繪制D7152441與PB2cap的結合模式圖（三）
必要時，可先將cartoo隱藏起來，等調整好label后，再顯示出來），讓視圖更清晰。經過上述一系列操作，得到下圖：2.6. 生成圖片上面的圖已經可以發表文章了，但為了更好看，還需要進行一步：光線追蹤（Ray tracing）。繼續使用命令：至此，我們拿到3張圖片：focus.png、label.png和overview.png。下面講述如何使用PS處理這些圖片。3. 使用PS添加字體打開PS，將focus.png文件拖進界面。此時，圖片背景可能有一排排的灰色格子，這是因為PyMOL生成的png圖片背景是透明的。只需要將圖片設為背景圖層（默認背景顏色是白色，如果不是，請自行更改），即可去除格子，得到白色背景的圖片。操作如下：然后，參照label.png文件，為focus圖添加文字標簽。按字母T鍵，然后左鍵點擊圖片任意地方，即可輸入文字內容，完成后按右側小鍵盤的Enter鍵（并非平時使用的字母鍵盤Enter鍵，兩者功能在PS中略有......閱讀全文
繪制D7152441與PB2cap的結合模式圖（三）
必要時，可先將cartoo隱藏起來，等調整好label后，再顯示出來），讓視圖更清晰。經過上述一系列操作，得到下圖：2.6. 生成圖片上面的圖已經可以發表文章了，但為了更好看，還需要進行一步：光線追蹤（Ray tracing）。繼續使用命令：至此，我們拿到3張圖片：focus.png、label.p
繪制D7152441與PB2cap的結合模式圖（一）
前言本期，我將帶大家使用PyMOL軟件（搭配Photoshop、MS Powerpoint）繪制D715-2441與PB2cap的結合模式圖。我們先來看一張成品圖：?研究背景根據上期的分析結果，我們獲得以下相互作用：1、化合物D715-2441的芳環夾在氨基酸殘基H357和F404之間并形成π-π堆
繪制D7152441與PB2cap的結合模式圖（二）
設置關鍵殘基對象：關鍵殘基包括：A鏈的K339、H357、E361、K376和F404。由于該蛋白只有一條鏈，在使用命令選擇殘基時，可以不用指定鏈名。按照下圖順序，將關鍵殘基設置為res對象。2.3. 顯示所需，隱藏多余在PyMOL中輸入以下命令：然后，進行鼠標操作：2.4. 繪制相互作用力前面說過
高質量PyMOL軟件作圖教程繪制D7152441與PB2cap的結合模式圖
上一期，小編教大家使用殷賦云計算平臺（http://cloud.yinfotek.com）重現了一篇2018年文獻《【文獻重現】D715-2441 抑制劑與PB2蛋白的結合模式研究》的分子對接計算結果。然而，要發表高質量SCI文章，還需要制作高質量的Figure。本期，我將帶大家使用PyMOL軟
分子對接技術研究D7152441－抑制劑與PB2蛋白的結合模式－－一
【前言】從本期起，小編將帶領大家使用殷賦云計算平臺（http://cloud.yinfotek.com/）來做一系列計算“文章”。這一期咱們來重現一篇2018年文獻[1]的計算結果，看看作者是如何運用分子對接技術來闡明機理、升華文章的。該文獻影響因子4.6，是典型的“實驗+計算”模式，比較接近大多數
分子對接技術研究D7152441－抑制劑與PB2蛋白的結合模式
從本期起，小編將帶領大家使用殷賦云計算平臺（http://cloud.yinfotek.com/）來做一系列計算“文章”。這一期咱們來重現一篇2018年文獻[1]的計算結果，看看作者是如何運用分子對接技術來闡明機理、升華文章的。該文獻影響因子4.6，是典型的“實驗+計算”模式，比較接近大多數科研
分子對接技術研究D7152441－抑制劑與PB2蛋白的結合模式－二
6、 提交計算任務Dock6方案為我們提供了多種對接計算模式，這里稍微解釋一下。在各種模式中，蛋白受體都是剛性不動的。因為Dock6的Grid算法實際上并非直接采用蛋白結構進行對接，而是采用其模型（正是前面生成的格點）。根據配體運動的方式，分為下面幾種情況：1）?柔性配體對接，即配體在對接過程中是柔
分子對接技術研究D7152441－抑制劑與PB2蛋白的結合模式－二
