DNA測序測序凝膠的銀染的影響因素
測序產物的銀染是顯現序列信息的一種新方法,本系統的成敗受幾個因素的影響 ① 水的質量對于染色的成功極其重要。超純水(NANOpureR或Milli-QR的水)或雙蒸水可獲得較好的效果,如果水中有雜質,則低分子量條帶可能無法出現。 ② 碳酸鈉也非常重要。使用新鮮的,美國化學學會級碳酸鈉較好,如Fisher和Kodak ACS試劑級碳酸鈉(Fisher Cat #S263-500或S262-3,或Kodak Cat #109-1990),一般可獲得較好的結果。 ③ 色后的洗滌步驟是非常關鍵的。如果凝膠洗滌時間太長,銀顆粒會脫離DNA,產生很少或沒有序列信號。如果洗滌時間過長,染色步驟可以重新進行。 ④ 如果凝膠厚度超過0.4 mm或丙烯酰胺濃度高于4~6%,則有必要延長固定和染色的時間。如果凝膠比0.4 mm薄,染色反應后的洗滌必須縮短至不超過5秒。 ⑤ 在室溫下進行所有步驟,顯影反應除外。顯影溶液必須預冷至10~12......閱讀全文
DNA測序測序凝膠的銀染的影響因素
測序產物的銀染是顯現序列信息的一種新方法,本系統的成敗受幾個因素的影響 ① 水的質量對于染色的成功極其重要。超純水(NANOpureR或Milli-QR的水)或雙蒸水可獲得較好的效果,如果水中有雜質,則低分子量條帶可能無法出現。 ② 碳酸鈉也非常重要。使用新鮮的,美國化學學會級碳酸鈉較好,如
影響DNA測序技術測序產物銀染的因素
1. 水的質量對于染色的成功極其重要。超純水(NANOpureR 或Milli-QR 的水)或雙蒸水可獲得較好的效果, 如果水中有雜質, 則低分子量條帶可能無法出現。 2. 碳酸鈉也非常重要。使用新鮮的,美國化學學會級碳酸鈉較好,如Fisher和Kodak ACS試劑級碳酸鈉(Fisher C
關于DNA測序測序凝膠的銀染
染色過程要求凝膠浸在塑料盤中。因而至少使用兩個盤子,大小與玻璃板類似。在盤中加入新鮮溶液之前須用高質量的水洗滌盤子。 1. 電泳完畢后用一個塑料片子小心地分開兩板,凝膠應該牢固地附著在短玻璃板上。 2. 固定凝膠:將凝膠(連玻璃板)放入塑料盤,用固定/停止溶液浸沒,充分振蕩20分鐘或直至樣品
關于DNA測序技術的測序凝膠的銀染介紹
染色過程要求凝膠浸在塑料盤中。因而至少使用兩個盤子,大小與玻璃板類似。在盤中加入新鮮溶液之前須用高質量的水洗滌盤子。 1.電泳完畢后用一個塑料片子小心地分開兩板,凝膠應該牢固地附著在短玻璃板上。 2. 固定凝膠:將凝膠(連玻璃板)放入塑料盤,用固定/停止溶液浸沒,充分振蕩20分鐘或直至樣品中
DNA測序——非同位素銀染
實驗方法原理Promega公司的SILVER SEQUENCETM DNA測序系統是一種無放射性的序列分析系統,它通過靈敏的銀染方法檢測凝膠中的條帶。 銀染提供了一種對于放射性或熒光法來說更加快速,廉價的替代方法。測序結果可以在同一天內得到;電泳完成后經90分鐘就可讀序,這是常規的放射性測序法做不到
DNA測序技術(非同位素銀染測序系統操作技術與T7-DNA聚...
