分子診斷常用技術（三）
二、核酸序列測定測序反應是直接獲得核酸序列信息的唯一技術手段，是分子診斷技術的一項重要分支。雖然分子雜交、分子構象變異或定量PCR 技術在近幾年已得到了長足的發展，但其對于核酸的鑒定都僅僅停留在間接推斷的假設上，因此對基于特定基因序列檢測的分子診斷，核酸測序仍是技術上的金標準。( 一) 第1 代測序1975 年Sanger 與Coulson 發表了使用加減法進行DNA 序列測定的方法，隨后Maxam 在1977年提出了化學修飾降解法的模型，為核酸測序時代的來臨拉開了序幕。Sanger 等于同年提出的末端終止法( Sanger測序法) 利用2'與3'不含羥基的雙脫氧核苷三磷酸( ddNTP) 進行測序引物延伸反應，ddNTP在DNA 合成反應中不能形成磷酸二酯鍵，DNA合成反應便會終止。如果分別在4 個獨立的DNA 合成反應體系中加入經核素標記的特定ddNTP，則可在合成反應后對產物進行聚丙烯酰胺凝膠電泳( pol......閱讀全文
分子診斷常用技術（三）
二、核酸序列測定測序反應是直接獲得核酸序列信息的唯一技術手段，是分子診斷技術的一項重要分支。雖然分子雜交、分子構象變異或定量PCR 技術在近幾年已得到了長足的發展，但其對于核酸的鑒定都僅僅停留在間接推斷的假設上，因此對基于特定基因序列檢測的分子診斷，核酸測序仍是技術上的金標準。( 一) 第1 代測序
分子診斷常用技術（二）
( 五) 生物芯片1991 年Affymetrix 公司的Fordor利用其所研發的光蝕刻技術制備了首個以玻片為載體的微陣列，標志著生物芯片正式成為可實際應用的分子生物學技術。時至今日，芯片技術已經得到了長足的發展，如果按結構對其進行分類，基本可分為基于微陣列( microarray) 的雜交芯片與
分子診斷常用技術（一）
分子診斷技術即是利用分子生物學方法對人類及病原體的各類遺傳物質進行檢測，以幫助對疾病進行診斷。以技術原理出發對分子診斷技術進行歸類與評價，以對目前臨床常用技術的沿革進行回顧。1961 年Hall 建立的液相分子雜交法標志著人類掌握分子生物學技術對特定核酸序列進行檢測，開啟了對疾病分子診斷的大門。19
漫談分子診斷常用技術沿革
一、基于分子雜交的分子診斷技術 上世紀60年代至80年代是分子雜交技術發展最為迅猛的20年,由于當時尚無法對樣本中靶基因進行人為擴增,人們只能通過已知基因序列的探針對靶序列進行捕獲檢測。其中液相和固相雜交基礎理論、探針固定包被技術與cDNA探針人工合成的出現,為基于分子雜交的體外診斷方法進行了最初
盤點：分子診斷常用技術（二）
(?五 )?生物芯片1991年Affymetrix公司的Fordor利用其所研發的光蝕刻技術制備了首個以玻片為載體的微陣列，標志著生物芯片正式成為可實際應用的分子生物學技術。時至今日，芯片技術已經得到了長足的發展，如果按結構對其進行分類，基本可分為基于微陣列( microarray)?的雜交芯片
盤點：分子診斷常用技術（一）
分子診斷技術即是利用分子生物學方法對人類及病原體的各類遺傳物質進行檢測，以幫助對疾病進行診斷。以技術原理出發對分子診斷技術進行歸類與評價，以對目前臨床常用技術的沿革進行回顧。1961年Hall 建立的液相分子雜交法標志著人類掌握分子生物學技術對特定核酸序列進行檢測，開啟了對疾病分子診斷的大門。1
CRISPR分子診斷技術（三）
13 ???或許是因為LbuC2c2的特異性和非特異性剪切活性遠遠高于LshC2c2的相應活性, Doudna團隊意識到LbuC2c2可以被用來構建高特異性、高靈敏度的RNA檢測方法。若想檢測出某一特定序列的RNA分子，先將與其互補的crRNA和LbuC2c2蛋白組裝，再加上一些報告RNA分
一文讀懂分子診斷常用技術
基于分子構象的分子診斷技術 (一)變性梯度凝膠電泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)與單鏈構象多態性(single strand conformation polymorphism,SSCP) 1970~1980年間,Fischer等
一文讀懂分子診斷常用技術（一）