4、 準備受體分子與配體不同，受體分子通常是生物大分子，無法通過手繪準備。平臺提供了其他輸入方式。點擊上傳文件，選擇剛才下載的4cb4.pdb文件，然后按提示進行下去。通常來說，從PDB庫下載的晶體結構文件里邊包含了很多組分，不僅有（單條或多條）肽鏈，通常還有有機小分子和溶劑分子（水分子、金屬離子）
XS質控圖的繪制與使用
??? X-S圖法由于它只需要單一濃度的未定值血清，繪圖方法簡單易懂，有較為成熟的理論和實際經驗。因此，成為國內外目前采用最廣泛的一種常規室內質量控制方法。一般步驟和具體做法如下： ⒈最佳條件和常規條件下的變異的測定及計算?選擇含量均勻、穩定性良好的未定值質控血清，在“最佳條件”，對該批血清反復測
Nature：美學者繪制三維鼠腦圖
在老鼠的大腦中，7000萬個神經細胞看起來就像是一團亂麻，但研究人員正在揭示在整個器官中傳遞信息的單個線程。10月27日發布的一幅名為“鼠光”的三維大腦圖譜，使研究人員能夠追蹤單個神經細胞的路徑，并最終揭示大腦是如何收集信息的。 這張圖譜包含了300個神經細胞，研究人員計劃在明年增加700
解析Python中利用Matplotlib繪制多圖并合并展示（三）
2、subplot2grid分格顯示這種方式和上一種實現的效果一樣，只不過更加容易理解罷了，先來看一個案例代碼：import ?matplotlib．pyplot as pltimport numpy as npplt．rcParams［＇font．sans－serif＇］＝［＇SimHei＇］ ＃
電氣原理圖的繪制原則與識別方法（一）
為了表達生產機械電氣控制系統的結構、原理等設計意圖，便于電氣系統的安裝、調試、使用和維修，將電氣控制系統中各電器元件及其連接線路用一定的圖形表達出來，這就是電氣控制系統圖。用導線將電機、電器、儀表等元器件按一定的要求連接起來，并實現某種特定控制要求的電路。 畫電氣原理圖的一般規律如下：
電氣原理圖的繪制原則與識別方法（二）
電氣原理圖繪制的基本步驟和注意事項 電氣原理圖繪制的基本步驟是：首先進行認真構思，對所要繪制的步驟及表達的內容和布局做的心中有數；然后對整個圖面進行布局，把所要表達的全部內容（不能遺漏），按其正確位置、主次及繁簡劃定實際所占畫面大小；第三，確定基準線，包括水平基準線和垂直基準線；第四，
BET圖用哪些數據繪制
一、dV/dD----pore size這個圖，因為我們獲得的數據中沒有dV/dD----pore size這組數據，所以應該可以用dA/dW----pore size數據作圖，但是最好是要表明是dA/dW。這個可以用BJH中的adsorption dA/dW pore area中的pore wid
graphpad－prism怎么繪制紫外圖
1、Graphpad中創建Newtable&graph，打開Graphpad，選擇XY，點擊Create。2、輸入，導入數據，建立DataTables：Data1。3、分析點擊左邊的Results里的NewAnalysis，然后選擇Transform里的TransposeXandY，點擊OK。4、繪
BET圖用哪些數據繪制
dV/dD----pore size這個圖，因為我們獲得的數據中沒有dV/dD----pore size這組數據，所以應該可以用dA/dW----pore size數據作圖，但是最好是要表明是dA/dW。這個可以用BJH中的adsorption dA/dW pore area中的pore width
國際科研團隊完成“準金星”大氣三維圖繪制
葡萄牙天體物理與空間科學研究所科學家牽頭的國際團隊，完成了“準金星”LP 890-9c行星的大氣三維圖繪制，有助于科學家們利用詹姆斯·韋伯空間望遠鏡或者未來其它的極大規模望遠鏡對LP 890-9 c行星等巖石行星進行觀測。相關研究成果刊登在英國皇家天文學會月刊。 金星大氣層可用作了解類地行星大氣演
《GigaScience》—實現文章與數據結合的創新學術發表模式
2012年7月12日，華大基因和生物醫學中心(BioMed Central)宣布其共同創辦的生物學期刊《GigaScience》首刊正式發行。該期刊采用標準全文文獻、數據庫信息以及信息分析工具相結合的嶄新模式，來發表大規模的生物學研究成果，為廣大科研工作者提供免費公開的有效數據以及生物學發現
Nature發文：繪制植物科學的分子圖
