構建硫氧還蛋白肽適配體組合庫實驗
實驗材料E.coli MC 1061 (Bio-Rad)硫氧還蛋白表達載體質粒DNA 洗脫液試劑、試劑盒DNA 聚合酶DNA 連接酶小牛腸堿性磷酸酶(CIP)限制性內切核酸酶反應緩沖液4dNTPTris·Cl培養基儀器、耗材QIAquick 膠回收試劑盒質粒制備試劑盒DNA 合成儀16℃ 和 95℃ 水浴PCR 純化柱電轉儀實驗步驟實驗所需「材料」、「試劑」、「耗材」具體見「其他」1. 用自動 DNA 合成儀合成如下的 91-堿基的隨機寡核苷酸和 17-堿基的引物。分別用水溶解使其終濃度為 1 ug/ul。寡核苷酸 : 5'-GACTGACTGGTCCG (NNK)20GGTCCTCAGTCAGTCA-3'。此處 N 代表 A,G,C 或 T; K 代表 G 或 C。引物:5'-CTGACTGACTGAGGACC-3'。2. 按順序加入下列試劑到一 1.5 ml 離心管中(終體積 890 ul):......閱讀全文
配體配體相互作用的功能
中文名稱配體-配體相互作用英文名稱ligand-ligand interaction定 義泛指不同配體之間的相互作用。如受體上有多個配體結合位點時,一個配體與受體的結合可能影響另一個配體與受體的結合。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),信號轉導(二級學科)
上海有機所在建立天然產物類似物庫方面取得進展
活性天然產物與其作用的大分子配基在長期共同進化的過程中保持了對于生命現象的精確控制,因而在藥物發現與發展(藥物化學)和生物有機化學基本規律(化學生物學)的研究方面扮演了十分重要的角色。構建既有數量又有質量的天然產物類似物庫是當前以多樣性為導向的化學合成(Diversity-Oriented
YAC實驗——YAC文庫構建
YAC帶有天然染色體所有的功能元件,包括一個著絲粒,一個DNA復制起點,兩個端粒。YAC能夠容納長達幾百kb的外源DNA,這是質粒和黏粒辦不到的。大片段的插入更有可能包含完整的基因,在染色體步移中每次允許更大的步移距離,同時能夠減少完整基因組文庫所需的克隆數目。實驗步驟1. ?盡管當插入片段大于10
科研人員構建出新型抗菌肽納米纖維
近日,東北農業大學團隊通過掃描陽離子氨基酸側鏈長度,首次成功構建了具備抗酶解、誘捕殺死及特異性靶向多功能化抗菌肽納米纖維,以對抗特定細菌感染。相關成果發表于Science Advances。 新型抗菌肽納米纖維示意圖。東北農業大學供圖 在畜牧業飼料端禁抗背景下,急需尋找緩解耐藥性細菌危機的潛
我國構建小鼠腸道微生物資源庫
1月7日,《自然-通訊》發表了中國科學家完成的小鼠腸道微生物資源庫工作。 腸道微生物是近年來生命科學和健康領域研究的前沿和熱點。越來越多的證據表明,腸道微生物與宿主健康和生長發育密切相關,在未來人體健康管理和醫療產業發展中,具有十分重要的作用。腸道微生物資源庫的建設,是開發利用腸道微生物的基礎
心理所構建偽裝表情數據庫并進行基準評價
面部表情是眉毛、眼睛和嘴角等區域的面部肌肉運動傳遞自身情緒感受的外在表達。除了常見的自然表情,人們還可以表現出偽裝的面部表情從而達到掩飾或抑制內心真實情緒狀態的目的。偽裝表情時有發生:比如家長面對著孩子潦草的作業心里很窩火,但為了不挫傷孩子的自信心,故作開心地繼續輔導;又比如一些窗口部門的工作人
基于ADS的射頻微波元器件模型庫構建(二)
3.3.1 線性模型提取對于線性模型,通常可以使用n端口散射矩陣(S參數)來進行描述。S參數使用入射電壓波和反射電壓波的方式定義網絡的輸入、輸出關系,從而表征整個網絡的特性。S參數采用Touchstone文件格式,也被稱作SnP文件。使用矢量網絡分析儀,可以直接生成SnP文件。大多數無源器件都可以使
綜合性的新生RNA數據庫構建成功
近日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員鮑習琛團隊成功構建了綜合性的新生RNA數據庫NaRaDa(http://www.narada.bio)。相關成果發表于《創新·生命》(The Innovation Life)。對基因組轉錄調控的動態解析是解讀細胞命運和疾病發生機制的關鍵。傳統RNA測序技
