首先一點，是“反相”色譜，不是“反向”色譜。
正相色譜和反相色譜是這么來的。一般情況下（歷史發展的原因），色譜法中固定相一般都是用極性較大物質，比如常用的硅膠柱，而流動相（洗脫劑、展開劑）一般用的是極性很小或者非極性的物質。因此固定相極性大，流動相極性小的色譜被稱作正相色譜。發展較早的色譜大多是遵循這個模式，比如薄層色譜（一般都是硅膠涂板，用石油醚等做展開劑），氣相色譜GC。
而后來隨著液相色譜特別是高效液相色譜HPLC的技術發展的實際需求，出于儀器制造以及應用于生物、有機分子的分析分離的具體實際情況，人們發現，固定相使用極性很小或者非極性的物質，而將流動相使用極性較大的物質，使用效果將會很好。和傳統的正相色譜正好相反，因此被命名為反相色譜，即固定相極性小，流動相極性大。現在科研和實際中大量使用的高效液相色譜HPLC絕大多數是反相色譜，用非極性柱或者小極性的柱子，而使用水，乙腈，甲醇，乙醇，丙酮等極性很大的物質來配制流動相。
非極性色譜這里的非極性指的是色譜柱材料是非極性。根據上面關于反相色譜的論述，你應該可以知道了，很多反相色譜的色譜柱用的是非極性物質，因此很多反相色譜其實也可以被叫做非極性色譜。只要使用的柱子是非極性的即可，常用的聚二甲基硅氧烷做填充柱固定相就是一個典型的非極性色譜。當然有非極性色譜，也有弱極性色譜，中等極性色譜，強極性色譜的命名。
注意，和上面一個概念的區別是，非極性色譜是另一種命名體系。這種命名關注的是固定相的極性大小。而正相色譜反相色譜關注的是固定相和流動相哪個極性更大，固定相極性大于流動相就可以稱作正相色譜，而固定相極性小于流動相就可以被叫做反相色譜。
液液色譜則是另一種命名，根據的是流動相和固定相的狀態。一般情況下，固定相都是固態，流動相為液態或者氣態。而液液色譜則固定相和流動相都為液態，這個某種意義上來說和萃取有點像（只是原理有點像）。當然這是針對特殊的工藝要求或者分離要求而發展的。液液色譜有幾個特殊的要求，第一是流動相和固定相一定要不互溶，不然分不開；第二是由于固定相是液體，因此還需要有載體（不然也流掉了怎么算固定相啊）。載體起到吸附固定相的作用。液液色譜的優勢是一般應用于實際的分離中，因為一般的色譜都是固定相是一定的然后調整流動相的極性（溶劑的配比）來取得較好的分離效果。但是很多實際條件下由于制得的樣品需要特殊的存在環境，因此成品往往直接作為流動相，流動相是不能變的，只能調整固定相的吸附能力來測試分離效果。所以液液色譜的優勢體現在這里，載體一般用的是多孔硅膠或者是均勻的硅膠藻土全多孔型載體，只要把需要的固定相涂在上面，就可以進行分析。如果極性不合適，也可以在換涂其他的固定相。
液液色譜的缺點是固定相是涂在載體上的，因此載體和固定相之間的相互作用就是吸附作用，流動相不可避免地會沖刷下一部分的固定相。為了彌補上述缺陷，70年代初發展了一種新型的固定相叫做化學鍵合固定相。這種固定相是通過化學反應把各種不同的有機基因鍵合，用化學鍵的作用來取代吸附作用。為了與傳統的液液色譜相區別，這種色譜被稱作化學鍵合相色譜（簡稱鍵合相色譜或者鍵合色譜）。現在鍵合相色譜在大多數時候已經取代了傳統的液液色譜。