細胞化學基礎??親水性原理
容易與水成氫鍵而結合的性質稱親水性。許多親水性基團,如羥基、羧基、氨基、磺酸基等都易與氫鍵結合,因而是親水性的。親水性在材料表面為水分所潤濕的性質。是一種界面現象,潤濕過程的實質是物質界面發生性質和能量的變化。當水分子之間的內聚力小于水分子與固體材料分子間的相互吸引力時,材料被水潤濕,此種材料為親水性的,稱為親水性材料;而水分子之間的內聚力大于水分子與材料分子間的吸引力時,則材料表面不能被水所潤濕,此種材料是疏水性的(或稱憎水性),稱為疏水性材料。親水性原理圖示水分子與不同固體材料表面之間的相互作用情況是各不相同的。在水(液相)、材料(固相)與空氣(氣相)三相的交點處,沿水滴表面的切線與水和材料接觸面所形成的夾角θ稱為接觸角(見圖),θ角在0°~180°之間,由θ角的大小可估計潤濕程度。θ角越小,潤濕性越好。如θ=0°,材料完全潤濕;θ<90°(如玻璃、混凝土及許多礦物表面),則為親水性的;θ>90°(如水滴在石蠟、......閱讀全文
細胞化學基礎β折疊鏈
在β折疊中,兩條以上氨基酸鏈(肽鏈),或同一條肽鏈之間的不同部分形成平行或反平行排列,成為“股”。
細胞化學基礎葉綠體DNA
chloroplast DNA(cpDNA),存在于葉綠體內的DNA。高等植物葉綠體的DNA為雙鏈共價閉合環狀分子,其長度隨生物種類而不同,其大小在120kb到217kb之間,相當于噬菌體基因組的大小,例如,T4噬菌體的基因組約165kb。葉綠體DNA不含5-甲基胞嘧啶,這是鑒定cpDNA及其純度的
細胞化學基礎線粒體DNA
線粒體DNA是線粒體中的遺傳物質,線粒體能為細胞產生能量(ATP),是在細胞線粒體內發現的脫氧核糖核酸特殊形態。線粒體是為細胞提供能量(ATP)的細胞器。一個線粒體中一般有多個DNA分子。它們攜帶著自己的DNA——mtDNA,而這些基因的突變能引起線粒體疾病。雖然疾病癥狀是多變的,但大腦、肌肉和心臟
細胞化學基礎互補-DNA
中文名稱:互補 DNA英文名稱:complementary DNA;cDNA定 義:利用反轉錄酶以mRNA為模板合成的DNA。應用學科:細胞生物學(一級學科),細胞化學(二級學科)
細胞化學基礎β片層
中文名稱:β片層英文名稱:β sheet定 義:免疫球蛋白分子中常見的二級結構,可分為平行式和反平行式兩種類型,兩條或多條幾乎完全伸展的多肽鏈側聚集在一起,相鄰肽鏈間形成有規則的氫鍵。應用學科:免疫學(一級學科),免疫系統(二級學科),免疫分子(三級學科)
細胞化學基礎A-型-DNA
中文名稱:A 型 DNA英文名稱:A-form DNA定 義:一種右手雙螺旋構型的DNA。螺旋每一圈為11個核苷酸,核苷酸對的平面與雙螺旋軸傾斜20°角。應用學科:細胞生物學(一級學科),細胞化學(二級學科)
細胞化學基礎稀有堿基
又稱修飾堿基,這些堿基在核酸分子中含量比較少,但他們是天然存在不是人工合成的,是核酸轉錄之后經甲基化、乙酰化、氫化、氟化以及硫化而成。
細胞化學基礎千堿基
中文名稱:千堿基英文名稱:kilobase;kb定 義:描述多核苷酸鏈的長度單位,相當于單鏈核酸中1000個堿基。應用學科:生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
細胞化學基礎轉移RNA
轉移RNA(tRNA)在蛋白質合成過程中負責轉運氨基酸、解讀mRNA遺傳密碼。tRNA占細胞總RNA的10%~15%,絕大多數位于細胞質中。tRNA由Crick于1955年提出其存在,Zamecnik和 Hoagland于1957年鑒定。1.tRNA一級結構具有以下特點:①是一類單鏈小分子RNA,長
細胞化學基礎?色散力
