染色質免疫沉淀DNA分析
實驗概要染色質免疫共沉淀是一種強力的方法,來聯系蛋白質或其修飾的定位與基因組的關系。染色質分離并用特異性抗體判斷是否與特異性 DNA 序列相結合。染色質免疫沉淀法亦可用來檢測目的位點在基因組中的時空分布(用芯片或 DNA 測序)。本操作規程詳細闡述了交聯染色質免疫沉淀 (X-ChIP) 實驗的具體步驟。實驗步驟1. 交聯和細胞收集1) 取 2 個 150 cm2培養皿的融合細胞(每皿細胞數約 1 X 107 - 5 X 107 個)。向培養基中滴加甲醛以使蛋白和 DNA 相交聯,甲醛的終濃度為 0.75%(體積百分比),室溫下輕輕搖動 10 分鐘。2) 加入甘氨酸至終濃度為 125 mM,輕輕振蕩孵育 5 分鐘。3) 用 10 ml 冷 PBS 洗滌細胞 2 次。4) 用 5 ......閱讀全文
染色質免疫沉淀DNA分析
實驗概要染色質免疫共沉淀是一種強力的方法,來聯系蛋白質或其修飾的定位與基因組的關系。染色質分離并用特異性抗體判斷是否與特異性 ?DNA?序列相結合。染色質免疫沉淀法亦可用來檢測目的位點在基因組中的時空分布(用芯片或 DNA 測序)。本操作規程詳細闡述了交聯染色質免疫沉淀 ?(X-ChIP) 實驗的具
染色質免疫沉淀DNA分析
實驗概要染色質免疫共沉淀是一種強力的方法,來聯系蛋白質或其修飾的定位與基因組的關系。染色質分離并用特異性抗體判斷是否與特異性 ?DNA?序列相結合。染色質免疫沉淀法亦可用來檢測目的位點在基因組中的時空分布(用芯片或 DNA 測序)。本操作規程詳細闡述了交聯染色質免疫沉淀 ?(X-ChIP) 實驗的具
染色質免疫沉淀分析
真核生物細胞狀態是由內源和外源因素共同影響的,所有信號傳遞途徑的終點都是DNA 。DNA 通過核蛋白復合物組成染色質,染色質是基因調控的一個重要作用位點。轉錄激活因子和輔助抑制因子的研究顯示存在一種新的調節機制--" 組蛋白密碼" ,其信息存在于組蛋白的轉錄后修飾等過程中。該類修飾包括組蛋白磷酸
關于染色質免疫沉淀法改變分析介紹
是研究轉錄調控蛋白和相應核苷酸序列結合的常用方法,但是由于許多轉錄調控蛋白有相似或相同的DNA結合位點,這種體外分析獲取的結果不一定能真實地反映體內轉錄調控蛋白和DNA結合的狀況。染色質免疫沉淀分析(ChIP)是基于體內分析發展起來的方法,它能真實、完整地反映結合在DNA序列上的調控蛋白,是確定
染色質免疫沉淀技術的應用
隨著人類基因組測序工作的基本完成,功能基因組學逐漸成為研究的熱點。而基因表達的調控又是功能基因組學的一個重要研究領域,要想提供蛋白因子直接調控的證據,需要直接檢測蛋白質-DNA的相互作用,而染色質免疫沉淀技術(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)就是一種研
體內甲醛交聯及染色質免疫沉淀研究DNA和蛋白質作用
染色質由真核基因組包裝而成,它參與了轉錄、復制、重組、修復等許多以DNA一蛋白質相互作用為基礎的生化過程。研究者感興趣的是這些過程涉及到哪些特異的基因或DNA序列,有哪些蛋白質參與。盡管有許多人對染色質進行分類,就像Holde將其分為轉錄活性或非活性位點,但染色質構本身是動態的,并且DNA與非組蛋白
關于染色質免疫沉淀法—沉淀分析的基本介紹
沉淀分析是基于體內分析發展起來的方法,它的基本原理是在活細胞狀態下固定蛋白質-DNA復合物,并將其隨機切斷為一定長度范圍內的染色質小片段,然后通過免疫學方法沉淀此復合體,特異性地富集目的蛋白結合的DNA片段,通過對目的片斷的純化與檢測,從而獲得蛋白質與DNA相互作用的信息。它能真實、完整地反映結
自然染色質免疫沉淀實驗設計
1. The preparation of native chromatin from cultured human cells1.1.Cultured cells (e.g. HL-60 or lymphoblastoids) are grown to a density of approxima
組織免疫沉淀中染色質的制備
實驗概要此步驟描述了從組織中制備染色質,以用于后續的染色質免疫沉淀反應。每個免疫沉淀/抗體反應推薦使用肝組織 30 mg,但組織使用量可根據實際進行調整。每種組織的用量依據組織蛋白豐度、抗體親和力和交聯效率而定。每個免疫沉淀反應最適染色質的量為 5-15 μg 。每次交聯免疫沉淀反應之前,需根據不同
染色質免疫沉淀(ChIP)技術的難點
染色質免疫沉淀技術(Chromatin Immunoprecipitation,簡稱ChIP)是研究體內蛋白質與DNA相互作用的一種技術。它利用抗原抗體的特異性反應,可以真實地反映體內蛋白分子與基因組DNA結合的狀況。下面我們就最基本的實驗步驟,實驗中的小技巧以及需要注意的問題簡單介紹一下。1.
