構建“整合AIR的序列和結構特征,預測免疫反應”學習框架
適應性免疫受體(AIR,包括 T 細胞受體,TCR;B 細胞受體,BCR)與其同源抗原之間的結構對接是適應性免疫中最基本的過程之一。然而,目前預測 AIR-抗原結合的方法很大程度上依賴于 AIR 的序列衍生特征,忽略了結合親和力所必需的結構特征。 騰訊 AI Lab 的研究人員提出了一個名為 DeepAIR 的深度學習框架,通過整合 AIR 的序列和結構特征來準確預測 AIR 與抗原的結合。 DeepAIR 在預測 TCR 的結合親和力方面實現了 0.813 的 Pearson 相關性,在預測 TCR 和 BCR 的結合反應性方面的接受者操作特征曲線(AUC)下面積中值分別為 0.904 和 0.942。 同時,利用 TCR 和 BCR 庫,DeepAIR 在測試數據中正確識別出每一位患有鼻咽癌和炎癥性腸病的患者。因此,DeepAIR 改進了 AIR-抗原結合預測,促進了適應性免疫的研究。 該研究以「DeepAIR:......閱讀全文
構建“整合AIR的序列和結構特征,預測免疫反應”學習框架
適應性免疫受體(AIR,包括 T 細胞受體,TCR;B 細胞受體,BCR)與其同源抗原之間的結構對接是適應性免疫中最基本的過程之一。然而,目前預測 AIR-抗原結合的方法很大程度上依賴于 AIR 的序列衍生特征,忽略了結合親和力所必需的結構特征。 騰訊 AI Lab 的研究人員提出了一個名為
分泌型免疫球蛋白A的結構特征
IgA在分泌物中主要以二聚體形式存在,SIgA是由十肽組成的免疫球蛋白,來自2個不同的細胞系,沉降系數為11S,它包含2個單體的IgA、1條J鏈和1個分泌片,它們通過共價結合就形成所謂的SIgA。 單體IgA主要存在于血清中,含量較低,其沉降系數為7S,相對分子質量約為165×103,是重鏈為
分泌型免疫球蛋白A的結構特征
IgA在分泌物中主要以二聚體形式存在,SIgA是由十肽組成的免疫球蛋白,來自2個不同的細胞系,沉降系數為11S,它包含2個單體的IgA、1條J鏈和1個分泌片,它們通過共價結合就形成所謂的SIgA。?單體IgA主要存在于血清中,含量較低,其沉降系數為7S,相對分子質量約為165×103,是重鏈為α的免
氧化反應的特征
1.物質與氧氣發生的化學反應是氧化反應的一種;氧氣可以和許多物質發生化學反應。得電子的作用叫還原。狹義的氧化指物質與氧化合;還原指物質失去氧的作用。氧化時氧化值升高;還原時氧化值降低。氧化、還原都指反應物(分子、離子或原子)。氧化也稱氧化作用或氧化反應。有機物反應時把有機物引入氧或脫去氫的作用叫氧化
氧化反應的特征
1.物質與氧氣發生的化學反應是氧化反應的一種;氧氣可以和許多物質發生化學反應。得電子的作用叫還原。狹義的氧化指物質與氧化合;還原指物質失去氧的作用。氧化時氧化值升高;還原時氧化值降低。氧化、還原都指反應物(分子、離子或原子)。氧化也稱氧化作用或氧化反應。有機物反應時把有機物引入氧或脫去氫的作用叫氧化
Ⅳ型超敏反應的反應特征
Ⅳ型超敏反應發生較慢,當機體再次接受相同抗原刺激后,通常需經24~72小時方可出現炎癥反應,因此又稱遲發型超敏反應(delayed typehypersensitivity,DTH)。此型超敏反應發生與抗體和補體無關,而與效應性T細胞和吞噬細胞及其產生的細胞因子或細胞毒性介質有關 。該型反應均在接觸
亮綠的結構特征
亮綠(Brilliant Green),又名堿性艷綠,燦爛綠,快綠。是一種堿性染料。通常用其酸性硫酸鹽,是細小發光的金色晶體,溶于水、醇,顯綠色。
鈷胺素的結構特征
谷氨酰胺和甲基谷氨酰胺是B12的兩種輔酶形式。在咕啉環平面上方鈷離子與5,6-二甲基苯基咪唑的N-3相連,在平面下方與5'-脫氧腺苷的C5’相連。一般應用的B12,和鈷離子相連的是CN,稱為氰鈷氨,為綠色結晶。
類病毒結構特征
