美國立衛生研究院投巨資獎勵大數據挖掘
ENIGMA項目將收集數千張大腦圖像。 為了馴服生物實驗室辛苦得出的數據洪流，美國國立衛生研究院（NIH）近日宣布，今年投資3200萬美元設立一個獎項，以推動研究人員開發分析和使用生物學大數據庫的方法。 該獎項出自NIH去年啟動的大數據知識（BD2K）創新計劃。NIH認為應當投入更多資源幫助使用不斷增長的數據集——生物醫學研究者積累的基因、蛋白質和患者檔案等數據。例如，在一個“干生物學”項目中，研究人員將細胞基因表達的公共數據和患者檔案混合在一起，預測現存藥物的新用途。 BD2K獎項“將幫助我們克服最大化利用數據洪流面臨的障礙，而且目前數據積累速度正在加速。”NIH院長Francis Collins在新聞發布會上說。他表示，這些獎金將資助開發計算工具、軟件、標準和方法，用于分享和使用大數據集。 在未來4年里，11個卓越創新中心每年將收到200萬~300萬美元，開發從建模癌癥細胞信號到整合移動傳感器數據等各個方面所需......閱讀全文
生物信息分析數據挖掘
DNA芯片技術能夠在基因組水平分析基因表達，檢測許多基因的轉錄水平及在不同條件下的基因轉錄變化，顯示反映特征組織類型、發育階段、環境條件應答、遺傳改變的基因譜。基因芯片產生了海量的數據，僅僅進行差異表達分析還遠遠不夠，如何管理分析這些數據、從中挖掘信息已經成為利用這一技術的新的難點。芯片數據大量出現
生物數據喚醒日常家居
談到智能物體，多數的家居用品都相當地不夠智能。它們蹲在固定位置，了無生氣，跟主人毫無交流。但據亞力克斯·羅瑟拉和詹姆斯·克拉厄所言，即使是最不聲不響的物體也能擁有神奇的互動性，而這只是個時間問題。這些設計師稱，通過身體傳達出的數據，家居用品將可以與我們進行互動。 在都柏林科學畫廊生命記錄展的
生物醫療大數據如何應用？
隨著生物科技和醫療技術的迅猛發展、高通量手段的成熟，生物醫療行業的大數據急劇膨脹。然而，與其它行業的數據不同，生物醫療行業的數據呈現分散、破碎、低透明度、以及意義尚等解析等特征。不象其它行業，數據具有時效性以及數據很輕、易于解析；生物醫療行業的數據普遍很“重”、信息量超大、不同的解析策略可能得出
生物醫學大數據亟待深挖利用
圖片來源于網絡 “我國是人類遺傳資源大國，但不是強國，隨著健康中國、大數據等國家重大戰略的實施，迫切需要加強對人類遺傳資源的深入研究和信息挖掘。” 10月10日，人類遺傳資源開發創新研究高層論壇在京召開。中國生物技術發展中心主任張新民坦承，國家人類遺傳資源管理和保護涉及生命倫理和國家安全，在資
大數據：生物醫學變革新契機
“我國目前每年醫療費用總額超過2.4萬億元，如果按照麥肯錫報告的預測，我國醫療領域利用大數據每年將節省醫療費用近2000億元。”軍事醫學科學院研究員朱云平在11月29日召開的“第五屆重大疾病防治科技創新高峰論壇”上如是說。 大數據影響的深度和廣度仍在不斷擴張。對于生物醫學來說，其發展過程中積淀
植物生物學研究數據庫
實驗概要植物生物學研究數據庫實驗步驟http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home?英國 Top 植物種的snoRNA基因數據庫。 綜合?http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant
英國生物庫數據開始對外開放
英國生物庫數據于3月30日正式面向研究人員開放。通過這一數據庫，全球的科學家都可以將近50萬英國人的各種健康數據用于研究，這無疑對全球醫學研究起到積極的推動作用。 英國生物庫項目于2006年8月正式啟動，旨在收集大量的生物樣本和醫學數據用于醫學研究。數據收集目標為40歲到65歲的英國人，數
世界微生物數據中心落戶微生物所
在近日召開的第12屆國際菌種保藏大會上，經過大會專家委員會評審并經世界菌種保藏聯合會理事會審議通過，中國科學院微生物研究所在眾多的競爭者中脫穎而出，成為世界微生物數據中心（World Data Center for Microorganisms, WDCM）新的主持單位。 W
微生物所發表中國微生物組數據平臺
