高質量豌豆參考基因組和泛基因組解析完成
9月22日，中國農業科學院作物科學研究所特色農作物優異種質資源發掘與創新利用創新團隊聯合國內外多家合作單位，成功繪制了中國豌豆基因組高質量精細物理圖譜，構建了栽培和野生豌豆泛基因組，解析了豌豆基因組進化特征、群體遺傳結構，為揭示豌豆起源馴化，以及基因挖掘、種質創新、育種改良提供了寶貴資源及數據支撐。相關研究成果以長文的形式在線發表在《自然遺傳學》（Nature Genetics）雜志上。 豌豆是糧菜飼綠肥兼用的北方一年生和南方越年生冷季食用豆類作物，具有豐富的營養價值和顯著的生態優勢，在世界范圍內廣泛種植。自孟德爾發現遺傳定律以來，豌豆作為遺傳研究的模式植物，受到了學界和公眾的廣泛關注。然而，豌豆基因組非常大，組裝起來相當復雜，豌豆高質量基因組精細物理圖譜一直未能完成，嚴重阻礙了豌豆的理論和應用研究。 該研究團隊利用中國豌豆主栽品種“中豌6號”，基于多種先進測序技術，整合優化多種組裝策略，提供了顯著改進的豌豆高質量精細物......閱讀全文
高質量豌豆參考基因組和泛基因組解析完成
9月22日，中國農業科學院作物科學研究所特色農作物優異種質資源發掘與創新利用創新團隊聯合國內外多家合作單位，成功繪制了中國豌豆基因組高質量精細物理圖譜，構建了栽培和野生豌豆泛基因組，解析了豌豆基因組進化特征、群體遺傳結構，為揭示豌豆起源馴化，以及基因挖掘、種質創新、育種改良提供了寶貴資源及數據支撐。
我國牽頭完成高質量豌豆參考基因組和泛基因組解析
9月22日，中國農業科學院作物科學研究所特色農作物優異種質資源發掘與創新利用創新團隊聯合國內外多家合作單位，成功繪制了中國豌豆基因組高質量精細物理圖譜，構建了栽培和野生豌豆泛基因組，解析了豌豆基因組進化特征、群體遺傳結構，為揭示豌豆起源馴化，以及基因挖掘、種質創新、育種改良提供了寶貴資源及數據支
首個野生大豆高質量參考基因組被解析
近日，香港中文大學林漢明教授團隊及華大基因等多家國內外機構合作完成了全球首個野生大豆高質量參考基因組解析，該成果為挖掘野生大豆遺傳資源和改良、優化栽培大豆品種提供了重要工具。相關研究成果近日在線發表于《自然-通訊》。圖片來源于網絡 基因組信息是當前作物改良計劃的重要基礎。過往大豆基因組研究主要
高質量沙漠蝗蟲基因組測序完成
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/6/481733.shtm 近日，美國農業部農業研究院（ARS）的一項研究公布了第一個高質量沙漠蝗蟲基因組。這項研究是ARS的Ag100Pest計劃的一部分。該計劃旨在破譯對農業和環境產生影響的100種害蟲
Nature：系統解析斑馬魚參考基因組
斑馬魚(Zebrafish)是研究發育生物學的新興模式動物。斑馬魚由于具有飼育容易、胚胎透明、體外受精、突變種多、遺傳學工具成熟等諸多優點，近年來已成為研究脊椎動物發育與人類遺傳疾病的新興模式動物。 近日，英國桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)
抗根腫病蕪菁高質量參考基因組發布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/4/478019.shtm 蕓苔屬植株在長期對抗根腫病菌的過程中CR基因的進化模型?? 課題組供圖 近日，華中農業大學教授張椿雨、教授楊慶勇團隊與沈陽農業大學教授樸鐘云團隊合作，發布了抗根腫病的歐
中國樹鼩全基因組解析完成
中科院昆明動物研究所張云研究員課題組與深圳華大基因研究院合作，解析了新型實驗動物中國樹鼩的全基因組，系統評估了樹鼩作為藥物研發實驗動物的特征和優勢。研究近日發表于《公共科學圖書館·綜合》。 研究不僅為中國樹鼩用于新藥研發的藥效學、藥理學和毒理學評價提供了系統的基礎信息數據和科學依據，而且揭示了
破譯對蝦基因組－獲國際首個高質量對蝦基因組參考圖譜
由中國科學院海洋研究所相建海和李富花研究組主導的研究團隊，與國內外多家單位共同合作，歷時十年成功破譯凡納濱對蝦基因組，獲得國際首個高質量對蝦基因組參考圖譜，研究成果于1月21日在《自然-通訊》（Nature communications）在線發表，為甲殼動物研究及對蝦基因組育種和分子改良提供了重
我國完成世界首個番茄超泛基因組構建
