DNA甲基化與擬南芥的免疫力
DNA甲基化有助于擬南芥的免疫力，它動態調控了某些基因的表達，讓植物能夠抵御細菌感染。近日，一篇在線發表于《PNAS》上的文章闡述了以上研究成果。 美國加州索爾克生物學研究所(Salk Institute for Biological Studies)的研究人員利用MethylC測序鑒定了暴露在致病或無害的丁香假單胞菌(Pseudomonas syringae)菌株下的擬南芥植物。他們還對經水楊酸處理的植物開展了全基因組范圍的單堿基甲基化圖譜分析。水楊酸是一種酚類激素，參與植物對病原體的抵御。 研究結果發現，在面對每種應激原時，植物基因組出現差異甲基化。例如，當植物被致病菌感染或用水楊酸處理時，研究小組在植物防御基因附近發現了差異甲基化的位點，往往低于平常的甲基化。水楊酸激素也會導致一些轉座子序列的甲基化改變。 過去的研究表明，擬南芥中的DNA甲基化有助于關鍵的發育和/或細胞類型特化過程，包括穩定的......閱讀全文
DNA甲基化與擬南芥的免疫力
DNA甲基化有助于擬南芥的免疫力，它動態調控了某些基因的表達，讓植物能夠抵御細菌感染。近日，一篇在線發表于《PNAS》上的文章闡述了以上研究成果。 美國加州索爾克生物學研究所(Salk Institute for Biological Studies)的研究人員利用MethylC測序鑒
“RNA－甲基化”研究匯總——擬南芥篇
關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature，Science，Cell等高分期刊上頻頻亮相，并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者，許多學者將它作為研究對象，并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合，證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育
PNAS熱點文章：表觀基因組可因環境而改變
長期以來，人們普遍認為作為有機體發育關鍵步驟的甲基化只是靜態地DNA修飾，不會隨環境條件變化而改變。Salk生物研究所的研究人員發現，處于逆境下植物的DNA甲基化模式會發生變化，從而改變對基因的調控。 科學家發現植物遭遇致病菌后，其表觀遺傳學密碼會發生廣泛的大量改
著名學者朱健康院士Cell－Research發表表觀遺傳學研究成果
生物通報道：轉座子通常是通過表觀遺傳學機制（包括DNA甲基化）保持沉默的。12月9日，在《Cell Research》雜志上發表的一項研究中，來自中科院上海生命科學研究院、美國普渡大學以及中科院遺傳與發育生物學研究所的研究人員，在擬南芥中將一對Harbinger轉座子衍生蛋白（HDPs）——HD
擬南芥RNA核糖甲基化修飾研究方面獲進展
3月30日，中國科學院生物物理研究所研究員葉克窮課題組、北京大學現代農學院博士王玉秋和中科院遺傳與發育研究所研究員李家洋課題組合作在Nucleic Acids Research上發表了題為Profiling of RNA ribose methylation in Arabidopsis tha
揭示DNA甲基化與基因沉默的關系
DNA 甲基化與真核基因和轉座子的轉錄抑制有關，但基因沉默的下游機制在很大程度上是未知的。 2021年6月3日，加州大學洛杉磯分校Steven E. Jacobsen團隊在Science 在線發表題為“MBD5 and MBD6 couple DNA methylation to gene s
云序生物最新“RNA－甲基化”研究匯總擬南芥篇
關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature，Science，Cell等高分期刊上頻頻亮相，并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者，許多學者將它作為研究對象，并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合，證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育期，
云序生物最新“RNA－甲基化”研究匯總擬南芥篇
