蛋白質組學技術分析方法及概括
1 蛋白質組學概述“蛋白質組”一詞的英文是Proteome，它是proteins 和genome 兩個詞的組合，意思是proteins expressed by a genome，即為基因組表達的蛋白質[1]。蛋白質組的概念是1994 年由Wilkins首先提出，并在1995 年7月的“Electrophoresis”上發表，指“一個細胞或一種組織基因組所表達的全部蛋白質”[2]， 蛋白質組學(proteomics) 是從整體水平上研究細胞內蛋白質的組成及其活動規律。與基因固定不變的基因組不同，蛋白質組作為相應基因組所表達的產物隨時間、地點、環境等條件變化。在同一機體不同的組織和不同細胞中、蛋白質的種類、數量不同； 即使同一組織或細胞在不同的發育階段、生理狀態、甚至不同的外界環境下，其蛋白質組也是在不斷的變化之中； 在病理或治療過程中， 與正常生理過程也不同。因此， 蛋白質組是一個動態的概念。其目的是從整體的角度分析機體內動態變......閱讀全文
華盈視角：蛋白質組學——質譜技術
蛋白質作為功能的直接執行者，在生物醫學領域中有著重要意義，檢測蛋白質表達、修飾、互作等有助于我們理解生命機體的各類機制和活動規律，為疾病的治療、診斷，藥物的開發、優化等提供有力的支持。質譜技術作為檢測蛋白質組學的主流技術，有必要了解其核心原理，才能更好的服務于科學問題的解決。1.質譜的原理： 質譜是
蛋白質組學哪些技術需要進行重復實驗？
Label free需要進行三次重復，而iTRAQ、TMT一般建議客戶做3次實驗重復，如果實驗方案后期設計了大量的驗證實驗如WB或ELISA等，最好做也能做兩次重復；如果不進行重復實驗后期的驗證實驗也少，在后期發表文章的時候結果可能會受到一些審稿人的質疑，從而影響文章的發表，特別是一些高分雜志較
“鳥槍法(shotgun)”定量蛋白質組學技術
1999年，Yates研究組提出“鳥槍法”(shotgun)，其基本技術路線是針對液體或SDS-PAGE條帶的復雜混合物用酶(Trypsin)酶解成肽段混合物，然后對肽混合物進行多維毛細管液相色譜分離和串聯質譜分析以及數據庫檢索，從而確定蛋白質的種類，可同時鑒定成百上千種蛋白質。他們把這種思路稱
實驗室分析技術基于HPLCMS/MS的蛋白質組學技術
基于高效液相色譜串聯質譜（HPLC-MS/MS）的蛋白質組學技術的發展主要取決于液相色譜-質譜聯用分析設備、樣品分離和制備技術、鑒定以及生物信息學。目前，shotgun鳥槍法是最常用的大規模蛋白質鑒定策略。如下圖所示，在自下而上分析策略中，蛋白質通過蛋白水解酶水解成肽的混合物，然后通過色譜法或親和分
質譜技術在蛋白質組研究中的分析方法
2003年人類基因組精細圖繪制完成，是人類科學史上一個里程碑式的事件。后基因組時代的研究重點自然落在了蛋白質頭上。為啥？因為中心法則告訴我們，基因的產物——蛋白質，是生命活動的最終執行者。與基因組類比，研究生物體內全套蛋白質的科學，就是蛋白質組學。基因組計劃完成的同年，人類蛋白質組計劃啟動，令人激動
第一屆全國代謝組學及蛋白質組學雙星峰會
繼測序之后，基于質譜技術的代謝組學及蛋白組學于生命科學研究領域發展迅速。應用質譜技術從分子層面對生命體進行動態、精準的檢測，可以了解生命體內代謝與蛋白整體水平的變化，為基礎科學研究提供新方向。 為了貫徹 “兩城一中心”的戰略，江北新區繼基因測序平臺后，又重磅打造了質譜檢測平臺，旨在服務生命
蛋白質組學幾種定量方法的案例解讀
上期分享的蛋白組學內容，是不是有些小伙伴還繞在云里霧里呀？這次，小編用實例說話，幫您梳理清楚。 一、Label-free定量 Label-free定量，顧名思義就是不需要對比較樣本做特定標記處理，只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化
大連化物所定量蛋白質組學新技術新方法研究取得進展
近日，中科院大連化學物理研究所生物分離分析新材料與新技術研究組(1809組)鄒漢法、葉明亮研究員等人在定量蛋白質組學新技術新方法研究方面取得新進展。相關研究成果發表在最新一期的Angew. Chem. Int. Ed.上(2013年52卷，9205-9209頁)。 該項研究工作利用胰蛋
馬來酸酐二次衍生技術的定量蛋白質組學方法研究
