植物所發現植物全基因組應答低溫中信使RNA降解新機制
信使RNA(mRNA)降解的動態模式是生物發育調控和適應環境的重要機制。但對植物mRNA降解在環境脅迫下的作用模式知之甚少。中科院植物研究所種康研究組通過RNA末端平行分析(parallel analysis of RNA ends)和轉錄組檢測,并借助高通量測序手段揭示了單子葉模式植物二穗短柄草mRNA去帽降解途徑及其低溫應答模式。 研究發現,mRNA降解存在Type I、II、III和IV4種方式。Type II基因在耐低溫脅迫反應中,捕光蛋白基因轉錄本的降解速度發生顯著變化,而其表達量則無明顯改變,推測可能是植物細胞能量經濟分配的一種應答方式。與TypeII相比,type III基因的轉錄本和mRNA去帽降解產物對低溫呈現相反的變化模式,顯示mRNA降解確實在耐低溫脅迫反應中發揮作用。RNA末端平行高通量測序、qSL-RT-PCR及LM-PAT分析還揭示了植物中核酸內切酶在mRNA降解中的功能機制。 ......閱讀全文
Nature發布大型全基因組RNA分析研究
由來自賓夕法尼亞州立大學的化學家和植物生物學家領導的一個研究小組開發出了一種分子技術,將有助于科學團體以從前不可能達到的規模,來分析在基因表達調控中起重要作用的分子。 科學家們開發出了一種方法,能夠更精確預測在活細胞內核糖核酸分子(RNAs)的折疊情況,由此闡明植物以及其他的活體生物對環境
RNA測序技術如何繪制全基因組轉錄終止?
近日,南方科技大學生命科學學院翟繼先團隊利用納米孔單分子RNA測序技術繪制了擬南芥全基因組水平轉錄終止圖譜。該方法能同時捕獲包括已轉錄過polyA位點的 readthrough轉錄本、完成3’末端切割的5’或3’切割產物、以及已完成或正在進行多腺苷酸化(polyadenylation)的轉錄本在
科學家用信使RNA研制疫苗
本周的《自然―生物技術》報道了一種僅由信使RNA組成的疫苗,這種疫苗可保護動物不受流感傳染。若能證實該疫苗對人體有效,那么流感疫苗的研發與生產周期或將從目前的數月縮短至數星期,對流行疾病的反應速度也將更快。 目前的流感疫苗是通過在雞蛋中接種或者細胞培養的方式獲得,其生產過程煩瑣、耗時。這意
關于信使RNA噬菌體QbRNA的復制
其RNA是單鏈,正鏈,侵入大腸桿菌后立即翻譯,產生復制酶的b亞基,與宿主的三個亞基(α為核糖體蛋白,γ、δ均為肽鏈延長因子)構成復制酶,進行復制。先以正鏈為模板合成負鏈,再根據負鏈合成正鏈。合成負鏈時需要宿主的兩個蛋白因子,合成正鏈則不需要,所以可大量合成。病毒的蛋白質合成受RNA高級結構的調控
信使RNA的拼接相關內容
一、轉運RNA的拼接:由酶催化,酶識別共同的二級結構,而不是序列。通常內含子插入到靠近反密碼子處,與反密碼子配對,取代反密碼子環。第一步由內切酶切除插入序列,不需ATP;第二步由RNA連接酶連接,需要ATP。 二、四膜蟲核糖體RNA的拼接:某些四膜蟲26S核糖體RNA基因中有一個內含子,其拼接
關于信使RNA的發現時間介紹
儲存在DNA分子中的這種遺傳信息能在復制中產生更多的拷貝,并翻譯成蛋白質。DNA的功能構成了信息的流動,遺傳信息如何轉變成蛋白質呢?轉錄就是其中的重要的一環。基因表達時以DNA的一條鏈為模板合成RNA,這一過程就是轉錄(transcription)。催化合成RNA的酶叫做RNA聚合酶(RNA p
信使RNA的檢測、分析及定量介紹
對mRNA的檢測、分析及定量方法目標RNA的類型同時定量的目標RNA的數量用途缺點Northern雜交mRNA通常為一個,最多幾個。主要用于估測不同組織、細胞中目標mRNA的分子質量,可用于mRNA的粗略定量。需要大量RNA;只可同時檢測一個或最多幾個mRNA;與PCR方法相比,靈敏度差、耗時。RN
信使RNA提取分離的操作步驟介紹
1.將0.5-1.0g寡聚(dT)-纖維懸浮于0.1M的NaOH溶液中。 2.用DEPC處理的1ml注射器或適當的吸管,將寡聚(dT)-纖維素裝柱0.5-1ml,用3倍柱床體積的DEPC H2O洗柱。 3.使用1×上樣緩沖液洗柱,直至洗出液pH值小于8.0。 4.將RNA溶解于DEPC H
