DISCOVERSeq，一種檢測CRISPR脫靶效應的新方法
自從CRISPR基因組編輯技術問世以來，它已經顯示出了治療許多棘手疾病的巨大希望。然而，科學家們一直在努力確定與治療有關的細胞類型的潛在非靶向效應，這仍然是臨床轉化的主要障礙。現在，Gladstone研究所和創新基因組學研究所（IGI）的一組科學家與AstraZeneca合作開發了一種可靠的方法來實現這一點。 CRISPR通過在特定位置切割DNA來編輯一個人的基因組。挑戰在于確保該工具不會在DNA上的其他地方進行切割，即所謂的“脫靶效應”，可能會產生不可預見的后果。 《Science》雜志的一項研究，兩位第一作者，Beeke Wienert和Stacia Wyman，找到了解決這個問題的新方法。 “當CRISPR切割時，DNA就會斷裂，”Wienert博士說，他之前在Jacob E.Corn的IGI實驗室工作，現在是Gladstone研究所Bruce R.Conklin實驗室的博士后學者。“因此，為了生存，細胞招募了許......閱讀全文
基因測序技術升級檢測CRISPR脫靶效應
政府主導致效率低 2014年末，習近平總書記前往鎮江視察時發表過如下言論：“一些大醫院始終處于‘戰時狀態’的狀況需要改觀。”新醫改啟動至今已是第七年，但因患者在大醫院高度擁堵造成的看病難、看病貴卻絲毫不見緩解，反而有所加劇，習總書記所指出的，正是這一輪醫療衛生體制改革最亟需解決的問題。 相關
CRISPR技術脫靶效應有了解決之道
CRISPR基因編輯技術廣受爭議的最大副作用——脫靶效應有了解決辦法。據物理學家組織網12日報道，CRISPR-Cas9技術發明人之一詹妮弗·杜德納參與的研究團隊證實，抗CRISPR蛋白能將CRISPR導致的脫靶效應降低四分之一，其中一種名叫“AcrllA4”的蛋白甚至能將脫靶效應發生率減少4倍
Nature－Methods：全面檢測CRISPR脫靶效應的新策略
CRISPR/Cas9基因組編輯目前正應用得如火如荼，但若要轉化到臨床應用，準確檢測脫靶效應則是必不可少的。近日，麻省總醫院的研究人員開發出一種新策略，能夠鑒定全基因組范圍的CRISPR/Cas9脫靶突變。 之前，在全基因組范圍鑒定脫靶效應的細胞方法也時有報道，但這些方法可能錯過低頻率的脫靶突
CRISPR實驗指南：如何檢測CRISPR脫靶突變（一）
張鋒實驗室的一位研究生：Winston Yan的項目就是利用CRISPR-Cas9基因組編輯系統的一個突變來敲除調控小鼠膽固醇的基因。“最終的目的是為治療應用鋪平道路，”Yan說，他最近完成了他的研究生工作，同時也第一次遇到CRISPR脫靶效應的問題。 CRISPR能幫助研究人員快速有效地對基
CRISPR女王最新發現：一種抗CRISPR蛋白能減少脫靶效應
去年12月，兩組科學家發表了幾種可以阻斷CRISPR-Cas9活性蛋白質的重要發現，而7月12日，研究人員又再次指出，利用其中的一種抗CRISPR蛋白能減少Cas9介導的人類細胞基因組編輯中的脫靶效應。 這一研究成果公布在Science Advances雜志上，由美國加州大學伯克利分校Je
CRISPR女王最新發現：一種抗CRISPR蛋白能減少脫靶效應
去年12月，兩組科學家發表了幾種可以阻斷CRISPR-Cas9活性蛋白質的重要發現，而7月12日，研究人員又再次指出，利用其中的一種抗CRISPR蛋白能減少Cas9介導的人類細胞基因組編輯中的脫靶效應。 這一研究成果公布在Science Advances雜志上，由美國加州大學伯克利分校Jenn
DISCOVERSeq檢測CRISPR脫靶效應的新方法
自從CRISPR基因組編輯技術于2012年發明以來，它已經顯示出治療許多難治性疾病的巨大希望。然而，科學家們一直在努力在治療相關的細胞類型中鑒定潛在的脫靶效應，這仍然是將治療方法轉移到臨床應用的主要障礙。如今，在一項新的研究中，來自美國加州大學伯克利分校、加州大學舊金山分校、格拉德斯通研究所和瑞
三篇Nature子刊：如何克服CRISPR的脫靶效應
規律成簇的間隔短回文重復CRISPR與內切酶Cas9的組合，原本是細菌抵御病毒的重要武器，現在這一組合已經成為了一個通用工具，被用于在真核生物中進行位點特異性的基因組修飾。 最近Nature Biotechnology雜志上發表了三個研究團隊的研究成果，研究人員深入分析了CRISPR的脫靶效應
Nature?Methods：兩種新型?CRISPR?脫靶效應的分析方法
