CRISPR實驗指南:如何檢測CRISPR脫靶突變(一)
張鋒實驗室的一位研究生:Winston Yan的項目就是利用CRISPR-Cas9基因組編輯系統的一個突變來敲除調控小鼠膽固醇的基因。“最終的目的是為治療應用鋪平道路,”Yan說,他最近完成了他的研究生工作,同時也第一次遇到CRISPR脫靶效應的問題。 CRISPR能幫助研究人員快速有效地對基因組進行有針對性的切割。它的特異性和易用性使其成為了頗具潛力的工具,可用于去除缺陷基因,治療遺傳疾病或癌癥,編輯作物的基因組增加其產量或抗病性等。 然而,研究人員也首先必須克服CRISPR的主要限制之一:不僅在其目標位置切割,而且在具有相似序列的非預期位置上也會進行切割。這些脫靶切割可能發生在整個基因組中,導致產生損害細胞功能或直接殺死細胞的有害突變。 要想研發檢測CRISPR脫靶突變的方法并不容易,但在過去幾年中,研究人員提出了各種新方法。The Scientist雜志最新介紹了這些方法。 計算機模擬預測與無偏差檢測 CRI......閱讀全文
CRISPR/Cas9抗體—CRISPR/Cas9研究
能夠方便而精確的對DNA和核苷酸序列進行編輯,是科研工作者們長期以來的夢想。CRISPR/Cas9系統的誕生和成熟標志這這一夢想逐漸變為現實。CRISPR/Cas9系統,作為第三代基因編輯技術,它的本質其實是細菌中一種對付諸如病毒等外來DNA的防御系統。此系統的工作原理是 成簇的、規律間隔的短回
CRISPR/Cas9-技術介紹
優秀的基因編輯技術CRISPR/Cas9基因編輯技術深受研究人員的喜愛,那么它為什么如此優秀呢?CRISPR(Clustered regularly interspaced short palindromicrepeats)規律成簇間隔短回文重復;Cas9(CRISPR associated nuc
crispr-cas9基因敲除原理
基本原理:CRISPR簇是一個廣泛存在于細菌和古生菌基因組中的特殊DNA重復序列家族,其序列由一個前導區(Leader)、多個短而高度保守的重復序列區(Repeat)和多個間隔區(Spacer)組成。前導區一般位于CRISPR簇上游,是富含AT長度為300~500bp的區域,被認為可能是CRISPR
什么是CRISPR/Cas9技術
CRISPR/Cas9系統的原理是利用gRNA特異性識別靶序列,并引導Cas9核酸內切酶對靶序列的PAM上游進行切割,從而造成靶位點DNA雙鏈斷裂,隨之利用細胞的非同源末端連接(NHEJ)或同源重組(HDR)的方式對切割位點進行修復,實現DNA水平的基因敲除、敲入或點突變。
crispr-cas9基因敲除原理
基本原理:CRISPR簇是一個廣泛存在于細菌和古生菌基因組中的特殊DNA重復序列家族,其序列由一個前導區(Leader)、多個短而高度保守的重復序列區(Repeat)和多個間隔區(Spacer)組成。前導區一般位于CRISPR簇上游,是富含AT長度為300~500bp的區域,被認為可能是CRISPR
什么是CRISPR/CAS9技術
CRISPR/Cas9(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)是最新出現的一種由RNA指導的Cas9核酸酶對靶向基因進行編輯的技術。CRISPR/Cas9是細菌和古細菌為應對病毒和質粒不斷攻擊而演化來的獲得性免疫防御機制。
什么是CRISPR/CAS9技術
CRISPR/Cas9(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)是最新出現的一種由RNA指導的Cas9核酸酶對靶向基因進行編輯的技術。CRISPR/Cas9是細菌和古細菌為應對病毒和質粒不斷攻擊而演化來的獲得性免疫防御機制。
什么是CRISPR/Cas9技術
CRISPR/Cas9系統的原理是利用gRNA特異性識別靶序列,并引導Cas9核酸內切酶對靶序列的PAM上游進行切割,從而造成靶位點DNA雙鏈斷裂,隨之利用細胞的非同源末端連接(NHEJ)或同源重組(HDR)的方式對切割位點進行修復,實現DNA水平的基因敲除、敲入或點突變。
CRISPR專家發表CRISPR/Cas9綜述
CRISPR技術的確在科學界掀起了基因組編輯的狂潮。在Pubmed中快速檢索“CRISPR”,目前已有1400多項結果。也相繼有專家為該技術撰寫了綜述論文,例如:Science綜述:CRISPR-Cas9系統的歷史和未來;北大魏文勝最新發表CRISPR綜述。 最近,來自美國加州大學伯克利分校和
Cell:CRISPR/Cas9再獲重要突破