關于信使RNA的提取分享試劑準備
真核細胞的mRNA分子最顯著的結構特征是具有5’端帽子結構(m7G)和3’端的Poly(A)尾巴。絕大多數哺乳類動物細胞mRNA的3’端存在20-30個腺苷酸組成的Poly(A)尾,通常用Poly(A+)表示。這種結構為真核mRNA的提取,提供了極為方便的選擇性標志,寡聚(dT)纖維素或寡聚(U
信使RNA反轉錄的生物學意義
1.對分子生物學的中心法則進行了修正和補充,修正后的中心法則表示為: 2.在致癌病毒的研究中發現了癌基因,在人類一些癌細胞如膀胱癌、小細胞肺癌等細胞中,也分離出與病毒癌基因相同的堿基序列,稱為細胞癌基因或原癌基因。癌基因的發現為腫瘤發病機理的研究提供了很有前途的線索。 3.在實際工作中有助于
信使RNA的原核生物的相關介紹
一、核糖體RNA:大腸桿菌共有7個核糖體RNA的轉錄單位,每個轉錄單位由16S、23S、5SRNA和若干轉運RNA基因組成。16S和23S之間常由轉運RNA隔開。轉錄產物在RNA酶III的作用下裂解產生核糖體RNA的前體P16和P23,再由相應成熟酶加工切除附加序列。前體加工時還進行甲基化,產生
信使RNA的啟動子和轉錄因子
一定義:酶識別、結合、開始轉錄的一段DNA序列。強啟動子2秒鐘啟動一次轉錄,弱啟動子10分鐘一次。 二原核生物:大腸桿菌在起點上游約-10堿基對處有保守序列TATAAT,稱為pribnow box,有助于局部解鏈。在其上游還有TTGACA,稱為-35序列,提供RNA聚合酶識別的信號。 三真核
信使RNA的真核生物的相關介紹
一、核糖體RNA:基因拷貝數多,在幾十到幾千之間。基因成簇排列在一起,由RNA聚合酶I轉錄生成一個較長的前體,哺乳動物為45S。核仁是rRNA合成與核糖體亞基生物合成的場所。RNA酶III等核酸內切酶在加工中起重要作用。5SRNA基因也是成簇排列的,由RNA聚合酶III轉錄,經加工參與構成大亞基
信使RNA的存在范圍和性質相關介紹
mRNA存在于原核和真核生物的細胞質及真核細胞的某些細胞器(如和)中。RNA病毒和RNA噬菌體中的 RNA既是遺傳信息的載體又具有mRNA的功能。生物體mRNA種類的多少與生物進化水平有關,高等生物所含的遺傳信息多,mRNA的種類也多。生物體內某種mRNA的含量根據需要而有不同,如5齡蠶后部絲腺
全血RNA提取
摘要:?RNA提取應該說已經成為了一種常見的分子生物學操作步驟了,但是不少科研人員仍然煩惱著如何尋找一種最好的方法,或者找到一種適合于特殊用途方法。比如說傳統的血液標本表達譜芯片實驗需要先把有核細胞從全血中分離出來,加白細胞分離液、離心等步驟,比較繁瑣,如果能進行全血的提取,那就再好不過。RNA提取
關于信使RNA提取和分離的注意事項
1.整個實驗過程必須防止Rnase的污染。 2.步驟⑷中將RNA溶液置65℃中溫育然后冷卻至室溫再上樣的目的有兩個,一個是破壞RNA的二級結構,尤其是mRNA Poly(A+)尾處的二級結構,使Poly(A+)尾充分暴露,從而提高Poly(A+)RNA的回收率;另一個目的是能解離mRNA與rR
關于信使RNA的終止子和終止因子
一、定義 二、所有原核生物的終止子在終點之前都有一個回文結構,可使酶減慢移動或暫停合成。大腸桿菌有兩類終止子: 1. 簡單終止子,回文區有一段富含GC對的序列,回文后有寡聚尿苷。 2.依賴ρ的終止子,必須在有ρ因子時才能發揮作用,不含GC對,也無寡聚尿苷。ρ因子是蛋白質,可與酶作用,釋放R
健康所在RNA結合蛋白調節信使RNA翻譯研究中取得新進展
近日,國際學術期刊Molecular and Cellular Biology在線發表了中科院上海生命科學研究院/上海交通大學醫學院健康所核酸與分子醫學研究組的最新研究進展:AU-Rich Element-Dependent Translation Repression Requires the
全血RNA提取實驗
實驗材料 鮮血液試劑、試劑盒 抗凝劑紅細胞裂解液RLB去蛋白液RW1乙醇漂洗液RW儀器、耗材 制冰機離心機離心管移液槍移液管針頭注射器水浴鍋實驗步驟 一、在適合大小的RNase free離心管中加入1體積(
