新研究解析栽培草莓“祖先”基因組圖譜
草莓具有重要的經濟價值和營養價值,現代八倍體栽培草莓起源于兩個八倍體野生種——弗州草莓和智利草莓的種間雜交。近日,中國科學院昆明植物研究所研究員朱安丹課題組深入解析了八倍體草莓的起源和遺傳分化特征。相關成果在線發表于《自然-植物》。 朱安丹表示,由于草莓屬系統發育解析涉及未知的祖先、同源染色體交換和不完全譜系分選等問題,八倍體草莓的二倍體祖先問題至今仍存在較大爭議。此外,八倍體草莓在馴化過程中的亞基因組的同源偏向性表達及轉變模式并不明確。 該研究提出了一套適用于多倍體的ALLHiC迭代掛載流程,構建了兩個八倍體野生草莓——弗州草莓和智利草莓染色體水平的高質量分型基因組。研究人員完成了八倍體草莓亞基因組的分離,并在此基礎上采用不同的分析方法重新追溯了八倍體草莓的二倍體祖先。 研究結果糾正了國外學者在亞基因組分配上的錯誤,并進一步確定森林草莓和飯沼草莓是八倍體草莓現存的二倍體祖先種。研究還探討了八倍體草莓在馴化過程中的同源......閱讀全文
研究解析栽培草莓“祖先”的基因組圖譜
草莓具有重要的經濟和營養價值,現代八倍體栽培草莓起源于兩個八倍體野生種弗州草莓和智利草莓的種間雜交。近日,中國科學院昆明植物研究所研究員朱安丹專題組深入解析了八倍體草莓的起源和遺傳分化特征。相關研究成果在線發表于《自然-植物》。朱安丹表示,由于草莓屬系統發育解析涉及未知的祖先、同源染色體交換和不完全
草莓和可可樹基因組圖譜出爐
據美國物理學家組織網12月26日報道,在26日出版的《自然—遺傳學》雜志上,兩組科學家表示,他們分別解開了野生草莓和克里奧洛可可樹的基因密碼,新發現有助于育種專家培育出品質更高的草莓和可可樹品種。 英國生物工藝學和生物學研究委員會(BBSRC)和其他4個國家的70名研究人員繪制出了野生草莓
首個草莓完整基因組發布
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494423.shtm草莓是薔薇科植物,在世界范圍內被廣泛栽植。其約有25個種,倍性十分豐富,從二倍體到十倍體均有。森林草莓作為草莓二倍體模式種,有很大的研究價值。2018年GigaScience發表了利用
日破譯人工栽培草莓基因組
日本研究人員27日報告說,他們破譯了人工栽培草莓的基因組,這一成果將有助于開發更好看好吃并能抵抗蟲害的新品種草莓。 位于千葉縣木更津市的上總DNA研究所在英國《DNA研究》雜志網絡版上介紹說,研究人員將人工栽培草莓品種“麗紅”的染色體DNA序列分成片段,分析堿基對的排列,并與4種野生草莓進
草莓甜度可控啦-基因組編輯能精細調控草莓糖分含量
無性繁殖植物在農業生產中具有重要地位,但是長期無性繁殖導致性狀多樣性的嚴重匱乏極大阻礙了無性繁殖作物的育種發展。在育種設計中,對數量性狀的精細調控可以避免產生劇烈的性狀變化,并且可以極大豐富性狀多樣性,對推進精準育種有重要意義。基因組編輯技術通過對調控元件的遺傳操作可以實現對數量性狀的改良。對于
Nature-Genetics:多種技術解析草莓基因組
近日,美國密歇根州立大學和加州大學戴維斯分校的研究人員組裝出近乎完整的栽培草莓基因組,并揭示了這種復雜的異源多倍體的起源和進化過程。 一轉眼又到了草莓上市的季節。這種小巧可愛的果實有著酸甜可口的味道,可搭配出各種各樣的美妙滋味。不過,對于草莓的基因組,你又了解多少? 世界各地廣泛種植的鳳梨草
最大動物基因組圖譜——南極磷蝦基因組圖譜破譯
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm ??? Cell官網截圖。黃海水產研究所供圖 ? 日前,由中國水產科學研究院黃海水產研究所聯合青島華大基因研究院、德國阿爾弗雷德?魏格納研究所、澳大利亞聯邦科學
科學家搭建草莓基因組數據庫
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454861.shtm 草莓為薔薇科草莓屬,因芳香多汁、營養豐富受到喜愛,在全國各地均可種植。栽培草莓為異源多倍體,基因組復雜,雜合度高。 2019年,《自然—遺傳學》發表了利用三代測序數據組裝的高
Nature公布大麥基因組圖譜