色散力(dispersion force 也稱“倫敦力”)所有分子或原子間都存在。是分子的瞬時偶極間的作用力,即由于電子的運動,瞬間電子的位置對原子核是不對稱的,也就是說正電荷重心和負電荷重心發生瞬時的不重合,從而產生瞬時偶極。色散力和相互作用分子的變形性有關,變形性越大(一般分子量愈大,變形性愈大
細胞化學基礎腺嘌呤核苷三磷酸配位原理
(1)由于在咪唑環和苯環上存在N元素,還有苯環上的氨基上的N元素,他們都存在著孤對電子,在溶液中加入金屬離子,就有可能發生配位反應。(2)在酸性溶液中氫離子與金屬離子間存在競爭(金屬離子有可能被質子化)即氫離子濃度過大。(3)苯環,咪唑環以及氨基上的氮元素的配位能力不一樣,配位能力越強的越容易與金屬
極性基因的親水性原理
容易與水成氫鍵而結合的性質稱親水性。許多親水性基團,如羥基、羧基、氨基、磺酸基等都易與氫鍵結合,因而是親水性的。親水性在材料表面為水分所潤濕的性質。是一種界面現象,潤濕過程的實質是物質界面發生性質和能量的變化。當水分子之間的內聚力小于水分子與固體材料分子間的相互吸引力時,材料被水潤濕,此種材料為親水
細胞化學基礎黃嘌呤計算化學數據
1、 疏水參數計算參考值(XlogP):-0.72、?氫鍵供體數量:33、 氫鍵受體數量:34、 可旋轉化學鍵數量:05、?互變異構體數量:156、 拓撲分子極性表面積(TPSA):86.97、 重原子數量:118、 表面電荷:09、 復雜度:21710、?同位素原子數量:011、 確定原子立構中心
細胞化學基礎鳥嘌呤計算化學數據
1、疏水參數計算參考值(XlogP):無2、氫鍵供體數量:33、氫鍵受體數量:24、可旋轉化學鍵數量:05、互變異構體數量:266、拓撲分子極性表面積:96.27、重原子數量:118、表面電荷:09、復雜度:22510、同位素原子數量:011、確定原子立構中心數量:012、不確定原子立構中心數量:0
細胞化學基礎α螺旋的功能
α-螺旋在DNA結合基序(DNA binding motifs)中有非常重要的作用,比如在鋅指結構,亮氨酸拉鏈,螺旋-轉角-螺旋等基序中都含有α-螺旋。這是因為α-螺旋的直徑為1.2nm,正好和B-DNA大溝的直徑相等,所以能夠和B型DNA緊密結合。
細胞化學基礎核苷酸
核苷酸是一類由嘌呤堿或嘧啶堿、核糖或脫氧核糖以及磷酸三種物質組成的化合物,又稱核甙酸。戊糖與有機堿合成核苷,核苷與磷酸合成核苷酸,8種核苷酸組成核酸。核苷酸主要參與構成核酸,許多單核苷酸也具有多種重要的生物學功能,如與能量代謝有關的三磷酸腺苷(ATP)、脫氫輔酶等。
細胞化學基礎堿基對
堿基對是形成DNA、RNA單體以及編碼遺傳信息的化學結構。組成堿基對的堿基包括A、G、T、C、U。嚴格地說,堿基對是一對相互匹配的堿基(即A:T,G:C,A:U相互作用)被氫鍵連接起來。然而,它常被用來衡量DNA和RNA的長度(盡管RNA是單鏈)。它還與核苷酸互換使用,盡管后者是由一個五碳糖、磷酸和
細胞化學基礎βαβ結構域
中文名稱:β-α-β結構域英文名稱:β-α-β motif;betaalpha-beta motif定 義:蛋白質超二級結構之一,由β折疊-α螺旋-β折疊所構成的功能結構域。應用學科:細胞生物學(一級學科),細胞化學(二級學科)
細胞化學基礎?疏水鍵
疏水鍵是多肽鏈上的某些氨基酸的疏水基團或疏水側鏈(非極性側鏈),由于避開水而造成相互接近、粘附聚集在一起。它在維持蛋白質三級結構方面占有突出地位。
細胞化學基礎Z型DNA
Z-DNA又稱Z型DNA,是DNA雙螺旋結構的一種形式,具有左旋型態的雙股螺旋(與常見的B-DNA相反),并呈現鋸齒形狀。
細胞化學基礎疏水性分析
蛋白質肽鏈上各殘基側鏈對溶劑的相對親水性是一個重要的特征參量。超二級結構中各殘基對溶劑的相對親水性或疏水性的性質是超二級結構的一個重要結構特征。在天然狀態,構成蛋白質的疏水氨基酸殘基多數是處在分子的內部,形成疏水內核,從而維系蛋白質的緊密三維結構。對于超二級結構這一局域空間結構的疏水特性的形成,疏水
