揭示eccDNA新功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤內的異質性，是腫瘤進化的動力。那么除此外，eccDNA是否還有其他生物學功能呢？相信各位老師跟小編一樣迫切想要了解eccDNA研究的新方向，而云序生物一直關注eccDNA的研究動態，今天帶來的文章剛好揭示了eccDNA新功能--驅動神經母細胞瘤基因組重排，為現代癌癥基因組學提供了令人興奮的新方向。下面請跟著編者一起走進eccDNA的新世界，了解這個神奇的分子在癌癥治療方面劃時代的功能。 2019年12月16日，eccDNA驅動致癌基因重構一文發表在Nature Genetics（IF=25.455）期刊上，該文章結合eccDNA......閱讀全文
揭示eccDNA新功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤
Nature－Genetics－揭示eccDNA功能—驅動神經母細胞瘤基因組重排
在剛剛過去不到一個月的時間，染色體外環狀DNA（eccDNA）重大科研成果相繼刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量級期刊，這無疑將eccDNA推向21世紀20年代科學研究的風口浪尖，吸引無數科學工作者的眼球。前期報道表明eccDNA能導致原癌基因擴增，極大地促進腫瘤
Nature－Genetics揭示eccDNA新功能—驅動神經母細胞瘤基因組重..
1.?神經母細胞瘤eccDNA整體統計研究人員聯合eccDNA-seq和RNA-seq（云序生物提供此服務）技術，與開創性的生物信息學算法相結合，首次在神經母細胞瘤（一種主要發生在兒童的致命腫瘤）中進行詳細的環狀DNA序列分析。本研究中分析了93名兒童的神經母細胞瘤組織樣本，結果顯示，每個組織樣本平
eccDNA新型生物標志物的多種應用
文章導讀 新年伊始，eccDNA（染色體外環狀DNA）的相關研究成果不斷。2019年11月同期Nature、Cell報道了環狀DNA通過高度開放染色質、復雜的拓樸異構特征增強表達的顛覆性發現，2019年12月Nature Genetics也剛剛揭示了eccDNA能夠驅動神經母細胞瘤基因重排
癌基因的關鍵——染色體外環狀DNA（eccDNA）
實驗方法：環狀DNA-seq,?RNA-seq（云序生物提供以上服務）1.?ecDNA是環狀結構為了了解ecDNA的結構，作者通過環狀DNA-seq（云序生物提供以上服務）方法研究了三種人類癌細胞系和來自于TCGA的臨床腫瘤樣品。通過這種方法檢測到了GBM39細胞中的圓形擴增子游離于染色體之外，并且
國自然研究熱點——eccDNA的前世今生（三）
小編在這兒也給大家整理了eccDNA表達譜的研究思路，如下圖。?（2）生物標志物eccDNA優于線性DNA的生物穩定性以及獨特的分子結構特征，為迅速發展的無創活檢道路增添了新的方向，如果有較多的臨床樣本，它非常適合做生物標志物的研究。下面這篇文章是eccDNA在液體活檢方面探索的先驅文章，小編帶大家
再登Nature－GeneticsecDNA與致ai基因擴增及多種ai癥不良...2
3.與線性DNA相比，ecDNA擴增導致的ai基因轉錄水平更高環狀ecDNA擴增的轉錄結果發現，在所有擴增子類別中觀察到DNA CN和ai基因表達水平高度明顯相關(圖3a)。然而，DNA CN歸一化后，環狀擴增子上的ai基因表達明顯高于非環狀擴增子。轉錄活性中不依賴于CN的增加現象可能部分是因為
eccDNA新型生物標志物的多種應用
新年伊始，eccDNA（染色體外環狀DNA）的相關研究成果不斷。2019年11月同期Nature、Cell報道了環狀DNA通過高度開放染色質、復雜的拓樸異構特征增強表達的顛覆性發現，2019年12月Nature Genetics也剛剛揭示了eccDNA能夠驅動神經母細胞瘤基因重排的全新功能。這一
eccDNA新型生物標志物的多種應用
