葉綠體基因組樹優化森林大樣地群落構建獲揭示
群落構建是生態學家廣泛關注的核心問題之一。1月2日，記者從中國科學院華南植物園獲悉，該園分子生態學團隊及其合作者，基于中國森林監測網絡（CForBio）平臺，揭示了葉綠體基因組樹優化我國森林大樣地群落構建認知。相關研究發表于《分子生態資源》。 據悉，系統發育群落生態學將系統發育分析方法整合到群落生態學的分析中，為探究群落生物多樣性的演化與維持機制提供了新視角。建立準確可靠的群落系統樹是進行群落系統發育分析的前提和基礎，分辨率較低的群落系統樹可能導致對系統發育多樣性指數的估計產生偏差，進而影響對特定群落的生態過程的推斷。 目前群落系統樹的構建主要是利用Phylomatic、V.PhyloMaker等軟件生成名錄合成樹，或是基于一代DNA條形碼片段構建分子系統樹。合成樹方法無需采樣、測序等步驟，成本較低，但結果中往往會出現較多的多歧分枝；一代DNA條形碼樹的物種分辨率相對更......閱讀全文
葉綠體基因組樹優化森林大樣地群落構建獲揭示
群落構建是生態學家廣泛關注的核心問題之一。1月2日，記者從中國科學院華南植物園獲悉，該園分子生態學團隊及其合作者，基于中國森林監測網絡（CForBio）平臺，揭示了葉綠體基因組樹優化我國森林大樣地群落構建認知。相關研究發表于《分子生態資源》。 據悉，系統發育群落生
葉綠體基因組樹優化森林大樣地群落構建獲揭示
群落構建是生態學家廣泛關注的核心問題之一。1月2日，記者從中國科學院華南植物園獲悉，該園分子生態學團隊及其合作者，基于中國森林監測網絡（CForBio）平臺，揭示了葉綠體基因組樹優化我國森林大樣地群落構建認知。相關研究發表于《分子生態資源》。 據悉，系統發育群落生
沿海拔梯度變化的森林群落構建機制研究中獲進展
森林群落構建機制是群落生態學研究的一個重要科學問題。在森林群落中，生態過程在不同空間尺度和不同垂直結構中的作用尚不清楚，需要量化不同生態因子對群落構建作用的影響。近年來，功能多樣性和系統發育多樣性的研究為探究群落構建機制提供了新思路。 2013年以來，中國科學院昆明植物研究所植物多樣性演化和生
武漢植物園在亞熱帶山地森林群落構建研究中獲進展
群落構建機制是生態學基本和核心問題之一。環境過濾、種間作用和隨機過程被認為是群落構建三類主要驅動力，區分它們在不同生態系統的相對貢獻也成為當下生態學家們關心的問題。湖南八大公山25 ha樣地代表了亞熱帶山地常綠落葉闊葉混交林類型，該樣地物種豐富，地形起伏多變，溝谷縱橫，厘清該樣地內不同生態學過程
我國荒漠微生物多樣性格局及群落構建機制獲揭示
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511565.shtm
峨眉山兩棲動物群落構建機制獲揭示
理解生物多樣性的空間格局及其沿地理梯度的內在驅動機制是生態學、生物地理學和保護生物學的重要科學問題之一。其中，物種共存和群落構建機制是研究的熱點，更是難點。近年來，隨著功能多樣性與系統發育多樣性研究的興起與發展，通過整合物種多樣性、物種在生態系統中的功能及其系統發育關系來探討物種共存和群落構建機制，
森林群落中物種稀有性機制研究中獲進展
局域群落中的大部分物種都是只有較少個體的稀有種，理解局域群落中物種稀有性的機制是群落生態學的挑戰之一。生態位分割假說（Niche partitioning hypothesis）認為，稀有種利用空間上有限且局域稀有的資源。 為了更好地理解不同多度樹種如何在群落里中實現共存，中國科學院西雙版納熱
我國在南亞熱帶常綠闊葉林群落構建機制研究獲新進展
長期以來，群落生態學家困惑于究竟是確定性過程（如：生境過濾和生態位分化），還是隨機過程（如：擴散限制）主導了生態系統群落的構建。當前，多數群落學家認為回答這一問題最好的途徑之一，是探究確定性和隨機過程在不同空間尺度上對生態群落構建的相對重要性，即：在不同的空間尺度上，影響群落構建的生態過程是不同
多養分添加下基因組大小調控草地群落機制獲揭示
近日，中科院植物研究所研究員韓興國團隊與合作者揭示了多養分添加下基因組大小調控草地群落的新機制。相關研究成果發表于《新植物學家》。 資源與植物生產力、多樣性之間的關系是生態學長期關注的核心問題之一，資源的增加通常會在提高植物群落生產力的同時降低其植物多樣性。草地生態系統是全球最重要的陸地生態系統