分子診斷技術是指以DNA和RNA為診斷材料，用分子生物學技術通過檢測基因的存在、缺陷或表達異常，從而對人體狀態和疾病作出診斷的技術。其基本原理是檢測DNA或RNA的結構是否變化、量的多少及表達功能是否異常，以確定受檢者有無基因水平的異常變化，對疾病的預防、預測、診斷、治療和預后具有重要意義。通俗簡單
一文讀懂分子診斷常用技術（二）
二核酸序列測定測序反應是直接獲得核酸序列信息的唯一技術手段,是分子診斷技術的一項重要分支。雖然分子雜交、分子構象變異或定量PCR技術在近幾年已得到了長足的發展,但其對于核酸的鑒定都僅僅停留在間接推斷的假設上,因此對基于特定基因序列檢測的分子診斷,核酸測序仍是技術上的金標準。(一)第1代測序1975年
分子克隆常用技術
一、核酸的純化 在分子克隆的所有操作中，最基本的操作是核酸的純化。其關鍵步驟是去蛋白質，通常只要用酚/氯仿。氯仿抽提核酸的溶液即可。每當需要把克隆有某一些所用的酶滅活或去除以便進行下一步時，可進行這種抽提。然而，如要從細胞裂解液等復雜的分子混合物中純化核酸，則要先用某些蛋白水解酶消化大部分蛋白質后
分子生物學常用實驗技術（三）
第二章DNA 酶切及凝膠電泳第一節概述一. DNA 的限制性內切酶酶切分析 限制性內切酶能特異地結合于一段被稱為限制性酶識別序列的DNA 序列之內或其附近的特異位點上,并切割雙鏈DNA。它可分為三類:Ⅰ類和Ⅲ類酶在同一蛋白質分子中兼有切割和修飾(甲基化)作用且依賴于ATP 的存在。Ⅰ類酶結
－盤點：分子診斷常用技術50年的沿革與進步
一、基于分子雜交的分子診斷技術 上世紀60年代至80年代是分子雜交技術發展最為迅猛的20年，由于當時尚無法對樣本中靶基因進行人為擴增，人們只能通過已知基因序列的探針對靶序列進行捕獲檢測。其中液相和固相雜交基礎理論、探針固定包被技術與cDNA探針人工合成的出現，為基于分子雜交的體外診斷方法進行了
常用的分子生物學基本技術（三）
初步應用有關原位PCR技術應用成功的第一篇報道是對感染綿羊中樞神經系統visna病毒在綿羊脈絡從一細胞中檢查，通過PCR擴增，僅用150堿基對的短探針就可通過ISH檢查到了細胞內的visna病毒。從開始在試管內細胞行PCR擴增后再涂片做ISH(原位雜交)檢查，已發展到用福爾馬林固定、石蠟切片的常規病
常用的分子生物學基本技術（三）
DNA序列分析（DNA sequencing） 應用各種突變檢測技術檢測到的基因突變，最后都需用序列分析才能確定突變類型及突變位置，其效率可以達到100％。現在的測序方法已與經典的方法有了很大的不同，其基本原理雖仍是雙脫氧終止法，但自動化程度大為提高，操作更簡便，測序時間也大大縮短。隨著PCR技術與
常用基因診斷技術
?? 當細胞的基因組DNA用特定的內切酶如Eco RⅠ切割時，凡有GAATTC的地方都被切開，得到許多長度一定但互不相等的片段，需要分析、分離的基因或DNA片段就在其中某一特定的的片段上。 然而許多長短不同的DNA片段混合在一起是很難分析的。因此首先必需將它們按大小（長短)分離開來，這可借助凝膠電
分子克隆（molecular－coloning）常用技術
一、核酸的純化在分子克隆 的所有操作中，最基本的操作是核酸的純化。其關鍵步驟是去蛋白質，通常只要用酚/氯仿。氯仿抽提核酸的溶液即可。每當需要把克隆 有某一些所用的酶滅活或去除以便進行下一步時，可進行這種抽提。然而，如要從細胞裂解液等復雜的分子混合物中純化核酸，則要先用某些蛋白水解酶消化大部分蛋白
基因診斷的常用技術
綜述當細胞的基因組DNA用特定的內切酶如Eco RⅠ切割時， 基因診斷凡有GAATTC的地方都被切開，得到許多長度一定但互不相等的片段，需要分析、分離的基因或DNA片段就在其中某一特定的的片段上。 然而許多長短不同的DNA片段混合在一起是很難分析的。因此首先必需將它們按大小（長短）分離開來，這可借助
分子雜交技術（三）
五、核酸分子雜交的類型 隨著基因工程研究技術的迅猛發展，新的核酸分子雜交類型和方法在不斷涌現和完善。核酸分子雜交可按作用環境大致分為固相雜交和液相雜交兩種類型。固相雜交是將參加反應的一條核酸鏈先固定在固體支持物上，一條反應核酸游離在溶液中。固體支持物有硝酸纖維素濾膜、尼龍膜、乳膠顆粒、磁珠和微孔板
分子雜交技術（三）
