關于克隆PCR產物的對照實驗相關介紹
A)涂布未轉化的感受態細胞。 如有菌落,表明氨芐失效,或污染上帶有氨芐抗型的質粒,或產生氨芐抗型的菌落。 B)轉化完整質粒,計算菌落生長數,測定轉化效率。 例如,將1ug/ul質粒1:100稀釋,1ul用于100ul感受態細胞轉化。用SOC稀釋到1000ul后,用100ul鋪板。培養過夜,產生1000個菌落。轉化率為:產生菌落的總數/鋪板DNA的總量。 鋪板DNA的總量是轉化反應所用的量除以稀釋倍數。具體而言轉化用10ng DNA,用SOC稀釋到1000u后含10 ng DNA,用1/10鋪板,共用1 ng DNA。轉化率為: 1000克隆X103ng /鋪板1 ng DNA ug=106cfu/ ug 轉化pGEM-T應用108cfu/ ug感受態細胞 如沒有菌落或少有菌落,感受態細胞的轉化率太低。 C)如用pGEM-T正對照,或PCR產物,產生>20-40藍斑(用指定步驟108cfu/ug感受態細胞......閱讀全文
PCR實驗對照原則
每一次試驗都需要設置嚴格的對照。陽性模板作為陽性對照;陰性模板或不加模板作為陰性對照。
克隆PCR產物的最優條件是什么?
最佳插入片段:載體比需實驗確定。1:1(插入片段:載體)常為最佳比,摩爾數比1:8或8:1也行。應測定比值范圍。連接用5ul 2X連接液, 50ng質粒DNA,1Weiss單位的T4連接酶,插入片段共10ul。室溫保溫1小時,或4℃過夜。在這2種溫度下,缺T-凸出端的載體會自連,產生藍斑。室溫保溫1
克隆PCR產物的最優條件是什么?
最佳插入片段:載體比需實驗確定。1:1(插入片段:載體)常為最佳比,摩爾數比1:8或8:1也行。應測定比值范圍。連接用5ul 2X連接液,50ng質粒DNA,1Weiss單位的T4連接酶,插入片段共10ul。室溫保溫1小時,或4℃過夜。在這2種溫度下,缺T-凸出端的載體會自連,產生藍斑。室溫保溫
PCR產物的假陽性的相關問題介紹
出現的PCR擴增條帶與目的靶序列條帶一致,有時其條帶更整齊,亮度更高。 引物設計不合適:選擇的擴增序列與非目的擴增序列有同源性,因而在進行PCR擴增時,擴增出的PCR產物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出現假陽性。需重新設計引物。 靶序列或擴增產物的交叉污染:這種污染有兩種原因:
PCR-產物純化實驗
試劑、試劑盒 TE 或去離子水PCR 產物儀器、耗材 離心機和轉子PCR 濾 件微量離心管實驗步驟 一、材料1. 緩沖液和溶液TE(lOmmol/L Tris-HCl,lmmol/L EDTA,pH7.5) 或去離子水2. 核酸和寡核苷酸待測序的 PCR 產物3. 離心機和轉子帶有固定傾角轉子的小型
PCR-產物純化實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 TE 或去離子水 PCR 產物 儀器、耗材 離心機和轉子 PCR 濾 件
PCR-產物定量實驗
測序之前對模板精確定量至關重要。根據 DNA 用量的多少,有幾種不同的方法可供選擇。下面介紹另外兩種方法:熒光測定法和比較溴化物染色法。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。試劑、試劑盒DNA 標準TEPCR 產物儀器、耗材熒光計金屬箔紙微量離心管實驗步驟方法 A: 熒光測定
PCR-產物定量實驗
試劑、試劑盒 DNA 標準TEPCR 產物儀器、耗材 熒光計金屬箔紙微量離心管實驗步驟 方法 A: 熒光測定法熒光測定法可以在納克級范圍精確定量。熒光計和 DNA 定量試劑盒許多公司都有出售。確定熒光計是否安裝了適合于特定染料的激發和發射的部件至關重要。該方法在設計上適用于配有帶藍色 LED
PCR-產物定量實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 DNA 標準 TE PCR 產物 儀器、耗材 熒光計 金屬箔紙
PCR-產物純化實驗
