人類胸腺單細胞圖譜助力腫瘤免疫治療
胸腺是T細胞的分化、發育和成熟的場所，是組成免疫系統的重要器官。到目前為止，還不清楚在整個生命過程中，人體胸腺中的早期免疫前體細胞如何發育為T細胞。盡管已通過各種動物模型對胸腺進行了廣泛的研究，但是還未有詳細的人類胸腺細胞圖譜得以報道。 由來自VIB炎癥研究中心（VIB Center for Inflammation Research）、根特大學（Ghent University）、英國維康桑格研究所（The Wellcome Sanger Institute）、和英國紐卡斯爾大學（Newcastle University）的研究人員組成的團隊于2020年2月21日，在Science發表了以 A cell atlas of human thymic development defines T cell repertoire formation 為題的研究文章，首次繪制了發育中的人類胸腺細胞的完整圖譜。 研究人員對胚胎發育......閱讀全文
Nature－immunoloy：新冠肺炎患者的單細胞免疫圖譜
研究人員應用單細胞測序技術全面揭示了輕中型、重型新冠肺炎患者及其從發病期到康復期機體整體免疫學變化特征、機制和規律。 今年年初，新冠肺炎疫情在世界范圍內快速暴發。根據世界衛生組織最新統計數據顯示，截止到2020年8月11日，新冠肺炎在全球已導致累計近2000萬確診病例和超過73萬死亡病例，平
獼猴大腦皮層單細胞空間分布圖譜發布
由860億個神經元組成的人類大腦，就像一座結構精巧的迷宮。為了繪制出這座迷宮的地圖，腦科學家們將目光聚焦在獼猴——這種與人類最接近的靈長類模式動物上，它的大腦包含超過60億個神經元。 7月12日23時，由中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心（神經科學研究所）聯合華大生命科學研究院、臨港實驗室
獼猴大腦皮層單細胞空間分布圖譜發布
由860億個神經元組成的人類大腦，就像一座結構精巧的迷宮。為了繪制出這座迷宮的地圖，腦科學家們將目光聚焦在獼猴——這種與人類最接近的靈長類模式動物上，它的大腦包含超過60億個神經元。 7月12日23時，由中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心（神經科學研究所）聯合華大生命科學研究院、臨港實驗室
楊樹次生木質部單細胞轉錄組圖譜建立
近日，北京林業大學教授張德強團隊在《植物生物技術雜志》發表研究論文。該研究以楊樹為研究模式，利用單細胞測序技術、基因組分析、RNA原位雜交、愈傷組織遺傳轉化等技術建立了楊樹次生木質部的單細胞轉錄組圖譜，重構了完整的楊樹次生木質部細胞類群，鑒定了調控木質部發育過程的關鍵轉錄因子，系統解答了次生木質
Cell：單細胞測序繪制骨髓基質細胞全景圖譜
最新發布在Cell上的一項研究表明，單細胞測序可以繪制骨髓基質細胞的完整類群，并為白血病研究提供新的視角。這一新研究由美國哈佛大學的David T. Scadden教授和馬薩諸塞州綜合醫院Broad研究所的Aviv Regev團隊合作而成。他們創新地使用單細胞RNA測序（scRNA-seq）技術
單細胞精度解析人類T淋巴細胞起源及胸腺器官發生
T淋巴細胞是宿主適應性免疫系統中最重要的免疫細胞之一，在抵抗病原入侵、維持機體穩態以及抗腫瘤等方面起到不可或缺的作用【1,2】。胸腺是T淋巴細胞發育的必需場所【3】。胎肝或骨髓來源的胸腺定植祖細胞（thymus seeding progenitor, TSP）遷移定植到胸腺后，即為早期胸腺祖細胞
“沉默腫瘤”首張全景分子圖譜繪成
??7日，記者從復旦大學附屬腫瘤醫院獲悉，該院院長虞先濬教授聯合北京大學腫瘤醫院、中國科學院上海藥物研究所、上海長海醫院等單位的研究團隊，歷時5年成功繪制全球首張無功能性胰腺神經內分泌瘤多組學全景圖譜，并根據圖譜突破性提出這種“沉默腫瘤”的分子分型框架、預后模型和靶向—免疫治療新策略，為臨床精準診療
聯合用藥治療胸腺上皮腫瘤效果顯著
近日，來自美國國家癌癥中心的研究人員通過研究在I/II期臨床試驗中評估了藥物belinostat同順鉑、多柔比星及環磷酰胺聯合用于治療胸腺上皮性腫瘤的效果，相關研究刊登于國際雜志Clinical Cancer Research上。 文章中，研究者Thomas表示，進行I/II期臨床試驗的目的就
迄今最完整植物單細胞圖譜問世，揭開葉片衰老“密碼”
