生物大分子國家重點實驗室召開PI學術講座
為增進學術交流,12月23日下午,杭海英研究員在9501會議室作了題為“Why study in vitro evolution”的學術報告。報告由王江云研究員主持,孫命、張凱、朱平、梁偉、畢利軍、劉迎芳、劉平生、苗龍、江濤、柯莎等參加了這次學術報告。 在報告中,杭海英研究員介紹了他回國后從事的(1)DNA修復與腫瘤發生和(2)蛋白質人工進化兩方面的研究。首先,杭海英研究員向大家描述了9-1-1復合體與細胞周期監控點和DNA損傷修復的關系,介紹了他的實驗室在9-1-1復合體功能的核心問題與腫瘤發生方面取得的研究成果;隨后,又重點闡述了他的實驗室在人工進化方面的研究思路和進展。人工進化是新興的合成生物學的一個重要研究領域,可以采用體外高速人工進化的方法生成新的有治療作用或其他應用價值的新型蛋白質,這些新型蛋白質也可以是新的人工合成生命系統的元件。通過對人工進化的研究,其實驗室已成功建成了細菌原生質體和人細胞兩個高速蛋......閱讀全文
蛋白質進化的相關介紹
可以用免疫學方法測定各種生物的蛋白質的親緣關系,例如用人的清蛋白注射家兔,從家兔取得抗血清,把抗血清分別和人、大猩猩、黑猩猩等的清蛋白進行沉淀反應測定,可以看到愈是親緣關系相近的清蛋白沉淀反應愈強。同工酶的電泳測定是70年代發展起來的可以用來比較生物蛋白質的親緣關系的方法。同工酶是功能相同而一級結構
最新模型定義蛇毒進化-劇毒蛋白質進化于無毒基因
據科學日報報道,目前描繪蛇或者蜥蜴嘴巴內部主要基因的科技改變了科學家們將動物定義為有毒的方式。如果口腔腺體能夠表達與“毒素”相關的20個基因家族中的一些基因,那么這個物種就被定義為有毒。然而,美國德克薩斯大學阿靈頓分校的一項最新研究挑戰了這一定義,這些研究還建立了一個描述蛇毒是如何產生的新模型。
研究顯示蛋白質進化難以逆轉
新華網倫敦9月24日電(記者黃堃)生物進化是否可逆一直是人們感興趣的問題。最新一期英國《自然》雜志刊登的研究報告說,分子水平的實驗顯示,蛋白質一旦向前進化,便難以原路返回過去的狀態。 美國俄勒岡大學等機構的研究人員發表報告說,他們研究了一種被稱為“糖皮質激素受體”的蛋白質進化路線。它存在于
加速蛋白質進化的新技術
所有的生物都需要蛋白質,蛋白質這個巨大的分子家族,是大自然根據基因中的藍圖定制而來的。 通過自然的進化過程,DNA突變會產生新的或更有效的蛋白質。人類已經發現了這些分子有那么多的替代用途——作為食品、工業酶、抗癌藥物,因此,科學家們渴望更好地了解如何設計用于特定用途的蛋白質變體。 現在,斯坦
關于抗凍蛋白質的進化介紹
APF顯著的多樣性和分布提示進化成不同類型是相應1-2百萬年前在北半球發生和1千萬-3千萬年前在南極發生的海平面冰川作用的結果。這種獨立發展的相似的適應化叫做趨同演化(進化)。為什么許多類型的AFP盡管它們具有多樣性,但是卻能執行相同的功能。這有兩個原因: 1、盡管冰是統一由氧和氫構成的,它有
《科學》論文:探尋人類DNA進化“密碼”
在現代科學蓬勃發展的今天,很多自然界的現象,都能夠從這套科學體系中找到答案。 但是,這還遠遠不夠。因為人類對于這個世界的了解,還存在很多未知空白,人類本身就是最大的一個謎。人類從哪里起源,未來怎樣發展,至今無人能解。 為了探尋這一答案,科學家們前仆后繼,渴望從經過翻天覆地變化的地球上,探尋
后代變“祖先”?人工選擇成進化研究“干擾項”
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502791.shtm作為我國特有的優良地方蜜蜂資源,東北黑蜂已經在黑龍江省生存了上百年。為了對東北黑蜂的特性加以更好地利用,揚州大學動物科學與技術學院教授吉挺團隊進行了多年深入研究。然而他們意外地發現,此
人工進化蛋白因子加速體細胞重編程取得進展
近日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員Ralf Jauch課題組建立了一種人工進化重編程轉錄因子的篩選平臺,以促進誘導多能干細胞的生成。 體細胞重編程技術可為再生醫學提供充足細胞來源,在研究與醫療領域有廣闊應用前景,但重編程的誘導效率有待進一步提高。Ralf Jauch 課題組將
蛋白質印跡技術30年“進化”史
