JACS|大連化物所：基于nMS表征影響蛋白質結構的分子機制

JACS|大連化物所：基于nMS表征影響蛋白質結構的分子機制

　　近日，連化物所生物分子結構表征新方法研究組（1822組）王方軍研究員、劉哲益副研究員團隊與西南交通大學封順教授團隊合作，利用我所自主搭建的高能紫外激光解離—串聯質譜儀器，揭示了質子化氨基酸側鏈的正電荷在電噴霧離子化過程中影響蛋白質結構的分子機制，為質譜精確表征蛋白質高級結構提供了參考。　　非變性

用高能紫外激光解離質譜實現蛋白質識別機制解析

原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/7/482501.shtm 近日，中科院大連化學物理研究所研究員王方軍團隊與南方科技大學教授田瑞軍、副教授李鵬飛等人合作，利用193nm紫外激光解離—質譜裝置，實現了免疫共受體CD28磷酸化胞質端與激酶PK

王方軍：高能紫外激光解離質譜實現蛋白質識別機制解析

　　近日，大連化物所生物分子結構表征新方法研究組（1822組）王方軍研究員團隊與南方科技大學田瑞軍教授、李鵬飛副教授等人合作，利用193nm紫外激光解離—質譜裝置，實現了免疫共受體CD28磷酸化胞質端與激酶PKCθ的C2結構域識別結合機制解析。　　與常規毫秒級碰撞誘導質譜解離（CID）相比，5ns單

紫外激光解離生成金納米團簇及原位質譜表征

近日，大連化物所所生物分子結構表征新方法研究組（1822組）王方軍研究員、基元反應動力學研究組（1111組）肖春雷研究員、催化反應化學研究組（501組）李杲研究員等合作，采用193nm脈沖紫外激光解離—質譜裝置，實現了有機配體保護金團簇前體高效氣相解離生成400余種不同尺寸、組成和電荷價態金納米團簇

氨基酸按側鏈基團分類

非極性氨基酸（疏水氨基酸）共9種：丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、蛋氨酸、甘氨酸；極性氨基酸（親水氨基酸）共13種：極性不帶電荷（中性氨基酸）：絲氨酸、蘇氨酸、半胱氨酸、酪氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、硒半胱氨酸、吡咯賴氨酸；極性帶正電荷的氨基酸（堿性氨基酸）：賴氨酸、精氨酸

我所發現小分子抑制劑誘導的CDK12/13Cyclin－K變構激活解離新機制

原文地址：http://www.dicp.cas.cn/xwdt/kyjz/202305/t20230521_6760199.html　　近日，我所生物技術研究部生物分子結構表征新方法研究組（1822組）王方軍研究員團隊與上海藥物研究所藥物發現與設計中心羅成研究員團隊合作，通過整合賴氨酸反應性分析質

百家爭鳴，質譜之花綻放杭州

　　2018年5月7日，中國化學會第31屆學術年會質譜分析分會進展到第三天，分為報告部分和墻報展部分，當天共有十位專家攜自己精彩的報告與眾多專家學者交流學習。清華大學教授 歐陽證　　清華大學教授歐陽證帶來了題為“分子結構分析在臨床質譜分析儀器的實現與應用”的報告。歐陽證介紹了清譜科技生產的Miniβ

氨基酸根據側鏈基團極性分類

非極性氨基酸（疏水氨基酸）共8種：丙氨酸（Ala）；纈氨酸（Val）；亮氨酸（Leu）；異亮氨酸（Ile）脯氨酸（Pro）；苯丙氨酸（Phe）；色氨酸（Trp）；蛋氨酸（Met）極性氨基酸（親水氨基酸）共14種：極性不帶電荷（中性氨基酸）：甘氨酸（Gly）；絲氨酸（Ser）；蘇氨酸（Thr）；半胱氨

根據側鏈基團極性分類氨基酸

非極性氨基酸（疏水氨基酸）共8種：丙氨酸（Ala）；纈氨酸（Val）；亮氨酸（Leu）；異亮氨酸（Ile）脯氨酸（Pro）；苯丙氨酸（Phe）；色氨酸（Trp）；蛋氨酸（Met）極性氨基酸（親水氨基酸）共14種：極性不帶電荷（中性氨基酸）：甘氨酸（Gly）；絲氨酸（Ser）；蘇氨酸（Thr）；半胱氨

氨基酸根據側鏈基團極性分類

　　非極性氨基酸（疏水氨基酸）共8種：　　丙氨酸（Ala）；纈氨酸（Val）；亮氨酸（Leu）；異亮氨酸（Ile）脯氨酸（Pro）；苯丙氨酸（Phe）；色氨酸（Trp）；蛋氨酸（Met）　　極性氨基酸（親水氨基酸）共14種：　　極性不帶電荷（中性氨基酸）：甘氨酸（Gly）；絲氨酸（Ser）；蘇氨酸（

