古DNA研究對東亞豹母系遺傳歷史提出新見解

　　1月15日，中國科學院古脊椎動物與古人類研究所、西北大學和湖南省文物考古研究院共同主導完成的題為《古DNA準確鑒定湖南老司城遺址殘缺頭骨以及東亞豹母系遺傳歷史新見解》（Ancient DNA unravels species identification from Laosicheng site, Hunan Province, China, and provides

　　insights into maternal genetic history of East Asian leopards）的研究論文，在線發表在《動物學研究》（Zoological

　　Research）上。該研究針對湖南老司城遺址兩個具有鑒定爭議的動物頭骨，開展了古DNA數據獲取，獲取了2例線粒體基因組數據。研究通過形態學（CT掃描三維重建）和分子生物學方法，將這兩個動物頭骨鑒定為華北豹。進一步的研究發現，東亞豹可以明確劃分為東北豹、華北豹和華南豹三個主要亞群（圖1）。這一成果為考古遺址中哺乳動物遺骸的準確鑒定提供了一個形態學和遺傳學方法相結合的范例，并對探索東亞地區豹的母系遺傳歷史具有重要意義。

　　老司城遺址位于湖南湘西土家族苗族自治州，是南宋紹興五年（1135年）至清雍正二年（1724年）永順彭氏土司的政治、經濟、軍事、文化的中心。該考古遺址出土了大量動物骨骼，為探討清代中期以前該地區動物群體組成提供了機會。在發現的1萬多例可鑒定骨骼標本中，有2例殘缺的哺乳動物頭骨存在較大爭議。

　　該研究運用micro-CT技術，對殘缺頭骨進行掃描并對形態數據進行分析。結果表明，2個動物頭骨的聽泡和乳突特征與貓科（Felidae）動物的形態特征存在高度相似性。因此，CT掃描結果認為這兩個頭骨應歸屬于貓科動物。然而，由于頭骨的殘缺，形態學鑒定無法做出進一步明確的物種鑒定結果。在這種情況下，科研人員利用古DNA方法獲取了2個頭骨樣品的高質量線粒體全基因組數據。系統發育和遺傳距離分析的結果均顯示，這2個動物頭骨來自于華北豹（Panthera

　　pardus

　　japonensis）（圖1、2、3）。

　　此前，國際自然保護聯盟貓科動物專家組將華北豹劃歸到東北豹（P. p. orientalis）。而本研究顯示東亞地區的東北豹、華北豹和華南豹（P.

　　p.

　　delacouri）被明確劃分為三個不同的亞群，且分別與東亞北部、中部和南部的地理位置相對應（圖1）。研究通過線粒體基因組數據的突變率推算發現，東北豹、華北豹和華南豹的分化時間約為15.5萬年前。上述成果為東亞地區豹的母系遺傳歷史提供了新見解。

　　考古學證據表明，在約600-300年前，湖南老司城遺址周邊的豹種群相當豐富，與現今豹種群的分布存在較大差異。種群歷史分析表明，豹的有效種群規模在過去3萬年中一直呈下降趨勢。過去幾個世紀以來，豹種群的快速下降則更可能是受到人類活動的影響。

　　研究工作得到國家自然科學基金、國家重點研發計劃和中國科學院等的支持。