IEEE-Access:構建偽裝表情數據庫并進行基準評價
面部表情是眉毛、眼睛和嘴角等區域的面部肌肉運動傳遞自身情緒感受的外在表達。除了常見的自然表情,人們還可以表現出偽裝的面部表情從而達到掩飾或抑制內心真實情緒狀態的目的。 偽裝表情時有發生:比如家長面對著孩子潦草的作業心里很窩火,但為了不挫傷孩子的自信心,故作開心地繼續輔導;又比如一些窗口部門的工
基于ADS的射頻微波元器件模型庫構建(一)
仿真是早期驗證最重要、最直觀的手段,也是研發過程中發現問題和優化設計的重要途徑。本文針對不同類型器件,提出了基于原理圖模型、行為級模型以及測試模型,建立射頻微波模型庫。其中,使用基于測試結果的X參數能夠成功對放大模塊、檢波器、混頻器等非線性器件進行有效建模。統一的射頻元器件模型平臺將使現有的元器件參
PNAS描述新型基因表達調控系統
報道:科學家們開發了一個調控基因表達的新系統,該系統只需將特定DNA序列簡單插入到基因的任意一側,就可以實現劑量依賴性的基因表達抑制。這項成果發表在美國國家科學院院刊PNAS雜志上,文章認為這一系統有望替代Tet基因表達調控系統。 這是首次采用適體酶核糖開關有條件地knockdown病毒基
抗肽抗體的制備實驗
提高免疫原性肽的抗血清,是最簡單的方法,獲得非隔離的蛋白質的抗體,例如,對來自DNA序列信息的推定蛋白質序列。 這種方法也是有用的,當隔離的抗原是困難或費時,或當抗原是一個大的蛋白家族的成員。實驗步驟: ?將10 mg BSA溶于0.5 ml 0.1 mol/l pH6.8的磷酸鈉
核酸適配體篩選實驗的難點在哪里
首先它確實是比較難,但是SELEX實驗的難和其它實驗的難是不太一樣的。像做單分子成像,或者某些超靈敏的檢測類的實驗,很多時候受制于我們的客觀條件,受制我們所擁有的儀器設備。可是,核酸適配體的篩選與這些實驗不同,因為SELEX實驗它所用的儀器設備條件其實都非常簡單,幾乎所有的分子生物學實驗室都具備。那
核酸適配體篩選實驗的難點在哪里
首先它確實是比較難,但是SELEX實驗的難和其它實驗的難是不太一樣的。像做單分子成像,或者某些超靈敏的檢測類的實驗,很多時候受制于我們的客觀條件,受制我們所擁有的儀器設備。可是,核酸適配體的篩選與這些實驗不同,因為SELEX實驗它所用的儀器設備條件其實都非常簡單,幾乎所有的分子生物學實驗室都具備。那
如何分辨單齒配體和多齒配體
單齒配體一個配體中只有一個配位原子的配體。多齒配體一個配體中有兩個或兩個以上配位原子的配體。如二亞乙基三胺( 簡寫為DEN)和乙二胺四乙酸根(簡寫為EDTA)。由一定數目的陰離子或中性分子與陽離子(或原子)以配位鍵形成的復雜分子或離子成為配位個體,含配位個體的化合物稱為配合物,而含有一個配位原子的配
研究闡明免疫激發子受體模塊賦予作物廣譜抗性
植物基因組編碼著數千種分泌小肽,這類肽類物質對植物從發育到防御反應等生命活動環節均發揮重要調控作用。其中,較多分泌小肽會被膜定位的模式識別受體感知,而富含亮氨酸重復序列的受體激酶便是這類受體中最大的家族之一。 近日,中國科學院遺傳與發育生物學研究所李磊研究組與崖州灣國家實驗室田志喜研究組合作,
上海生科院:預處理提高定量蛋白質組數據鑒定效率
11月30日,國際學術期刊《分子與細胞蛋白質組學》(Molecular & Cellular Proteomics)在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所系統生物學重點實驗室曾嶸研究組與美國范德堡大學定量科學中心石瑜研究組的最新合作研究成果,揭示了穩定同位素化學標記高精
基因置換實驗——構建融合蛋白
實驗材料菌株BY4741質粒PDB118試劑、試劑盒磷酸鹽緩沖液儀器、耗材YPD 平板YPD 液體培養基血球計數板SC-his平板實驗步驟YPD 平板 第 1 天將菌株 7-3 在 YPD 平板上劃單克隆,30°C 下培養兩天。第 3 天挑取單克隆,在 5 mlYPD 液體培養基中培養,30°C 過