多養分添加下基因組大小調控草地群落機制獲揭示
近日，中科院植物研究所研究員韓興國團隊與合作者揭示了多養分添加下基因組大小調控草地群落的新機制。相關研究成果發表于《新植物學家》。 資源與植物生產力、多樣性之間的關系是生態學長期關注的核心問題之一，資源的增加通常會在提高植物群落生產力的同時降低其植物多樣性。草地生態系統是全球最重要的陸地生態系
海岸帶土壤細菌群落構建研究獲進展
中國科學院華南植物園生態中心碩士研究生吳賜豪在該園研究員任海的指導下，在海岸帶土壤細菌群落構建研究方面取得新進展。相關成果近日發表于《全球生態與保護》（Global Ecology and Conservation）。資源匱乏在自然界中普遍存在，影響了土壤微生物的多樣性和共存。然而，目前資源可得性對
揭示樹種菌根類型對溫帶森林群落結構的調控機制
森林是陸地生態系統的主體，因而針對森林群落結構及其影響因素的研究一直受到廣泛關注，為林業生產和管理提供重要參考。然而，以往研究多關注土壤養分等環境因子對森林群落結構的影響，結果發現存在很大不確定性。土壤微生物作為重要的生物因子，其對群落結構的影響也逐漸受到重視。近期大量的控制實驗研究表明，土壤微
從全基因組水平構建鳥類物種生命樹
近日，“第一屆萬種鳥類基因組（B10K）項目國際研討會——鳥類復雜性狀的進化解析與調控”在北京召開。會議由中國科學院昆明動物研究所主辦，中國科學院動物研究所協辦。會議組織委員會主席由昆明動物所特聘講座研究員張國捷和動物所研究員雷富民擔任。 據悉，由中國科學院昆明動物研究所、中國科學院動物研究所
研究揭示樹種菌根類型對溫帶森林群落結構的調控機制
森林是陸地生態系統的主體，因而針對森林群落結構及其影響因素的研究一直受到廣泛關注，為林業生產和管理提供重要參考。然而，以往研究多關注土壤養分等環境因子對森林群落結構的影響，結果發現存在很大不確定性。土壤微生物作為重要的生物因子，其對群落結構的影響也逐漸受到重視。近期大量的控制實驗研究表明，土壤微
榕屬葉綠體基因組比較研究獲進展
近年來，葉綠體基因組因基因組小、突變率和重組率低的特點，被廣泛用于植物系統發育、分子進化、譜系地理學的研究。榕屬（Ficus）作為桑科的最大屬，且是熱帶雨林的關鍵物種，而其系統發育關系仍需進一步研究。榕屬物種具有多樣的生態型，體現了對不同生境的高度適應性。盡管近年來關于榕屬葉綠體基因組的研究有所
葉綠體和線粒體基因組變異檢測獲突破
近日，《公共科學圖書館―綜合》發表了中國農業科學院油料作物研究所博士后曾長立與合作導師伍曉明研究建立的能高通量檢測葉綠體和線粒體基因組遺傳變異的新方法。 據曾長立介紹，葉綠體和線粒體基因組作為植物細胞質基因組，對光合作用、呼吸作用等重要生命過程具有重要意義。 研究葉綠體和線粒體基因組
葉綠體基因組
葉綠體是地球上綠色植物把光能轉化為化學能的重要細胞器，葉綠體中進行的光合作用是嚴格地受到遺傳控制的。早在20世紀初，人們就已知葉綠體的某些性狀是呈非孟德爾式遺傳的，但直到60年代才發現了葉綠體DNA(chloroplast DNA，ctDNA)。葉綠體基因組是一個裸露的環狀雙鏈DNA分子，其大小在1
科學家揭示德保蘇鐵葉綠體基因組特征
廣西大學植物生理生態與進化課題組在蘇鐵植物的基因組學研究方面取得新進展，首次用蘇鐵的葉綠體全基因組重建了蘇鐵植物的系統進化樹，揭示托葉鐵科為非單系起源，該研究成果近日發表在《科學報告》上。 據介紹，研究人員通過對德保蘇鐵展開二代測序，獲得了德保蘇鐵基因組幾百萬條的短片段，用先進的算法進行組裝，
二代測序技術助龍膽族葉綠體基因組進化和系統學獲進展
隨著二代測序技術的發展，植物葉綠體基因組序列已普遍應用于重建植物“生命之樹”研究中。大多數植物葉綠體基因組呈環狀四分體結構，包含約80個蛋白編碼基因。葉綠體基因組由于缺乏重組，而常被認為是連鎖的單一基因座；然而，越來越多的研究表明，葉綠體基因組中不同區域以及不同編碼基因具有不同的核酸替代速率，經
在這個天然實驗室－他們揭示了鳥類群落構建機制
