新方法可全局性解析“修飾調控酶—底物”互作
近日，中國科學院上海藥物研究所陳小華課題組與譚敏佳課題組合作，利用前期開發的PANAC光點擊化學，發展了一種在活細胞內直接捕捉“修飾調控酶—底物”相互作用的時空可分辨解析新方法，為蛋白質相互作用和蛋白質翻譯后修飾研究提供了新工具。相關研究發表于《自然—通訊》。 精確解析“修飾調控酶—底物”的動態互作對于深入理解蛋白質功能和靶標發現具有重要意義，但利用現有技術直接進行“修飾調控酶—底物”的時空動態全局性解析，尤其對動態和微弱相互作用產生的修飾底物、修飾位點的準確鑒定，非常具有挑戰性。 作為直接捕捉“修飾調控酶—底物”動態互作策略的概念性驗證，研究團隊基于前期發展的化學生物學工具，發展了一種在活細胞中直接捕捉賴氨酸酰基化修飾酶的全局性底物新方法。通過整合酰基化修飾調控酶的催化機制及在酶活性口袋中定點引入的賴氨酸殘基選擇性交聯的非天然氨基酸，研究人員實現了對多種原核系統的賴氨酸修飾調控酶和真核系統的賴氨酸修飾調控酶......閱讀全文
Cell子刊：DNA酶促氧化修飾新調控作用
哺乳動物基因組DNA中5-甲基胞嘧啶(5mC)的動態平衡調節胚胎和成年哺乳動物的神經發生。這種表觀遺傳修飾不僅控制神經前體細胞的增殖和存活，還會影響新生神經元的軸突生長。近期研究發現5mC在體內可以被TET家族蛋白氧化成5-羥甲基化胞嘧啶(5hmC)等形式，而這些氧化修飾在早期胚胎和哺
核酸的修飾酶
The restriction/modification system in bacteria is a?small-scale immune systemfor protection from infection by foreign DNA.?W. Arber and S. Linn (1969
新方法可全局性解析“修飾調控酶—底物”互作
近日，中國科學院上海藥物研究所陳小華課題組與譚敏佳課題組合作，利用前期開發的PANAC光點擊化學，發展了一種在活細胞內直接捕捉“修飾調控酶—底物”相互作用的時空可分辨解析新方法，為蛋白質相互作用和蛋白質翻譯后修飾研究提供了新工具。相關研究發表于《自然—通訊》。?精確解析“修飾調控酶—底物”的動態互作
新方法可全局性解析“修飾調控酶—底物”互作
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519752.shtm近日，中國科學院上海藥物研究所陳小華課題組與譚敏佳課題組合作，利用前期開發的PANAC光點擊化學，發展了一種在活細胞內直接捕捉“修飾調控酶—底物”相互作用的時空可分辨解析新方法，為蛋白
新方法可全局性解析“修飾調控酶—底物”互作
近日，中國科學院上海藥物研究所陳小華課題組與譚敏佳課題組合作，利用前期開發的PANAC光點擊化學，發展了一種在活細胞內直接捕捉“修飾調控酶—底物”相互作用的時空可分辨解析新方法，為蛋白質相互作用和蛋白質翻譯后修飾研究提供了新工具。相關研究發表于《自然—通訊》。?精確解析“修飾調控酶—底物”的動態互作
RNA修飾相關酶PCR芯片
應用場景：通過關鍵酶/蛋白的RNA表達變化，確定樣品表型與特定RNA 修飾的聯系 優勢：預制的PCR板,覆蓋68個針對不同RNA修飾的Writers/Erasers/Readers基因。精心優化的引物Tm值均一，并經過了嚴格的預實驗驗證，無須摸索引物設計和測試。工業化生產的高度均一的PCR
修飾酶的基本信息
體內有些酶可在其他酶的作用下，將酶的結構進行共價修飾，而使其在高活性形式和相對較低的活性形式之間互相轉變，這種調節稱為共價修飾調節(covalent modification regulation)，這類酶稱為修飾酶(prosessing enzyme)。例如某些酶的巰基發生可逆的氧化還原，一些酶以
關于修飾酶的相關介紹
體內有些酶可在其他酶的作用下，將酶的結構進行共價修飾，使該酶活性發生改變，這種調節稱為共價修飾調節(covalent modification regulation)，這類酶稱為修飾酶(prosessing enzyme)。 堿性磷酸酶去除5′－P，可防止二分子DNA片段5′端P基團自身空間障
修飾性工具酶功能應用
（一）末端轉移酶（terminal transferase）l 末端轉移酶是一類不依賴于DNA模板的DNA聚合酶。l 特性：該類酶可以在沒有模板鏈存在的情況下，將核苷酸連接到dsDNA或ssDNA的在3’－OH。特別是對于平末端的雙鏈DNA末端加尾十分有用。l 最常見的用途：給外源DNA片段及載體分
修飾酶的基本信息
體內有些酶可在其他酶的作用下，將酶的結構進行共價修飾，而使其在高活性形式和相對較低的活性形式之間互相轉變，這種調節稱為共價修飾調節(covalent modification regulation)，這類酶稱為修飾酶(prosessing enzyme)。例如某些酶的巰基發生可逆的氧化還原，一些酶以
上海藥物所發現賴氨酸丙二酰化的新蛋白修飾及其調控酶
蛋白翻譯后修飾是調控諸多生物學過程和疾病的主要生物學通路之一，因而，蛋白翻譯后修飾通路研究正成為目前新藥研發的重要熱點之一。近日，中科院上海藥物研究所聯合美國芝加哥大學Ben May癌癥研究所趙英明教授實驗室建立的中科院上海藥物所化學蛋白質組學研究中心發現了細胞中賴氨酸丙二酰化的新蛋白修飾及
篩選或驗證RNA修飾直接靶點，研究RNA修飾靶基因的調控...