昨日，在 Nature Methods 同時刊登的兩篇研究中，發表了兩種分析 CRISPR/Cas -9 基因組編輯脫靶效應的新方法。其中一種方法可以鑒定細胞類型特異性 SNP 相關的脫靶突變，另一種則可以檢測潛在脫靶切割位點。 第一項研究中，來自麻省綜合醫院（MGH）和哈弗大學的研究人員開發
Editas創始人再破“脫靶效應”，向精準CRISPR時代邁進！
在CRISPR系列的基因編輯系統中，Cas9酶是一個非常關鍵的組成部分，更是“元老級”的成員，但是CRISPR/Cas9的脫靶效應是一直急需攻克的難題。在CRISPR技術向醫學臨床不斷轉化的過程中，科學家們正想法設法的解決這一重大技術難題，希望形成更精準的基因編輯系統。 1月6日，發表在《自然
CRISPR導致突變－從而大范圍“脫靶”？
CRISPR基因編輯會導致數以百計意想不到的突變？5月30日，《自然-方法》刊登的一篇通信文章顯示，來自美國哥倫比亞大學等研究機構的科學家確認通過CRISPR基因編輯技術成功修復了導致兩只小鼠失明的基因后，經全基因組測序發現小鼠體內有超過1500個單核苷酸發生突變，并有百個以上的位點發生發生了大片段
DISCOVERSeq，一種檢測CRISPR脫靶效應的新方法
自從CRISPR基因組編輯技術問世以來，它已經顯示出了治療許多棘手疾病的巨大希望。然而，科學家們一直在努力確定與治療有關的細胞類型的潛在非靶向效應，這仍然是臨床轉化的主要障礙。現在，Gladstone研究所和創新基因組學研究所（IGI）的一組科學家與AstraZeneca合作開發了一種可靠的方法
完美基因編輯:－新方法可消除CRISPRCas的脫靶效應
前段時間，麻省理工的研究人員發現基因編輯工具CRISPR-Cas系統具有脫靶效應。近日，這個研究小組的負責人張峰教授表示，他們已經找到了影響CRISPR-Cas系統精確度的關鍵因素，這一發現將使該系統在人類細胞中的應用更安全。目前，這一研究發表在Nature Biotechnology上。
Science：張鋒再發重大突破，新成果“劍指”CRISPR脫靶效應！
2015年，基因編輯這個詞可謂是最活躍的科技詞匯之一；CRISPR作為最受歡迎的基因編輯神器更是突破不斷。雖然今年它最終沒能摘得諾獎，但是技術的一次次更新和突破讓科學界根本無法忽視這一技術的巨大實力和無限潛力。 Cas9酶是基因編輯系統中一個非常關鍵的組成部分，而脫靶效應一直是CRISPR技術
證實CRISPR/Cpf1基因組編輯幾乎沒有脫靶效應
作為CRISPR基因組編輯的新工具，Cpf1因其不同于Cas9的性質而引起人們的廣泛關注。它只需要單個RNA，即crRNA（CRISPR RNA），因而組裝更加簡單；它的交錯切割模式可能促進利用所需的序列替換現有的DNA序列；它識別富含胸腺嘧啶的DNA序列，而且相對于Cas9識別的富含鳥嘌呤的序
基因編輯新進展:－關鍵酶消除CRISPRCas技術脫靶效應
近來全球興起的CRISPR-Cas編輯技術是基于細菌和古細菌天然防御機制的一項技術。與真核生物體內的RNA干擾過程極為相似，CRISPR-Cas 技術能夠特異性切割核酸片段，不過該技術也有可能發生非特異性切割，引起基因組非靶向位點的突變，這一問題越來越受到科研人員的關注。 CRISPR
研究發現CRISPRCas9在非人靈長類中不會導致明顯脫靶效應
CRISPR-Cas9基因編輯系統已被廣泛應用于生物和醫學研究，研究人員正在嘗試利用它進行人類疾病的基因治療，然而，它在臨床前的安全性方面還缺少全面評估。記者從中科院昆明動物研究所了解到，近期該所多個課題組合作，發現這一基因編輯系統在非人靈長類中不會導致明顯脫靶效應，因而有較高安全性。研究成果發
CRISPRCas9基因編輯系統在靈長類中不會導致明顯脫靶效應
CRISPR-Cas9基因編輯系統已被廣泛應用于生物和醫學研究，研究人員正在嘗試利用這一系統進行人類疾病的基因治療。然而，CRISPR-Cas9系統在臨床前的安全性卻缺少全面的評估。之前有研究表明，CRISPR-Cas9系統在小鼠中會造成大量脫靶突變。此外，對細胞系的研究發現，Cas9編輯細胞的
哈佛大學實驗室發現CRISPR/Cas9存在嚴重脫靶效應
哈佛大學David R Liu實驗室利用體外篩選和高通量測序檢測CRISPR/Cas9的脫靶，針對CLTA基因的四個不同靶位點共設計了八條不同序列的gRNA，即每個靶位點有兩條gRNA，結果發現，四個靶位點均存在脫靶現象，脫靶效率最高可達 84%，同時CRISPR/Cas9的特異性僅與g
本周Science期刊發布－檢測CRISPR脫靶效應新方法DISCOVERSeq