類病毒為環狀閉合單鏈RNA分子,由一些堿基配對的雙鏈區和不配對的單鏈環狀區相間排列而成。通常在二級結構分子中央處有一段保守區。位于棒狀結構中心有一個高度保守的序列,其能決定類病毒的種類。靠近這一保守中心區的左側有一個多聚嘌呤區,棒狀結構左側序列保守性強,右側變異性大。危害病理類病毒會引起植物基因序列
布魯氏菌的結構特征
布魯氏菌為小球桿狀菌,革蘭氏染色陰性,無鞭毛,不形成芽孢,一般無莢膜,毒力菌株可有菲薄的莢膜。初次分離時多呈球狀,球桿狀和卵圓形,該菌傳代培養后漸呈短小桿狀。 布魯氏菌細胞膜是一個三層膜的結構,最內層的膜稱為細胞質膜、外層膜稱為外周胞質膜,最外層膜稱為外膜。外膜與聚肽糖(peptidoglyc
tRNA的結構特征
tRNA的結構特征之一是含有較多的修飾成分,如上面提到的 D、T、 Ψ等;核酸中大部分修飾成分是在tRNA中發現的。修飾成分在tRNA分子中的分布是有規律的,但其功能不清楚。1974年用X射線晶體衍射法測出第一個tRNA——酵母苯丙氨酸tRNA晶體的三維結構,分子全貌象倒寫的英文字母L,呈扁平狀,長
結構基因的特征
1.它們彼此緊密連鎖。按Z,Y,A順序排列,而且在一起轉錄形成一個多順反子的mRNA;2.只有當乳糖存在時,這些基因才迅速轉錄,形成多順反子的mRNA,并翻譯成相應的酶。所以這些酶,就是由乳糖誘導產生的誘導酶,其活性的產生和活性的提高不是已有的酶被激活所致,而是在誘導物的誘導下酶的重新合成,并隨著合
抗原的結構特征
抗原在化學結構上與機體自身不同,具有異物性:①異種物質。從生物進化過程來看,異種動物間的血緣關系越遠,則免疫原性越強。如馬的血清和各種微生物與人的血緣關系遠,所以免疫原性強。而馬的血清與驢、騾的血緣關系近,所以免疫原性相對就弱。②同種異體物質。如人的紅細胞抗原物質和人的白細胞抗原等。③自身物質。自身
光聚合的反應特征
與普通化學法引發的聚合反應相比不同之處:引發聚合的活性種的產生方式。活性種是由光化學反應產生的聚合反應稱為光聚合反應。因此,就鏈式反應而言光聚合只有在鏈引發階段需要吸收光能。
固有免疫的住特征
固有免疫是生物在長期進化中逐漸形成的,是機體抵御病原入侵的第一道防線。參與固有免疫的細胞如單核-巨噬細胞、樹突狀細胞、粒細胞、NK細胞和NK T細胞,其識別免疫原雖然不像T細胞和B細胞那樣具有高度的特異性,但可通過一類模式識別受體去識別病原微生物表達的稱為病原體相關模式分子的結構。其特征是:(1)無
一文解析:光化學反應釜的結構特征
一、光化學反應釜的結構特征: 1、又稱為光化學反應儀,多功能光化學反應器,光催化反應裝置,多功能光化學反應儀等多系列光催化裝置是光化學反應儀的基礎上和實驗室實踐合作共同開發的新一代光化學反應裝置。 2、主要用于研究氣相、液相固相、流動體系在模擬紫外光、模擬可見光、特種模擬光照射下,是否負載光
電熱套的結構特征
電熱套是用無堿玻璃纖維作絕緣材料,將Cr20Ni80合金絲簧裝置于其中,用硅酸鋁棉經真空定型的半球形保溫體保溫,外殼一次性注塑成型,上蓋采用靜電噴電熱套常見外觀(8張)塑工藝,由于采用球形加熱,可使容器受熱面積達到60%以上。控溫采用計算機芯片做主控單元,采用多重數字濾波電路,模糊PID控制算法,具
鋅指結構的共同特征
鋅指結構的共同特征是通過肽鏈中氨基酸殘基的特征基團與Zn2+的結合來穩定一種很短的,可自我折疊成“手指”形狀的的多肽空間構型。
鹵素原子結構特征
原子結構特征最外層電子數相同,均為7個電子,由于電子層數不同,原子半徑不同,從F~I原子半徑依次增大,因此原子核對最外層的電子的吸引能力依次減弱,從外界獲得電子的能力依次減弱,單質的氧化性減弱。
類病毒的結構特征
類病毒為環狀閉合單鏈RNA分子,由一些堿基配對的雙鏈區和不配對的單鏈環狀區相間排列而成。通常在二級結構分子中央處有一段保守區。位于棒狀結構中心有一個高度保守的序列,其能決定類病毒的種類。靠近這一保守中心區的左側有一個多聚嘌呤區,棒狀結構左側序列保守性強,右側變異性大。
