賽默飛IonS5首批數據公布，玩爆前任PGM?系列

　　北美時間9月1日，賽默飛發布了兩款最新的NGS系統Ion S5 和Ion S5XL，旨在提供更加簡捷的靶向測序流程。10月29日Ion S5測序儀的首批實驗數據產生于阜外醫院。阜外醫院研究人員選用了主動脈基因疾病組合測序，該基因組合包括15個與主動脈疾病相關的致病疾病，研究人員通過文庫構建——模板制備——上機測序三個大步驟最后得出了Ion S5的首批數據。

　　Ion S5以5“S”為主要特性：Simple-最簡捷的靶向測序流程，Scalability -靈活的通量選擇，Speed-最快的測序速度，Small Sample Input-微量樣本輸入，Streamlined Data Analysis-流暢的數據分析流程。那么Ion S5真實實驗數據如何，研究人員將此批數據與Ion Torrent PGM數據做了比對，結果如下表所示：

　　該表格最顯眼的就是測序時間、總數據量、平均深度以及總讀數。

　　（1） 測序時間

　　Ion S5的第三個“S”為 Speed—最快的測序速度，實驗數據顯示IonS5的測序時間為2.5小時，比Ion Torrent PGM系統所需時間明顯少2小時。

　　（2） 總數據量

　　與Ion Torrent PGM不同，IonS5總數據量以G為單位，總數據量為1.15G，為Ion Torrent PGM總數據量的1.4倍左右。

　　（3） 平均深度

　　測序的錯誤率和假陽性結果與測序深度息息相關，隨測序深度的提升而下降。IonS5系統平均深度為449，比Ion Torrent PGM高出128，由此可見IonS5系統測序錯誤率和假陽性結果均低于Ion Torrent PGM。

　　（4） 總讀數

　　由比對數據可知，IonS5系統總讀長為5995559個 Reads，比Ion Torrent PGM多出472592個Reads。

　　（5） 信號值、均一性、平均變異位點數目等

　　無論在信號值、均一性還是平均變異位點數目，IonS5系統均優于Ion Torrent PGM系統。

　　研究人員還對該系統文庫擴增效果進行了比對。本次試驗中研究人員采用Ion ChefTM 儀器進行自動化測序模板的制備，試劑采用Ion 520TM & 530TM Chef試劑盒，芯片類型是Ion 520（與318芯片通量一致），起始文庫使用量為60pM/25μL。經過與Ion Torrent PGM系統比對，研究人員發現Ion Chef在文庫制備操作上更簡單，針對長片段擴增效率更高。

　　最終，阜外醫院對IonS5系統的首批數據下了三個結論：

　　1. Ion Chef在文庫制備操作上更簡單，針對長片段擴增效率更高。

　　2. Ion S5測序速度和分析速度均比PGM快。

　　3. Ion S5數據的整體質量優于PGM。