基于馬來酸酐二次衍生技術的定量蛋白質組學方法研究田姍姍1，柏雪1，翟貴金1，張鍇*,1，張玉奎2（1天津醫學表觀遺傳學協同創新中心，天津醫科大學基礎醫學院，天津 3000702中國科學院大連化學物理研究所，國家色譜研究分析中心，遼寧省大連市 116023）摘要：定量蛋白質組學在當前生物醫學研究中發揮
綜述：基于質譜技術的糖蛋白質組學與糖組學研究進展
糖是組成生命體的四大類重要分子之一，糖蛋白質是由糖鏈與肽鏈中的特定氨基酸殘基以糖苷鍵共價連接而成的蛋白質。糖蛋白質普遍存在于生物體內，在很多生命過程中起著重要作用，如蛋白質的折疊、細胞之間的相互識別、炎癥反應等。同時，糖基化修飾在疾病中，特別是腫瘤的發生、發展和轉移過程中也起到重要作用，許多疾
探索蛋白質組學新境界——第一屆AI蛋白質組學技術研討會召開
2023年11月17日，上海易算生物科技有限公司與復旦大學生物醫學研究院聯合舉辦第一屆AI蛋白質組學技術研討會-暨易算生物第一代易肽蛋白質組學質譜前處理機器人發布研討會。研討會邀請了多位業內專家、學者，分享臨床蛋白質組學大隊列研究最新進展。易算生物同時為參會專家老師介紹第一代易肽蛋白質組學質譜前
什么是蛋白質組學
(Marc Wilkins（1994))A study of proteome using the technologies of large-scale protein separation, identification and quantitation.The study of protein
什么是蛋白質組學
這個概念最早是在1995年提出的，它在本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征，包括蛋白質的表達水平，翻譯后的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發生，細胞代謝等過程的整體而全面的認識。目前，在蛋白質功能方面的研究是極其缺乏的。大部分通過基因組測序而新發現的基因編碼的蛋白質的
什么是蛋白質組學
這個概念最早是在1995年提出的，它在本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征，包括蛋白質的表達水平，翻譯后的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發生，細胞代謝等過程的整體而全面的認識。目前，在蛋白質功能方面的研究是極其缺乏的。大部分通過基因組測序而新發現的基因編碼的蛋白質的
什么是蛋白質組學
這個概念最早是在1995年提出的，它在本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征，包括蛋白質的表達水平，翻譯后的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發生，細胞代謝等過程的整體而全面的認識。目前，在蛋白質功能方面的研究是極其缺乏的。大部分通過基因組測序而新發現的基因編碼的蛋白質的
定量蛋白質組學質譜采集技術進展（一）
摘要 質譜是定量蛋白組學的主要工具。近年來隨著定量蛋白質組學研究的深入,傳統質譜定量技術面臨著復雜基質干擾、分析通量限制等諸多問題。而最近一系列質譜新技術的發展,包括同步母離子選擇(SPS)、質量虧損標記、平行反應監測(PRM)、多重累積(MSX)和多種全新數據非依賴性采集(DIA)等,為解決目前蛋
定量蛋白質組學質譜采集技術進展（二）
同步母離子選擇(Synchronous precursor selection, SPS)技術的出現徹底解決了MS3 響應弱的問題。SPS 技術利用多頻切跡的選擇波形電壓(MultiNotch) [27] ,在線性離子阱中實現一次選擇同時獲得多個離子,最多可同時選擇15 個(圖2A)。利用這一原理,
定量蛋白質組學質譜采集技術進展（三）
然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同時監測最多10 ~15 個母離子,而SRM 能同時監測上百個離子對,因為高分辨質譜的有效掃描速度通常只有10 ~15 Hz,遠慢于SRM 的有效掃描速度。但是這一問題正逐步得到解決,多重累積(Multiplexing, MSX)技術的發展和使用有
定量蛋白質組學質譜采集技術進展（四）
無論是相對定量還是絕對定量方法,DIA很好地克服了DDA鳥槍法和SRM目標監測的種種不足, 在定量蛋白質組學中具有良好的應用前景。然而,目前DIA 方法的循環時間仍然較長,只能與納流液相聯用,并使用較長的梯度以獲得足夠的色譜峰寬,限制了DIA 的應用范圍。這也是DIA 技術下一步需要解決