Whitehead研究所的科學家們首次對頂復門(Apicomplexa)生物進行了全基因組篩選。這項重要的研究成果于九月二日發表在Cell雜志上。頂復門的單細胞寄生蟲會引起瘧疾、巴貝斯蟲病、隱孢子蟲病和弓形蟲病,但我們對這些家伙還知之甚少。 “我們一直沒什么辦法研究頂復門寄生蟲所有基因的功能,
crispr/cas9的技術優缺點
CRISPR (Clustered Regularly Interspersed Short Palindromic Repeats)是細菌用來抵御病毒侵襲/躲避哺乳動物免疫反應的基因系統。科學家們利用RNA引導Cas9核酸酶可在多種細胞(包括iPS)的特定的基因組位點上進行切割,修飾。 Rudol
crispr/cas9的技術優缺點
CRISPR (Clustered Regularly Interspersed Short Palindromic Repeats)是細菌用來抵御病毒侵襲/躲避哺乳動物免疫反應的基因系統。科學家們利用RNA引導Cas9核酸酶可在多種細胞(包括iPS)的特定的基因組位點上進行切割,修飾。 Rudol
Science:CRISPR/Cas9大革命
??????? DNA編輯技術CRISPR近年來風生水起,已經開始取代了其它基因組編輯工具,如鋅指核酸酶和 TALENs等。不過目前科學家們對于這一技術中的RNA引導核酸內切酶:Cas9了解的還不夠多,如果能更精確的掌握這種酶在CRISPR系統中如何發揮作用的,將能提高這一技術的使用效率和
crispr/cas9的技術優缺點
CRISPR (Clustered Regularly Interspersed Short Palindromic Repeats)是細菌用來抵御病毒侵襲/躲避哺乳動物免疫反應的基因系統。科學家們利用RNA引導Cas9核酸酶可在多種細胞(包括iPS)的特定的基因組位點上進行切割,修飾。 Rudol
ES打靶和CRISPR/Cas9如何選擇?
近年隨著生物醫藥技術快速迭代,靶向藥物、免疫療法、基因治療等個性化治療方式成為生物藥創新的主要方向。國內企業亦紛紛向生物藥領域挺進或轉型,生物藥市場愈發火熱。 其中,基因編輯嬰兒事件雖然近日被《科學》雜志列入2018年度十大科學突破的負面事件,但從一年前的ZL之爭,到年底基因編輯公司Editas人類
Science發布創新性CRISPR/Cas9技術
利用一種脫氨酶將單核苷酸改變導入DNA中,研究人員創建了一種改進的CRISPR/Cas9工具,它能夠避免生成有害的雙鏈斷裂,減少采用CRISPR/Cas9技術可能引入的附加突變,且不需要添加DNA模板。這項發布在8月4日《科學》(Science)雜志上的新研究工作,是第二次報道這樣的精確基因編輯
ES打靶和CRISPR/Cas9如何選擇?
近年隨著生物醫藥技術快速迭代,靶向藥物、免疫療法、基因治療等個性化治療方式成為生物藥創新的主要方向。國內企業亦紛紛向生物藥領域挺進或轉型,生物藥市場愈發火熱。 其中,基因編輯嬰兒事件雖然近日被《科學》雜志列入2018年度十大科學突破的負面事件,但從一年前的ZL之爭,到年底基因編輯公司E
CRISPR/Cas9驅動的瞬時表達系統
維克森林再生醫學研究所的科學家改進了DNA編輯工具,縮短了編輯蛋白停留在細胞內的時間,他們稱這種新方法為“打了就跑”。 CRISPR技術用于改變DNA序列和改變基因功能,CRISPR/Cas9是一種酶,它像剪刀一樣,在特定位置切割兩條DNA鏈,添加、移除或修復DNA片段,但CRISPR/Cas
CRISPR/Cas9應用近期重大進展
基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一,受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱,Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas最初是在細菌體內發現的,是細菌用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防御系統。
Nature-Methods發布CRISPR/Cas9新技術
麻州大學醫學院的科學家們開發出了一種新的CRISPR/Cas9技術,其可以精確地在幾乎所有的基因組位點如外科手術般編輯DNA,同時避免標準CRISPR基因編輯技術中看見的一些潛在的有害脫靶改變。通過配對CRISPR/Cas9系統與一個可編程的DNA結合結構域(CRISPR/Cas9-pDBD),
ES打靶和CRISPR/Cas9如何選擇?