新年伊始，eccDNA（染色體外環狀DNA）的相關研究成果不斷。2019年11月同期Nature、Cell報道了環狀DNA通過高度開放染色質、復雜的拓樸異構特征增強表達的顛覆性發現，2019年12月Nature Genetics也剛剛揭示了eccDNA能夠驅動神經母細胞瘤基因重排的全新功能。這一
國自然研究熱點—eccDNA的前世今生
2019年11月，頂尖國際學術期刊《Nature》和《Cell》相繼發表了關于染色體外環狀DNA(extrachromosomal circular DNA，eccDNA)的重要研究，徹底顛覆了人們對癌基因的傳統認知，同時也迅速引爆了整個生物醫學界，一時之間，將人們的目光都吸引到這個科研界的新寵
什么是神經母細胞瘤
神經母細胞瘤是一種兒童常見的實質性腫瘤。主要起源于腎上腺，但也可起源于腎上腺外的交感神經的其他部分，包括腹膜后或胸部。 約%的神經母細胞瘤患者在歲以下某些患者有家族傾向性大約%的腫瘤起源于腹部%~%起源于胸部其余%起源于不同的部位例如頸部骨盆等原發于中樞神經系統的神經母細胞瘤極少見許多神經母細胞瘤
神經母細胞瘤的簡介
不同神經母細胞瘤患者預后差別很大，也即神經母細胞 瘤間存在廣泛的腫瘤異質性。根據高危因素的不同，神經母細胞瘤可以分為低危組、中危組和高危組。對于低危組神經母細胞瘤患者（最常見于嬰幼兒），靠單純的觀察或者是手術治療往往可以取得很好的效果；但是高危組神經母細胞瘤患者，即使綜合各種強化的治療方案，預
嗅覺神經母細胞瘤治療
由于嗅覺神經母細胞瘤這種疾病的罕見性，觀察性研究通常只有有限的患者數量。此外，疾病的自然病史需要長時間觀察才能充分評估治療效果。目前，關于嗅神經母細胞瘤的遺傳和分子改變的信息不足以指導治療決策。原發腫瘤手術治療、放射治療（RT）或化療都已用于治療原發性嗅神經母細胞瘤。觀察性研究通常表明，與手術或單獨
國自然研究熱點—eccDNA的前世今生
?1. eccDNA為什么火？它到底是何方神圣？ 2019年11月，頂尖國際學術期刊《Nature》和《Cell》相繼發表了關于染色體外環狀DNA(extrachromosomal circular DNA，eccDNA)的重要研究，徹底顛覆了人們對癌基因的傳統認知，同時也迅速引爆了整個生
神經母細胞瘤的臨床癥狀
神經母細胞瘤的初發癥狀不典型，因此在早期診斷有 所困難。比較常見的癥狀包括疲乏，食欲減退，發燒以及關節疼痛。腫瘤所導致的癥狀取決于腫瘤所處的器官以及是否發生轉移。 腹腔的神經母細胞瘤一般表現為腹部膨隆以及便秘；胸腔神經母細胞瘤一般表現為呼吸困難；脊髓神經母細胞瘤一般表現為軀干與肢體力量減退，
關于神經母細胞瘤的診斷
最終的診斷依賴于術后的病理，但同時也要綜合考慮患者的臨床表現以及其他的輔助檢查結果。 生化檢查 將近90%的神經母細胞瘤患者，其血液或尿液里兒茶酚胺及其代謝產物（多巴胺，高香草酸、香草扁桃酸）的濃度較正常人群有顯著升高。 影像檢查 另外一個檢測神經母細胞瘤的手段是間位腆代芐胍（meta-
神經母細胞瘤的生化檢查
將近90%的神經母細胞瘤患者，其血液或尿液里兒茶酚胺及其代謝產物（多巴胺，高香草酸、香草扁桃酸）的濃度較正常人群有顯著升高。
神經母細胞瘤的影像檢查
另外一個檢測神經母細胞瘤的手段是間位腆代芐胍（meta-iodobenzylguanidine，mIBG）掃描。該檢查的分子機理為，間位腆代芐胍是去甲腎上腺素的功能類似物（analog），并可被交感神經元所攝取。當間位腆代芐胍與放射性物質如碘-131或者是碘-123耦聯后，即可作為放射性藥物而用
研究發現染色體外環狀DNA驅動神經母細胞瘤癌基因重構
近日，紀念斯隆?凱特林癌癥中心等科研機構的研究人員在Nature Genetics上發表了題為“Extrachromosomal circular DNA drives oncogenic genome remodeling in neuroblastoma”的文章，發現染色體外環狀DNA驅動神
Nature重磅新星eccDNA的物種發現史（三）
6.染色體外環狀DNA來源于植物基因組（擬南芥和短毛菊）的串聯重復序列發表期刊：The Plant Journal影響因子：5.786發表時間：2007.12.3??文章鏈接：Extrachromosomal circular DNA derived from tandemly repeated g
