全球首個奶牛多組織單細胞表達圖譜誕生
中國農業大學動物科學技術學院教授孫東曉團隊構建了覆蓋奶牛59種組織、179萬個細胞的多組織單細胞表達圖譜,為解析牛重要性狀遺傳調控機制、推進精準育種及探索人類疾病的牛模型研究提供了重要資源。9月5日,相關研究成果發表于《自然-遺傳》。作為人類最早馴化的家畜之一,奶牛在全球糧食安全與農業生態系統中占據關鍵地位。傳統研究多聚焦于組織層面的轉錄組分析,難以揭示細胞異質性對奶牛產奶、繁殖、抗病等重要性狀的調控作用。本研究突破技術瓶頸,采用單細胞轉錄組測序技術,對1頭荷斯坦奶牛胎兒、4頭犢牛和10頭成年荷斯坦奶牛(含公牛、母牛)的59種組織進行深度測序,最終篩選出179萬個高質量細胞,成功注釋出131種細胞類型,涵蓋免疫細胞、內皮細胞、上皮細胞、基質細胞、神經細胞、肌肉細胞和生殖細胞7大細胞譜系。團隊深入分析乳腺上皮細胞,發現乳腺上皮細胞分為8個亞型。其中6個腔分泌細胞亞型高表達 ELF5、LTF 等標記基因,ME0-3亞型因高表達泌乳相......閱讀全文
全球首個奶牛多組織單細胞表達圖譜誕生
中國農業大學動物科學技術學院教授孫東曉團隊構建了覆蓋奶牛59種組織、179萬個細胞的多組織單細胞表達圖譜,為解析牛重要性狀遺傳調控機制、推進精準育種及探索人類疾病的牛模型研究提供了重要資源。9月5日,相關研究成果發表于《自然-遺傳》。作為人類最早馴化的家畜之一,奶牛在全球糧食安全與農業生態系統中占據
花生莖稈單細胞基因表達圖譜構建成功
廣東省農業科學院作物研究所花生遺傳育種團隊在國家重點研發計劃、國家自然科學基金等項目的資助下,成功攻克了花生莖稈單細胞基因表達圖譜構建的技術難題。近日,相關成果在線發表于《植物生物技術雜志》(Plant Biotechnology Journal)。花生莖稈單細胞基因表達圖譜構建。研究團隊供圖
首個豆科植物根尖單細胞表達圖譜繪制成功
?百脈根單細胞圖譜細胞類型。中國農科院供圖 近日,中國農業科學院生物技術研究所作物生物技術育種創新團隊與國內其他科研單位合作,共同繪制完成首個豆科植物百脈根的根尖單細胞表達圖譜,鑒定出根尖的主要細胞類型,發現了新的細胞類型特異基因,并分析了各個細胞類型的潛在功能,對研究豆科植物根系發育、結瘤固氮
北京生科院建立單細胞環形RNA分析技術及表達圖譜
環形RNA是一類在真核細胞中廣泛存在的內源性非編碼RNA分子,在生物體發育過程中發揮重要作用。之前研究已在不同物種中鑒定出數百萬個環形RNA分子,并產生了大量用于揭示生物體組織表達模式的環形RNA數據資源。然而,由于大多數環形RNA表達量較低,傳統的轉錄組測序方法無法表征單個細胞環形RNA表達譜
北京基因組所發布癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM
近日,中國科學院北京基因組研究所(國家生物信息中心)國家基因組科學數據中心開發的癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM上線。該研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cance
北京基因組所發布癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM
近日,中國科學院北京基因組研究所(國家生物信息中心)國家基因組科學數據中心開發的癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM上線。該研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human can
暨南大學報道-造血干細胞發育單細胞lncRNA動態表達圖譜
來自暨南大學基礎醫學院蘭雨課題組、中國醫學科學院基礎醫學研究所余佳課題組、軍事醫學科學院附屬醫院(現為解放軍總醫院第五醫學中心)劉兵課題組合作發表研究論文“Combined Single-Cell Profiling of lncRNAs and Functional Screening Re
充滿差異的單細胞蛋白表達
哈佛大學謝曉亮小組的最新研究結構顯示,蛋白的數量(綠色)與mRNA的數量(紅色)在各個細胞中有很大差異。 科學家們近日首次實現了對物種在整個表達譜范圍內的蛋白表達噪聲測量。該項成果是單分子技術與系統生物學交互融合的典范,預示了單細胞基因表達分析時代的來臨。 在基因表達研究領域,傳
