包括的范圍很廣.而淀粉酶就是其中一種,因為淀粉無論是α淀粉酶還是β淀粉酶都是催化糖苷鍵水解,故其都是水解酶的一種.
青島能源所糖苷水解酶底物特異性機制研究獲得進展
木質纖維素是地球上最豐富的可再生資源之一,其合成與降解是自然界碳素循環的中心環節。植物細胞壁在進化過程中形成了天然的“抗降解屏障”,特別是在半纖維素中,大多數多糖均含有側鏈修飾,降解困難。中國科學院青島生物能源與過程研究所微生物資源團隊致力于嗜熱微生物降解木質纖維素的機制研究,近期與美國北卡羅來
營養所揭示脲水解酶的三維結構及作用機制
近日, 《美國生物化學雜志》(Journal of Biological Chemistry)發表了中科院上海生科院營養科學研究所向嵩研究組的研究論文Structure and function of allophanate hydrolase。該研究解析了脲水解酶(allophanat
內涵體G蛋白信號終止的分子調控機制獲揭示
近日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員徐進新和客座研究員劉勁松團隊研究揭示了分選轉運蛋白SNX25通過氧化還原依賴的方式調控內涵體G蛋白偶聯受體(GPCR)-G蛋白信號轉導的分子機制。相關成果在線發表于《氧化還原生物學》(Redox Biology)。 最近十幾年來,越來越多的研究表明
人類膽汁酸外排蛋白ABCB11的分子機制揭示
記者從中國科學技術大學獲悉,該校生命科學與醫學部陳宇星教授和周叢照教授課題組,利用單顆粒冷凍電鏡技術解析了一系列人類膽汁酸外排蛋白ABCB11與其生理底物—牛磺膽酸鈉的復合物的三維結構,發現該蛋白內部存在兩個串聯的底物結合口袋,借助一系列生化實驗闡明了ABCB11特異性外排膽汁酸的分子機制。該研究成
科研人員首次發現G蛋白偶聯受體分子識別機制
中科院上海藥物研究所蔣華良課題組和王明偉課題組與美國、荷蘭、丹麥等國科學家合作,提出了G蛋白偶聯受體(GPCR)胞外段與跨膜區的動態變化模式,發現了該受體存在“開放”和“關閉”兩種分子構象,從而為其本身以及其他B型G蛋白偶聯受體的全長結構解析、功能研究和藥物發現奠定了基礎。相關研究7