關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature，Science，Cell等高分期刊上頻頻亮相，并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者，許多學者將它作為研究對象，并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合，證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育期，
上海生科院揭示擬南芥DNA主動去甲基化調控新機制
12月9日，《細胞研究》（Cell Research）雜志在線發表了中國科學院上海生命科學研究院上海植物逆境生物學研究中心朱健康研究組題為A pair of transposon-derived proteins function in a histone acetyltransferase c
研究發現去甲基化酶REF6是基因組中靶向的重要因素
核小體是真核生物染色質的基本單位，由DNA纏繞組蛋白八聚體構成。組蛋白翻譯后共價修飾是表觀遺傳調控的重要方式之一，通過影響染色質的狀態而調控基因表達等過程。組蛋白H3第27位賴氨酸的三甲基化修飾(H3K27me3)通過維持基因的沉默狀態，在動植物細胞命運決定以及生長發育中發揮重要的調控作用。基因
朱健康院士PNAS發布表觀遺傳新成果
來自中國科學院上海植物逆境生物學研究中心、美國普渡大學的研究人員證實，在擬南芥雜交種中甲基化互作需要RNA介導的DNA甲基化（RdDM），并受到遺傳變異的影響。 中國科學院上海植物逆境生物學研究中心主任朱健康（Jian-Kang Zhu）是這篇論文的通訊作者。朱教授是植物抗逆生物學領域世界級領
擬南芥轉化
實驗概要本實驗以擬南芥為試材介紹了轉化及篩選的過程。主要試劑1. 滲透培養基:(1L)1/2xMurashige-Skoog5%蔗糖0. 5克MES用KOH調至pH5. 7再加:10微升lmg/ml的6-BA母液200微升Silwet L-77Top agar0. 1%瓊脂PNS或水溶液2. 篩選培
揭示富含GC區域的一類非CG甲基化
DNA胞嘧啶甲基化是一個重要的DNA修飾，植物中DNA甲基化可調節基因和轉座子的表達。通常甲基化水平與基因表達負相關，在植物中的DNA甲基化發生在CG、CHG和CHH區域。然而，在非CG區域的DNA甲基化不僅在植物中廣泛存在，并且在哺乳動物組織中也大量存在，如大腦和多能細胞等。 結構和功能不同
RNAi產生的基因沉默與生物學功能
RNAi所產生的基因沉默具有如下特點：1)高效性。 Elbashir等在研究中發現分別為25 nmol/L與100 nmol/L的起始雙鏈RNA產生的結果是一樣的，只是高濃度起始的更有效些。將雙鏈RNA濃度降低到1.5 nmol/L時產生的基因沉默效果變化不大，只有當濃度降低到0.05 nm
研究揭示擬南芥組蛋白去甲基化酶JMJ13的結構功能
3月21日，《自然-通訊》（Nature Communications）雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所上海植物逆境生物學研究中心杜嘉木研究組、中科院遺傳與發育生物學研究所曹曉風研究組和河北師范大學孫大業研究組合作完成的題為The Arabidopsis H3
頂級實驗室《Nature》發布表觀基因組學圖譜
基因組中表觀遺傳變化是能遺傳的，近期來自Salk生物學研究所等處的一組研究人員完成了一項野生植物表觀基因組學全范圍內的研究分析，從中發現了這種修飾與遺傳信息相互作用的共同模式。這一成果公布在3月7日Nature雜志在線版上。 文章通訊作者是Salk研究所的著名教授Joseph R. E
Cell－Research：一類全新植物異染色質蛋白
研究人員發現一類植物特有的新型組蛋白甲基化閱讀器ADCP1，并確定其為動物HP1（Heterochromatin Protein 1，異染色質蛋白1）功能同源蛋白，揭示出其在植物異染色質維持和轉座子元件沉默中的作用，彰顯了不同生命界中表觀機制的復雜性和保守性。 2018年11月13日，清華-北
朱健康院士PLOS發表植物學新研究
2015年1月8日，中科院上海生命科學研究院朱健康課題組，在國際著名學術期刊《PLOS Genetics》發表一項最新研究成果，題為“An AP Endonuclease Functions in Active DNA Dimethylation and Gene Imprinting in A
植物所在植物轉座子進化方面取得進展