3、質粒膜板制備:參照第一章所述的方法。(二)超螺旋質粒DNA 的堿變性:1、取4mg(約2pmol)超螺旋質粒DNA 至一eppendorf管中,加無離子水到終體積18ml。2、加2ml 2mmol/L NaOH/2mmol/L EDTA 溶液,置于室溫(25℃下)保溫5分鐘。3、加2ml 2mo
DNA測序技術(非同位素銀染測序系統操作技術與T7-DNA...6
3、為阻止Taq DNA 聚合酶延伸非特異性退火引物, 熱循環儀必須預熱至95℃。溫度變換應越快越好。下面的循環時間不包括變溫時間。如果你無法確定使用何種模式,建議從模式1開始。 ? 模式1:適用于引物
DNA測序技術(非同位素銀染測序系統操作技術與T7-DNA...7
在分子生物學研究中,DNA 的序列分析是進一步研究和改造目的基因的基礎。目前用于測序的技術主要有Sanger等(1977)發明的雙脫氧鏈末端終止法和Maxam和 Gilbert(1977)發明的化學降解法。這二種方法在原理上差異很大,但都是根據核苷酸在某一固定的點開始,隨機在某一個特定的堿基
DNA測序技術(非同位素銀染測序系統操作技術與T7-DNA...4
7. 在超純水中浸洗凝膠兩次,每次2分鐘,注意在本操作中戴手套拿著膠板邊緣避免在膠上印上指紋。8. 將凝膠置于室溫干燥或用抽氣加熱法干燥。在可見光燈箱或亮白,黃色背景(如紙)上觀察凝膠,若需永久保存的記錄,則可用EDF膠片保留實驗結果。[注意] 測序產物的銀染是顯現序列信息的一種新方法,本系統的成敗
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(三)電泳:1、預電泳(1)當凝膠聚合完全后,撥出鯊魚齒梳,將該梳子反過來,把有齒的一頭插入凝膠中,形成加樣孔。(2)立即將膠板固定在測序凝膠槽中,一般測序凝膠槽的上下槽是分開的,因而只有在固定好凝膠板后,方能加入TBE緩沖液。(3)稀釋10×TBE緩沖液至1×TBE,將該緩沖液加入上下二個電泳槽中
DNA測序技術(非同位素銀染測序系統操作技術與T7-DNA...3
二、材料待測的DNA 模板,可用雙鏈或單鏈模板。 三、設備高壓電泳儀,測序用電泳槽,照相顯影用大號塑料盆,制膠設備,吹風機,放射自顯影盒,X-光片。 四、試劑 1、5×T7 DNA 聚合酶緩沖液:200mmol/L Tris?Cl,pH7.5,100mmol/L MgCl2,
DNA測序技術(非同位素銀染測序系統操作技術與T7-DNA...2
(1)過夜培養的宿主細胞(如NM522或JM101)用3ml TYP肉汁培養基以1:100稀釋。在37℃強烈震蕩1小時之后,細胞進入對數早期。此時,將一個合適的含有重組M13的噬菌斑(連同瓊脂)用滴管轉入該細胞培養液中。(2)37℃強烈震蕩(300rpm) 培養6小時。(3)把細胞培養液轉入兩只1.
關于DNA測序技術的測序凝膠板的制備
一、玻璃板的處理 銀染測序的玻璃板一定要非常清潔,一般先用溫水和去污劑洗滌,再用去離子水沖洗玻璃板,除去殘留的去污劑,最后用乙醇清洗玻璃板。玻璃板上遺留的去污劑微膜可能導致凝膠染色時背景偏高(棕色)。短玻璃板經粘合溶液處理可將凝膠化學交聯于玻璃板上。這一步對于在銀染操作過程中防止凝膠撕裂至關重
DNA測序的凝膠的制備介紹
(1)玻璃板經粘合硅膠和Sigmacote處理后,即可固定玻璃板。該方法是用0.2 mm或0.4 mm厚的邊條置于玻璃板左右兩側,將另一塊玻璃板壓于其上。在長玻璃板的一側插入鯊魚齒梳平的一面邊緣,用夾子固定住。 (2)根據所需要的凝膠濃度,按下表制備測序凝膠,一般6%~8%的膠濃度可獲得較好的
非同位素銀染測序系統操作技術
Promega公司的SILVER SEQUENCETM DNA測序系統是一種無放射性的序列分析系統,它通過靈敏的銀染方法檢測凝膠中的條帶。銀染提供了一種對于放射性或熒光法來說更加快速,廉價的替代方法。測序結果可以在同一天內得到;電泳完成后經90分鐘就可讀序,這是常規的放射性測序法做不到的。 此外
DNA測序非同位素銀染色法的測序反應
1. 對于每組測序反應,標記四個0.5 ml eppendorf管(G、A、T、C)。每管加入2 ml適當的d/ddNTP混合物(d/ddNTP Mix)。各加入1滴(約20 μl)礦物油,蓋上蓋子保存于冰上或4℃備用。 2. 對于每組四個測序反應,在一個eppendorf管中混合以下試劑:
關于DNA測序技術的凝膠的制備
(1)玻璃板經粘合硅膠和Sigmacote處理后,即可固定玻璃板。該方法是用0.2mm或0.4mm厚的邊條置于玻璃板左右兩側,將另一塊玻璃板壓于其上。在長玻璃板的一側插入鯊魚齒梳平的一面邊緣,用夾子固定住。 (2)根據所需要的凝膠濃度,按下表制備測序凝膠,一般6%-8%的膠濃度可獲得較好的結果