植物的衰老往往伴隨著新生，在衰老的過程中，葉片并非簡單地枯萎掉落，而是悄悄進行一場資源大轉移，將自己積累的碳、氮等營養物質分解，轉運給花朵、果實，甚至根部，用“犧牲”自己，換來果實的茁壯成長。 在葉片衰老的過程中，植物細胞如何進行時空協調？哪些關鍵基因參與了調控？4月11日，一項發表于《細胞》
Cell：繪制人類單細胞染色質可及性圖譜
在人類細胞中，總長約2米的基因組DNA通過與組蛋白纏繞形成核小體，并經過螺旋折疊等方式盤繞形成染色體進而團聚于直徑10微米的細胞核中。在細胞內的DNA需要進行轉錄等活動的時候，DNA才會從組蛋白中釋放出來，裸露出需要與轉錄因子結合的位點從而便于轉錄，染色質的這種特性叫做染色質可及性，暴露的區域被
首個豆科植物根尖單細胞表達圖譜繪制成功
?百脈根單細胞圖譜細胞類型。中國農科院供圖 近日，中國農業科學院生物技術研究所作物生物技術育種創新團隊與國內其他科研單位合作，共同繪制完成首個豆科植物百脈根的根尖單細胞表達圖譜，鑒定出根尖的主要細胞類型，發現了新的細胞類型特異基因，并分析了各個細胞類型的潛在功能，對研究豆科植物根系發育、結瘤固氮
Nature重磅！利用單細胞RNA測序構建人類肝臟細胞圖譜
肝臟是人體最大、功能最多的器官之一，在人體的新陳代謝及免疫過程中發揮著關鍵作用。更值得關注的是，肝臟還是人體唯一一種僅需原體積的25%，就能夠完全再生的內臟器官。另外，包括脂肪肝、肝癌及肝炎在內的各類肝病是當今世界最大的健康問題之一，也是導致死亡的主要原因。 盡管肝臟對人類健康極為重要，但健康
科學家繪制出腦前額葉發育單細胞圖譜
? 近日，中科院生物物理所王曉群課題組、北京大學未來基因診斷高精尖創新中心湯富酬課題組、北京大學第三醫院喬杰課題組和首都醫科大學附屬安貞醫院張軍課題組合作，繪制出人腦前額葉胚胎發育過程的單細胞轉錄組圖譜，并對其中關鍵的細胞類型進行了系統功能研究，為繪制完整的人腦細胞圖譜奠定重要基礎。相關研究成果已發
Nature：浙大領銜在構建人類單細胞圖譜方面取進展
在一項新的研究中，來自中國浙江大學等研究機構的研究人員朝構建全面的人類單細胞圖譜邁出了一大步。相關研究結果于2020年3月25日在線發表在Nature期刊上，論文標題為“Construction of a human cell landscape at single-cell level”。在這
中國科學家發表泛癌癥T細胞單細胞圖譜
T細胞單細胞圖譜的研究框架和主要發現。（張澤民供圖） 12月17日，北京大學生物醫學前沿創新中心教授張澤民課題組聯合北京大學腫瘤醫院季加孚、步召德課題組以及北京大學第三醫院，在《科學》上發表了泛癌癥T細胞圖譜。結合基因表達譜和T細胞受體序列，研究者系統刻畫了腫瘤浸潤性T細胞的異質性和動態變化，并系
研究人員繪制七鰓鰻單細胞轉錄組圖譜
雷氏七鰓鰻作為現存的無頜脊椎動物代表，是一種由無脊椎動物向脊椎動物進化的過渡類型，被視為研究脊椎動物演化的重要模式生物。近日，華大生命科學研究院聯合遼寧師范大學七鰓鰻研究中心等單位在《自然—通訊》發表最新研究成果，團隊基于華大自主研發的DNBelab C4和 DNBSEQ測序平臺，采用單細胞RNA測
北京生科院建立單細胞環形RNA分析技術及表達圖譜
環形RNA是一類在真核細胞中廣泛存在的內源性非編碼RNA分子，在生物體發育過程中發揮重要作用。之前研究已在不同物種中鑒定出數百萬個環形RNA分子，并產生了大量用于揭示生物體組織表達模式的環形RNA數據資源。然而，由于大多數環形RNA表達量較低，傳統的轉錄組測序方法無法表征單個細胞環形RNA表達譜
科學家繪制水稻幼苗根葉單細胞轉錄圖譜
水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄組二維UMAP圖與組織解剖圖 圖片來源：錢文峰等 中國科學院遺傳與發育生物學研究所錢文峰研究組應用單細胞轉錄組測序技術，獲得了水稻幼苗葉和根超過20萬個單細胞的轉錄組信息，利用細胞類型標記基因和原位雜交技術，對每個細胞的身份進行了鑒定，構建了水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄
科學家繪制水稻幼苗根葉單細胞轉錄圖譜
中國科學院遺傳與發育生物學研究所錢文峰研究組應用單細胞轉錄組測序技術，獲得了水稻幼苗葉和根超過20萬個單細胞的轉錄組信息，利用細胞類型標記基因和原位雜交技術，對每個細胞的身份進行了鑒定，構建了水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄圖譜。相關結果近日發表于《遺傳學和基因組學期刊》。水稻幼苗葉和根的單細胞轉錄組