氨基酸根據側鏈基團極性分類

? 非極性氨基酸（疏水氨基酸）共8種：丙氨酸（Ala）；纈氨酸（Val）；亮氨酸（Leu）；異亮氨酸（Ile）脯氨酸（Pro）；苯丙氨酸（Phe）；色氨酸（Trp）；蛋氨酸（Met）極性氨基酸（親水氨基酸）共14種：極性不帶電荷（中性氨基酸）：甘氨酸（Gly）；絲氨酸（Ser）；蘇氨酸（Thr）；半

2025－中國質譜學術大會圓滿落幕：凝心聚力探前沿，共繪領域新未來

　　——致敬前輩?賦能青年　　2025年9月22日，2025 年中國質譜學術大會在鄭州落下帷幕。圍繞“中國質譜——凝心聚力，共創未來”的主題，來自全國 138 所高校/科研院所/企業以及日本兩所高校的 2000 余位專家學者匯聚一堂，共同探討質譜技術的最新進展、應用挑戰與未來趨勢。過去三天時間內，大

我所發展蛋白質疏水功能熱點原位三氟甲基化標記和質譜探測新方法

原文地址：http://www.dicp.cas.cn/xwdt/kyjz/202402/t20240227_7003113.html近日，我所生物技術研究部生物分子結構表征新方法研究組（1822組）王方軍研究員團隊與南方科技大學董哲副教授團隊合作，發展了一種蛋白質疏水功能熱點原位三氟甲基化標記和質

我所發展可實現靶蛋白結構穩定性分析的時間分辨紫外激光解離質譜法

我所發展可實現靶蛋白結構穩定性分析的時間分辨紫外激光解離質譜法發布時間：2024-04-08??|??供稿部門：1822組??|??【放大】?【縮小】??|??【打印】?【關閉】近日，我所生物技術研究部生物分子結構表征新方法研究組（1822組）王方軍研究員團隊發展了整合紫外激光解離的時間分辨質譜法，

科學家改進整合紫外激光解離的時間分辨質譜法

近日，中國科學院大連化學物理研究所研究員王方軍團隊發展了整合紫外激光解離的時間分辨質譜法，實現了對氨基酸位點突變引起的靶蛋白穩定性和動態精細結構的表征，為研究靶蛋白氨基酸突變的病理機制提供了新技術。相關成果發表在《美國化學會志》上。氨基酸位點突變如何影響靶蛋白穩定性和動態結構，對于理解疾病的分子機制

科學家革新紫外激光質譜法，精準解析蛋白質突變影響

近日，中國科學院大連化學物理研究所研究員王方軍團隊發展了整合紫外激光解離的時間分辨質譜法，實現了對氨基酸位點突變引起的靶蛋白穩定性和動態精細結構的表征，為研究靶蛋白氨基酸突變的病理機制提供了新技術。相關成果發表在《美國化學會志》上。氨基酸位點突變如何影響靶蛋白穩定性和動態結構，對于理解疾病的分子機制

關于蛋白質結構的側鏈構象介紹

　　蛋白質結構：殘基側鏈上的原子根據希臘字母表的順序（α、β、γ、δ、ε等）來命名，如Cα指的是對應殘基上最接近羰基的碳原子，而Cβ則是次接近的。Cα通常被認為是主鏈骨架的組成原子。這些原子之間的鍵對應的二面角則相應以χ1、χ2、χ3等來命名，如賴氨酸側鏈上第一、二個碳原子（即Cα和Cβ）之間共價鍵

ESI－質譜和－MALDI－質譜對聚乙烯亞胺進行結構表征

氨基酸解離常數表

氨基酸解離常數縮寫中文譯名支鏈分子量等電點羧基解離常數氨基解離常數Pkr(R)R基GlyG甘氨酸親水性75.075.972.359.78-HAlaA丙氨酸疏水性89.096.022.359.87-CH?ValV纈氨酸疏水性117.156.482.399.74-CH-(CH?)?LeuL亮氨酸疏水性1

高深度空間代謝組學助力腫瘤微環境研究

腫瘤的發展除了與癌細胞自身基因突變導致的惡性增殖有關以外，還與腫瘤微環境息息相關。在癌癥中，正常組織中和諧的細胞相互作用關系被破壞，原本保護正常細胞生存的微環境在腫瘤細胞的影響下，逐漸演變成適應腫瘤生長的條件。針對腫瘤微環境的檢測和表征研究也可為癌癥治療提供新的思路。目前空間多組學技術已用于研究幾種

