科學家“復活”石器時代分子,展現古代微生物多樣性
古代基因組重建和生物技術的突破正在揭示舊石器時代微生物豐富的分子秘密。在最新一期《科學》雜志上發表的研究中,德國萊布尼茨天然產物研究和感染生物學研究所、馬克斯·普朗克進化人類學研究所以及美國哈佛大學領導的跨學科研究團隊重建了更新世以前未知細菌的基因組,并由此建立了一個平臺以恢復古代細菌的天然產物。當一個生物體死亡時,它的DNA會迅速降解并分裂成許多微小的碎片。科學家可通過將這些DNA片段與數據庫進行匹配來識別其中的一些片段,但大多數古代DNA無法與當今已知的任何東西相匹配。這個問題長期以來一直困擾著科學家。近年來計算技術的進步使得將DNA片段重新組合在一起成為可能,就像拼圖一樣,或可重建未知的基因和基因組。經過3年的測試和優化,科學家取得了突破,實現了長度超過100000個堿基對的DNA片段,并恢復了廣泛的古代基因和基因組。他們現在可從數十億個未知的古代DNA片段開始,系統地將它們整理成冰河時代失傳已久的細菌基因組。團隊專注于重......閱讀全文
調整基因編碼蛋白的檢測
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微生物所發現植物保護內源編碼基因避免RNA沉默的新機制
在真核生物中,RNA沉默是一個具有核苷酸序列特異性的,能夠導致RNA降解、DNA甲基化,異染色質形成,以及蛋白翻譯抑制的調控機制。在植物中,誘發高效的RNA沉默還包括siRNA和甲基化在靶序列上的漂移、沉默信號在細胞間和整株植物的擴散并產生由信號誘導的RNA沉默(非自主性沉默)。植
EGFR負相關基因編碼功能描述
EGFR編碼的蛋白是一種跨膜糖蛋白,也是表皮生長因子受體家族中的一員,該家族包括HER1(erbB1,EGFR)、HER2(erbB2,NEU)、HER3(erbB3)及HER4(erbB4),也屬于受體酪氨酸激酶家族。EGFR作為細胞表面蛋白可與配體如表皮生長因子(EGF)結合,EGFR可被激活,
PTEN負相關基因編碼功能描述
PTEN基因編碼的蛋白具有蛋白磷酸酶和脂質磷酸酶活性,是第一個具有磷酸酶活性的抑癌基因,也是是繼p53和Rb基因之后,與腫瘤發生密切相關的一種抑癌基因,其主要機制因為PTEN是PI3K/Akt通路的主要負調控因子。PTEN的功能缺陷在人類多種腫瘤中廣泛存在。
常見癌基因編碼蛋白的檢測
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ITPA基因編碼功能及結構描述
該基因編碼一種肌苷三磷酸焦磷酸水解酶。編碼蛋白水解肌苷三磷酸和脫氧肌苷三磷酸,得到一磷酸核苷酸和二磷酸。這種蛋白質是ham1 ntpase蛋白家族的一員,存在于細胞質中,起著同二聚體的作用。編碼蛋白的缺陷可導致肌苷三磷酸焦磷酸化酶缺乏,從而導致紅細胞中itp的積聚。交替剪接導致多個轉錄變體。[由Re
GOPC基因編碼功能及結構描述
該基因編碼一個具有PDZ結構域的高爾基蛋白PDZ結構域是球狀的,含有它們的蛋白質通過C末端附近的短基序與其他蛋白質結合缺乏原代蛋白的小鼠有球形精子癥,并且不育。已發現該基因編碼不同亞型的多個轉錄變體。[由RefSeq提供,2011年12月]This gene encodes a Golgi prot
MGMT基因編碼功能及結構描述
烷基化劑是一種有效的致癌物,可導致細胞死亡、突變和癌癥。該基因編碼的蛋白質是一種DNA修復蛋白,參與細胞抵御烷基化劑的誘變和毒性。這種蛋白催化甲基從O(6)-烷基鳥嘌呤和DNA的其他甲基化部分轉移到它自己的分子,從而修復毒性損傷。基因啟動子甲基化與多種癌癥類型有關,包括結直腸癌、肺癌、淋巴瘤和膠質母
GAST基因編碼功能及結構描述
