細菌Argonaute蛋白生成和加載DNA引導鏈的分子機制
近期，《分子細胞》（Molecular Cell）雜志在線發表了中國科學院生物物理研究所王艷麗課題組及其合作者關于細菌Argonaute（Ago）蛋白獨立生成和加載DNA引導鏈的最新研究成果，題為Autonomous Generation and Loading of DNA Guides by Bacterial Argonaute。 真核生物的Ago蛋白是RNA干擾通路的重要組分，它們利用小的RNA引導鏈靶向互補配對的RNA分子。RNA引導鏈的成熟和加載是通過不同的酶來完成的一系列催化反應。Ago蛋白也存在于原核生物中，它們參與抵抗外源入侵的DNA。與真核Ago蛋白利用RNA引導鏈靶向RNA分子不同，大量研究表明原核Ago蛋白利用DNA引導鏈靶向DNA分子。但是小干擾DNA（small interfering DNA， siDNA）引導鏈如何產生并加載到原核Ago蛋白的分子機制依然有待研究。 嗜熱菌（Thermust......閱讀全文
RNA干擾相關知識Argonaute（AGO）
Argonaute（AGO）：一類龐大的蛋白質家族，是組成RISCs復合物的主要成員。AGO蛋白質主要包含兩個結構域：PAZ和PIWI兩個結構域，但具體功能尚不清楚。研究表明，PAZ結構域結合到siRNA 的3’的二核苷酸突出端；一些AGO蛋白質的PIWI結構域賦予slicer以內切酶的活性。PAZ
Argonaute（AGO）蛋白的結構和功能
Argonaute（AGO）：一類龐大的蛋白質家族，是組成RISCs復合物的主要成員。AGO蛋白質主要包含兩個結構域：PAZ和PIWI兩個結構域，但具體功能尚不清楚。研究表明，PAZ結構域結合到siRNA 的3’的二核苷酸突出端；一些AGO蛋白質的PIWI結構域賦予slicer以內切酶的活性。PAZ
關于AGO蛋白質的基本介紹
Argonaute（AGO）：一類龐大的蛋白質家族，是組成RISCs復合物的主要成員。AGO蛋白質主要包含兩個結構域：PAZ和PIWI兩個結構域，但具體功能尚不清楚。研究表明，PAZ結構域結合到siRNA 的3’的二核苷酸突出端；一些AGO蛋白質的PIWI結構域賦予slicer以內切酶的活性。P
什么是Argonaute（AGO）？
Argonaute（AGO）：一類龐大的蛋白質家族，是組成RISCs復合物的主要成員。AGO蛋白質主要包含兩個結構域：PAZ和PIWI兩個結構域，但具體功能尚不清楚。研究表明，PAZ結構域結合到siRNA 的3’的二核苷酸突出端；一些AGO蛋白質的PIWI結構域賦予slicer以內切酶的活性。PAZ
科學家揭示外源核酸誘導的原核生物短Ago蛋白系統發揮功能的分子機理
RNA介導的轉錄后基因調控在生命個體抵御外源入侵的過程中起到重要作用。Argonaute（Ago）蛋白是存在于古菌、細菌和真核生物中的一種蛋白。它為非編碼小RNA提供錨位點，達到降解靶基因或者抑制翻譯的目的。對比真核生物的Ago，原核生物的Ago展現出多樣性，分為三個家族——長A型、長B型和短Ago
Nature：外源核酸誘導的原核生物短Ago蛋白系統發揮功能的分子機理
RNA介導的轉錄后基因調控在生命個體抵御外源入侵的過程中起到重要作用。Argonaute（Ago）蛋白是存在于古菌、細菌和真核生物中的一種蛋白。它為非編碼小RNA提供錨位點，達到降解靶基因或者抑制翻譯的目的。對比真核生物的Ago，原核生物的Ago展現出多樣性，分為三個家族——長A型、長B型和短A
我國學者揭示Agos蛋白指導導向DNA鏈切割靶標DNA鏈機制
近日，《Proceedings of the National Academy of the Sciences of the United States of America，PNAS》雜志在線發表題為“Two symmetric arginine residues play distinct
上海生科院發明一種高效安全的新型RNAi載體
10月12日，國際學術期刊Nature Communications 在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所國家蛋白質科學中心（上海）吳立剛研究組的最新研究成果：Ribozyme-enhanced single-stranded Ago2-processed inter