篩選或驗證RNA修飾直接靶點，研究RNA修飾靶基因的調控機制技術簡介用體外轉錄法標記生物素RNA探針，然后與胞漿蛋白提取液孵育，形成RNA-蛋白質復合物。該復合物可與鏈霉親和素標記的磁珠結合，從而與孵育液中的其他成分分離。復合物洗脫后，通過Western Blot檢測特定的RNA結合蛋白是否與R
關于組蛋白修飾—基因調控的基本介紹
基因表達是一個受多因素調控的復雜過程.組蛋白是染色體基本結構-核小體中的重要組成部分，其N-末端氨基酸殘基可發生乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化、多聚ADP糖基化等多種共價修飾作用.組蛋白的修飾可通過影響組蛋白與DNA雙鏈的親和性，從而改變染色質的疏松或凝集狀態，或通過影響其它轉錄因子與結構基因啟
研究揭示RNA去甲基化酶的氧化還原修飾調控番茄果實成熟機制
活性氧作為重要的信號分子，在植物抵御病原菌侵染、響應逆境脅迫以及維持正常生長發育的多個生物學過程中發揮重要的調控作用。在多種活性氧分子中，過氧化氫具有較長的半衰期，可調控干細胞分化、花粉管伸長、氣孔發育、果實成熟等植物發育過程，但過氧化氫如何與其他信號途徑協同作用，共同調控植物發育過程卻不甚清楚。中
徐國良研究組Cell子刊發現DNA酶促氧化修飾的新調控作用
哺乳動物基因組DNA中5-甲基胞嘧啶(5mC)的動態平衡調節胚胎和成年哺乳動物的神經發生。這種表觀遺傳修飾不僅控制神經前體細胞的增殖和存活，還會影響新生神經元的軸突生長。近期研究發現5mC在體內可以被TET家族蛋白氧化成5-羥甲基化胞嘧啶(5hmC)等形式，而這些氧化修飾在早期胚胎和哺乳動物腦內
什么是酶的共價修飾調節？
是指酶活性因其分子內的某些氨基酸殘基發生共價修飾而發生變化的過程。這種調節方式比別構調節要慢。共價修飾的方式有：磷酸化、腺苷酸化、尿苷酸化、ADP-核糖基化和甲基化，其中磷酸化是最為常見的形式。
研究揭示蛋白β羥基丁酰化修飾關鍵調控因子
近日，中國科學院上海藥物研究所研究員黃河課題組與美國芝加哥大學教授趙英明團隊合作，通過全面分析哺乳動物細胞中的Kbhb底物，系統揭示了新型蛋白動態修飾β-羥基丁酰化（Kbhb）的關鍵調控因子。相關研究成果于2月25日在線發表在Science Advance上。 細胞代謝為生命過程提供能量，同時
蛋白質乙酰化修飾的精細調控
近期，國際著名學術期刊《美國國家科學院院刊》在線發表了中國科學技術大學生命科學學院施蘊渝教授與姚雪彪教授研究組的合作成果，文章標題為EB1 acetylation by P300/CBP-associated factor (PCAF) ensures accurate kinetochore -m
SUMO化修飾調控m6A－RNA甲基化酶METTL3及其催化功能
RNA甲基化是目前最炙手可熱的研究領域，近3個月以來，該方向影響因子10分以上的文章數量竟接近20篇。云序生物曾對RNA甲基化研究方法及思路進行了深度剖析，感興趣的老師可瀏覽云序生物前期公眾號（2018國自然熱點二：RNA甲基化研究深度剖析）。 近三個月高分文章部分列表： 2月28日
修飾酶的組成性質及特點
體內有些酶需在其它酶作用下,對酶分子結構進行修飾后才具催化活性,這類酶稱為修飾酶(modification enzyme)。其中以共價修飾為多見,如酶蛋白的絲氨酸,蘇氨酸殘基的功能基團-OH可被磷酸化,這時伴有共價鍵的修飾變化生成,故稱共價修飾(covalent modification)。由于這種
蛋白酰化修飾調控天然產物生物合成研究取得進展
近期，中國科學院上海藥物研究所譚敏佳課題組與華東理工大學葉邦策課題組合作研究，揭示了蛋白賴氨酸酰化修飾在天然產物的生物合成代謝通路中的調控新機制，研究工作發表在8月Cell Chemical Biology（25(8): 984-995. doi: 10.1016/j.chembiol.2018
