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    發布時間:2019-03-28 12:01 原文鏈接: 多元實時PCR實驗

    多元實時 PCR 時,在一個反應管中加入不同標記的成對引物,從而可以同時分析多個不同的基因。在許多反應中,用 JOE 標記看家基因對模板定量,用 FAM 標記目的基因,證明 LUX 引物非常有效。在標準的多元體系中,使用的引物濃度和加入的體積與進行一元反應時相同,如下。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。

    試劑、試劑盒

    PCR Super Mix-UDGROX 染料蒸餾水反向引物正向引物

    儀器、耗材

    ABIPrism7700型號系列檢測系統

    實驗步驟

    一、材料

    1. 緩沖液、溶液和試劑

    以50ul反應體系為例。

    Platinum Quantitative PCR Super Mix-UDG(Invitrogen11730-025)         25ul

    ROX染料(Invitrogen12223012)                                                        1ul

    滅菌的蒸餾水(Gibco15230-162)                                                      10ul

    10umol/L反向引物I                                                                              1ul

    10umol/L正向引物I                                                                              1ul

    10umol/L反向引物II                                                                             1ul

    10umol/L正向引物II                                                                             1ul

    小計                                                                                                    40ul

    溶于0.1XTE或無菌水的模板                                                                10ul

    總計                                                                                                     50ul

    2. 專門的儀器

    ABIPrism7700型號系列檢測系統。

    二、方法

    1.PCR循環時的溫度條件與方案2相同

    典型的多元擴增結果見圖15-3(見封二彩圖)。實驗以白介素-4 為目的基因,以肌動蛋白基因(看家基因)為參照基因。結果表明,當β-肌動蛋白基因為 106 拷貝數時,對白介素-4 的定量范困為 22~3X15 拷貝。對 PCR 條件沒有進一步優化,體系中試劑的濃度與一元擴增時的完全相同。以防實時 PCR 效率下降,可以按照下面步驟對 PCR 體系進行優化。

    2. 優化多元反應的條件

    a. 對于高風度基因(特別是看家基因)其引物濃度可以降低到其他基因引物濃度 1/4。

    b.MgCl2 濃度從 3 mmol/L 升到 6 mmol/L。

    c. 每種 dNTP 濃度提高到 400umol/L。

    d. 聚合酶的酶量加倍(反應體系中每 1ul 為 0.06U)。也可以使用 PlatinumTaqDNA 優質聚合酶(Invitrogen10966-018)。

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