轉座子（Transposable elements，TEs）是較多生物基因組中主要的組成部分（在玉米中可達到80%以上）。與單堿基變異相比，轉座子序列長、突變速率快，可更快速地產生大效應的突變。轉座子能夠通過多種機制影響基因的功能和生物的表型。盡管已有較多關于轉座子的研究，但尚不清楚轉座子對生物
擬南芥的轉化
實驗概要本實驗采用花浸泡法利用農桿菌介導將目的基因轉入擬南芥。主要試劑YEB液體培養基，LB培養基，0.1 M CaCl2，0.05 M MgSO4，花浸泡緩沖液(0.5XMS，5%蔗糖，0. 03%Silwet L-77 )，Rif，Kan主要設備搖床，離心機，培養缽，溫室，托盤，塑料薄膜實驗材料
擬南芥的培養
實驗概要本實驗方法就擬南芥的培養技術進行了簡單介紹。主要試劑1. PNS營養液:每升含2.5m1 1M磷酸緩沖液(pH5.5)5ml 1M KN03，2m1 1M MgSO4.7H20，2m1 1M Ca(N03)a.4H20，2.5m1 20mM? Fe.EDTA，1 ml MS微量兀素。2. 人
朱健康院士Cell－Research發布表觀遺傳新發現
來自中國科學院上海植物逆境生物學研究中心、美國普渡大學的研究人員，在擬南芥中揭示出了Dicer非依賴性的RNA介導的DNA甲基化機制（RdDM）。這一重要的研究發現發布在12月8日的《細胞研究》（Cell Research）雜志上。 中國科學院上海植物逆境生物學研究中心主任朱健康（Jian-K
轉座子及轉座子標簽法克隆基因的改進
1 轉座子及轉座子標簽法克隆基因基因標簽法克隆植物組織中的基因是較為常用的一種方法，T-DNA和轉座子均可作為基因標簽。轉座子最早由美國的細胞遺傳學家Mc-clintock在玉米中發現，它是指基因組中一段特定DNA片段，能在轉位酶的作用下從基因組的一個位點轉移到另一個位點。轉座子不僅能在本基因組中轉
研究首次揭示DNA主動去甲基化可靶向病毒基因
βC1在體外和體內增強DME活性。中國農科院植保所供圖 近日，中國農業科學院植物保護研究所作物病原生物功能基因組研究創新團隊聯合清華大學生命科學學院，首次發現植物病毒可以利用植物的DNA主動去甲基化機制來逃逸植物的防御反應，相關研究結果在線發表于《自然—通訊》（Nature Communicati
上海生科院發現植物去甲基化調控的新機制
2月12日，國際權威學術期刊《分子細胞》（Molecular Cell）在線發表了中國科學院上海生命科學研究院上海植物逆境生物學研究中心朱健康課題組的研究論文The Methyl-CpG-Binding Protein MBD7 Facilitates Active DNA Demethylat
上海生科院揭示等位遺傳調控機制
5月14日，國際學術期刊Cell Reports在線發表了中國科學院上海生命科學研究院植物逆境生物學研究中心朱健康研究組題為Involvement of multiple gene silencing pathways in a paramutation-like phenomenon in A
RNA干擾RNAi的生物特性
RNAi抑制轉座子活性兩方面的證據提示轉座子活性的抑制與siRNA有關① 發現蠕蟲mut-7 基因參與RNAi 并且與轉座子的轉座抑制有關；② 在果蠅中，參與RNAi 的RNA 解螺旋酶Spindle-E 的突變將導致該基因引起的基因沉默的缺失，同時提高了反轉錄轉座子活性。RNAi抵御病毒感染在擬南
RNAi的生物特性
RNAi抑制轉座子活性兩方面的證據提示轉座子活性的抑制與siRNA有關① 發現蠕蟲mut-7 基因參與RNAi 并且與轉座子的轉座抑制有關；② 在果蠅中，參與RNAi 的RNA 解螺旋酶Spindle-E 的突變將導致該基因引起的基因沉默的缺失，同時提高了反轉錄轉座子活性。RNAi抵御病毒感染在擬南
RNAi的生物特性介紹
1、RNAi抑制轉座子活性兩方面的證據提示轉座子活性的抑制與siRNA有關 ① 發現蠕蟲mut-7 基因參與RNAi 并且與轉座子的轉座抑制有關； ② 在果蠅中，參與RNAi 的RNA 解螺旋酶Spindle-E 的突變將導致該基因引起的基因沉默的缺失，同時提高了反轉錄轉座子活性。 2、R
RNAi的生物特性
RNAi抑制轉座子活性兩方面的證據提示轉座子活性的抑制與siRNA有關① 發現蠕蟲mut-7 基因參與RNAi 并且與轉座子的轉座抑制有關；② 在果蠅中，參與RNAi 的RNA 解螺旋酶Spindle-E 的突變將導致該基因引起的基因沉默的缺失，同時提高了反轉錄轉座子活性。RNAi抵御病毒感染在擬南