全轉錄組測序的“一箭三雕”：circRNA，lncRNA，mRNA
1. 文章主題：環狀RNA通過靶向miRNA調控的信號傳導促進結直腸癌的轉移發表期刊：Journal of pathology影響因子：5.942發表時間：201906實驗方法：全轉錄組測序實驗樣本：結直腸癌組織肝轉移是結直腸癌（CRC）患者的主要死亡原因。作者使用全轉錄組測序在CRC肝轉移的小鼠模型中搜索CRC轉移相關的環狀RNA。確定了一種新穎的環狀RNA--circ-NSD2，能夠啟動CRC轉移。Circ-NSD2表達在CRC組織中升高，并在CRC患者的晚期或轉移性腫瘤中顯著增加。敲除和過表實驗證明，circ-NSD2在體外和體內均可促進CRC的遷移和轉移。從機制上講，circ-NSD2充當了抑癌基因miR-199b-5p的海綿，并激活了與CRC轉移相關的基因DDR1和JAG1。綜上所述，我們的發現了一種新型致癌環狀RNA--circ-NSD2,并揭示了circ-NSD2 / miR-199b-5p / DDR1 / ......閱讀全文
全轉錄組測序的“一箭三雕”：circRNA，lncRNA，mRNA
1. 文章主題：環狀RNA通過靶向miRNA調控的信號傳導促進結直腸癌的轉移發表期刊：Journal of pathology影響因子：5.942發表時間：201906實驗方法：全轉錄組測序實驗樣本：結直腸癌組織肝轉移是結直腸癌（CRC）患者的主要死亡原因。作者使用全轉錄組測序在CRC肝轉移的小鼠模
全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制（一）
2月7日，加拿大多倫多大學的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授團隊對144例前列腺癌樣本進行全轉錄組測序，結合后續的功能機制研究，揭示了前列腺癌circRNA新的調控機制！該研究成果以題為“Widespread and Functional RNA Circ
全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制（二）
3. 環狀RNA的差異表達與前列腺癌的進展有關研究者對144個前列腺癌進行了聚類分析，與線性RNA相比，環狀RNA最強模式與它們在每個樣本中的總體豐度相一致。另外，極端circRNA分布的患者的預后明顯較circRNA分布穩定的患者差，同時極端circRNA index組也與更高的轉移發生率
《Cell》重磅！全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制
2月7日，加拿大多倫多大學的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授團隊對144例前列腺癌樣本進行全轉錄組測序，結合后續的功能機制研究，揭示了前列腺癌circRNA新的調控機制！該研究成果以題為“Widespread and Functional RNA Ci
Cell》重磅！全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制！
2月7日，加拿大多倫多大學的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授團隊對144例前列腺癌樣本進行全轉錄組測序，結合后續的功能機制研究，揭示了前列腺癌circRNA新的調控機制！該研究成果以題為“Widespread and Functional RNA Ci
轉錄組測序和全轉錄組測序的區別
全轉錄組廣義上是指細胞在特定狀態下所能轉錄出來的?所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA?。借助高通量測序技術，可以全面獲取樣本中轉錄產物信息，結合競爭性內源RNA ( ceRNA)機制， 進行聯合分析，深入挖掘轉錄水平調控網絡。轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有
氯堿技術革新－“一箭三雕”
當下，“兩堿”行業處境困難，效益下行與環保壓力劇增，產業結構調整的任務非常艱巨。新氯化銨分解法對于兩大行業來說，無疑具有畫龍點睛之巧和四兩撥千斤之效。 新氯化銨分解法抓住催化劑這個靈魂，具有價格低廉、可連續使用、便于控制等特點。盡管目前才剛剛完成了中試，與大型工業化生產尚有一段距離，但卻給
Nature重要成果：發現“一箭三雕”的藥物
科學家們發現了一種化合物能夠殺死導致三種被忽視的疾病：美洲錐蟲病（Chagas disease）、利什曼病（leishmaniasis）和昏睡病（sleeping sickness）的寄生蟲。在拉丁美洲、亞洲和非洲這些疾病影響了數百萬人，當前幾乎沒有有效的治療方法。 發表在今天《自然》（Nat