細胞化學基礎核糖核酸
核糖核酸(縮寫為RNA,即Ribonucleic Acid),存在于生物細胞以及部分病毒、類病毒中的遺傳信息載體。RNA由核糖核苷酸經磷酸二酯鍵縮合而成長鏈狀分子。一個核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和堿基構成。RNA的堿基主要有4種,即A(腺嘌呤)、G(鳥嘌呤)、C(胞嘧啶)、U(尿嘧啶),其中,U(尿
細胞化學基礎次黃嘌呤
本品水中溶解度為0.078/100m1(19℃)1.4g/100ml(100℃)。溶于稀酸和堿,如0.5mol/L硫酸或10mol/L氫氧化鈉中,100℃,1h后小于5%分解。在生物學上,次黃嘌呤用大寫字母“I”表示,可以由腺嘌呤脫去一個氨基得到(鳥嘌呤脫氨基成為黃嘌呤,胞嘧啶脫氨基成為尿嘧啶)。
細胞化學基礎β折疊鏈作用
能形成β折疊的氨基酸殘基一般不大,而且不帶同種電荷,這樣有利于多肽鏈的伸展,如甘氨酸、丙氨酸在β折疊中出現的幾率最高。免疫球蛋白有大量的β折疊層。另一種常見的蛋白質模序是α螺旋和三種不同的β轉角。不屬于一個模序的蛋白質一級結構部分被稱之為不規則螺旋。這些部分對蛋白質的空間構象非常重要。
細胞化學基礎?分子色散力
色散力(dispersion force 也稱“倫敦力”)所有分子或原子間都存在。是分子的瞬時偶極間的作用力,即由于電子的運動,瞬間電子的位置對原子核是不對稱的,也就是說正電荷重心和負電荷重心發生瞬時的不重合,從而產生瞬時偶極。色散力和相互作用分子的變形性有關,變形性越大(一般分子量愈大,變形性愈大
細胞化學基礎?分子誘導力
誘導力(induction force)在極性分子和非極性分子之間以及極性分子和極性分子之間都存在誘導力。由于極性分子偶極所產生的電場對非極性分子發生影響,使非極性分子電子云變形(即電子云被吸向極性分子偶極的正電的一極),結果使非極性分子的電子云與原子核發生相對位移,本來非極性分子中的正、負電荷重心
細胞化學基礎分配系數
分配系數是指在一定溫度下,達到分配平衡時某一物質在兩種互不相溶的溶劑中的活度(常近似為濃度)之比,為一常數。分配系數可用于表示該物質對兩種溶劑的親和性的差異。對分配系數的測定可提供該物質在環境行為方面許多重要的信息。常用的溶劑體系是由水和一種與水不互溶的有機溶劑組成,如正辛醇-水體系,所得的分配系數
細胞化學基礎腺苷一磷酸
腺苷一磷酸(Adenosine 3'-monophosphate,from Yeast,簡稱AMP)是一種有機化合物。化學式為C10H14N5O7P。外觀為白色針狀結晶或結晶性粉末 。是一種在核糖核酸(RNA)中發現的核苷酸。它是一種磷酸及核苷腺苷的酯,并由磷酸鹽官能團、戊糖核酸糖及堿基腺嘌
細胞化學基礎疏水性結合
在藥物分子中大都會有非極性部分,即只由碳氫原子組成的部分,在受體分子中含有非極性氨基酸殘基,如苯丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸,這些氨基酸殘基的側鏈在形成蛋白質的立體結構時,可能遇到一起形成活性部位的非極性區,稱為疏水袋(hy-drophobic pocket)。在體內,藥物的非極性部分和受體的非
細胞化學基礎β折疊鏈結構
肽平面之間呈手風琴狀折疊,股與股之間會通過氫鍵固定,但氫鍵主要在股間而不是股內。氨基酸殘基的R側鏈分布在片層的上下。β折疊層并不是平的,因為側鏈的存在使得它看上去像手風琴一樣波紋起伏。(英語pleated)這樣每一股會更緊密排列,氫鍵更容易建立。氫鍵的距離為7埃。在蛋白質結構中β折疊通常會用箭頭表示