本周又有一期新的Science期刊（2019年4月19日）發布，它有哪些精彩研究呢？讓小編一一道來。圖片來自Science期刊。 1.Science：開發出一種檢測CRISPR脫靶效應的新方法---DISCOVER-Seq doi:10.1126/science.aav9023； doi:1
科學家掌握了識別CRISPR基因編輯造成的靶標外損傷新方法
自從CRISPR基因組編輯技術問世以來，它已經顯示出了治療許多棘手疾病的巨大希望。然而，科學家們一直在努力確定與治療有關的細胞類型的潛在非靶向效應，這仍然是臨床轉化的主要障礙。現在，Gladstone研究所和創新基因組學研究所（IGI）的一組科學家與AstraZeneca合作開發了一種可靠的方法
全基因組測序揭示CRISPR－/－Cas9在葡萄上的脫靶效應
近日，Horticulture Research在線發表了西北農林科技大學葡萄種質資源與育種團隊王西平課題組題為“Whole genome sequencing reveals rare off-target mutations in CRISPR/Cas9-edited grapevine”的
應用慢病毒載體檢測CRISPRCAS9和TALEN脫靶
近日，國際生物學期刊nature biotechnology在線刊登了美國科學家的一項最新研究成果，他們應用整合酶缺陷的慢病毒載體（IDLV）檢測CRISPR-CAS9和TALEN對基因組造成的脫靶效應，最低可檢測1%的脫靶頻率。這項研究或對推廣CRISPR-CAS9和TALEN技術，保證基因操
盤點全基因組檢測CRISPR脫靶位點的幾種重要技術
在2013年，來自麻省總醫院的研究人員發現使用CRISPR-Cas RNA引導性核酸酶的一個重要局限：會在預期靶點以外的位點上生成多余的DNA突變。此后陸續有研究直接說明了CRISPR/Cas9存在嚴重的脫靶性，即該技術可以發生非特異性切割，引起基因組非靶向位點的突變，這樣會造成研究結果的不確定
CRISPR大范圍“脫靶”？可能還需要進一步驗證
來源：Pixbay編者按：CRISPR基因編輯會導致數以百計意想不到的突變？5月30日，《自然-方法》刊登的一篇通信文章顯示，來自美國哥倫比亞大學等研究機構的科學家確認通過CRISPR基因編輯技術成功修復了導致兩只小鼠失明的基因后，經全基因組測序發現小鼠體內有超過1500個單核苷酸發生突變，并有百個
CRISPR的前世今生：酸奶中的CRISPR
兩年前，一個縮寫為CRISPR（clustered regularly interspaced short palindromic repeats，規律間隔成簇短回文重復序列）的基因編輯工具橫空出世，席卷了許多實驗室。而在這一系統被開發的數億年前，細菌和古細菌就利用其非常精確的對幾乎每個基因組中
CRISPR的前世今生：酸奶中的CRISPR
兩年前，一個縮寫為CRISPR（clustered regularly interspaced short palindromic repeats，規律間隔成簇短回文重復序列）的基因編輯工具橫空出世，席卷了許多實驗室。而在這一系統被開發的數億年前，細菌和古細菌就利用其非常精確的對幾乎每個基因組中
CRISPR專家發表CRISPR/Cas9綜述
CRISPR技術的確在科學界掀起了基因組編輯的狂潮。在Pubmed中快速檢索“CRISPR”，目前已有1400多項結果。也相繼有專家為該技術撰寫了綜述論文，例如：Science綜述：CRISPR-Cas9系統的歷史和未來；北大魏文勝最新發表CRISPR綜述。 最近，來自美國加州大學伯克利分校和
CRISPR女王：她的生命被CRISPR照亮
一位多年來埋頭于實驗室枯燥生活的微生物學家，突然有一天由于基因編輯技術站在了聚光燈下 現年48歲的Emmanuelle Charpentier在過去二十年學術生涯中輾轉去過了5個國家九所不同的研究院，“我總是不得不從零開始，親自構建新的實驗室，”她說。45歲之前Charpentier還無法雇
NatureMethods發布CRISPR新技術：CRISPRX
斯坦福大學遺傳學系，藥理學系的幾位學者合作，開發出了一種為原位蛋白質工程重利用體細胞超突變的新技術――? CRISPR-X ，這將能幫助科學家們創建復雜的原始遺傳突變文庫，分析完善蛋白質工程。這一研究成果在線公布在10月31日的Nature Methods雜志上，文章的通訊作者是斯坦福大學Micha