五、核酸分子雜交的類型 隨著基因工程研究技術的迅猛發展，新的核酸分子雜交類型和方法在不斷涌現和完善。核酸分子雜交可按作用環境大致分為固相雜交和液相雜交兩種類型。固相雜交是將參加反應的一條核酸鏈先固定在固體支持物上，一條反應核酸游離在溶液中。固體支持物有硝酸纖維素濾膜、尼龍膜、乳膠顆粒、磁珠和微孔板
CRISPR分子診斷技術（一）
本篇為“連環畫”系列中的第二篇。“連環畫”中的每一篇都會介紹一個最新生物醫藥技術或趨勢。以圖畫為主，文字為輔。雖然無法做到系統全面，但希望能給讀者帶來一些啟發。每篇文章只代表作者個人的觀點或解讀，與禮來亞洲基金的投資決定無關。1 ???脊椎動物的免疫系統分為先天免疫（或非特異性免疫），和獲得性免疫（
CRISPR分子診斷技術（五）
25 ? DETECTR達到了aM水平的靈敏度和≤7個堿基的特異性。例如，它能準確地檢測出受試者攜帶的是哪種亞型的HPV。圖片來源：參考資料2和1026 ??在同期Science論文中，張鋒團隊從三個方面著手完善SHERLOCK：多重化、定量化和去熒光。先說多重化：他們挑選了來自兩個不同菌株的Cas
分子診斷技術大盤點
分子診斷技術盤點分子診斷技術是指以DNA和RNA為診斷材料，用分子生物學技術通過檢測基因的存在、缺陷或表達異常，從而對人體狀態和疾病作出診斷的技術。分子診斷技術為疾病的預測、診斷、預防、治療和轉歸提供了信息和決策依據，已廣泛應用于傳染病的診斷、流行病的調查、食品衛生檢查、腫瘤和遺傳病的早期診斷及法醫
CRISPR分子診斷技術（二）
6 ?? Sherlock和Mammoth兩家公司的技術并非橫空出世，而是源于張鋒和Doudna兩家實驗室于2015-2018年期間在知名期刊上發表的一系列科研成果。這場學術上的比拼猶如兩個武林高手過招，精彩紛呈，讓人目不暇接。兩個團隊互相競爭，也互相學習，開拓了CRISPR分子診斷這一全新
CRISPR分子診斷技術（七）
39 ??加上Cas9，它們為分子診斷和基因編輯提供了多樣靈活的工具。圖片來源：參考資料240??? CRISPR分子診斷技術并不是只有Doudna和張鋒兩家在開發。2019年3月，在Keck Graduate Institute任職的Kiana Aran博士與合作者在Nature Biomedic
CRISPR分子診斷技術（四）
19 ???由于其高靈敏度和特異性，CRISPR診斷技術或CRISPR-Dx可以有很多用途：病毒檢測和病毒亞型區分，病菌識別和耐藥性基因確認，即時檢測（POCT）, 患者基因分型，以及癌癥突變分析和液體活檢。這篇論文也初步展示了CRISPR-Dx在這些方面的應用前景。圖片來源：參考資料320???比
CRISPR分子診斷技術（六）
34 ???不是所有的塞卡病毒都一樣。2017年9月， 中科院遺傳所的許執恒團隊和軍事醫學科學院的秦成峰團隊在Science上報導，prM蛋白的一個突變(S139N)增加了塞卡病毒的傳染性，并引起更嚴重的小頭癥和更高的致死率。在該論文發表后一周內，Sabeti團隊和張鋒團隊就設計、開發出幾個能區分出
現有分子診斷技術大盤點
感染性疾病如今出現了很多新的變化，舊的疾病有了新的特點，也出現了諸如埃博拉病毒之類新的疾病。傳統的病原學檢測以分離、培養、染色、生物化學鑒定為主，但是有操作復雜、檢測周期長、干擾因素多、敏感性與特異性有限等缺點。雖然自動化技術縮短了檢測時間，但并沒有解決根本性問題，臨床應用中急需一種新的，更有效的診
基因診斷的概念、常用技術與應用
?基因診斷的概念??一、基本概念：??1．人類的絕大多數疾病都與基因有關，基因變異引起疾病兩種類型：??1)?內源基因變異：由于先天遺傳和后天內外環境因素的影響，人類的基因結構及表達的各個環節都可發生異常，從而導致疾病。分基因結構突變和表達異常。??2)?外源基因的入侵：各種病原體感染人體后，其特異
漫談分子診斷技術50年（一）
一、基于分子雜交的分子診斷技術 上世紀60年代至80年代是分子雜交技術發展最為迅猛的20年,由于當時尚無法對樣本中靶基因進行人為擴增,人們只能通過已知基因序列的探針對靶序列進行捕獲檢測。其中液相和固相雜交基礎理論、探針固定包被技術與cDNA探針人工合成的出現,為基于分子雜交的體外診斷方法進行了最初