細菌Argonaute蛋白生成和加載DNA引導鏈的分子機制
近期，《分子細胞》（Molecular Cell）雜志在線發表了中國科學院生物物理研究所王艷麗課題組及其合作者關于細菌Argonaute（Ago）蛋白獨立生成和加載DNA引導鏈的最新研究成果，題為Autonomous Generation and Loading of DNA Guides by
研究揭示Agos蛋白指導導向DNA鏈切割靶標DNA鏈的機制
2018年12月27日，《美國國家科學院院刊》（PNAS）雜志在線發表題為Two symmetric arginine residues play distinct roles in Thermus thermophilus Argonaute DNA guide strand-mediated
細菌Argonaute蛋白生成和加載DNA引導鏈的分子機制被發現
3月2日，《分子細胞》（Molecular Cell）雜志在線發表了中國科學院生物物理研究所王艷麗課題組及其合作者關于細菌Argonaute（Ago）蛋白獨立生成和加載DNA引導鏈的最新研究成果，題為Autonomous Generation and Loading of DNA Guides
浙大：RNA編輯阻止RISC識別靶標mRNA
MicroRNAs（miRNAs）結合Ago形成RNA誘導沉默復合體，通過沉默靶mRNA調控基因表達。miRNA的RNA編輯可能影響miRNA的加工，Ago復合物的組裝，以及靶mRNA的結合。然而，組裝進Ago復合物的被編輯的miRNA的功能，還沒有被深入研究過。 浙江大學生命科學學院章曉波教
植物內源激素油菜素內酯負調控miRNA靶基因的翻譯抑制
植物體內非常重要的小分子非編碼RNA——miRNA在翻譯水平介導的靶標基因抑制是一種非常保守的基因沉默機制。在模式植物擬南芥中，miRNA被裝載到其效應分子ARGONAUTE1（AGO1）蛋白上，以堿基互補配對的方式與其靶標mRNA結合，最終誘導細胞質中靶基因mRNA的切割，或者在內質網中抑制靶
上海交大Hepatology文章解析癌轉移新機制
來自上海交通大學醫學院、上海人類基因組研究中心的研究人員在新研究中證實，Argonaute2通過上調黏著斑激酶(focal adhesion kinase，FAK)的表達，促進了肝癌轉移。相關研究論文發表在4月22日國際著名肝臟疾病雜志Hepatology(最新影響因子11.665)上。
Cell－Rep：KRAS可以被“沉默”
大約三分之一的人類癌癥中存在HRAS、KRAS或NRAS原癌基因突變。其中KRAS突變最為常見，其突變導致人類很多致命癌癥的發生，包括胰腺癌和肺癌等。一直以來，科研工作者都致力于找到藥物能抑制KRAS本身或KRAS信號通路中的關鍵分子。但到目前來看，這個問題仍沒有得到有效地解決。 最近在Cel
原核生物和真核生物Argonaute酶的主要區別
Argonaute蛋白（Ago）是一類龐大的蛋白質家族，是組成RISC復合物的主要成員。在進化過程中演變出了各種亞科蛋白。這些亞科蛋白可以識別各種不同類型的小RNA分子，從而在各種小RNA沉默途徑中發揮作用。 酶有明確的活性位點，與底物分子復雜地結合。這通常伴隨催化反應發生前的酶構象變化。對A
環狀RNA結合功能蛋白
環狀RNA作為研究持續火熱的明星分子，不同于對其豐富的表達譜研究，環狀RNA功能機制研究還僅僅處在起步階段。環狀RNA研究多為miRNA海綿機制，部分circRNA可競爭性結合miRNA，解除miRNA對靶基因的抑制作用，上調靶基因的表達。其實，環狀RNA可以通過結合不同種類的功能蛋白，分別在轉錄前
LACEseq——一種RNA結合蛋白靶標研究的新方法
在真核細胞中，RNA可以“形單影只”，也可以與蛋白質“珠聯璧合”。后者被稱為RNA結合蛋白，它擁有著強大的基因調節能力。 RNA究竟與那些蛋白結合？將怎樣作用于人類的發育、疾病？這都是懸而未解的難題。 6月10日，中國科學院生物物理研究所研究員薛愿超團隊與合作者開發了可在微量細胞中鑒定RNA
在生物學中RITS和RISC的含義
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing（RITS）：是一種組織染色質變型的復合物。RITS復合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白質，通過結合到異染色質的基因池上來促使異染色質上基因的沉默。RNA-induced