《自然》發布重要單細胞RNA圖譜:首張小腸細胞圖譜
我們腸道上皮是人體內多樣性最高,最具活力的組織之一, 作為機體與外界的主要界面之一,組成了一個細胞的生態系統。為了更好地理解這些復雜的組織及其功能,還有影響它的疾病,麻省理工學院、哈佛大學和麻省總醫院研究人員領導的一個研究團隊通過分析從小鼠腸道或腸道類器官中取樣的5.3萬多個單獨的細胞,完成了一
Nature重要論文:大型基因表達圖譜
來自艾倫腦科學研究所的科學家們在最新出版的《自然》(Nature)雜志上報告稱證實人類大腦具有一致的遺傳藍圖,且擁有巨大的生物化學復雜性。這些研究結果來自于對“艾倫人腦圖譜庫”(Allen Human Brain Atlas)公開提供的大量數據集的首次深入大規模分析。 這項研究的結果是基于對“艾
《細胞》:單細胞測序助力基因重組圖譜
來自斯坦福大學醫學院等處的研究人員發表了題為“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章,首次公布了來自一個成人男子91個
人類腎臟最詳盡單細胞圖譜繪制
來自美國費城兒童醫院及賓夕法尼亞大學佩雷爾曼醫學院的科學家,成功繪制出人類腎臟最詳盡的單細胞圖譜,以前所未有的水平捕捉了健康和患病腎臟的復雜性,并在病程早期預測了慢性腎病(CKD)的進展。最新研究有望為CKD患者提供更好的診斷和精確的治療。相關論文發表于近日出版的《自然·遺傳學》雜志。研究示意圖。圖
Science:新型單細胞基因表達檢測技術
發表在最新一期《科學》(Science)雜志上的一篇研究論文,證實了一種新型的大規模平行測序技術可借助于新一代測序(NGS)在單細胞水平上檢測基因表達。 論文作者、來自Cellular Research, Inc公司的Christina Fan博士、Glenn Fu博士以及Stephen Fo
大規模單細胞測序構建第一個人腦神經元表達圖譜
這項研究開發了首個方法用于人類大腦神經性元不同亞型的鑒定,奠定了"繪制"人腦神經元細胞基因活性方法的基礎;同時,可以幫助我們更好的理解人腦正常功能及疾病異常,包括阿爾茨海默氏癥、帕金森癥、精神分裂癥和抑郁癥等。通過分離和對單個人類大腦神經元細胞核進行單細胞核轉錄組測序,研究人員在人腦的六個高級功
建立莖尖細胞特異基因表達圖譜
基因差異表達是細胞分化和不同細胞類型形式特異功能的基礎。細胞特征的轉錄圖譜對于了解不同類型細胞如何生長發育、響應環境至關重要。但植物細胞由細胞壁固著,不易分離,很難獲得細胞類型特異的轉錄數據。 中國科學院遺傳與發育生物學研究所焦雨鈴研究組在之前的工作中建立了器官邊界區的細胞特異表達圖譜 (Ti
大腦完整基因表達圖譜和神經元聯系圖譜繪制完成
繼美國總統奧巴馬宣布“推進創新神經技術腦研究計劃”(簡稱BRAIN計劃或腦計劃)一年后,美國科學家成功給“整個大腦”做了圖譜。4月3日出版的英國《自然》雜志發表兩項相關研究,介紹了哺乳動物大腦中完整的基因表達圖譜和神經元聯系圖譜。此次的圖譜對于研究人類大腦發育和神經回路,從而理解人類的行為和認知
Nature:大腦基因表達圖譜和神經元聯系圖譜繪制完成
2013年4月2日奧巴馬政府公布“腦計劃”,現在一年過去,腦計劃出了兩項突破性成果:科學家繪制出哺乳動物大腦中完整的基因表達圖譜和神經元聯系圖譜??????? 在美國總統巴拉克·奧巴馬宣布了“使用先進革新型神經技術的人腦研究”(BRAIN)計劃 1 年后,《自然》雜志于4月3日發表了兩項研究,介
2016值得關注的技術:綜合單細胞圖譜
《Nature Methods》盤點2015年度技術,選出了最受關注的技術成果:單粒子低溫電子顯微鏡(cryo-EM)技術。 除此之外,也整理出了2016年最值得關注的幾項技術,分別為:細胞內蛋白標記(Protein labeling in cells)、細胞核結構(Unraveling nuc
PNAS:單細胞測序繪制大腦的細胞圖譜
斯坦福大學的著名學者Stephen Quake及其同事本周在《美國科學院院刊》(PNAS)上發表文章,介紹了人類腦細胞的單細胞轉錄組測序研究成果。 研究小組對近500個成人或胎兒腦細胞進行了單細胞RNA測序。利用這種方法,他們能夠鑒定出大腦中所有主要的細胞類型,并確定神經元的亞型。他們還觀察了
