最常見的體征有口角粘膜蒼白和浸軟（口角炎），以及唇表面呈朱砂色（唇干裂），繼而出現淺表的線狀裂紋，愈合時可留下傷疤.這些損傷部位受到白色念珠菌感染時，便產生灰白色高度增生性損害（念珠菌性口角炎）.舌面可呈品紅色.皮膚損害常見于鼻唇皺襞，鼻兩翼，耳部，眼瞼，陰囊及大陰唇處.這些部位變得發紅，呈鱗狀，而且油脂過多，此外，皮脂堆積在毛囊內，引起皮脂障礙癥或鯊魚皮.
難得有角膜新血管形成及上皮性角膜炎，引起流淚和畏光.營養性弱視用核黃素有效.
尿排出的每克肌酸酐內核黃素<30μg時可伴隨產生核黃素缺乏的臨床體征.由核黃素引起的紅細胞谷胱甘肽還原酶活性增強，是核黃素缺乏的早期體征.