任何生物體的每個細胞都包含完整的遺傳信息，或者說是一個生物的“藍圖”，編碼所謂的DNA核苷酸構建塊序列。但是植物是如何創造出各種各樣的組織的呢？比如將光能轉化成化學能并產生氧氣的葉子，或者從土壤中吸收養分的根？答案就在各自組織細胞的蛋白質模式。 蛋白質是每個細胞的主要分子。它們是生物催化劑，在
繪制夏威夷島“魚流圖”
?珊瑚礁中的魚 ? ?圖片來源：Shawn Heinrichs/Conservation International近日，美國夏威夷大學馬諾阿分校的研究人員在《生態學與環境前沿》上發表了一篇論文。海洋學、遺傳學、生態學、漁業生物學和社會科學等領域的專家，對魚類的自然和商業流動進行了深入研究，繪制出“
怎么利用origin繪制紫外譜圖
1、下載并打開origin軟件。2、首先我們打開origin這個軟件同時打開我們的實驗數據。3、從儀器上直接導出的數據不是這樣的，需要分裂一下。4、選擇并復制exxcel表格上的數據，再打開origin粘貼在表格里，如圖所示。5、添加完數據以后，點擊上方的“繪圖”會出現下圖中的界面，選擇你需要的圖形
怎么利用origin繪制紫外譜圖
1、打開Origin8，新建文件，選擇porject類型；2、在彈出的數據框中導入要生成曲線的數據，然后將設置好橫坐標和縱坐標，同時在每列表格上面三欄填寫好單位、標題等3、選擇所有數據，選擇導出圖表（左下角曲線的下拉菜單里面選擇line+symbol）4、其他要更改的地方都可以通過單擊形成對話框進行
什么是核型模式圖？
中文名稱核型模式圖英文名稱karyogram;idiogram定 義根據一個細胞中全部染色體的形態特征所描繪并排列而成的模式圖。應用學科細胞生物學（一級學科），細胞遺傳（二級學科）
用RNAseq快速繪制大腦圖
在過去的十年中，DNA和RNA測序技術已迅猛發展并且更加便宜，現在它們被運用到各種新的領域中。最近在《Neuron》發表的一項新研究中，研究人員使用RNA測序技術，在單個神經元水平上繪制小鼠的大腦圖。這種新技術被稱為Multiplexed Analysis of Projections by S
如何用電腦繪制HPLC色譜圖
方法如下：精密取相應對照品，加適當的溶劑溶解，分別精密量取1、2、3、4、5ml（或相應成梯度的量），稀釋成各個梯度的溶液，注入液相色譜儀，記錄色譜圖，以峰面積為縱坐標，以濃度C為橫坐標進行線性回歸。在Excel中就直接可以繪制高效液相色譜法標準曲線。有的色譜工作軟件能直接繪制標準曲線。色譜法也叫層
衛星繪制熱能分布圖闡明云層與氣候變化關系
北京時間6月17日消息，據美國宇航局官網報道，2010年5月30日，美國地球同步軌道環境衛星繪制了西半球的熱能分布圖，圖片闡明全球氣候變化與云層變化之間的關系。 云相當于能量的媒介。通過氣候系統，云層將太陽能從溫暖的熱帶地區傳送到全球其他地區。同時，云層也在地球與太空之間充當了
科學家為模式植物擬南芥繪制“藍圖”
任何生物體的每個細胞都包含完整的遺傳信息，或者說是一個生物的“藍圖”，編碼所謂的DNA核苷酸構建塊序列。但是植物是如何創造出各種各樣的組織的呢？比如將光能轉化成化學能并產生氧氣的葉子，或者從土壤中吸收養分的根？答案就在各自組織細胞的蛋白質模式。科學家為模式植物擬南芥繪制“藍圖”。圖片來源：Cha
關于細胞質膜的模式圖介紹
１、細胞質膜的模式圖— 緊密連接 緊密連接的焊接線由跨膜細胞粘附分子構成，主要的跨膜蛋白為claudin和occludin，另外還有膜的外周蛋白ZO. 緊密連接的主要作用是封閉相鄰細胞間的接縫，防止溶液中的分子沿細胞間隙滲入體內，從而保證了機體內環境的相對穩定；消化道上皮，膀胱上皮，腦毛細血
中國繪制世界首張南極土地覆蓋圖
在國家863項目支持下，中國科研人員成功繪制1：10萬全南極洲土地覆蓋圖，這是世界首張南極土地覆蓋圖，也是中國自主掌握的首批關于南極洲的重要科學數據。 北京師范大學全球變化與地球系統科學研究院副院長程曉教授在2010中國極地科學學術年會上介紹說，相關課題組通過收集1999—2003期
先進院發現GPCR藥物全新結合模式
日前，中國科學院深圳先進技術研究院醫藥所計算機輔助藥物設計中心袁曙光課題組帶領團隊與上海科技大學合作，通過計算藥學與生物化學相結合的方法，發現G蛋白偶聯受體蛋白（GPCR）全新藥物分子結合模式與激活機制。相關工作近期發表在ACS Central Science上。 GPCR參與著人類體內包括細