為什么熒光素酶互補實驗結果陰性也有
三大類的非編碼RNA（ncRNA），miRNA/lncRNA/circRNA仍然是醫學基礎研究領域最為火熱的研究熱點，大部分的研究人員在立項之初，通過查閱文獻或二代測序+生物信息學分析，獲得了合適的研究對象，但在實驗推進的過程中卻遇到了重重困難。主要有以下幾個原因：1. 找錯了轉錄本；2. ncRN
中科大院士PNAS解析“垃圾”RNA
來自中國科技大學，英國鄧迪大學的研究人員圍繞一種關鍵小蛋白：Stc 1的結構和功能展開了研究，從中揭示出了裂殖酵母中RNAi與染色質修飾之間的分子作用機制，指出了非編碼RNA的又一重要作用。相關成果公布在《美國國家科學院院刊》(PNAS)雜志上。 文章的通訊作者是中國科技大學生命科學學
中科大院士PNAS解析“垃圾”RNA
來自中國科技大學，英國鄧迪大學的研究人員圍繞一種關鍵小蛋白：Stc 1的結構和功能展開了研究，從中揭示出了裂殖酵母中RNAi與染色質修飾之間的分子作用機制，指出了非編碼RNA的又一重要作用。相關成果公布在《美國國家科學院院刊》(PNAS)雜志上。 文章的通訊作者是中國科技大學生命科學學
PNAS：植物病原真菌抑制宿主小RNA跨界干擾增強毒力機制
通過生物活性分子相互作用的生物之間的交流在自然界中很普遍，并且在各種生物過程中發揮著關鍵作用。小 RNA (sRNA) 可以在宿主植物和絲狀病原體之間傳播，以觸發受體細胞中的跨界 RNA 干擾 (RNAi) 并調節植物防御和病原體毒力。然而，很少有關于真菌病原體如何對抗跨界抗真菌 RNAi 的報
陳大華研究組JCB解析piRNAs發生機制
小分子piRNAs(Piwi-interacting RNAs)在抑制轉座子活性和維持基因組穩定性起重要作用，但其發生和調控的分子機制仍不清楚。果蠅生殖細胞為研究這一機制提供了良好的模型。果蠅生殖細胞中piRNAs 的發生包括初級加工和次級加工兩個過程，其中piRNAs次級加工途徑，又稱乒乓循環
首次！黃超蘭：單堿基分辨率和單細胞層面的精準鑒定
2021年6月10日，北京大學醫學部精準醫療多組學研究中心黃超蘭團隊，與中國科學院生物物理研究所薛愿超團隊、廣東省第二人民醫院孫青原團隊，合作在Nature Cell Biology上發表了題為“Global profiling of RNA-binding protein targetsite
如何預測和鑒定miRNA的靶基因
免疫沉淀當然，確定miRNA與mRNA之間的互作，我們還有更直接的方法，那就是從實驗上尋找物理相互作用。我們可以利用RNA誘導沉默復合物（RISC）中的Argonaut（AGO）蛋白的抗體進行免疫共沉淀（co-IP）。目前更先進的方法是通過紫外線照射以交聯復合物，然后開展深度測序以鑒定發現的RNA，
動物所揭示小分子piRNAs的發生和調控機制
小分子piRNAs(Piwi-interacting RNAs)在抑制轉座子活性和維持基因組穩定性方面起重要作用，但其發生和調控的分子機制仍不清楚。果蠅生殖細胞為研究這一機制提供了良好的模型。果蠅生殖細胞中piRNAs 的發生包括初級加工和次級加工兩個過程，其中piRNAs次級加工途徑，又稱乒乓
－Gene－Dev：研究果蠅提示衰老相關疾病的發病機制
阿爾茨海默氏病和亨廷頓病通常都與老化相關，但她們之間的生物聯系一直不甚明了。現在，Rutgers大學研究人員通過學習常見果蠅中小RNA分子，尋求解答上述問題。 Ammar Naqvi博士表示：利用果蠅，我們能夠檢測特定microRNA模式，當microRNA綁定到特定蛋白質時，會有助于
吳立剛課題組Nature子刊發布RNAi新工具
來自中科院上海生命科學研究院的研究人員報告稱，他們設計出了一種替代性的小干擾RNA（small interfering RNA，siRNA）前體，將之命名為saiRNA (single-stranded, Argonaute 2 (Ago2)-processed interfering RNA)
我國科學家解析小RNA的生物合成機制
小RNA是真核生物中重要的基因調控分子，在生長發育、基因沉默、抵御病毒等動植物的各類生理過程中起著至關重要的作用。小RNA的生物合成中，Dicer家族核酸內切酶選擇性識別小RNA前體，切割RNA至特定長度，并選擇性地將一條鏈遞呈給下游AGO蛋白從而介導下游基因沉默。Dicer如何起到“分子尺”和