關于神經母細胞瘤病的簡介
不同神經母細胞瘤患者預后差別很大，也即神經母細胞瘤間存在廣泛的腫瘤異質性。根據高危因素的不同，神經母細胞瘤可以分為低危組、中危組和高危組。對于低危組神經母細胞瘤患者（最常見于嬰幼兒），靠單純的觀察或者是手術治療往往可以取得很好的效果；但是高危組神經母細胞瘤患者，即使綜合各種強化的治療方案，預后仍
神經母細胞瘤的癥狀與體征
神經母細胞瘤的初發癥狀不典型，因此在早期診斷有所困難。比較常見的癥狀包括疲乏，食欲減退，發燒以及關節疼痛。腫瘤所導致的癥狀取決于腫瘤所處的器官以及是否發生轉移。 腹腔的神經母細胞瘤一般表現為腹部膨隆以及便秘；胸腔神經母細胞瘤一般表現為呼吸困難；脊髓神經母細胞瘤一般表現為軀干與肢體力量減退，患者
治療小兒神經母細胞瘤的簡介
由于NB預后差異大，部分患兒如小年齡、早期NB預后明顯優于大年齡晚期組，因此應根據患兒的預后因素，如年齡、分期、N-myc擴增、1p缺失等采用分級治療。早期患兒無N-myc擴增及1p缺失，可僅做手術，手術后隨訪。而大年齡、晚期，伴有N-myc擴增，1p缺失者，需接受強化療和手術，直至骨髓移植。
小兒神經母細胞瘤的基本介紹
小兒神經母細胞瘤（NB）從原始神經嵴細胞演化而來，交感神經鏈、腎上腺髓質是最常見的原發部位。不同年齡、腫瘤發生部位及不同的組織分化程度使其生物特性及臨床表現有很大差異，部分可自然消退或轉化成良性腫瘤，但另一部分患兒卻又十分難治，預后不良。在過去的30年中，嬰兒型或早期NB預后有了明顯的改善，但大
神經母細胞瘤的發病原因
關于神經母細胞瘤真正的病因尚不清楚。一些遺傳 易感因素被發現與神經母細胞瘤的發病相關。家族型神經母細胞瘤被證明與間變淋巴瘤激酶（anaplastic lymphoma kinase，ALK）的體細胞突變（somatic mutation）所導致。此外，在神經母細胞瘤還發現有許多分子突變。N-m
再登Nature－GeneticsecDNA與致ai基因擴增及多種ai癥不良...1
再登Nature Genetics-ecDNA與致ai基因擴增及多種ai癥不良預后相關文章導讀研究發現，許多擴增的原ai基因，并不只是位于染色體，而且還能變成游離的染色體外DNA（ecDNA），并出現大量拷貝，而且相當高比例的ecDNA是以環狀DNA分子的形式存在，即eccDNA（染色體外環狀DNA
遠距離的神經元連接或能驅動人類膠質母細胞瘤的進展
膠質母細胞瘤（GBM）是一種最具侵襲性和致死性的腦瘤，盡管患者進行了治療，但GBM的復發往往是不可避免的，而且其往往會在手術邊緣之外或遠離原發性腫瘤的地方復發，這就突出了腫瘤浸潤在這種惡性疾病中所扮演的核心角色。目前研究人員對于驅動GBM浸潤背后的潛在分子機制知之甚少，近日，一篇發表在國際雜志N
Cell：單分子測序揭示驚人的基因組重排
科學家們發現，生活在池塘里的單細胞生物Oxytricha trifallax有一種非凡的能力，它們能在交配時將DNA打碎并快速重排這些片段。這項研究發表在上一期的Cell雜志上。 Oxytricha的基因重排是一個非常精密的過程，“這是大自然早期一種的復雜化嘗試，”文章的資深作者，Prince
Cell：單分子測序揭示驚人的基因組重排
科學家們發現，生活在池塘里的單細胞生物Oxytricha trifallax有一種非凡的能力，它們能在交配時將DNA打碎并快速重排這些片段。這項研究發表在上一期的Cell雜志上。 Oxytricha的基因重排是一個非常精密的過程，“這是大自然早期一種的復雜化嘗試，”文章的資深作者，Prince
神經母細胞瘤的發病原因介紹
目前關于神經母細胞瘤真正的病因尚不清楚。一些遺傳易感因素被發現與神經母細胞瘤的發病相關。家族型神經母細胞瘤被證明與間變淋巴瘤激酶（anaplastic lymphoma kinase，ALK）的體細胞突變（somatic mutation）所導致。此外，在神經母細胞瘤還發現有許多分子突變。N-m