西南高山亞高山區主要指位于四川西部、云南西北部和西藏東南部一帶的長江上游、瀾滄江等源頭的高海拔地區，一般在海拔2500-4500 m范圍分布有以亞高山針葉林為主的森林生態系統，其是相關規劃中青藏高原和黃土高原-川滇兩大生態屏障的重要組成部分，也是長江上游重要的生態屏障和國家實施“天然林保護工程”的重要地區。特殊的高寒生態環境，疊加人為干擾和全球氣候變化等因素的影響，使得大部分退化森林生態系統仍存在自然恢復困難、恢復進程緩慢和生態服務功能低下等問題，目前，學界尚不清楚高海拔森林生態系統退化的過程與驅動機制，高山亞高山退化森林生態恢復與資源利用技術和理念亟待進一步提升。
2017年，國家重點研發計劃重點專項“典型脆弱生態修復與保護研究”支持了“西南高山亞高山退化森林生態系統恢復重建技術研究”項目（2017YFC0505000）。該項目由中國科學院成都生物研究所牽頭，中國林業科學研究院、四川農業大學、四川省林業科學研究院、中科院成都山地災害與環境研究所、西南大學、電子科技大學和成都理工大學等單位參與。基于植被演替階段和主體生態功能提升的總體思路，項目團隊開展了長期的試驗示范研究，包括森林退化演替地下生態過程基礎理論研究和生態恢復、景觀塑造、苗木繁育、功能評價技術研發及集成等。在以下三個方面的研究中取得進展。
在地下生態基礎理論方面：研究發現，在增溫模擬氣候變暖條件下，亞高山針葉林的主要建群種粗枝云杉（Picea asperata）和林下優勢物種大熊貓的主食植物華西箭竹（Fargesia nitida）單種情況下根區土壤酶活性顯著增加，對土壤胞外酶起主導作用的土壤理化因子發生改變；森林演替后期針葉樹種粗枝云杉、闊葉樹種紅樺（Betula albo-sinensis）以及演替中期灌叢樹種高山柳（Salix oritrepha）不同植物根際土壤酶活性對無機肥和有機肥的響應不同，且物種間相互作用對土壤酶的影響及其對肥料的響應因物種而異；草地、灌叢和次生樺木林3種次生演替階段因前期采伐疊加后期干擾，較之原始針葉林，土壤容重顯著增加、孔隙度顯著降低、蓄水能力遭到了不同程度的破壞。上述研究成果為區域內森林生態系統對氣候變化的響應、植被更新與恢復機制以及生態功能評估與提升提供了重要科學依據。
在生態恢復促進技術方面：針對亞高山區廣泛分布的次生灌叢水源涵養功能低、修復技術缺乏等問題，通過灌木層與根際微生境調控，創建了退化次生灌叢快速成林的恢復技術體系，包括灌叢冠幅調控、地被物調控、建群樹種種子直播和栽植撫育技術等，使高山區建群樹種萌發率提高了10%-20%，定植成功率提高了10%以上，有效促進了建群樹種的更新、生長和恢復演替，可應用于天然林保護、經濟林栽培和景觀恢復工程。
在資源開發利用技術方面：改變以往觀賞植物評價片面采用觀賞價值或生態價值情況，全面考慮植物觀賞價值、生態適應性和開發價值，基于文獻分析、實地調查和模型構建多層次篩選了山光杜鵑（Rhododendron oreodoxa）、云南勾兒茶（Berchemia yunnanensis）、毛葉薔薇（Rosa mairei）等50種川西亞高山地區生態恢復與景觀塑造鄉土植物；通過外源激素、菌肥、凋落物等處理的探索，攻克特有樹種四川紅杉打破種子休眠、促進萌發和壯苗的快速繁育技術，促進先鋒樹種白樺（Betula platyphylla）成功定居。相關篩選與繁育成果為區域生態恢復和高海拔城鎮綠化等提供了多樣化材料。
成都生物所上述理論和技術新成果與項目其他團隊部分成果以“西南高山亞高山退化森林生態恢復”專題和封面論文形式，發表在《應用與環境生物學報》上。