組織免疫沉淀中染色質的制備
實驗概要此步驟描述了從組織中制備染色質,以用于后續的染色質免疫沉淀反應。每個免疫沉淀/抗體反應推薦使用肝組織 30 mg,但組織使用量可根據實際進行調整。每種組織的用量依據組織蛋白豐度、抗體親和力和交聯效率而定。每個免疫沉淀反應最適染色質的量為 5-15 μg 。每次交聯免疫沉淀反應之前,需根據不同
技術和方案18-染色質免疫沉淀
試劑、試劑盒甲醛甘氨酸TBS蛋白酶抑制劑裂解緩沖液免疫共沉淀洗脫液TESTE儀器、耗材超聲波粉碎儀實驗步驟1.培養要分析的細胞。每一個樣品,需要在三角瓶中培養 50~100ml 細胞至 OD600 大約為 1。2.甲醛處理細胞交聯蛋白質和 DNA。加甲醛到細胞中至終濃度為 1%(37% 的甲醛按 1
染色質免疫沉淀芯片(ChipChip)
該技術能夠快速在目標基因組的染色體中確定特異DNA結合蛋白的準確結合位點,ChIP芯片也可以在一個基因組的任何感興趣的區域內尋找染色體的結構改變。一、ChIP-Chip的用途(1)在基因組范圍內確定基因轉錄因子的DNA結合位點和其他DNA結合蛋白或蛋白復合體的DNA結合位點。(2)染色體活性狀態的定
染色質免疫沉淀法(Chromatin-immunoprecitation,ChIP)
染色質免疫沉淀法(Chromatin immunoprecitation,ChIP)是研究體內DNA與蛋白質相互作用的重要工具。它可以靈敏地檢測目標蛋白與特異DNA片段的結合情況,還可以用來研究組蛋白與基因表達的關系。核小體組蛋白可以發生多種翻譯后的共價修飾,如乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化等,這些
關于染色質免疫沉淀法的基本介紹
染色質免疫沉淀法(Chromatin immunoprecipitation,ChIP)是研究體內DNA與蛋白質相互作用的重要工具。它可以靈敏地檢測目標蛋白與特異DNA片段的結合情況,還可以用來研究組蛋白與基因表達的關系。 核小體組蛋白可以發生多種翻譯后的共價修飾,如乙酰化、甲基化、磷酸化、泛
關于染色質免疫沉淀的基本信息介紹
染色質免疫沉淀(英語:Chromatin Immunoprecipitation, ChIP)被用來研究細胞內DNA與蛋白質相互作用,具體來說就是確定特定蛋白(如轉錄因子)是否結合特定基因組區域(如啟動子或其它DNA結合位點)——可能定義順反組。 ChIP還被用來確定基因組上與組蛋白修飾相關的
Active-Motif的染色質免疫沉淀試劑盒(ChIP)
ChIP(染色質免疫沉淀)方法是研究活體“蛋白質-DNA”相互反應的一種非常強大的工具。目前,這種方法用于染色質結構的動力學研究、轉錄因子的調節和輔助調節因子及其他表觀遺傳變化的研究。ChIP的使用過程分為三個主要步驟:第一步,在甲醛固定后分離和破碎染色質;第二步,使用感興趣的蛋白的抗體完成特定染色
染色質免疫沉淀(ChIP)技術的難點及應用1
序言隨著人類基因組測序工作的基本完成,功能基因組學的研究逐漸成為研究的熱點。而基因表達的調控又是功能基因組學的一個重要研究領域。研究某個蛋白因子的調控功能,可以通過對蛋白活性(激活或抑制其活性),蛋白數量(過表達Overexpression或基因缺陷型Knockout), 以及蛋白功能(功能缺陷
染色質免疫沉淀(ChIP)技術的難點及應用2
3. 染色質免疫沉淀Input對照:在進行免疫沉淀前,需要取一部分斷裂后的染色質做Input對照。Input是斷裂后的基因組DNA,需要與沉淀后的樣品DNA一起經過逆轉交聯,DNA 純化,以及最后的PCR或其他方法檢測。Input對照不僅可以驗證染色質斷裂的效果,還可以根據Input中的靶序
植物染色質免疫沉淀試劑盒(CHIP)的使用說明
蛋白質和DNA的相互作用是調控細胞反應過程的要素之一。染色質免疫沉淀分析方法(chromatin immunoprecipitation, CHIP)是研究活體內DNA和蛋白質的相互作用的最新最有力的研究工具。CHIP技術通過三大步驟實現:第一,甲醛固定后染色質分離和斷片;第二,運用特異蛋白
