一:儀器:同cDNA文庫構建技術-cDNA鏈的反轉合成
二:試劑:EcoRⅠ連接子試劑盒
三:操作:
1:cDNA加接頭反應
a:按下表準備反應體系
10×緩沖液T4DNA連接酶3μl
BSA 3μl
cDNA 2.5μl
連接子 1μl
T4DNA連接酶 1μl
加水至 30μl
b: 15℃保溫6-18小時
c:70℃加熱10分鐘后放置于冰浴
2:磷酸化反應
a:按下表準備反應體系
上述1.a反應物 30μl
T4磷酸激酶10×緩沖液 4μl
0.1mM ATP 2μl
T4激酶(10μ/μl) 1μl
水 3μl
總體積 40μl
b:37℃保溫30分鐘。用DNA純化柱純化帶接頭的cDNA
c: 用1ml Sephacryl S-400裝柱,TEN緩沖液平衡拄,平衡液流干后,加套管,800g5min
d: 上樣,用1mlTEN緩沖液洗柱2次,收集洗脫液。洗脫時加套管,800g5min
e:合并洗脫液.
D:3M NaAC和無水乙醇沉淀,干燥復溶
3:cDNA與載體聯接:
a:準備4個離心管,按下表加入
A B C D
載體DNA0.5ug/ul) 2
cDNA(10ng/ul) 0 32 1
10×T4DNA連接酶緩沖液 1
水 6 3 4 5
T4DNA連接酶 1
b:保溫,室溫:3小時;4℃過夜
4:體外包裝:
a:從-70℃取出包裝蛋白,冰浴中溶化,每管50ul
b:包裝蛋白混合液完全溶化后,立即加入10ul“3.a”中的連接液,輕彈管壁,輕輕混勻。
c:22℃(室溫)放置3小時
d:上述包裝混合液中加入445ul的phage緩沖液和25ul氯仿,輕輕混勻,冰浴保存。(包裝液4℃下可存放7天)
5:感染
a:滅菌培養皿中倒入下層LB培養基,凝固后,37℃保溫
b;安1:1000的比例稀釋“4”中的包裝混合液。
c:取100ul稀釋液和100ul菌株(Y1090、LE392)
d:取4ml熔化45℃保溫的上層培養基加入到“c”中的混合液中,混勻后鋪板在37℃預熱的下層培養基上,37℃過夜。
6:收集和擴增文庫
構建的cDNA文庫經擴增后,才能保存和進行長期篩選。本文庫由λgt11作為載體而構成,因此擴增時應在大腸桿菌Y1090中進行。
a:在過夜后的培養皿上挑取出現的噬菌斑,加2-3mlSM緩沖液,室溫震蕩2小時。4℃7000g離心30min,以除去細胞碎片,分裝上清,溶解噬菌斑,4℃8000-10000g快速離心10min,以除去細胞碎片和培養基成分。
b:重復上步操作
c:上清液轉入一新管 中,如要在4℃短期保存則按1ml上清中加入20-30μl的比例加入氯仿,4℃保存;如要長期保存則應加入終濃度為7%的二甲基亞砜,于-70℃保存。以被需要時重新涂板篩選文庫。。
總結:C文庫構建的簡單流程為:
RNA-mRNA-cDNA單一鏈的合成-cDNA單二鏈的合成-加接頭-與載體連接-體外包裝-轉染-篩選文庫(見總RNA的提取(試劑盒法、氯化鋰法和蛋白酶-熱酚法)、mRNA的提取及純化(磁珠法和親和柱層析法)、cDNA文庫構建技術-cDNA鏈的反轉合成)