家蠶絲腺單細胞轉錄組圖譜繪成
中新網重慶6月15日電 (記者 鐘旖)記者15日從家蠶基因組生物學國家重點實驗室(西南大學)獲悉,我國家蠶研究又有新進展。該實驗室徐漢福教授課題組近日在國際知名期刊Nature Communications《自然通訊》上發表相關主題研究論文,以單細胞分辨率揭示了家蠶絲腺的全細胞異質性及其基因轉
水稻多器官單細胞多組學圖譜問世
記者楊舒從中國農業科學院生物技術研究所獲悉,該所作物耐逆性調控與改良創新團隊日前聯合國內外研究機構,構建了首個水稻的多器官單細胞多組學圖譜,系統解析了水稻不同細胞類型的功能及其對復雜性狀的調控作用,有力助力水稻設計育種。相關研究成果近日發表在國際學術期刊《自然》上。 單細胞組學是近年來生命科學
泛癌癥T細胞單細胞圖譜-相關成果發表
北京大學生物醫學前沿創新中心(BIOPIC)、生命科學學院、北京未來基因診斷高精尖創新中心(ICG)張澤民課題組聯合北京大學腫瘤醫院季加孚、步召德課題組以及北京大學第三醫院,在國際期刊Science上發表了題為“Pan-Cancer Single Cell Landscape of Tumor-
人腦血管通路首張單細胞圖譜問世
科技日報北京7月11日電(記者劉霞)由加拿大多倫多大學健康網絡和瑞士蘇黎世大學領導的一個國際研究團隊,成功創建了首張單細胞分辨率的人腦血管系統圖譜。該圖譜涵蓋了大腦從早期發育到成年階段,以及腦腫瘤和腦血管畸形等疾病狀態。這一最新圖譜有望為未來治療相關疾病開辟新途徑。研究成果發表于10日出版的《自然》
人腦血管通路首張單細胞圖譜問世
由加拿大多倫多大學健康網絡和瑞士蘇黎世大學領導的一個國際研究團隊,成功創建了首張單細胞分辨率的人腦血管系統圖譜。該圖譜涵蓋了大腦從早期發育到成年階段,以及腦腫瘤和腦血管畸形等疾病狀態。這一最新圖譜有望為未來治療相關疾病開辟新途徑。研究成果發表于10日出版的《自然》雜志。 在最新研究中,科學家從
人腦血管通路首張單細胞圖譜問世
研究示意圖由加拿大多倫多大學健康網絡和瑞士蘇黎世大學領導的一個國際研究團隊,成功創建了首張單細胞分辨率的人腦血管系統圖譜。該圖譜涵蓋了大腦從早期發育到成年階段,以及腦腫瘤和腦血管畸形等疾病狀態。這一最新圖譜有望為未來治療相關疾病開辟新途徑。研究成果發表于10日出版的《自然》雜志。在最新研究中,科學家
首個海洋生物空間單細胞圖譜獲揭示
記者從深圳華大基因科技有限公司(簡稱“華大”)獲悉,3月29日,中國海洋大學聯合青島華大基因研究院,利用華大自主研發的時空組學技術Stereo-seq,結合單細胞轉錄組測序,以柄海鞘的內柱器官為研究對象,繪制了高質量的空間分辨率單細胞圖譜,全面解析了海洋動物咽部器官的細胞類型和潛在功能特征,為揭示脊
單細胞水平肺癌T細胞免疫圖譜繪就
今天,《自然—醫學》在線發表中國科學家的一項成果,研究通過國際領先的單細胞轉錄組測序技術和生物信息學分析方法,完整刻畫了與非小細胞肺癌相關的T淋巴細胞圖譜,揭示了肺癌T細胞的亞群分類、組織分布特征、腫瘤內群體異質性及藥物靶基因表達情況,鑒定了跨組織分布的T細胞類群及亞群間潛在的狀態轉換關系,為肺
單細胞水平肺癌T細胞免疫圖譜繪就
今天,《自然—醫學》在線發表中國科學家的一項成果,研究通過國際領先的單細胞轉錄組測序技術和生物信息學分析方法,完整刻畫了與非小細胞肺癌相關的T淋巴細胞圖譜,揭示了肺癌T細胞的亞群分類、組織分布特征、腫瘤內群體異質性及藥物靶基因表達情況,鑒定了跨組織分布的T細胞類群及亞群間潛在的狀態轉換關系,為肺
迄今最完整胚胎發育單細胞圖譜發布
科技日報北京8月4日電 (實習記者張佳欣)科學家以果蠅為模型生物,構建了迄今為止最完整、最詳細的動物胚胎發育單細胞圖譜。這一發表在最新一期《科學》雜志上的成果,利用了來自100多萬個各個發育階段的胚胎細胞數據,代表了多個層面的重大進步,有助于科學家探索突變如何導致不同的發育缺陷,以及了解人類基
人類胸腺單細胞圖譜助力腫瘤免疫治療
胸腺是T細胞的分化、發育和成熟的場所,是組成免疫系統的重要器官。到目前為止,還不清楚在整個生命過程中,人體胸腺中的早期免疫前體細胞如何發育為T細胞。盡管已通過各種動物模型對胸腺進行了廣泛的研究,但是還未有詳細的人類胸腺細胞圖譜得以報道。 由來自VIB炎癥研究中心(VIB Center for