DNA測序的測序原理
DNA測序的測序原理是:利用一種DNA聚合酶來延伸結合在待定序列模板上的引物。直到摻入一種鏈終止核苷酸為止。每一次序列測定由一套四個單獨的反應構成,每個反應含有所有四種脫氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一種不同的雙脫氧核苷三磷酸。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基團,使延長的寡聚核苷酸
DNA測序的測序技術
高通量測序技術(High-throughput sequencing)又稱“下一代”測序技術(Next-generation sequencing technology),以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。根據發展歷史、影響力、測序原理和技術不同等,主要有以
簡述DNA測序的測序規律
生成互相獨立的若干組帶放射性標記的寡核苷酸,每組寡核苷酸都有固定的起點,但卻隨機終止于特定的一種或者多種殘基上。 由于DNA上的每一個堿基出現在可變終止端的機會均等,因此上述每一組產物都是一些寡核苷酸混合物,這些寡核苷酸的長度由某一種特定堿基在原DNA全片段上的位置所決定。 在可以區分長度僅
DNA測序的測序目的
確定重組DNA的方向與結構,對突變進行定位、鑒定和比較研究。
DNA測序技術的測序規律
生成互相獨立的若干組帶放射性標記的寡核苷酸,每組寡核苷酸都有固定的起點,但卻隨機終止于特定的一種或者多種殘基上。由于DNA上的每一個堿基出現在可變終止端的機會均等,因此上述每一組產物都是一些寡核苷酸混合物,這些寡核苷酸的長度由某一種特定堿基在原DNA全片段上的位置所決定。在可以區分長度僅差一個核苷酸
DNA測序技術的測序原理
化學修飾法測序原理化學試劑處理末段DNA片段,造成堿基的特異性切割,產生一組具有各種不同長度的DNA鏈的反應混合物,經凝膠電泳分離。化學切割反應:包括堿基的修飾,修飾的堿基從其糖環上轉移出去在失去堿基的糖環處DNA斷裂。Sanger法測序的原理就是利用一種DNA聚合酶來延伸結合在待定序列模板上的引物
DNA測序的測序原理介紹
化學修飾法測序原理 化學試劑處理末段DNA片段,造成堿基的特異性切割,產生一組具有各種不同長度的DNA鏈的反應混合物,經凝膠電泳分離。化學切割反應:包括堿基的修飾,修飾的堿基從其糖環上轉移出去在失去堿基的糖環處DNA斷裂。 Sanger法測序的原理 就是利用一種DNA聚合酶來延伸結合在待定
DNA測序技術的測序的規律
生成互相獨立的若干組帶放射性標記的寡核苷酸,每組寡核苷酸都有固定的起點,但卻隨機終止于特定的一種或者多種殘基上。由于DNA上的每一個堿基出現在可變終止端的機會均等,因此上述每一組產物都是一些寡核苷酸混合物,這些寡核苷酸的長度由某一種特定堿基在原DNA全片段上的位置所決定。在可以區分長度僅差一個核苷酸
DNA測序PCR測序反應
1. 取0.2 ml的PCR管,用記號筆編號,將管插在顆粒冰中,按下表加試劑: 所加試劑 測定模板管 標準對照管 BigDye Mix 1 μl 1 μl 待測的質粒DNA 1 μl - pGEM-3Zf (+) 雙鏈DNA - 1 μl 待測DNA的正向引物 1 μl - M13(
DNA測序技術的測序反應的介紹
1. 對于每組測序反應,標記四個0.5ml eppendorf管(G、A、T、C)。每管加入2ml適當的d/ddNTP混合物(d/ddNTP Mix)。各加入1滴(約20ml)礦物油,蓋上蓋子保存于冰上或4℃備用。 2. 對于每組四個測序反應,在一個eppendorf管中混合以下試劑: (1
DNA測序
? ? ? ? ? ? ? ? 自動測序法 雙脫氧鏈末端終止法 非同位素銀染 鳥槍法 Maxam-Gilbert化學修飾法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法
DNA測序
實驗方法原理 ABI ?PRISM 310型基因分析儀(即DNA測序儀),采用毛細管電泳技術取代傳統的聚丙烯酰胺平板電泳,應用該公司ZL的四色熒光染料標記的ddNTP(標記終止物法),因此通過單引物PCR測序反應,生成的PCR產物則是相差1個堿基的3'末端為4種不同熒光染料的單鏈DN
DNA測序
DNA測序(主要內容如下)·?????????Sequencing Gel Preparation·?????????Preparation of Templates?·?????????DNA Sequencing by the Dideoxy Method·?????????DNA Sequen