4月6日，由新疆農科院加工番茄生物育種創新團隊牽頭，聯合中國農業科學院、新疆大學、新疆農業大學等多家單位，在國際學術期刊《自然·遺傳》在線發表了題為《超泛基因組研究揭示野生和栽培番茄物種基因組和結構變異多樣性》的科研成果。這是新疆農科院首次以第一單位在《自然·遺傳》發表論文。 新疆農科院余慶輝
香港中文大學等解析全球首個野生大豆高質量參考基因組
香港中文大學林漢明團隊和華大基因等多家機構合作，完成全球首個野生大豆高質量參考基因組解析。該成果為挖掘野生大豆遺傳資源和改良、優化栽培大豆品種提供了重要依據。相關成果近日在線發表于《自然—通訊》。 “大豆的基因組含有大量重復區，組裝時困難重重。我們整合了幾種最新測序方法產生大量數據，才最終把問
認識泛基因組測序
什么是泛基因組？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念（pangenome，pan源自希臘語‘παν’，全部的意思），泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年，Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接，發現了個體獨有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“
我國學者攻破高質量角苔參考基因組
苔蘚類包括苔、蘚和角苔三大分支，是現存最早的陸生植物，代表了植物演化過程中從水生到陸生的過渡類群。長久以來關于早期陸地植物的起源與植物登陸一直存在諸多爭論和未解之謎。近年來，人們利用組學數據將早期陸地植物的系統位置爭論聚焦到了角苔類上。角苔類以其難解的系統位置、衍生與原始兼具的形態特征、與細菌和
PacBio構建目前最高質量的植物基因組參考序列
來自中科院遺傳與發育生物學研究所，四川農業大學的研究人員發表了題為“Sequencing and de novo assembly of a near complete indica rice genome”的文章，對一個秈稻基因組蜀恢498（R498）進行PacBio單分子測序，結合遺傳圖譜和
水生所發布高質量AB品系斑馬魚參考基因組
斑馬魚是生命科學、健康科學和環境科學等研究領域的重要模式生物之一。常見的兩種實驗室斑馬魚品系分別是Tubingen品系和AB品系。其中，AB品系斑馬魚被國內外很多實驗室作為研究對象。然而，卻缺乏一個高質量的AB品系斑馬魚參考基因組。 由于不同品系斑馬魚來源不同，各品系之間存在著大量基因序列上的
我科學家完成棘球絳蟲基因組解析
包蟲病威脅著我國約5000萬人口，其元兇――細粒棘球絳蟲的遺傳密碼最近被科學家“破譯”。昨天，記者從國家人類基因組南方研究中心獲悉，經過中外科學家長達三年的協同努力，解析出了細粒棘球絳蟲的基因組合轉錄組，英國《自然?遺傳學》雜志前天在線發布了這一成果。 由棘球絳蟲所引起的包蟲病是人和家畜
人類泛基因組首個草圖發布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500424.shtm5月10日，《自然》發表了人類泛基因組參考的初稿，這一集合旨在最終代表整個人類物種中盡可能多的DNA序列。該項研究組合的人群遺傳物質來自47個遺傳多樣化個體，為人類基因組提供了更完整的
Frontiers－in－Genetics首個非性逆轉黃鱔高質量基因組參考圖譜
中國水產科學研究院長江水產研究所水產養殖與遺傳育種研究室科研人員在國際期刊《遺傳學前沿》（Frontiers in Genetics）發表題為《Chromosome-Scale, Haplotype-Resolved Genome Assembly of Non-Sex-Reversal Fem
《自然》發表中國人泛基因組參考圖譜，26家單位聯合研究
近日，復旦大學、西安交大、中國醫學科學院等26家單位聯合發布了中國人群泛基因組聯盟（CPC）一期研究進展。6月14日，相關成果以《基于36個族群的中國人泛基因組參考圖譜》為題發表于《自然》（Nature）主刊。這是我國學者領導的人群基因組研究首次發表在《自然》主刊。這項研究初步構建了我國人群的泛基因
中科院等完成橡膠草基因組序列解析
中國科學院遺傳與發育生物學研究所李家洋研究組與中國農業科學院、中國熱帶農業科學院等合作，在橡膠草基因組序列解析方面取得重要進展，標志著以橡膠草作為模式植物進行天然橡膠合成研究進入后基因組時代。研究成果近日在線發表在權威學術期刊《國家科學評論》（National Science Review）雜