10月26日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在線發表中國科學院微生物研究所微生物資源與大數據中心、世界微生物數據中心馬俊才團隊題為gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar
水德浮游生物大數據平臺的使用與數據分析方法
水德浮游生物大數據平臺?目前，絕大多數海洋和淡水生態領域的研究機構和業務監測單位，對浮游生物的研究手段還停留在人工鏡檢及手工測定的階段，這樣經常導致操作過程繁瑣、工作量巨大、分析結果滯后，而且需要資深專業技術人員。此平臺用于對浮游生物樣品進行快速安全清洗、掃描成像、種類鑒定、數量統計、大小測量、生物
－生物醫學基因大數據：現狀與展望
生物醫學大數據廣泛涉及人類健康相關的各個領域：臨床醫療、公共衛生、醫藥研發、醫療市場與費用、個體行為與情緒、人類遺傳學與組學、社會人口學、環境、健康網絡與媒體數據。 大數據(big data)是指由于容量太大和過于復雜，無法在一定時間內用常規軟件對其內容進行抓取、管理、存儲、檢索、共享、傳輸和
JAMA：生物醫學大數據缺失的環節
有人認為，大數據將有助于提高醫療保健行業的效率，促進在該行業推行問責制。然而到目前為止，其他行業在這方面要成功得多：通過對多種數據源進行大規模的整合和分析，獲得了實用價值。那些成功行業弄明白了一個問題，那就是：當不同的數據集在具體某個人的層面上連接起來時，大數據就會產生變革性的價值。相比之下，生
英國生物樣本庫發布大規模遺傳數據
近日在線發表于《自然》的兩篇論文集中介紹了英國生物樣本庫的遺傳數據。兩篇論文對整個數據集進行了詳細描述，并對大腦遺傳結構進行了深入研究。該數據集涵蓋了約50萬個個體的全基因組遺傳數據、臨床測量以及健康記錄。 英國生物樣本庫包含50萬年齡（招募時）在40~69歲之間英國人的遺傳和臨床數據，這些資
全球首個冰川微生物數據庫
青藏高原被稱為世界“第三極”和“亞洲水塔”。除南北極外，它是全球最大的冰川分布區，現有冰川2萬條以上，面積超過2萬平方公里，也是我國及亞洲20億人賴以生存的十多條大江大河的源頭。青藏高原冰川是微生物的天然存儲器，封存了不同歷史時期的微生物。 現在，中國科學家構建的
生物大數據研討會聚焦前沿問題
首屆中國生物大數據統計方法研討會近日在重慶舉行。會議圍繞大數據統計方法與傳統統計方法的關系、生物大數據的特征與分類、生物醫學大數據的功能與運用等前沿問題展開專題報告和自由研討。 會議由中國衛生信息學會衛生統計理論與方法專業委員會主辦，第三軍醫大學軍事預防醫學院承辦，來自北京大學、重慶大學、中山
中國生物技術發展中心調研生物大數據發展情況
為應對大數據時代帶來的挑戰，了解大數據技術發展態勢以及對未來我國生物技術領域的科研能力、公共管理和產業競爭力方面的影響，探討應對措施，生物中心肖詩鷹副主任于2014年5月6-7日帶隊到復旦大學、浙江大學進行了調研。 在復旦大學、浙江大學科研管理部門的支持配合下，召開了題為“大數據對我國生物
生物梅里埃收購Applied－Maths，增強生物數據處理能力
分析測試百科網訊 生物梅里埃于近日宣布收購Applied Maths，Applied Maths是一家專業為生物科技開發最先進的軟件解決方案的公司，尤其擅長復雜數據的數據庫存儲、分析和解讀。該公司成立于1992年，以其在信息學和生物學方面專業的綜合知識而享譽全球。 隨著新技
融智生物發布全球首個商用化生物組學微生物質譜數據庫
近日，融智生物宣布建設完成基于全新生物組學理念的微生物質譜數據庫。這是全球首次發布商品化生物組學微生物質譜數據庫。 傳統上，基于不同的細菌或真菌內蛋白組成分特別是核糖體蛋白有顯著的差異，對核糖體蛋白組的質譜測試，可用于快速、高準確度鑒定微生物。基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜（MALDI-TO
簡述鄰氯苯甲酸的生物學數據
該物質對環境有危害，對水體和大氣可造成污染，有機酸易在大氣化學和大氣物理變化中形成酸雨。因而當PH值降到 5以下時，會給動、植物造成嚴重危害，魚的繁殖和發育會受到嚴重影響，流域土壤和水體底泥中的金屬可被溶解進入水中毒害魚類。水體酸化還會導致水生生物的組成結構發生變化，耐酸的藻類、真菌增多，而有根