在發明蛋白質印跡法(Western Blot)出現了30多年之后,這項技術仍然是獲取特定蛋白可靠鑒定的關鍵。許多近期涌現的產品利用各種方法來提高蛋白質印跡實驗的可重復性、敏感性、定量性以及速度。 有三個人都被認為發展了蛋白質的免疫印跡方法,但其中只有一人才算得上是“Western
人工智能再進化-一日“通殺”3種棋
英國“深度思維”公司最新發布的論文說,該公司一種通用棋類人工智能“阿爾法零”能從零基礎開始強化學習,24小時之內擊敗了此前最強的國際象棋、日本將棋和圍棋人工智能程序,由此前專攻一項技能走向多種技能“通殺”。 “深度思維”公司在最新論文中透露,“阿爾法零”從零開始,通過自我對弈強化學習,約2小時
人工定向進化:讓葫蘆科作物長得更緊湊
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/12/491012.shtm ? ?中國農科院供圖 一個物種的種質資源群體內,變異缺乏,同質化嚴重,是目前主要農作物都面臨的遺傳基礎狹窄的問題。遺傳基礎狹窄是農作物改良難以取得突破性進展
人工定向進化:讓葫蘆科作物長得更緊湊
一個物種的種質資源群體內,變異缺乏,同質化嚴重,是目前主要農作物都面臨的遺傳基礎狹窄的問題。遺傳基礎狹窄是農作物改良難以取得突破性進展的全球問題。 近期,來自中國農業科學院蔬菜花卉研究所(以下簡稱蔬菜所)、深圳農業基因組所、西北農林科技大學、北京市農林科學院蔬菜研究所等4家合作單位的研究團隊,
糞便DNA證實大熊貓仍具進化潛力
傳統觀點認為大熊貓已走到進化盡頭——— 大熊貓作為地球千萬年變遷的見證者,伴隨著人類走到現今,曾經和它同時代的劍齒象、巨貘等動物早已滅絕消失,人們普遍認為,像大熊貓這樣古老而進食單一的物種能撐到今天似乎是一個不小的奇跡。然而,中國科學院動物研究所魏輔文研究員領導的研究小組采用的最新的研究方法發現
結合DNA的蛋白質
結構蛋白可與DNA結合,是非專一性DNA-蛋白質交互作用的常見例子。染色體中的結構蛋白與DNA組合成復合物,使DNA組織成緊密結實的染色質構造。對真核生物來說,染色質是由脫DNA與一種稱為組織蛋白的小型堿性蛋白質所組合而成;而原核生物體內的此種結構,則摻雜了多種類型的蛋白質。DNA可在組織蛋白的表面
人工合成XNA可實現DNA功能
對許多人來說,簡稱DNA的脫氧核糖核酸并不陌生,它是攜帶生命遺傳密碼的重要載體。但如今,即便如此重要的載體也能被人工合成的物質替代了。 英國醫學研究委員會分子生物學實驗室等機構的研究人員在最新一期美國《科學》雜志上發表報告說,他們人工合成了一種名為XNA的物質,在許多關鍵功能上可替代
從預測進化-AI能“構想”新蛋白質結構
半個世紀以來,科學家一直在尋找解決“蛋白質折疊問題”的方法。這是生物學領域的一項重大挑戰,難倒了幾代科學家。但現在,人工智能(AI)解決了這一問題。據《自然》雜志1日發表的論文,包括美國華盛頓大學、倫斯勒理工學院和哈佛大學的研究人員在內的研究小組描述了一種升級的阿爾法折疊系統,該系統由深度思維(
人類DNA僅8.2%有用-其余是進化殘余物
人類DNA僅8.2%有用 其余是進化殘余物 8月1日消息,根據美國媒體報道,牛津大學的研究人員指出,人類DNA中僅僅有8.2%是“起作用的”的! 倫特還說:“我們發現,8.2%的人類基因是有用的。我們無法知道其中每一個有用基因在基因組中的位置,但我們基本沒有采用假設的方法。例如,我們的研究并不依
生物大分子國家重點實驗室召開PI學術講座
為增進學術交流,12月23日下午,杭海英研究員在9501會議室作了題為“Why study in vitro evolution”的學術報告。報告由王江云研究員主持,孫命、張凱、朱平、梁偉、畢利軍、劉迎芳、劉平生、苗龍、江濤、柯莎等參加了這次學術報告。 在報告中,杭海英研究員介紹了他回
日本合成可“剪斷”病毒DNA的人工酶
日本研究人員成功利用人工酶作為“剪刀”,切斷了引發宮頸癌的人乳頭瘤病毒的DNA,從而遏制了其增殖。這一技術有望應用于治療由DNA病毒引起的疾病。 宮頸癌是女性最常見的惡性腫瘤,人乳頭瘤病毒是引發宮頸癌的主要原因。人乳頭瘤病毒是一種球形DNA病毒,所謂DNA病毒是核酸為單鏈或雙鏈DNA的一種
人工搭建DNA-傳統生命倫理將面臨沖擊