ChIP實驗的四個注意事項
染色質免疫沉淀 (ChIP) 用于檢測細胞核中天然染色質內的蛋白質與?DNA?之間的相互作用。ChIP 實驗首先需要將細胞固定,即將蛋白質與 DNA 相互作用交聯固定到位。然后將染色質打斷為片段,使用抗體對目的蛋白質以及與其結合的所有 DNA 進行免疫沉淀。最后,解交聯,對沉淀 DNA 進行純化。純
植物染色質免疫沉淀試劑盒的使用說明
EpiQuik?植物染色質免疫沉淀試劑盒包括全套的試劑,允許試驗者有效地在體內研究蛋白-DNA相互關系。整個過程可以在6小時內完成,產品效果遠遠優于任何競爭對手的試劑盒。EpiQuik?植物染色質免疫沉淀試劑盒適用于將特異性免疫沉淀與定性和定量PCR、ChIP-Seq、ChIP-on-chip結合使
Cell特輯:免疫沉淀
“Cell Press Selections”是由Cell出版社推出的一份推薦文章集合手冊,主要介紹某個生命科學研究領域最新的進展及突出成果。相關特輯內容包括研究論文,評論性文章以及snapshots,涉及了同一領域的方方面面,更為重要的是這些文章由贊助商贊助,可以免費獲取。 蛋白與DNA之間
免疫學技術專題:染色質免疫沉淀芯片(ChipChip)
該技術能夠快速在目標基因組的染色體中確定特異DNA結合蛋白的準確結合位點,ChIP芯片也可以在一個基因組的任何感興趣的區域內尋找染色體的結構改變。一、ChIP-Chip的用途(1)在基因組范圍內確定基因轉錄因子的DNA結合位點和其他DNA結合蛋白或蛋白復合體的DNA結合位點。(2)染色體活性狀態的定
關于染色質免疫沉淀法—真核生物的基本介紹
是由內源和外源因素共同影響的,所有信號傳遞途徑的終點都是DNA。DNA通過核蛋白復合物組成染色質,染色質是基因調控的一個重要作用位點。轉錄激活因子和輔助抑制因子的研究顯示存在一種新的調節機制--“組蛋白密碼”,其信息存在于組蛋白的轉錄后修飾等過程中。該類修飾包括組蛋白磷酸化、乙酰化、甲基化、AD
染色質免疫共沉淀研究
真核生物的基因組DNA以染色質的形式存在,研究蛋白質與DNA在染色質環境下的相互作用是闡明真核生物基因表達機制的基本途徑。與傳統的EMSA技術相比,染色質免疫沉淀技術(ChIP)能真實完整地反映結合在DNA序列上的調控蛋白,是目前研究體內DNA與蛋白質相互作用的最佳方法。染色質免疫沉淀技術(chro
染色質的組成DNA的簡介
細胞中編碼和控制的信息是與DNA分子緊密地聯系在一起的。DNA與染色質有著重大聯系。DNA是一種高分子聚合物,即由重復單位構成的大分子。每一單位都由三種較小分子組成,它們彼此結合形成核苷酸。堿基共有四種:胸腺嘧啶(T),胞嘧啶(C),腺嘌呤(A),鳥嘌呤(G)。人的堿基比例 A:T:G:C是29
北京大學Cell-Res獲染色質免疫沉淀測序技術突破
生物動態光學成像中心黃巖誼課題組與湯富酬課題組合作,發展了一種基于微流控芯片的微量細胞樣品處理與核酸俘獲方法,成功實現了針對1000個細胞的染色質免疫沉淀測序(ChIP-Seq),大幅減少了這類實驗中對樣品起始量的要求,并利用這一方法研究了組蛋白H3第4位賴氨酸的3甲基化修飾(H3K4me3)在
免疫沉淀法的類型
個別免疫沉淀法(IP):用來分離某個細胞萃取物中的已知特定蛋白質免疫沉淀法免疫共沉淀法(Co-IP):研究整個蛋白質復合體染色質免疫沉淀法(ChIP):用來研究DNA上的特定蛋白質RNA免疫沉淀法(RIP):和ChIP相近,但RNA免疫沉淀法是用來研究會與RNA結合的蛋白質RIP技術(RNA Bin
免疫沉淀法的主要類型
個別免疫沉淀法(IP):用來分離某個細胞萃取物中的已知特定蛋白質免疫共沉淀法(Co-IP):研究整個蛋白質復合體染色質免疫沉淀法(ChIP):用來研究DNA上的特定蛋白質RNA免疫沉淀法(RIP):和ChIP相近,但RNA免疫沉淀法是用來研究會與RNA結合的蛋白質RIP技術(RNA Binding