生物醫藥產業大數據應用概覽
一、國家大數據戰略 數據是國家基礎性戰略資源，是21世紀的“鉆石礦”。黨的十八屆五中全會提出“實施國家大數據戰略”，國務院印發《促進大數據發展行動綱要》、工信部印發《大數據產業發展規劃（2016－2020年）》，全面推進大數據發展，加快建設數據強國。 2016年6月，國務院辦公廳印發《國務院
科研數據難共享阻礙國內生物科技發展
上海生物信息技術研究中心主任李亦學的“科研數據共享之夢”已做了13年。但在近日舉行的首屆金橋產業技術創新會議上，當記者向他問及相關進展時，聽到的卻是一聲嘆息。 13年前，“大數據”尚未被任何字典收錄，而今卻被公認是全球生命科學研究的核心工具。李亦學告訴記者，科研數據難以共享已成為國內生命科
生物學家借助數據科學破解生命奧秘
自2000年人類基因組圖譜繪制后，生物學研究邁入全新的“組學”時代，科學家們爭先恐后地測序各種有機生物的基因組或蛋白質組。 現在，即使一些簡單的實驗都會產生大量數據，而從“背景噪音”中獲得想要的結果則成為了一大挑戰。美國趣味科學網站近日報道指出，計算機技術正幫助科學家們征服這些數據大山，甚至提
劉偉：生物多樣性數據共享現狀和建議
數據共享對于科學發展和大科學研究模式至關重要，也是各國政府部門科學決策的重要基礎，備受關注。 在信息時代的背景下，生物多樣性領域面臨的一個重要挑戰是如何有效地共享及整合生物多樣性數據。 生物多樣性數據共享的重要性至少體現在三個方面：一是拓展生物多樣性相關領域研究的深度和廣度需要數據共享；二是
中國BIGD躋身國際生物組學數據庫
測序技術的發展將生命科學領域帶入組學時代，海量的數據產出成為常態。組學是將基因、蛋白及代謝物等生物分子以整體為單位進行系統性的研究，基因組學、蛋白質組學和代謝物組學等相應產生。相較于此前以個體為單位的研究，組學最主要的特征就是大數據。隨著組學數據的產出，搭建組學數據庫，實現海量信息的存儲、整合及
生物芯片實驗信號檢測及數據處理
芯片實驗完成后，芯片就可以放人商品化的生物芯片掃描儀中進行掃描、識別、提取和分析(掃描儀的操作根據商家提供的具體操作執行)。掃描儀得到圖像后，必須對數據進行提取，才能進行后續的數據分析。圖像處理和數據分析是基因芯片研究的核心技術之一。對于SNP實驗結果分析較簡單，而對于基因表達譜研究、CGH分析及高
我國微生物大數據平臺建設獲進展
近日，中國科學院微生物研究所微生物資源與大數據中心、世界微生物數據中心團隊題為World Data Centre for Microorganisms: an information infrastructure to explore and utilize preserved microbia
美推出生物醫學數據管理戰略
組織良好、安全高效運營的數據資源對于現代科學研究至關重要。4日，美國國立衛生研究院（NIH）發布了其第一個數據科學管理戰略——《NIH數據科學戰略計劃》，為推動生物醫學數據科學管理現代化制定路線圖。NIH希望通過最大程度地提高其所資助研究生成的醫學數據的利用價值，更好地推動美國生物醫學研究。
各種模式生物必需基因在線數據庫
Essential Genes are the genes that are indispensable to sustain cellular life. The functions encoded by essential genes are considered as a foundation
首個國際ISO微生物數據標準正式發布
微生物資源是國家的重要戰略資源，微生物數據資源則是微生物資源共享和開發的關鍵環節，數據資源的豐富性、準確性和共享水平，決定著微生物學領域研究和應用的綜合能力。 2020年11月9日，國際標準化組織生物技術委員會（ISO/TC 276）正式發布微生物資源中心數據管理和數據發布標準（ISO 217
劉偉：生物多樣性數據共享現狀和建議
數據共享對于科學發展和大科學研究模式至關重要，也是各國政府部門科學決策的重要基礎，備受關注。 在信息時代的背景下，生物多樣性領域面臨的一個重要挑戰是如何有效地共享及整合生物多樣性數據。 生物多樣性數據共享的重要性至少體現在三個方面：一是拓展生物多樣性相關領域研究的深度和廣度需要數據共享；二是