胃泌素是一種激素,其主要功能是刺激胃粘膜分泌鹽酸,從而抑制胃泌素的形成這種激素也是胃腸道上皮細胞有絲分裂因子胃泌素有兩種生物活性肽形式,G34和G17[由RefSeq提供,2008年7月]Gastrin is a hormone whose main function is to stimulate
HGF基因編碼功能及結構描述
該基因編碼轉錄因子缺氧誘導因子-1(hif-1)的α亞單位,是由α亞單位和β亞單位組成的異二聚體。HIF-1通過激活許多基因的轉錄,包括那些參與能量代謝、血管生成、細胞凋亡和其他蛋白質產物增加氧氣輸送或促進對缺氧的代謝適應的基因,作為細胞和全身對缺氧的穩態反應的主要調節器。因此,HIF-1在胚胎血管
MAGOh基因編碼功能及結構描述
果蠅的mago-nashi(無孫)基因突變產生的后代在種質組合和種系發育方面存在缺陷這個基因編碼哺乳動物的mago-nashi同源基因在哺乳動物中,mRNA的表達并不局限于原生質,而是在成體組織中廣泛表達,可通過血清刺激靜止成纖維細胞誘導表達[由RefSeq提供,2008年7月]\Drosophil
CYLD基因編碼功能及結構描述
該基因編碼一種細胞質蛋白,具有三個細胞骨架相關蛋白-甘氨酸保守(cap-gly)結構域,作為一種去氫酶。該基因突變與圓筒狀瘤、多發性家族性毛發上皮瘤和brooke-spiegler綜合征有關。交替轉錄剪接變體,編碼不同的亞型,已經被描述出來。[由RefSeq提供,2008年7月]This gene
GUSB基因編碼功能及結構描述
該基因編碼一種降解糖胺聚糖的水解酶,包括硫酸乙酰肝素、硫酸皮膚素和硫酸軟骨素。這種酶形成一個定位于溶酶體的四聚體該基因突變導致粘多糖病第七型。選擇性剪接導致多個轉錄變體人類基因組中有許多這個位點的假基因。[由RefSeq提供,2014年5月]This gene encodes a hydrolase
FANCL基因編碼功能及結構描述
這個基因編碼泛素連接酶,它是范科尼貧血互補組(FANC)的成員。這一組的成員通過組裝成一個共同的核蛋白復合物而不是通過序列相似性來聯系。該基因編碼互補群L的蛋白,該蛋白介導FANCD2和FANCI的單泛素化。范科尼貧血是一種遺傳異質性隱性疾病,其特征是細胞遺傳不穩定、對dna交聯劑過敏、染色體斷裂增
GGH基因編碼功能及結構描述
該基因通過去除γ鏈多聚谷氨酸鹽和谷氨酸鹽來催化葉酸聚γ-谷氨酸鹽和抗多聚γ-谷氨酸鹽的水解。[由RefSeq提供,2008年7月]This gene catalyzes the hydrolysis of folylpoly-gamma-glutamates and antifolylpoly-ga
ARFRP基因編碼功能及結構描述
該基因編碼的蛋白是一種膜相關gtp酶,定位于質膜,與adp核糖基化因子(arf)和arf樣蛋白(arl)有關。這個基因在跨高爾基體網絡和內切體之間的膜運輸中起作用。另外,還發現了編碼不同亞型的剪接轉錄變體。[由RefSeq提供,2012年5月]The protein encoded by this
DAXX基因編碼功能及結構描述
該基因編碼一種多功能蛋白質,位于細胞核和細胞質的多個位置。它與多種蛋白質相互作用,如凋亡抗原fas、著絲粒蛋白c和轉錄因子紅細胞增多癥病毒e26癌基因同源物1。在細胞核中,編碼的蛋白質作為一種與sumoylated轉錄因子結合的有效轉錄抑制因子發揮作用。它的抑制作用可以通過將這種蛋白質固定在早幼粒細
NKAP基因編碼功能及結構描述
該基因編碼一種參與普遍存在的轉錄因子nf-kappab激活的蛋白質。該蛋白和組蛋白去乙酰化酶HDAC3和Notch共加壓因子復合物相關,從而充當Notch靶基因的轉錄抑制因子它也是αβT細胞發育所必需的在x染色體上發現了一個相關的假基因,而在6號染色體上發現了一個相關的無內含子的逆轉錄酶,該逆轉錄酶