大麥是世界上最重要的糧食作物之一,17日Nature公布了目前為止最完善的大麥基因組測序圖譜。這項由美國農業部主導的大工程,在德國、日本、芬蘭、澳大利亞、英國、美國和中國科學家們的共同努力下,歷經六年終于取得了重大進展。大麥基因組圖譜將成為人們提高大麥產量、增強大麥抗蟲抗病能力、增加大麥營養價值
幾近完整的高質量草莓參照基因組公布
據英國《自然·遺傳學》雜志25日在線發表的一項研究,美國科學家報告了一個幾近完整的草莓參照基因組。該高質量基因組不但為了解草莓起源和演化歷史提供了新見解,還對未來改善其品種及提高抗病性大有助力。 八倍體栽培種草莓卡姆羅莎有8組染色體,也被稱為花園草莓,因其味美清香而深受喜愛。 此次,美國密歇
草莓基因組研究取得成果-|《自然遺傳學》
《自然-遺傳學》本周在線發表的一篇論文Origin and evolution of the octoploid strawberry genome報告了一個幾近完整的草莓參照基因組。該基因組為了解這一廣受歡迎的水果的起源和演化歷史提供了新見解。八倍體草莓的演化史。Edger et al. 八
首次繪制小麥表觀基因組圖譜
最近,英國利物浦大學的科學家們,對小麥中調節基因活性的遺傳性分子變化,進行了首次全基因組范圍的調查,這可能成為提高作物育種技術的一種新工具。相關研究結果發表在最新一期的《Genome Biology》。延伸閱讀:權威期刊發布首個小麥單體型圖譜。 表觀遺傳標記是一種化學標簽,將自己附著在DNA上
基因組圖譜的方法和意義
中文名稱基因組圖譜英文名稱genomic map定 義展示一種生物全基因組結構的圖譜。按建立圖譜的研究目的方法和精細程度,可以有不同的形式,包括以遺傳學方法建立的遺傳連鎖圖譜,按距離繪出基因位置分布的物理圖譜,經測定核酸序列建立的核苷酸序列圖譜,以及標記出可表達序列的轉錄圖譜等。應用學科生物化學與
首個家雞基因組圖譜繪制完成
西南大學教授徐洛浩課題組以中國特有家雞品系胡須雞為材料,在國際上率先繪制出首個家雞全基因組圖譜。2月13日,相關研究成果以《家雞基因組完成圖的演化分析》為題,發表在美國《國家科學院院刊》上。這是繼去年人類基因組完成圖公布以來,首個發表的脊椎動物基因組完成圖,也是基因組完成圖譜繪制技術首次在經濟動物中
揭秘:帝王蟹的基因組圖譜
科學家成功獲得高質量帝王蟹基因組圖譜 帝王蟹 唐伯平供圖 帝王蟹基因組染色體圖譜 唐伯平供圖 帝王蟹和其他泛甲殼動物的系統演化關系 唐伯平供圖 近日,《分子生態資源》發表了首個歪尾類螃蟹的高質量基因組圖譜,即一種重要經濟蟹類藍帝王蟹(Paralithodes platypus)的基因組
Scientific-Reports:創建首個全面基因組圖譜
近日,澳大利亞加文醫學研究所的研究人揭示身體不同部位脂肪積聚所造成的傷害的驅動因素。他們的一項新研究比較了皮膚下的脂肪細胞和腹部內的有害脂肪,創建了第一個全面的基因組圖譜。該圖譜揭示了在細胞發育早期獨特的特征,不同類型的脂肪似乎“硬捆綁”(hard-wire)在一起。該研究發表于Scientif
小須鯨全基因組圖譜獲破譯
11月25日,韓國海洋科學技術研究所、深圳華大基因研究院等宣布成功破譯了小須鯨全基因組圖譜,并對鯨類獨特生理習性的遺傳學機制進行了分析。相關成果在線發表于《自然—遺傳學》雜志。 人們一直癡迷于海洋生物是如何演化為陸生生物的。鯨類的進化卻反其道而行之,由陸生向水生演化,和陸生偶蹄動物如牛、豬等
玉米基因組更詳細圖譜出爐
美國研究人員12日在《自然》雜志網絡版上發表論文稱,他們利用新一代測序技術對玉米自交系B73進行測序,得到了新的、更詳細的基因組圖譜。研究顯示,玉米具有良好的表型可塑性,不同品系玉米的基因組差異明顯。這意味著在全球氣候環境變化不斷加劇的情況下,玉米仍有巨大的發展空間。 玉米是生物學研究中的重要
老鼠基因組單體型圖譜出爐
美國的研究人員希望通過對15只常用于生物醫藥研究的小鼠的DNA進行研究來幫助科研人員確定出與環境疾病敏感性相關的基因。目前這些數據被存放在了基因變異數據目錄之下,即小鼠基因組單體型圖譜(將染色體分隔成許多小的片段),從而幫助研究人員找出小鼠中影響健康和疾病的基因和遺傳變異。這個單體型圖譜公布在7月2