近日，中國科學院成都生物研究所研究員胡軍華團隊揭示了峨眉山鳥類多層次多樣性的海拔梯度格局及群落構建機制，相關成果發表于《生物地理學雜志》。?峨眉山獨特的地理位置和顯著的海拔梯度共同塑造了多樣的氣候條件并孕育了豐富的鳥類多樣性，使其成為研究鳥類多樣性海拔梯度格局及群落構建機制的天然實驗室。?研究過程中
青藏高原松科植物外生菌根真菌群落構建機制被揭示
近日，中國科學院成都生物研究所尹華軍研究團隊在青藏高原松科植物外生菌根真菌群落構建機制方面取得進展。研究以青藏高原亞高山森林的11種松科植物（云杉屬、冷杉屬、松屬）為對象，對其195個單優林分的外生菌根（EcM）真菌群落進行系統分析，相關研究成果發表在《植物生態學報》上。微生物群落構建機制是微生物生
在這個天然實驗室－他們揭示了鳥類群落構建機制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519235.shtm近日，中國科學院成都生物研究所研究員胡軍華團隊揭示了峨眉山鳥類多層次多樣性的海拔梯度格局及群落構建機制，相關成果發表于《生物地理學雜志》。?峨眉山獨特的地理位置和顯著的海拔梯度共同塑造
西雙版納20公頃熱帶雨林動態監測大樣地研究獲進展
自從美國史密斯研究院在巴拿馬建立世界第一個熱帶森林動態監測大樣地以來，基于大型固定樣地的森林生物多樣性監測受到越來越多的關注，為人們了解生物多樣性的變化及其影響，理解物種共存機制等提供了翔實的數據。 從2004年開始，中國森林生物多樣性監測網絡在我國不同氣候帶建立了一系列森林動
大尺度森林土壤固氮菌群落分布格局研究獲進展
生物固氮每年能向陸地生態系統提供40~100Tg的氮素，其中共生和自生固氮菌是生物固氮的主要貢獻者，它們能將大氣中的氮還原成氨，可為植物生長提供有效氮，維持森林生態系統土壤肥力并提高植物生產力。因此，闡明固氮菌群落分布格局可為理解森林氮循環過程以及調控氮素供給策略提供重要支撐。 為此，中國科學
大尺度森林土壤固氮菌群落分布格局研究獲進展
生物固氮每年能向陸地生態系統提供40~100Tg的氮素，其中共生和自生固氮菌是生物固氮的主要貢獻者，它們能將大氣中的氮還原成氨，可為植物生長提供有效氮，維持森林生態系統土壤肥力并提高植物生產力。因此，闡明固氮菌群落分布格局可為理解森林氮循環過程以及調控氮素供給策略提供重要支撐。 為此，中國科學院
科研人員在蘭科植物研究方面獲得進展
15日從中科院成都生物研究所獲悉，中科院成都生物研究所植物多樣性研究團隊利用Illumina測序技術分別研究了極小種群之一的巴郎山杓蘭和對葉杓蘭的葉綠體基因組特征，并基于葉綠體基因組數據重建了蘭科植物5個亞科中的47個物種的系統發育樹，為闡明杓蘭屬和蘭科植物的系統發育關系和分類關系作出了重要貢
我國學者揭示花葉組重樓植物葉綠體基因組特征
重樓屬植物主要生物活性物質為甾體皂苷，具有消炎、止血、抗腫瘤等功效，是云南白藥、宮血寧等86種著名中成藥的重要原料。重樓屬花葉組包括花葉重樓與祿勸花葉重樓兩種，與屬內其它植物相比，葉具斑塊，植株矮小，果實很小且產量低。花葉組重樓植物含有中國藥典規定的四種重樓皂苷。然而，花葉組重樓生長十分緩慢，對
我國森林WUE和NA空間變化格局獲揭示
中國科學院華南植物園生態中心博士生湯松波在研究員曠遠文的指導下，聯合國內多個團隊，對我國森林水分利用效率（WUE）和大氣氮可利用性（NA）經緯向變化格局及其調控因子研究取得進展。相關研究近日發表于《環境研究快報》。 全球變化，如全球變暖、降水格局變化及N沉降增加，顯著影響森林生態系統植物WU
葉綠體基因組的概念
采用高鹽、低pH值法提取雷蒙德氏棉葉綠體DNA;通過物理剪切法獲得隨機斷裂的DNA片段;剪切片段末端、補平修飾后與pCC1FOS載體連接;用噬菌體包裝蛋白包裝重組DNA,侵染大腸桿菌EPI300,構建了雷蒙德氏棉葉綠體基因組文庫。對于葉綠體DNA剪切,以1 mL注射器中等速度吸打18次為最佳參數。
花葉芋葉片關聯分析和葉綠體基因組研究獲進展
廣東省農業科學院環境園藝研究所特色花卉研究室在花葉芋葉片重要觀賞性狀關聯分析和葉綠體基因組研究方面取得新進展。相關研究分別發表于Physiologia Plantarum和Genes。 花葉芋（Caladium）是天南星科花葉芋屬多年生草本植物，被譽為“觀葉皇后”。花葉芋資源豐富，表型性狀變異豐