MCC基因編碼功能及結構描述
該基因是一個候選的大腸腫瘤抑制基因,被認為是負調控細胞周期進程小鼠的同源基因表達一種與質膜和膜細胞器相關的磷蛋白,而小鼠蛋白的過度表達抑制了進入s期。已發現該基因編碼不同亞型的多個轉錄變體。[由RefSeq提供,2008年7月]This gene is a candidate colorectal
GNAS基因編碼功能及結構描述
GNAS作為一個重要的信號轉導蛋白,主要功能是在G蛋白偶聯受體信號轉導途徑中,激活腺苷酸環化酶,導致cAMP水平的升高,參與調控細胞生長和細胞分裂。
EDNRA基因編碼功能及結構描述
這個基因編碼內皮素-1的受體,內皮素-1是一種在有效和持久的血管收縮中起作用的肽這種受體與鳥嘌呤核苷酸結合(G)蛋白相結合,這種結合激活了磷脂酰肌醇鈣第二信使系統該基因的多態性與偏頭痛抵抗有關。選擇性剪接導致多個轉錄變體[由RefSeq提供,2009年10月]This gene encodes th
BMX-基因編碼功能及結構描述
該基因編碼一個屬于Tec激酶家族的非受體酪氨酸激酶該蛋白包含一個PH樣結構域,通過結合磷脂酰肌醇3,4,5-三磷酸(PIP3)介導膜靶向性,以及一個結合酪氨酸磷酸化蛋白和信號轉導功能的SH2結構域該蛋白參與多種信號轉導途徑,包括stat途徑,并調節多種癌細胞的分化和致瘤性。另外,已經發現該基因的剪接
CAST基因編碼功能及結構描述
該基因編碼的蛋白質是一種內源性鈣蛋白酶(鈣依賴半胱氨酸蛋白酶)抑制劑它由一個N-末端結構域L和四個重復的鈣蛋白酶抑制結構域(結構域1-4)組成,參與淀粉樣前體蛋白的蛋白水解。calpain/calpastatin系統參與許多膜融合事件,如神經囊泡胞吐、血小板和紅細胞聚集編碼的蛋白質也被認為會影響編碼
MAFB基因編碼功能及結構描述
該基因編碼的蛋白質是一種堿性亮氨酸拉鏈(bZIP)轉錄因子,在血緣特異性造血調控中起重要作用編碼的核蛋白抑制ets1介導的髓系細胞中紅系特異基因的轉錄。這個基因不含內含子[由RefSeq提供,2008年7月]The protein encoded by this gene is a basic le
INSR基因編碼功能及結構描述
胰島素受體(IR)是一種由胰島素,IGF-I,IGF-II激活的跨膜受體,屬于大類酪氨酸激酶受體。在細胞學上,胰島素受體在調節葡萄糖穩態中起關鍵作用, 在退化條件下可能導致一系列臨床表現的功能性過程,包括糖尿病和癌癥。生物化學上,胰島素受體由單個基因INSR編碼,轉錄期間的交替剪接導致IR-A或IR
CBLC基因編碼功能及結構描述
該基因編碼E3泛素連接酶CBL家族的一個成員。cbl蛋白通過泛素化和隨后的酪氨酸激酶下調在細胞信號傳導中發揮重要作用。該基因的表達可能僅限于上皮細胞,而且還觀察到該基因編碼多種亞型的選擇性剪接轉錄變體。This gene encodes a member of the Cbl family of E
GOPC基因編碼功能及結構描述
該基因編碼一個具有PDZ結構域的高爾基蛋白PDZ結構域是球狀的,含有它們的蛋白質通過C末端附近的短基序與其他蛋白質結合缺乏原代蛋白的小鼠有球形精子癥,并且不育。已發現該基因編碼不同亞型的多個轉錄變體。[由RefSeq提供,2011年12月]This gene encodes a Golgi prot
ASMTL基因編碼功能及結構描述
該基因編碼的蛋白有一個N-末端,與枯草芽孢桿菌的多拷貝相關絲狀(maf)蛋白和大腸桿菌的orfE相似,而C-末端與N-乙酰5-羥色胺O-甲基轉移酶相似該基因位于X染色體和Y染色體的假常染色體區1(PAR1)。已經發現了三個編碼不同亞型的轉錄變體[由RefSeq提供,2010年3月]The prote