鐵樹“開花”:蘇鐵喜獲完整基因組圖譜
蘇鐵基因組圖譜研究由來自22個科研機構的65位科學家聯合完成。??蘇鐵目系統發育樹支持現存蘇鐵是在經歷大量滅絕以后,幾次輻射演化的后代。如今蘇鐵有2科10屬。(劉陽供圖)??也許你不熟悉蘇鐵類植物,但你一定聽說過“鐵樹開花”這個成語,比喻事情很難實現。相傳因受蘇東坡青睞,鐵樹得名“蘇鐵”。作為現存最
玉米基因組更詳細圖譜出爐
美國研究人員12日在《自然》雜志網絡版上發表論文稱,他們利用新一代測序技術對玉米自交系B73進行測序,得到了新的、更詳細的基因組圖譜。研究顯示,玉米具有良好的表型可塑性,不同品系玉米的基因組差異明顯。這意味著在全球氣候環境變化不斷加劇的情況下,玉米仍有巨大的發展空間。 玉米是生物學研究中的重要
基因組物理圖譜的主要構架途徑
基因組物理圖譜的構建不需要經過減數分裂的世代群體,可直接利用DNA分子分析,主要有以下三種構建途徑:限制性酶圖譜。利用限制性內切酶構建圖譜,對于DNA分子長度在50kb以下的片段,一般沒有什么困難。而對于大于50kb的DNA分子,可選用稀有切點的內切酶酶切DNA。(1)用識別較多核苷酸的內切酶,如N
OPGEN全基因組圖譜應用系列——鞭蟲全基因組測序
鞭蟲是一種常見的土壤傳播寄生蟲,地理分布廣,感染率高,寄生于人體盲腸,導致人體慢性感染,對人類危害巨大。鞭蟲的全基因組測序研究由著名的桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)完成,發表在世界頂級期刊《Nature Genetics》上。該研究通過對2種不同
草莓季來襲!蓮都23個草莓種植基地草莓檢測結果在此!
現在正值草莓季,蓮都區的草莓已經全面上市,為保障廣大消費者舌尖上的安全,保障蓮都草莓質量安全,蓮都區農業局近期對轄區內23個草莓種植基地,開展質量安全監督抽檢。 都檢查了哪些項目?檢測結果如何?趕緊隨小編一起來看看吧~ 檢測項目 區農業局隨機抽取草莓樣品23批次進行監督抽檢。檢測內容包括:
印度繪制出結核桿菌基因組圖譜
印度科學與工業研究理事會會長布拉姆哈查里近日宣布,印度研究人員成功繪制出了結核桿菌的基因組圖譜,這將有助于研發有效治療結核病的新型藥物。 綜合當地媒體報道,來自印度全國的數百名研究人員參與繪制出了包含4000個基因的結核桿菌基因組圖譜。 據悉,印度將在互聯
草魚全基因組序列圖譜繪制完成
近日,記者從中國科學院水生生物研究所獲悉,該所魚類功能基因組學學科組負責的草魚全基因組序列圖譜繪制完成。該成果由水生生物研究所、中國科學院國家基因研究中心和中山大學等機構合作完成,相關研究成果于5月4日在線發表于《自然—遺傳學》雜志。 據該所研究員汪亞平介紹,該研究采用鳥槍法測序策略,分別對一
新基因圖譜揭示基因組交叉地帶
據英國《新科學家》網站近日報道,美國科學家繪制出了目前世界上最先進的人類基因圖譜,該圖譜能幫助更準確地識別某些影響特定人群的遺傳病根源。 這一基因圖譜發現,西非人后裔的基因中有著歐洲人后裔所沒有的基因重組的高發地帶,這有可能是導致特定人種先天性疾病諸如貧血癥的遺傳學原因。當然
牡蠣全基因組序列圖譜繪制完成
牡蠣基因組部分序列及其分析牡蠣基因組計劃(OGP)團隊成員在深圳華大基因研究院討論項目中國科學院海洋研究所和深圳華大基因研究院簽約儀式牡蠣是產量最大的海水養殖動物 牡蠣養殖 近日,牡蠣基因組計劃(Oyster Genome Project,OGP)項目組宣布,
-首個越南人基因組圖譜繪制完成
越南科學家日前首次成功繪制出一名越南人的基因組圖譜。 越通社報道說,來自河內國家大學下屬科技大學的研究小組1月16日公布了這份基因組圖譜繪制與分析的初步結果。 該研究組主任黎士榮表示,2013年年底,研究小組收到一名越南人的基因組數據,在此基礎上對其進行分析排序,成功繪制出基因組圖譜
歷經13年-小麥基因組圖譜繪制完成
經過13年努力,來自20個國家73個研究機構的200多名科學家終于繪制完成完整的小麥基因組圖譜。這項“里程碑”工作為培育產量更高、營養更豐富、氣候適應性更強的小麥品種奠定基礎。 國際小麥基因組測序協會16日在說,他們以一種叫做“中國春”的小麥遺傳研究模式品種為材料,研究整合了21條小麥染色