2018年12月27日,《美國國家科學院院刊》(PNAS)雜志在線發表題為Two symmetric arginine residues play distinct roles in Thermus thermophilus Argonaute DNA guide strand-mediated DNA target cleavage 的論文。該論文在原子水平闡明了細菌的Agos蛋白中參與切割活性的兩個對稱的精氨酸的重要意義。
RNA干擾對基因的表達調控具有重要作用,并且在生物中普遍存在。Ago蛋白結合小RNA是RNA誘導的沉默復合體的核心組分,它們利用小的RNA引導鏈靶向互補配對的RNA分子,降解目的mRNA或者抑制目的mRNA的翻譯。與真核Ago蛋白利用RNA引導鏈靶向RNA分子不同,大量研究表明原核Ago蛋白利用DNA引導鏈靶向DNA分子,具有DNA介導的DNA干擾作用。TtAgo是通過RNase H型機制剪切靶標DNA或者RNA,Ago構象的改變促進活性中心在非活性狀態和活性狀態之間轉換,但是Ago具體催化機制還不清楚。在該項研究中,中國科學院生物物理研究所王艷麗課題組及其合作者發現在TtAgo中的兩個帶正電荷的氨基酸具有重要作用。在TtAgo中R545在切割靶鏈時是穩定指構象的主要的氨基酸殘基,而R486的作用比較微弱,這就表明在不同種生物的Ago蛋白切割靶鏈時谷氨酸指兩邊的氨基酸殘基的分子機制有所變化。
該研究由王艷麗課題組與香港科技大學Xuhui Huang實驗室以及紐約大學Yingkai Zhang實驗室合作完成。其中,生物物理所研究員王艷麗、香港科技大學教授Xuhui Huang、紐約大學教授Yingkai Zhang是論文的共同通訊作者。該研究得到科技部、國家自然科學基金以及中科院戰略性先導科技專項(B類)的資助,上海同步輻射光源(SSRF)以及日本同步輻射光源SPring-8為該研究提供了重要的技術支持。
2018年12月27日,《美國國家科學院院刊》(PNAS)雜志在線發表題為TwosymmetricarginineresiduesplaydistinctrolesinThermusthermophi......