具有獨特濃郁風味的中國水蜜桃高質量參考基因組發布
近日，北京市農林科學院在《自然·通訊》上發表了研究論文，公布了具有獨特濃郁風味的中國水蜜桃高質量參考基因組，闡釋了以水蜜桃為代表的優質資源對于全球桃現代育成品種遺傳貢獻；揭示了桃風味改良過程中，東、西方對甜度趨同選擇和酸度分化選擇的模式，解析了重要基因在果實有機酸和可溶性糖積累中的功能。該研究提
人類泛基因組首張草圖發布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/515798.shtm （圖片來源：Gideon MendelCorbis via Getty）5月10日，《自然》雜志發表了人類泛基因組參考的“初稿”，在3篇論文的合集中，人類泛基因組參考聯盟（H
我科學家主導完成全球首個梨基因組解析
由南京農業大學梨工程技術研究中心、深圳華大基因研究院、浙江省農業科學院等多家科研院所合作完成的碭山酥梨基因組研究成果于 11月 13日在《基因組研究》(Genome Research)上發表。全球首個梨基因組的成功解析及其基因組層面的功能研究將為培育高產、優質和抗病的新品種梨奠定堅實的遺
補全中國人“拼圖”－《自然》發表中國人群泛基因組參考圖譜
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502872.shtm6月14日，《自然》期刊在線發表了西安交通大學、復旦大學、中國醫學科學院等26家單位聯合發布的中國人泛基因組聯盟（CPC）一期研究進展——《基于36個族群的中國人泛基因組參考圖譜》。人
中國蓮基因組測序完成
繼中國科學家成功完成水稻、玉米基因組測序工作后，近日，中國科學院武漢植物園研究人員與國外多家科研機構合作，順利完成中國蓮的基因組測序，構建了首張中國蓮全基因組圖譜，相關論文在線發表于《基因組生物學》雜志。 “該項目為將來的蓮分子育種提供了堅實的基礎，也標志著我國相關研究將對生物進
白肉靈芝完成基因組測序
?在韶關產業園種植的白肉靈芝。吳清平團隊 供圖 近日，中國工程院院士、廣東省科學院微生物研究所名譽所長吳清平團隊完成了第一個白肉靈芝全基因組測序。據悉，這是世界上首次對白肉靈芝的基因組進行組裝和注釋。相關研究發表于《G3：基因，基因組，遺傳學》（G3-Genes Genomes Genet
海綿基因組草圖繪制完成
一個國際研究小組在5日出版的英國《自然》雜志上報告說，他們繪制出了海綿的基因組草圖，并從中發現了許多有助于探索多細胞動物起源的信息。 這個由美國、德國、澳大利亞等國研究人員組成的小組報告說，他們完成了大堡礁海綿基因組測序草圖，結果顯示其中包含約1.8萬個基因。海綿6億多年前就出現在地球上，是已
我國完成小麥A基因組測序
本報訊（記者丁佳）5月10日，《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果，該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。 這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究，全面揭示了小麥A基因組的結構和
我國完成小麥A基因組測序
?? 5月10日，《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果，該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究，全面揭示了小麥A基因組的結構和表達特征，對深入和
Nature完成桉樹基因組測序
一個橫跨五大洲的科學團隊宣布，巨桉(Eucalyptus grandis)的基因組測序已經完成，巨桉是世界上最廣泛種植的樹木之一。這一成果于六月十一日發表在Nature雜志上。 巨桉生長速度快，可以用作燃料和木材，是纖維、紙漿、生物燃料、藥物和工業用油的重要可再生原料。這種樹木原產于澳大利亞東
《自然》：葡萄基因組測定完成
葡萄成為人類完成基因測序的第一種水果作物和第四種開花植物 ?一項由法國科學家領導的最新研究捍衛了法國作為“葡萄酒之都”的榮譽，他們完整測定了一種葡萄的基因組。葡萄也由此成為人類完成基因測序的第一種水果作物和第四種開花植物（其它3種分別是小麥、擬南芥和白楊木），這有望加深科學家對開花植物進化過程的理解