又傳喜訊云序客戶一次測序兩項成果影響因子合計10分！
感恩有你，一路同行，新年快樂！ 感恩有你，一路同行！2019年伊始，云序生物攜全體員工對一直以來關心和支持公司發展的廣大新老客戶致以最誠摯的問候！一元復始，萬象更新！轉眼間我們迎來了2019年，站在新時代新的歷史起點，回望剛剛過去的2018年，不斷創新收獲碩果豐盈；展望2019，任重道遠卻
全轉錄組測序文章
研究背景? ? ?? 長鏈非編碼RNA（Long noncoding RNA，lncRNA）普遍被認為是一類不能編碼蛋白的長鏈RNA。由于其序列較長，所以可以有較大的潛力形成多種復雜構象，從而通過不同生物學途徑發揮其作用。此外，由于其不具備蛋白編碼能力，因此此類RNA也主要由其堿基序列形成的高級
一箭三雕！吃“全谷物”改變代謝、腸道微生物和免疫反應
2月8日，在線發表于The American Journal of Clinical Nutrition雜志上題為“Substituting whole grains for refined grains in a 6-wk randomized trial favorably affects
一次RNA甲基化測序的多項成果云序RNA甲基化測序技術...1
一次RNA甲基化測序的多項成果-云序RNA甲基化測序技術大公開文章導讀RNA修飾是表觀遺傳學中調控轉錄后基因表達的關鍵過程，目前對m6A RNA修飾的研究已進行的如火如荼，而除了m6A以外仍有多種RNA修飾類型參與調控轉錄后的基因表達，其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修飾以及ac
不得了，大牛告訴你lncRNA甲基化如何研究
lncRNA分子通過海綿機制結合microRNA發揮生物學功能，這個ceRNA機制已經讓大家心生厭倦了。可大牛就是大牛，引入甲基化就能輕松的變廢為寶，竟然能讓lncRNA的ceRNA思路變得瞬間高大上發表10分以上的文章，你一定和小編我一樣很好奇他是怎么做到的。 RNA甲基化，作為最新的國
全基因組及轉錄組測序案例分析
案例：應用全基因組測序和 RNA 測序來描繪常見的變異型免疫缺陷綜合癥（CVIDs）的基因圖譜 背景：常見的變異型免疫缺陷綜合癥（CVIDs）是機體免疫應答反應中不能產生抗體的最主要原因。CVIDs 變異度很高，大概 5% 的病人是由基因改變引起的。 目的：利用 Illumina HiSeq25
影響因子高達7.8分的直腸癌轉移肝癌環狀RNA文章思路解析
云序客戶發表首篇直腸癌轉移肝癌環狀RNA文章，影響因子高達7.8分!? 文章導讀： 在非編碼RNA的大家族中，環狀RNA是近年來繼microRNA和lncRNA之后又一個明星成員。因其3’-5’端成環，所以在生物體中具有穩定性高，不易被降解的特性。大部分環狀RNA通過直接或間接調控m
5篇m6A甲基化文章教你如何使用純測序數據得高分
2019年m6A修飾曾創下單月發表100+篇10分影響因子文章佳話。2020年1月17日何川教授團隊最新Science揭示了m6A新功能---調控染色質狀態和轉錄預示m6A等RNA修飾將仍然是目前最為熱門的科研方向。 云序生物是國內最早提供m6A測序的科研平臺，也是客戶發表文章最多的RNA甲基化測
5篇m6A甲基化文章教你如何使用純測序數據
文章導讀2019年m6A修飾曾創下單月發表100+篇10分影響因子文章佳話。2020年1月17日何川教授團隊最新Science揭示了m6A新功能---調控染色質狀態和轉錄預示m6A等RNA修飾將仍然是目前最為熱門的科研方向。m6A甲基化與mRNA關聯分析案例一：非洲爪蟾睪丸組織中m6A甲基化圖譜發表
一次RNA甲基化測序的多項成果云序RNA甲基化測序技術...2
（二）云序客戶m6A RNA甲基化修飾表達譜，一次測序兩篇文章疾病：胃癌樣品：胃癌組織vs癌旁組織（6 vs 6）研究方法：m6A-MeRIP-Seq，RNA-seq4. m6A修飾對其修飾基因在胃癌中的異常表達及預后的潛在影響發表雜志：Frontiers in Genetics影響因子：3.258
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
RNA甲基化是目前申請國自然項目熱點，也是唯一能在短短3個月內發數十篇nature，cell級別高分文章領域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究熱潮。因mRNA參與蛋白編碼，之前多數文章針對mRNA甲基化進行研究（詳細見云序課堂之前往期回顧）。然而許多研究表明發生m6A甲基化的非編碼RN
