董孟秋·科學：蛋白質組學新技術

來自美國斯克利普斯研究所（Scripps Research Institute）Salk生物研究院，加州大學圣地亞哥分校的研究人員利用一種蛋白定量分析新方法對長壽命線蟲進行了研究，發現了能延長和縮短壽命的蛋白。這對于進一步豐富蛋白定量研究方面來說意義重大。這一研究成果公布在《Science》雜志上。

文章的第一作者是來自斯克利普斯研究所的Andrew Dillin實驗室的董孟秋（Meng-Qiu Dong，音譯）。

原文檢索：
Science 3 August 2007:
Vol. 317. no. 5838, pp. 660 - 663 DOI: 10.1126/science.1139952
Quantitative Mass Spectrometry Identifies Insulin Signaling Targets in C. elegans
[Abstract]

僅僅知道蛋白質的身份并不足以對蛋白質給出最終定論，因為蛋白質的濃度對于實現其在細胞中的功能來說極其重要，一種特殊蛋白質在濃度上的變化就能預示細胞的突變過程。因此，科學家能夠對蛋白質的相對和絕對濃度進行測量，是很重要的事情。過去，科學家通常先進行二維(2D)凝較電泳，切斷條帶，再用質譜方法測量條帶中的蛋白質。可是，這種方法不是很理想：既不是非常敏感，也不是非常精確。

蛋白組學中的方法一直在不斷提高。基于高度敏感性和精確性的串聯質譜方法，不需要凝膠，就可以獲得相對和絕對定量的蛋白質結果。同位素標記相對和絕對定量（iTRAQ）和同位素親和標簽（iCAT）是這些新進展中的兩大主力，這些技術具有較好的定量效果、較高的重復性，并可對多達四種不同樣本同時進行定量分析。但是仍然存在不盡如人意的地方，需要不斷改進。

在這篇文章中，研究人員利用一種蛋白定量分析新方法對長壽命線蟲進行了研究，發現了能延長和縮短壽命的蛋白。這種新方法即質譜儀分析方法，他們利用質譜儀比較了帶有daf-2突變的線蟲和不帶突變的線蟲的蛋白質的量。識別出47個蛋白質在突變線蟲中更豐富，另有39個蛋白質在突變線蟲中的量不豐富。實驗顯示，有些蛋白質增加壽命、有些降低壽命。Stuart K. Kim在一篇相關的研究評述中寫道：研究人員將繼續改進這個方法，因為這個技術現在只能用來研究線蟲基因組中不到10%的蛋白質。

以前科學家也曾了解帶有daf-2基因突變的美麗線蟲比沒有突變的線蟲的壽命長一倍。daf-2降低一個名為“類胰島素信號發生”過程的活性，從而延長了壽命。