7月7日,日本富山大學的化學家經過數年的努力,合成出一個近乎完全人造的DNA分子,其聲稱該成果意義重大而多元,將為基因療法、納米級計算機及此類高技術產業帶來突破性進展。 在所有生命形式的遺傳藍圖上,DNA皆是由腺嘌呤(A)、鳥嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)這四種核苷酸搭建而成,其對蛋白質
廣州生物院人工進化蛋白因子加速體細胞重編程取得進展
近日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員Ralf Jauch課題組建立了一種人工進化重編程轉錄因子的篩選平臺,以促進誘導多能干細胞的生成。 體細胞重編程技術可為再生醫學提供充足細胞來源,在研究與醫療領域有廣闊應用前景,但重編程的誘導效率有待進一步提高。Ralf Jauch 課題組將蛋白質
科學家合成人工細胞-可自我進化成生命形態
據國外媒體報道,美國哈佛大學醫學院的科學家日前稱,他們最近正在實驗室人工構造一種單細胞模型,這種模型能夠自我復制和進化,已經具備了“生命”的基本特征。這表明科學家們已經可以將沒有生命的物質合成為新的生命形態。 在實驗室人工構造的單細胞模型 人工合成生命即將誕生 在意大利佛羅倫薩舉行的第15
進化新方式?線粒體DNA會插入我們的基因組
劍橋大學和倫敦瑪麗女王大學的研究人員表明,線粒體DNA也會出現在一些癌癥DNA中,這表明它就像一塊創可貼,試圖修復我們遺傳密碼的損傷。這項研究成果于10月5日發表在《Nature》雜志上。 線粒體是細胞內的微小細胞器,它們像電池一樣,以ATP分子的形式為細胞提供能量。每個線粒體都有自己的DNA
分子定向進化的概念
中文名稱分子定向進化英文名稱directed molecular evolution定 義模仿自然進化過程的人工進化策略。不需要事先了解蛋白質的結構和作用機制,去獲得期望功能或全新功能的蛋白質或DNA。如從一個靶基因或一群相關家族基因或DNA開始,用突變或重組等手段去創建分子的多樣性,然后對這多樣
DNA的主要功能結合DNA的蛋白質
結構蛋白可與DNA結合,是非專一性DNA-蛋白質交互作用的常見例子。染色體中的結構蛋白與DNA組合成復合物,使DNA組織成緊密結實的染色質構造。對真核生物來說,染色質是由脫DNA與一種稱為組織蛋白的小型堿性蛋白質所組合而成;而原核生物體內的此種結構,則摻雜了多種類型的蛋白質。DNA可在組織蛋白的表面
蛋白質復性人工分子伴侶的介紹
受蛋白質分子伴侶輔助蛋白質復性的啟發,Rozema和Gellman對人工分子伴侶體系(去污劑+環糊精)輔助碳酸酐酶和雞蛋白溶菌酶復性進行了研究[17、18]。與分子伴侶GroEL+ATP輔助復性的作用機制相似,其復性過程分為兩步進行:第一步捕獲階段,在變性蛋白質溶液中加入去污劑,去污劑分子通過疏
神經科學會成為人工智能“超進化”的關鍵嗎
人工智能會取代人類嗎?這個問題一度引發全民熱議。雖然目前人工智能正在快速提“智”,但是這不代表它真的很聰明。相反,很多時候它還很傻很天真,仍然需要向人腦學習。 近日,以色列魏茨曼科學研究學院計算機科學系教授希蒙·厄爾曼發文表示,相信神經科學能為人工智能發展提供進一步的助力。那么,人工智能和神經
不用遺傳基因-科學家首次創造出人工“化學進化”
英國格拉斯哥大學的科研團隊在不使用DNA的情況下首次創造出可進化的化學系統,向創造人造生命的可能邁進了一大步。相關論文發表在本周一的《自然·通訊》上。 據物理學家組織網12月9日報道,研究人員使用一個以3D打印機為基礎的特制開源機器人來制造油滴,并將油滴滴入裝滿水的培養皿中。每個油滴都由四
研究發現僅8.2%人類DNA“有用”:余為進化殘余物質
研究人員運用計算方法,比較了從老鼠、豚鼠、兔子到狗、馬和人類的各種哺乳動物的完整DNA序列。 研究報告資深作者之一、英國牛津大學韋爾科姆基金會人類遺傳學中心的格頓·倫特博士說:“這些擁有共同祖先的物種在進化過程中,DNA出現變異,而自然選擇抵制了這些變化,以確保有用的DNA序列完好無損。”
美制造出迄今最大人工蛋白質
據美國物理學家組織網11月15日報道,最近,美國范德堡大學通過改進目前的蛋白質設計軟件,設計并人工合成了迄今最大的蛋白質,打破了華盛頓大學2003年合成的最大蛋白質紀錄。研究人員指出,他們開發的新方法可以設計自然界沒有的而且更大的蛋白質,比如更有效的抗體和其他有益蛋白。 該蛋白質稱為