趨化因子的結構特征
所有趨化因子都很小,分子量在8到10 kDa之間。它們之間大約有20-50%是相同的;也就是說,它們具有相同的基因序列和氨基酸序列同源性。它們也都擁有保守的氨基酸,這些氨基酸對形成它們的三維或三級結構很重要,例如在大多數情況下四個半胱氨酸相互作用,形成一個希臘鑰匙形狀,這是趨化因子的一個特征。分子內
藍細菌的結構特征
藍細菌的細胞一般比細菌大,通常直徑為3~10μm,最大的可達60μm,如巨顫藍細菌。根據細胞形態差異,藍細菌可分為單細胞和絲狀體兩大類。單細胞類群多呈球狀、橢圓狀和桿狀,單生或團聚體,如粘桿藍細菌和皮果藍細菌等屬;絲狀體藍細菌是有許多細胞排列而成的群體,包括:有異形胞的(如魚腥藍細菌屬),無異形胞的
氧化反應的主要特征
1.物質與氧氣發生的化學反應是氧化反應的一種;氧氣可以和許多物質發生化學反應。得電子的作用叫還原。狹義的氧化指物質與氧化合;還原指物質失去氧的作用。氧化時氧化值升高;還原時氧化值降低。氧化、還原都指反應物(分子、離子或原子)。氧化也稱氧化作用或氧化反應。有機物反應時把有機物引入氧或脫去氫的作用叫氧化
Ⅳ型超敏反應的特征
Ⅳ型超敏反應是由效應性T細胞與相應抗原作用后,引起的以單個核細胞浸潤和組織細胞損傷為主要特征的炎癥反應。細胞介導的免疫反應有不同的類型。與上述的由特異性抗體介導的三種類型的超敏反應不同,Ⅳ型或遲發型超敏反應(delayed type hypersensitivity,DTH)是由特異性致敏效應T細胞
酶催化反應的特征
特征酶催化反應還表現出一種在非酶促反應中不常見到的特征,即可與底物飽和。當底物濃度增加時,酶反應速率達到平衡并接近一個最大值Vm(見圖)。公式簡介1913年L.邁克利斯和L.M.門頓發展了關于酶的作用和動力學的一般理論,假定酶E首先與底物S結合形成酶-底物復合物ES;然后此復合物在第二步反應中分解形
還原反應的定義和特征
還原反應就是物質(分子、原子或離子)得到電子或電子對偏近的反應。一個完整的化學反應中,還原反應與氧化反應一般是同時存在的。中文名還原反應外文名Reduction Reaction概????念得到電子或電子對偏近的反應領????域化學特????征還原反應與氧化反應是同時存在舉????例氫氣與氯氣的化合
催化反應特征的介紹
催化反應有四個基本特征,可以根據定義導出,對了解催化劑的功能很重要。 1、催化劑只能加速熱力學上可以進行的反應。要求開發新的化學反應催化劑時,首先要對反應進行熱力學分析,看它是否是熱力學上可行的反應。 2、催化劑只能加速反應趨于平衡,不能改變反應的平衡位置(平衡常數)。 3、催化劑對反應具
細胞免疫缺陷的臨床特征
細胞免疫(T細胞)缺陷為主的疾病單純T細胞免疫缺陷較為少見,一般常同時伴有不同程度的體液免疫缺陷,這是由于正常抗體形成需要T、B細胞的協作。T細胞免疫缺陷病的發生與胸腺發育不良有關,故又稱胸腺發育不良或Di George綜合征。本病與胚胎期第Ⅲ、Ⅳ對咽囊發育缺陷有關,因此,患者常同時有胸腺和甲狀旁腺
體液免疫缺陷的臨床特征
體液免疫(B細胞)缺陷為主的疾病表現為免球蛋白的減少或缺乏。包括:(1)原發性丙種球蛋白缺乏癥:有兩種類型:①Bruton型,較常見,為嬰兒性聯丙種球蛋白缺乏病,與X染色體隱性遺傳有關,僅發生于男孩,于出生半年以后開始發病;②常染色體隱性遺傳型,男女均可受累,也可見于成年人。(2)孤立性IgA缺乏癥
基因免疫的主要特征
基因免疫(gene immunization)又稱DNA免疫(DNA immunization)、核酸疫苗(polynucleotide vaccine)、DNA疫苗、體細胞轉基因免疫(somatic transgene immunization)。由于基因免疫將質粒DNA直接免疫,又稱為裸DNA免