近年隨著生物醫藥技術快速迭代,靶向藥物、免疫療法、基因治療等個性化治療方式成為生物藥創新的主要方向。國內企業亦紛紛向生物藥領域挺進或轉型,生物藥市場愈發火熱。 其中,基因編輯嬰兒事件雖然近日被《科學》雜志列入2018年度十大科學突破的負面事件,但從一年前的ZL之爭,到年底基因編輯公司E
Nature-Methods:Cas9大有潛力
提到目前最熱門的基因組編輯工具,非CRISPR/Cas莫屬。今年以來,國內外多個研究小組聚焦這一領域,在Science、Nature和Cell等雜志上發表多項重要成果,而生物公司也迅速推出相關產品。 CRISPR/Cas系統經過改造,可實現多個哺乳動物系統內高效可靠的RNA導向基因組修飾,
用CRISPR/cas9編輯精原細胞基因
利用CRISPR/Cas9 系統對胚胎進行基因編輯,可有效地產生具有靶向基因組修飾的生物體。三月十二日在Cell子刊《Cell Reports》發表的一項研究中,來自德克薩斯大學西南醫學中心、芝加哥大學和猶他大學等處的研究人員,用CRISPR / cas9技術對大鼠的精原細胞進行基因編輯,為在大
利用CRISPR/Cas9來攻克乙肝
在一項新研究中,麻省理工學院的研究人員利用CRISPR/Cas9 系統,對受到感染的哺乳動物肝細胞進行基因組編輯,從中刪除了乙肝病毒(HBV)DNA。根據發表在《Scientific Reports》雜志上的研究結果,該研究小組靶向切割了HBV病毒共價閉合環狀DNA(cccDNA)的一些特異位點
教你學會-CRISPR-Cas9-基因敲除技術
CRISPR/Cas 是進行基因編輯的強大工具,可以對基因進行定點的精確編輯。在向導 RNA(guide RNA, gRNA)和 Cas9 蛋白的參與下,待編輯的細胞基因組 DNA 將被看作病毒或外源 DNA,被精確剪切。一、尋找目的基因的靶標使用在線設計網站 CRISPR direct,如需直接復
CRISPR/Cas9技術,熱度背后的冷思考
近年來,CRISPR/Cas9基因編輯技術正在給整個科研界帶來革命性變化,該技術使用CRISPR系統將Cas9蛋白和向導RNA注入小鼠受精卵,就能輕松實現基因敲除,同時,注入Donor DNA則可實現基因敲入,甚至國際著名學術期刊Genome Biology有文章指出這項新技術將很快取代使用胚胎
基因編輯CRISPR/Cas9新技術路在何方?
CRISPR/Cas9這項新技術使人們能更精準地對DNA代碼進行控制,引發了遺傳學和細胞生物學領域的革新,科學家們對它寄予厚望,希望借助它的力量,治療包括癌癥在內的疾病并進一步解開人類細胞身上籠罩的謎團。 但這一基因編輯技術也引發了科學家們的憂慮。據美國趣味科學網站報道,有科學家擔心,這一新工
首個CRISPR/Cas9靶序列數據庫
近期,來自美國國立衛生研究院和瑞典烏普薩拉大學的研究人員,在國際著名學術期刊《Nucleic Acids Research》上發表的一項研究中,首次提出了一個已在斑馬魚中經過實驗驗證的CRISPR/Cas9靶序列數據庫。 CRISPR及CRISPR相關蛋白(Cas9),是在古細菌和細菌中發現的
CRISPR/Cas9-技術,熱度背后的冷思考
近年來,CRISPR/Cas9 基因編輯技術正在給整個科研界帶來革命性變化,該技術使用 CRISPR 系統將 Cas9 蛋白和向導 RNA 注入小鼠受精卵,就能輕松實現基因敲除,同時,注入 Donor DNA 則可實現基因敲入,甚至國際著名學術期刊 Genome Biology 有文章指出這
crispr/cas9到底是什么東西
最近幾年基因編輯技術異常火爆,CRISPR/Cas9技術面世以后,彌補了傳統基因編輯技術的諸多不足,使得基因的“任意編輯”變得越來越容易。也因此,CRISPR/Cas9技術當仁不讓的成為基因編輯技術的“王牌”,大有一副取而代之的勢頭。所以這里就給大家簡單介紹一下CRISPR/Cas9的技術原理!一、