《基因組蛋白質組與生物信息學報》：蛋白質組學技術面臨
《基因組蛋白質組與生物信息學報》：蛋白質組學技術面臨挑戰 2003年4月人類基因組圖譜基本繪制完成，但對基因的調節與功能問題仍未能解讀。由于基因的功能主要是通過其編碼的蛋白質來實現，蛋白質才是生命活動真正的執行者，所以越來越多的科學家致力于蛋白質的研究，試圖找出人類疾病的致病機理，最終解決人類
質譜技術在蛋白質組研究中的分析方法介紹
2003年人類基因組精細圖繪制完成，是人類科學史上一個里程碑式的事件。后基因組時代的研究重點自然落在了蛋白質頭上。為啥？因為中心法則告訴我們，基因的產物——蛋白質，是生命活動的最終執行者。與基因組類比，研究生物體內全套蛋白質的科學，就是蛋白質組學。基因組計劃完成的同年，人類蛋白質組計劃啟動，令人
蛋白質組學技術對營養脅迫中泛素化修飾變化情況分析與
吃貨們，為了健康，少吃點吧！ 小編知道一名資深的吃貨，無論什么都阻擋不了美食的誘惑。但我忍不住要阻止：“吃貨們！為了健康，少吃點吧！” 為什么要讓熱愛美食的你們做出如此痛苦的選擇呢？看看下面這篇文獻解讀你就知道了。 Cell Death and Disease IF=5.96
蛋白質組學技術對營養脅迫中泛素化修飾變化情況的分析
吃貨們，為了健康，少吃點吧！ 小編知道一名資深的吃貨，無論什么都阻擋不了美食的誘惑。但我忍不住要阻止：“吃貨們！為了健康，少吃點吧！” 為什么要讓熱愛美食的你們做出如此痛苦的選擇呢？看看下面這篇文獻解讀你就知道了。 Cell Death and Disease IF=5.96
蛋白質組學分離分析方法進展
分析測試百科網訊 2015年10月17日，第二屆全國質譜分析學術報告會（質譜大會）在浙江大學紫荊港校區體育館盛大開幕。中國科學院大連化學物理研究所 張玉奎 來自中國科學院大連化學物理研究所的張玉奎院士帶來了題為《蛋白質組學分離分析方法進展》的報告。 張玉奎主要介紹了蛋白質樣品預處理、蛋白質組
安捷倫舉辦芯片液相色譜及蛋白質組學/代謝組學用戶交流會
疾病蛋白質組學重慶市市級重點實驗室第二屆學術委員會研討會 暨安捷倫第一屆芯片液相色譜及蛋白質組學/代謝組學用戶交流會成功舉辦 2007年秋，為了開發建立一套全新理念的，與臨床研究緊密聯結的整體化蛋白質組學研究平臺，以實現科研及早期臨床診斷、新藥開發及個體化醫療的需求，安捷倫科技和西南
蛋白質組和蛋白質組學分析
?隨著人類基因 組計劃研究成果的公布，人們對基因的認識逐漸清晰，但基因數量的有限性和基因結構的相對穩定性，與生命現象的復雜性和多樣性之間存在巨大反差。如何了解眾多的基因與危害人類身心健康的疾病之間的關系，對生命科學研究者來說仍是一項長期而艱巨的任務。因此，作為生命活動的直接承擔者――蛋白質，成為后基
蛋白質組學大會及學術研討會
第五屆中國蛋白質組學大會暨首屆粵港澳蛋白質組學學術研討會 會議時間： 2007-8-20 會議地點： 廣州 主辦單位： 中國生物化學與分子生物學會蛋白質組學專業委員會（CNHUPO） 承辦單位： 南方醫科大學 暨南大學 香港大學 香港中文大學 北京蛋白質組研究中心 協辦單位： 廣州市科學技術協會
ETD：將成為蛋白質組學研究的標準方法
——訪賽默飛ETD技術發明人John E.P. Syka 博士 【導語】質譜已經成為開展蛋白質組學研究的基礎平臺，更確切地說，具有MS/MS功能的質譜已成為蛋白質組學研究的基礎平臺。過去，CID/CAD技術是實現MS/MS功能的唯一手段，在蛋白質鑒定的自下而
新蛋白質組學方法引領蛋白功能研究革命
人類細胞是通過成千上萬個蛋白質的協同作用來控制它們生長和分化的。但是，到目前為止，大多數人類蛋白質的特定功能還不清楚。 疾病的發生常常是由于冠軍細胞蛋白質功能的失常。目前，世界各地已經啟動了大量大規模的研究計劃以了解所有人類蛋白質的功能。 現在，來自IRCM（Instiut de recherc
蛋白質組學幾種定量方法的案例解讀（一）
一、Label-free定量Label-free定量，顧名思義就是不需要對比較樣本做特定標記處理，只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化，通常用于分析大規模蛋白鑒定和定量時所產生的質譜數據。Label-free技術又可分為基于譜圖數（Spectra Co