關于真核生物的基因調控—修飾作用的介紹
真核細胞修飾 DNA的主要途徑是胞嘧啶(c）在5位上的甲基化反應。5-甲基胞嘧啶通常位于鳥嘌呤（G）的旁邊。可見 GC順序最容易被甲基化。在剛剛完成復制的 DNA分子中只有母鏈（模板鏈）是甲基化的。新生 DNA鏈的甲基化在母鏈的指導下進行。用限制酶進行分析的結果表明在不轉錄的DNA中的GC有 7
最新研究揭示蛋白β羥基丁酰化修飾關鍵調控因子
近日，中國科學院上海藥物研究所研究員黃河課題組與美國芝加哥大學教授趙英明團隊合作，通過全面分析哺乳動物細胞中的Kbhb底物，系統揭示了新型蛋白動態修飾β-羥基丁酰化（Kbhb）的關鍵調控因子。相關研究成果在線發表在Science Advance上。 細胞代謝為生命過程提供能量，同時代謝物可通過
蛋白酰化修飾調控天然產物生物合成研究取得進展
近期,中國科學院上海藥物研究所譚敏佳課題組與華東理工大學葉邦策課題組合作研究,揭示了蛋白賴氨酸酰化修飾在天然產物的生物合成代謝通路中的調控新機制,研究工作發表在8月Cell Chemical Biology（25(8)： 984-995. doi： 10.1016/j.chembiol.2018
揭示RNA－m6A修飾調控抗腫瘤免疫機制
免疫治療是對抗腫瘤的前沿陣地，其治療成功的關鍵是引發針對腫瘤抗原的自發性T細胞反應。許多病人的免疫系統無法有效識別腫瘤抗原，難以引發持續性的T細胞應答并清除腫瘤。研究免疫系統識別腫瘤抗原的分子機制有望發現新型藥物靶點，提高免疫治療效果。 中國科學院北京基因組研究所韓大力團隊與清華大學徐萌團隊、
SUMO化修飾調控m6A－RNA甲基化酶METTL3及其催化功能分子機制
RNA甲基化是目前最炙手可熱的研究領域，近3個月以來，該方向影響因子10分以上的文章數量竟接近20篇。云序生物曾對RNA甲基化研究方法及思路進行了深度剖析，感興趣的老師可瀏覽云序生物前期公眾號（2018國自然熱點二：RNA甲基化研究深度剖析）。 近三個月高分文章部分列表： 2月28日
蒲慕明小組發現泛素連接酶修飾途徑
來自加州大學伯克利分校Helen Wills神經科學研究所等處的研究人員發現了蛋白泛素化途徑中的一種關鍵酶調控的新機制，有助于解釋細胞功能蛋白選擇性降解。這一研究成果公布在《神經元》(Neuron)雜志上。 領導這一研究的是著名的神經生物學家蒲慕明教授，其現任中科院神經科學研究所所長，
組蛋白修飾分工調控基因表達水平和基因表達噪音
基因表達過程依賴于轉錄因子、染色質調控因子和染色質等生物大分子在布朗運動過程中的隨機碰撞，因此，即使是基因型和分化類型完全相同的細胞在相同環境下也存在基因表達的差異，被稱為基因表達噪音。研究基因表達噪音，對研究干細胞增殖分化、個體發育、病原菌的抗藥性以及農作物的穩產有著重要的意義，而其在人類早期
組蛋白修飾調控水稻干旱應答新機制獲揭示
華中農業大學教授熊立仲課題組在《分子植物》在線發表研究論文，揭示了組蛋白單泛素化修飾精細調控水稻干旱應答的新機制，對于探究植物抗旱分子機理和抗旱遺傳改良具有十分重要的意義。 水稻作為主要的糧食作物和科學研究的模式植物，要提高自身抗旱性來增強糧食產量的穩產性，其抗旱應答分子機制研究尤為重要。
何川教授新發Nature綜述：mRNA修飾介導的基因調控
在分子生物學的中心法則中，遺傳信息從DNA、RNA流向蛋白。基因組DNA和組蛋白上都存在可逆的表觀遺傳學修飾，這些修飾可以調控基因的表達，并由此決定細胞的狀態，影響細胞的分化和發育。近年來人們發現，mRNA和其他RNA上也存在類似的調控機制。 N6-methyladenosine（m6A）是真