中外學者Nature子刊發文：環狀RNA翻譯出抑癌蛋白質！
由中山大學、復旦大學、暨南大學、美國安德森癌癥中心等多家單位發表一項發現：使用翻譯組測序技術，在腦膠質瘤細胞中發現了數千種可能翻譯的環狀RNA（circRNA），其中320個有差異表達現象，并具體驗證了一種名為LINC-PINT的環狀RNA可編碼長度為87個氨基酸的蛋白質PINT87aa。 近
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
RNA甲基化是目前申請國自然項目熱點，也是唯一能在短短3個月內發數十篇nature，cell級別高分文章領域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究熱潮。因mRNA參與蛋白編碼，之前多數文章針對mRNA甲基化進行研究（詳細見云序課堂之前往期回顧）。然而許多研究表明發生m6A甲基化的非編碼RN
m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
RNA甲基化是目前申請國自然項目熱點，也是唯一能在短短3個月內發數十篇nature，cell級別高分文章領域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究熱潮。因mRNA參與蛋白編碼，之前多數文章針對mRNA甲基化進行研究（詳細見云序課堂之前往期回顧）。然而許多研究表明發生m6A甲基化的非編碼RNA在
5篇m6A甲基化文章教你如何使用純測序數據得高分
文章導讀 2019年m6A修飾曾創下單月發表100+篇10分影響因子文章佳話。2020年1月17日何川教授團隊最新Science揭示了m6A新功能---調控染色質狀態和轉錄預示m6A等RNA修飾將仍然是目前最為熱門的科研方向。 云序生物是國內最早提供m6A測序的科研平臺，也是客戶發表
睪丸間質細胞（LCs）m6A修飾提供新治療靶點在不育癥...3
總結：?細胞的生長與分化依賴于基因的調控表達方式，越來越多的研究表明m6A 甲基化在更多領域發揮著關鍵作用，而本文作者正是利用多組學MeRIP,?RIP,?CoIP,?CHIP（云序生物提供此服務）等多種技術聯合分析，揭示了m6A修飾通過影響Camkk2轉錄的穩定性和Ppm1a的翻譯效率調節LC
“一箭三雕”液態活檢技術用于前列腺癌的精準醫療
前列腺癌是老年男性最常見的惡性腫瘤，其發病率在西方一些國家僅次于肺癌，占男性惡性腫瘤的第二位。然而，前列腺癌的篩查方法一直十分有限，并且與檢測結果存在很大程度的不一致性。隨著越來越多的生物標志物被逐漸驗證，以及高通量測序技術的普及應用，像液體活檢之類的新型技術正逐漸應用于指導醫生的治療方案中。
為什么熒光素酶互補實驗結果陰性也有
三大類的非編碼RNA（ncRNA），miRNA/lncRNA/circRNA仍然是醫學基礎研究領域最為火熱的研究熱點，大部分的研究人員在立項之初，通過查閱文獻或二代測序+生物信息學分析，獲得了合適的研究對象，但在實驗推進的過程中卻遇到了重重困難。主要有以下幾個原因：1. 找錯了轉錄本；2. ncRN
《Cell》發現“一箭雙雕”的新型抗體
來自杜克大學的研究人員在小鼠研究中發現了一種可同時阻斷疼痛和瘙癢感覺的抗體。這種新型抗體是通過靶向神經元細胞膜中的電壓門控鈉離子通道（voltage-sensitive sodium channel）來發揮作用。新型抗體研究結果在線發表在5月22日的《細胞》（Cell）雜志上。 電壓門控鈉離子
轉錄組測序原理
而轉錄組測序即是利用高通量測序技術，將細胞或組織中的全部或部分mRNA, miRNA, lnc RNA 進行測序分析的技術。通過RNA-seq，也就是轉錄組測序，可以幫助我們了解各種比較條件下所有基因的表達差異包括：正常組織與腫瘤組織；藥物治療前后的表達差異；發育過程中，不同發育階段，不同組織的表達
轉錄組測序與轉錄表達譜測序的異同
轉錄組測序可以得到特定條件下所有mRNA轉錄本的豐度信息，從而發現新的轉錄本和可變剪接體基因表達譜(gene expression profile)：指通過構建處于某一特定狀態下的細胞或組織的非偏性cDNA文庫,大規模cDNA測序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群體組成,從而描繪該特
影響因子高達7.8分的直腸癌轉移肝癌環狀RNA文章思路解析
在非編碼RNA的大家族中，環狀RNA是近年來繼microRNA和lncRNA之后又一個明星成員。因其3’-5’端成環，所以在生物體中具有穩定性高，不易被降解的特性。大部分環狀RNA通過直接或間接調控miRNA和靶基因參與海綿機制，現已有多篇文章報道該機制在疾病的發生發展過程中起至關重要的作用。另