全血RNA提取實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 紅細胞裂解液選擇性裂解紅細胞,然后獨特的裂解液/β-巰基乙醇迅速裂解白細胞和滅活細胞RNA酶,然后用乙醇調節結合條件后,RNA在高離序鹽狀態下選擇性吸附于離心柱內硅基質膜, 再通過一系列快速的漂洗-離心的步驟, 去蛋白液和漂
全血RNA提取實驗
全血RNA的提取可用于:(1)研究RNA干擾機制等;(2)用作反轉錄模板;(3)分子生物學其他研究。實驗方法原理紅細胞裂解液選擇性裂解紅細胞,然后獨特的裂解液/β-巰基乙醇迅速裂解白細胞和滅活細胞RNA酶,然后用乙醇調節結合條件后,RNA在高離序鹽狀態下選擇性吸附于離心柱內硅基質膜, 再通過一系列快
全血RNA快速提取
操作步驟:(實驗前請先閱讀注意事項)提示:??第一次使用前請先在漂洗液RW瓶和70%乙醇瓶中加入指定量無水乙醇!??使用前將10X紅細胞裂解液RLB用DEPC處理水稀釋到1X。??操作前在裂解液RLT中加入β-巰基乙醇至終濃度1%,如1 ml RLT 中加入10μl β-巰基乙醇。此裂解液最好現用現
信使RNA的反轉錄酶與反轉錄過程
定義:以反義RNA為模版,通過反轉錄酶,進行的RNA轉錄 1.概念反轉錄是以RNA為模板合成DNA的過程,也稱逆轉錄。這是DNA生物合成的一種特殊方式。 2.反轉錄酶與反轉錄過程 反轉錄過程由反轉錄酶催化,該酶也稱依賴RNA的DNA聚合酶(RDDP),即以RNA為模板催化DNA鏈的合成。合
OPGEN全基因組圖譜應用系列——鞭蟲全基因組測序
鞭蟲是一種常見的土壤傳播寄生蟲,地理分布廣,感染率高,寄生于人體盲腸,導致人體慢性感染,對人類危害巨大。鞭蟲的全基因組測序研究由著名的桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)完成,發表在世界頂級期刊《Nature Genetics》上。該研究通過對2種不同
首款小干擾RNA藥物-能干擾RNA的“信使”功能
?? 美國食品和藥物管理局日前批準首款小干擾RNA藥物,用于治療患有遺傳性轉甲狀腺素蛋白淀粉樣變性的成年患者。 小干擾RNA是一段微小的RNA分子,能干擾RNA的“信使”功能,導致致病基因“沉默”,相關蛋白質無法合成。新獲批的Onpattro是第一款利用這一機理研制的藥物。 遺傳性轉甲狀腺素
人類全基因組測序計劃
全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序。 1986年, Renato Dulbecco是Z早提出人類基因組測序的科學家之一。他認為如果能夠知道所有人類基因的序列,對癌癥的研究將會很有幫助。美國能源部(DOE)與美國國家衛生研究院(NIH),分別在1986年與1987年加入人類基
虎尾海馬全基因組破譯
中科院南海海洋研究所、德國康斯坦茨大學、華大基因和新加坡A*STAR研究院聯合破譯了虎尾海馬的全基因組。有關研究成果日前以封面文章的形式發表在《自然》雜志上。 海馬隸屬于海龍科。與其他硬骨魚不同,海馬呈現高度特殊的形態,例如頭部前方具有管狀長嘴,無腹鰭和尾鰭,尾端卷曲,全身覆蓋硬骨骼,沒有鱗片
全基因組擴增技術介紹
研究人員通常會在下游分析中遭遇DNA樣本量有限或不足的問題。QIAGEN的全基因組擴增技術通過以包括單細胞在內的小量樣本或珍貴樣本擴增獲得基因組DNA,解決此類難題。REPLI-g?Kit能夠準確地復制原始DNA樣本,不會造成偏差,擴增后的DNA可以直接應用于廣泛的遺傳學分析。什么是全基因組擴增(w
信使RNA-疫苗大幅降低無癥狀新冠感染和傳播他人風險
羅切斯特,明尼蘇達州 — 接受第二劑信使RNA或mRNA COVID-19疫苗10天后,與未接種COVID-19疫苗的患者相比,無癥狀COVID-19感染者檢測為陽性和在不知不覺中傳播COVID-19的可能性大幅降低。Pfizer-BioNTech和Moderna信使RNA COVID-19疫苗
全基因組的比較基因組雜交技術介紹
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a