探索界面相互作用：大連化物所發布結構質譜實驗手冊

　　近日，中國科學院大連化學物理研究所生物技術研究部生物分子結構表征新方法研究組研究員王方軍團隊發布了表征蛋白質-納米材料界面相互作用精細結構的賴氨酸反應性分析-質譜（LRP-MS）實驗手冊。　　微/納米材料在生命科學、醫藥健康、生物催化等領域廣泛應用，探討蛋白質與材料之間的界面相互作用分子機制對生

大連化物所解析出光系統II復合物的動態光損傷分子機制

　　近日，中國科學院大連化學物理研究所生物分子結構表征新方法創新特區研究組研究員王方軍團隊在超大分子量膜蛋白質復合物組成和結構動態分析方面取得進展，通過整合化學交聯質譜法和整體蛋白質組學分析，解析出光系統II復合物的動態光損傷分子機制。　　光系統II（PSII）是光合作用過程中光依賴性反應中的第一膜

我所發表功能蛋白質復合物發現和結構表征質譜策略綜述

　　近日，我所生物技術研究部生物分子結構表征新方法研究組（1822組）王方軍研究員團隊與南方科技大學田瑞軍教授團隊合作，發表了功能蛋白質復合物發現和結構表征質譜策略的綜述文章。　　功能蛋白復合物的發現和結構—功能表征研究在理解和干預生物學過程中發揮著至關重要的作用。親和純化質譜（AP-MS）是發現功

蛋白質質譜測序

蛋白質譜一般來講是用來對某個蛋白質進行鑒定的方法而蛋白質測序實際上就是檢測蛋白質的多肽鏈數目，不一定要用到質譜技術簡單說，蛋白質測序的方法有很多，一般是在構建完成后，通過測序來對比之前的預測的序列是否正確。而質譜檢測一般是用在蛋白質表達純化完成后，用來鑒定是否是最初設計的那個蛋白。

直播預告丨多肽藥物第五期多肽藥物的結構表征與分析

多肽類藥物由多種氨基酸組成，通常分子量較大，紫外光譜、紅外光譜、核磁共振波譜等常用的小分子化學藥物確證方法不能滿足全方面結構解析的要求。指導原則提出“多肽原料藥一級結構應明確氨基酸連接順序，對于具有氨基酸側鏈修飾的多肽和存在兩個以上分子內環（如二硫鍵、酰胺鍵等）的環肽，應明確具體修飾位點、修飾物結構

氨基酸結構和分類（二）

二、氨基酸的性質 （一）物理性質 α-氨基酸都是白色晶體，每種氨基酸都有特殊的結晶形狀，可以用來鑒別各種氨基酸。除胱氨酸和酪氨酸外，都能溶于水中。脯氨酸和羥脯氨酸還能溶于乙醇或乙MI中。 除甘氨酸外，α-氨基酸都有旋光性，α-碳原子具有手性。蘇氨酸和異亮氨酸有兩個手性碳原子。從蛋白質水解得到的氨基酸

國人發AC：結合質譜將蛋白配體互作結構表征提至亞殘基

　　近日，中國藥科大學郝海平、葉慧團隊在Analytical Chemistry雜志上發表題為“Sub-residue Resolution Footprinting of Ligand-Protein Interactions by Carbene Chemistry and Ion Mobili

利用質譜技術測蛋白質的氨基酸序列成本多少

基于質譜的蛋白分析成本主要取決于兩個方面：第一、質譜儀及其聯用設備的類型，高分辨率高靈敏度質譜通常都大幾百萬甚至上千萬人民幣的；第二，數據處理方法，如果你用商業的數據分析軟件比如mascot等；第三，樣品處理方式，是簡單鑒定還是相對定量或者絕對定量。ps：質譜技術很少能做氨基酸測序的（少部分如mal

側鏈理論的定義

中文名稱側鏈理論英文名稱side chain theory定　　義1900年由德國科學家埃爾利希(P.Ehrlich)提出的抗體形成理論，認為同一個淋巴細胞表面有很多側鏈，抗原與相應側鏈特異性結合，可誘導該側鏈大量合成和分泌，即為特異性抗體。應用學科免疫學（一級學科），概論（二級學科），免疫學相關名

中檢院合作文章——高分辨質譜對AAV2衣殼蛋白表征分析

腺相關病毒 (Adeno-associated virus，AAV) 因其低免疫原性、低基因毒性、在多種不同組織類型具有持久基因表達、作用時間長以及易于生產等特性，成為了臨床基因治療領域廣泛應用的基因治療載體[1]。AAV病毒屬于細小病毒家族，無包膜，由衣殼蛋白和單鏈DNA（全長4.7kb）組成。不