介紹一個采用 AmiconMicrocon-PCR 濾件(Millipore) 的方法,有效地去除冗余dNTP 和引物的方法純化 PCR 產物。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。試劑、試劑盒TE 或去離子水PCR 產物儀器、耗材離心機和轉子PCR 濾 件微量離心管實驗步驟
克隆化的PCR產物連入T載體
由 Taq DNA 聚合酶 PCR 擴增產生的帶 3' 突出端為 A 堿基的 DNA 片段能高效地克隆至 T 載體上,這種 T 載體有與 A 堿基互補的未配對 3' T 堿基(Holton and Graham 1991; Marchuk et al. 1991)。本實驗來源「分子克
克隆化的PCR產物連入T載體
實驗方法原理 由 Taq DNA 聚合酶 PCR 擴增產生的帶 3' 突出端為 A 堿基的 DNA 片段能高效地克隆至 T 載體上,這種 T 載體有與 A 堿基互補的未配對 3' T 堿基(Holton and Graham 1991; Marchuk et al. 1991
PCR擴增產物的克隆技術2
T-載體的構建一:儀器:同質粒DNA提取實驗、酶切實驗及RT-PCR實驗二:試劑:SmaI、其余同質粒DNA提取實驗、酶切實驗及RT-PCR實驗三:操作:1:提純載體DNA2:將1ug提純的PGEMDNA用SmaI1ul進行全酶切(為了切割徹底、甚至能破壞酶切位點周圍堿基序列而防止自連發生,酶可過量
PCR擴增產物的克隆技術1
利用各種PCR技術擴增特異DNA是獲得目的基因和特異探針的一種最有效、最簡便的方法。但PCR擴增出的片斷如不經進一步克窿是無法變成可利用基因,因此PCR擴增產物的克窿技術是DNA重組技術中的一個最重要部分,該技術是目前分子生物學實驗中最重點內容,要綜合前面實驗中所介紹的各種技術,起著承上啟下的作用。
iPCR或混合PCR產物的SLIC亞克隆
實驗概要SLIC(Sequence and Ligation Independent Cloning)是一種不依賴于基因序列和連接反應的高效基因克隆新方法,它可以實現體外同源重組反應中多個DNA片段在單一反應中的裝配和單鏈的退火。實驗步驟1. 用限制性內切酶處理2微克載體,使用QIAEX II凝膠提
克隆化的PCR產物連入T載體
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 由 Taq DNA 聚合酶 PCR 擴增產生的帶 3' 突出端為 A 堿基的 DNA 片段能高效地克隆至 T 載體上,這種 T 載體有與 A 堿基互補的未配對 3' T 堿基(Holton and Graha
熒光定量PCR實驗中的陽性對照和陰性對照
陽性對照和陰性對照是指在相同的處理條件下,比如一份已知的感染樣品和一份已知的未感染樣品,都進行了提取和擴增最終獲得了陽性結果和陰性結果。陰陽性對照強調處理過程與樣品一致,并且有明確的預期結果。
內切酶用于克隆PCR的相關介紹
克隆PCR產物的方法之一,是在PCR產物兩端設計一定的限制酶切位點,經酶切后克隆至用相同酶切的載體中。但實驗證明,大多數限制酶對裸露的酶切位點不能切斷。必須在酶切位點旁邊加上一個至幾個保護堿基,才能使所定的限制酶對其識別位點進行有效切斷。酶切位點(內切酶的識別序列)要加在引物的5'端,為
PCR擴增產物的克隆——平端連接法
PCR擴增產物的克隆可以:(1)獲得目的DNA片段;(2)用于原核表達的研究;(3)廣泛應用于分子生物學相關研究。實驗方法原理平頭連接是將制備好的平頭載體和補平或削平的PCR產物直接進行連接。載體可用EcoR V或Sma I切成平頭;PCR產物純化后,可以在22℃用DNA聚合酶I作用30min(利用
PCR產物的克隆(平頭連接和粘頭連接)
PCR產物克隆大致分為兩類,即平頭連接和粘頭連接。平頭連接是將制備好的平頭載體和補平或削平的PCR 產物直接進行連接。載體可用EcoR V或Sma I切成平頭;PCR 產物純化后,可以在22℃用DNA聚合酶I作用30min(利用該酶所具有的3’→5’外切酶活性和5’→3’的聚合酶活性)。如果要求