Nature重磅！利用單細胞RNA測序構建人類肝臟細胞圖譜
肝臟是人體最大、功能最多的器官之一，在人體的新陳代謝及免疫過程中發揮著關鍵作用。更值得關注的是，肝臟還是人體唯一一種僅需原體積的25%，就能夠完全再生的內臟器官。另外，包括脂肪肝、肝癌及肝炎在內的各類肝病是當今世界最大的健康問題之一，也是導致死亡的主要原因。 盡管肝臟對人類健康極為重要，但健康
《科學》：北大團隊發表泛癌癥T細胞單細胞圖譜
北京大學生物醫學前沿創新中心（BIOPIC）、生命科學學院、北京未來基因診斷高精尖創新中心（ICG）張澤民課題組聯合北京大學腫瘤醫院季加孚、步召德課題組以及北京大學第三醫院，在國際期刊Science上發表了題為“Pan-Cancer Single Cell Landscape of Tumor-
解密神經元：腦連接圖譜走向單細胞精度時代
稀疏標記系統工作原理15個多巴胺神經元的全腦投射形態重構 就像廣袤無垠的宇宙中有無數星體，人類大腦中分布著千億數量的神經元，它們“雜亂無章”地分布且相互連接，發揮著感受刺激和傳導興奮的作用。這些決定人類思考能力的大腦神經元究竟是怎么連接的？這個問題自神經生物學興起以來一直懸而未解。 過去，神經生
研究揭示人類免疫系統起源
人類胸腺的首個細胞圖譜可能會導致新的免疫療法來治療癌癥和自身免疫疾病。如今，在一項新的研究中，來自英國紐卡斯爾大學、韋爾科姆基金會桑格研究所和比利時根特大學等研究機構的研究人員繪制出胸腺組織在人類一生中的圖譜，以了解它如何發育和產生重要的稱為T細胞的免疫細胞。在未來，這些信息可能有助于科學家們構
DeepDEP：深度學習構建腫瘤依賴性圖譜
大家好呀！今天給大家介紹一篇2021年發表在Science Advances上的文章。全基因組功能缺失篩查揭示了對癌細胞增殖十分重要的基因，稱為腫瘤依賴性。然而將腫瘤依賴性關系與癌細胞的分子組成聯系起來并進一步與腫瘤聯系起來還是一個巨大的挑戰。本研究，作者提出了DeepDEP，基于深度學習模型和
花生光暗幼苗的單細胞轉錄組圖譜構建成功
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518535.shtm近日，廣東省農業科學院作物研究所花生研究團隊與合作者，在花生光暗形態轉變的單細胞基因表達譜研究方面取得進展，成功構建的花生光暗幼苗的單細胞轉錄組圖譜。相關成果發表于《植物生物技術雜志》
首張單細胞分辨率的人類卵巢細胞圖譜發布
美國密歇根大學工程師創建了一份新的人類卵巢“圖譜”，揭示了促使卵泡成熟的因素。研究人員可利用這份圖譜來確定哪些基因在單細胞水平上表達，從而發現攜帶卵母細胞的卵泡。這有助人們找到恢復卵巢激素產生功能的方法。相關研究發表在《科學進展》雜志上。人類卵泡熒光圖像清晰顯示了各個不同部分，包括卵母細胞（小橢圓形
研究成果：靈長類海馬衰老的單細胞轉錄組圖譜繪制
海馬體作為腦的重要組成部分，在學習和記憶中發揮重要作用。隨著年齡增長，海馬功能逐漸退化，導致認知功能的減退以及多種人類神經退行性疾病發生。由于海馬結構復雜，細胞組成具有高度異質性，傳統研究技術難以精確揭示海馬衰老過程中不同細胞類型的衰老規律及分子調控網絡。此外，由于倫理及樣本來源的限制，不同年齡
單細胞水平揭示造血干細胞擴增的動態圖譜
造血干細胞具有自我更新和分化的生物學特征，既可以維持其自身在造血組織中的恒定數量，又能向紅系、粒系、巨核系和淋巴系等多種血細胞分化。造血干細胞移植廣泛應用于白血病、再生障礙性貧血、骨髓增生異常綜合征等臨床血液系統惡性腫瘤的治療，然而，造血干細胞來源不足，限制其廣泛應用。因此，如何模擬體內造血干細
首個棉花纖維起始發育單細胞時空組學圖譜發布
近日，中國農業科學院棉花研究所鄉村振興科技創新團隊牽頭構建了首個結合單細胞轉錄組、空間轉錄組及空間代謝組的棉花纖維起始發育圖譜。利用該圖譜可以識別關鍵基因的表達模式及其與代謝途徑的關系，深入剖析纖維發育過程中的核心調控機制。相關研究成果發表在《自然通訊（Nature Communications）》
單細胞測序新突破:－北大繪制出人類胚胎基因調控圖譜
北京大學第三醫院的湯富酬研究員等采用先進的單細胞RNA測序技術，繪制出人類植入前胚胎和胚胎干細胞的轉錄組圖譜，有望在干細胞領域改善人類輔助生殖技術，以及預測潛在遺傳病產生的健康影響。研究成果發表在8月11日《自然結構與分子生物學》(Nature Structural & Molecular