關于PCR實驗室的布局相關介紹
PCR實驗室按規定需要四間,分別是1 試劑儲存和準備區、2 標本制備區、3擴增反應混合物配制和擴增區、4擴增產物分析區,四間PCR實驗室區域設置 如果使用全自動分析儀,各區域可適當合并,我們建議將擴增區和產物分析區合并為擴增檢測區即共三個間。 三間PCR實驗室區域設置 按國家衛生部的要求,
怎樣設定原位PCR對照實驗
設立陽性對照,即用已知陽性細胞或組織切片做陽性標志,實驗結果應呈陽性,表明實驗方法準確可靠。同時要設立陰性對照,即用已知陰性細胞或組織切片作陰性對照,實驗結果應呈陰性,表示實驗方法無假陽性結果;也可以用實驗細胞或組織切片,不加標記的dUTP(直接法),PCR結果顯示陰性,或不加引物或不加TaqD
熒光定量PCR實驗中的擴增對照
通常說的陽性對照和陰性對照指的是擴增試劑盒中附帶的不需要提取的陽性對照和陰性對照,更準確的定義應該是擴增陽性對照和擴增陰性對照。擴增陽性對照含有陽性擴增模板,擴增陰性對照應含有陰性擴增模板(基質核酸)。擴增對照只能監控每次擴增過程中的擴增系統是否正常,不能監控采樣、提取和每份樣品的操作過程。如果是檢
PCR-產物電泳銀染實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理聚丙烯酰胺凝膠(PAG)是由丙烯酰胺單體和交聯劑亞甲基雙丙烯酰胺,在引發劑過硫酸胺(AP)提供自由基和催化劑四甲基乙二胺(TEMED)的作用下聚合而成。丙烯酰胺可由天然光線誘發聚合,所以其水溶液應貯藏在棕色瓶中,置低溫 4℃ 更佳。由于其水溶液穩定性
PCR-產物電泳銀染實驗
常用的核酸電泳法有兩種。①水平電泳:瓊脂糖凝膠,紫外光下判斷條帶。此法經濟省時,但分辨率較低。②垂直電泳:聚丙烯酰胺凝膠,可見光下判斷條帶。此法相對費力,但分辨率較高。分辨率高是聚丙烯酰胺電泳法被優先用于克隆性基因重排條帶判斷的關鍵。在聚丙烯酰胺凝膠上較寬彌散被判斷為假陽性(陰性)的條帶,在瓊脂糖膠
PCR-產物電泳銀染實驗
實驗方法原理 聚丙烯酰胺凝膠(PAG)是由丙烯酰胺單體和交聯劑亞甲基雙丙烯酰胺,在引發劑過硫酸胺(AP)提供自由基和催化劑四甲基乙二胺(TEMED)的作用下聚合而成。丙烯酰胺可由天然光線誘發聚合,所以其水溶液應貯藏在棕色瓶中,置低溫 4℃ 更佳。由于其水溶液穩定性較差,通常 2 個月內用完為好。
用-dUTP-凈化-PCR-產物的實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 dNTP 溶液 ?MgCl2 溶液 PCR 緩沖液 引物 尿嘧啶-DNA-糖基酶 Taq DNA 聚合酶
用-dUTP-凈化-PCR-產物的實驗
試劑、試劑盒 dNTP 溶液 MgCl2 溶液PCR 緩沖液引物尿嘧啶-DNA-糖基酶 Taq DNA 聚合酶儀器、耗材 PCR 儀離心管實驗步驟 一、材料1. 試劑(1)dNTP溶液(含有dATP、dCTP、dGTP和dUTP,每種濃度10 mmol/L)多數情況下,直接替換dUTP就可以
用-dUTP-凈化-PCR-產物的實驗
在 PCR 擴增過程中將 dUTP 摻入復制子是最為有效和廣泛使用的凈化 PCR 產物的方法(Longoetal.1990;HartleyandRashtchian1995)。下面介紹這一方法的詳細操作過程。本實驗來源于PCR實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。試劑、試劑盒dNTP 溶液MgCl
關于克隆實驗的過程介紹
先將含有遺傳物質的供體細胞的核移植到去除了細胞核的卵細胞中,利用微電流刺激等使兩者融合為一體,然后促使這一新細胞分裂繁殖發育成胚胎,當胚胎發育到一定程度后,再被植入動物子宮中使動物懷孕,便可產下與提供細胞者基因相同的動物。這一過程中如果對供體細胞進行基因改造,那么無性繁殖的動物后代基因就會發生相