國際首個雙生病毒—植物—昆蟲數據庫構建成功
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/497155.shtm近日,中國農業科學院植物保護研究所作物病原生物功能基因組研究創新團隊聯合國內其他科研單位,構建了國際首個雙生病毒—植物—昆蟲數據庫。該數據庫提供了最完整的雙生病毒、寄主植物、傳毒介體,
中國學者構建完成西蘭花DNA指紋圖譜庫
記者近日在浙江省臺州市舉辦的2019浙江西蘭花新品種大會上獲悉,2019年,國家西蘭花良種重大科研聯合攻關組構建完成了西蘭花DNA指紋圖譜庫。 西蘭花又名青花菜,是全球重要的健康蔬菜之一,近10多年來西蘭花產業在中國發展迅速。然而,中國西蘭花種子供給卻長期為外國壟斷。 2018年,農業農村部
研究人員構建人類陰道微生物基因組庫
6月21日,深圳市寶安中醫院(集團)副院長黃鏈莎、轉化醫學中心助理研究員孫文與大連醫科大學副教授鄢秋龍等課題組的最新合作成果發表于《自然—微生物學》。人類女性陰道是一個包括細菌、真菌和病毒在內的復雜微生態系統,各微生物之間是相互制約、相互作用、相互依賴、對立統一的關系,其間的平衡關乎女性生殖健康及胎
AI模型助力構建我國玉米骨干父本的突變體庫
近日,中國農業科學院作物科學研究所作物基因組選擇技術與應用創新團隊聯合國內外科研團隊完成了我國玉米骨干自交系“昌7-2”的高質量基因組圖譜,構建了超過250萬個化學誘變位點的突變庫,并完成了系統性功能注釋。相關研究成果發表在《基因組生物學》(Genome biology)上。“昌7-2”是我國玉米雜
大規模、高精度三維人臉數據庫成功構建
在今年的春晚舞臺上,機器仿真蔡明為什么能讓人真假難辨?答案或許就藏在人臉的細微變化中。三維人臉關鍵點檢測,是虛擬人擁有生動表情、識別身份、具身智能等多種應用的關鍵技術環節之一。 然而,傳統方法普遍依賴2D紋理輔助或標準3D數字人臉模型,其性能受限于紋理映射誤差以及數字人臉與真實人臉之間的差異。
硫氧還原蛋白融合蛋白的表達和純化實驗
實驗材料融合蛋白試劑、試劑盒氨芐青霉素甘油色氨酸儀器、耗材電泳儀培養箱搖床試管實驗步驟1. ?將編碼目的序列的DNA片段克隆于pTRXFUS或hpTRXFUS質粒上的trxA基因3‘末端,構建符合讀框的融合基因,或者于pALtrxA-781的單一Rsr 2位點上插入短肽編碼序列。2. ?用含有重組硫
硫氧還原蛋白融合蛋白的表達和純化實驗
實驗材料 融合蛋白試劑、試劑盒 氨芐青霉素甘油色氨酸儀器、耗材 電泳儀培養箱搖床試管實驗步驟 1. ?將編碼目的序列的DNA片段克隆于pTRXFUS或hpTRXFUS質粒上的trxA基因3‘末端,構建符合讀框的融合基因,或者于pALtrxA-781的單一Rsr 2位點上插入短肽編碼序列。2. ?用含
硫氧還原蛋白融合蛋白的表達和純化實驗
基本方案 ? ? ? ? ? ? 實驗材料 融合蛋白 試劑、試劑盒
組合砝碼的巧妙組合
我們使用的人民幣是按“1、2、2、5”序列組合的,是由1分、2分、5分……10元、50元、100元等面值的硬幣或人民幣組成的,砝碼也是采用這樣的序列組合。?①1,2,2,5,10,20,20,50,100克;?②10,20,20,50,100,200,200,500毫克。???? 從砝碼的組合很容易
隨機序列庫的純化實驗
實驗方法原理 實驗材料 DNA 庫試劑、試劑盒 氫氧化銨正丁醇TE 緩沖液 尿素上樣緩沖液NaCl 乙醇儀器、耗材 熒光薄層層析板(VWR)紫外燈剃刀刀片小孔注射器能耐受極端溫度的 13 ml 離心管(Sarstedt) 90℃水浴旋轉混合器實驗步驟 實驗所需「材料」、「試劑」、「耗材」具體見「其他
隨機序列庫的純化實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 實驗材料 DNA 庫 試劑、試劑盒 氫氧化銨
隨機序列庫的純化實驗
實驗方法原理實驗材料DNA 庫試劑、試劑盒氫氧化銨正丁醇TE 緩沖液尿素上樣緩沖液NaCl乙醇儀器、耗材熒光薄層層析板(VWR)紫外燈剃刀刀片小孔注射器能耐受極端溫度的 13 ml 離心管(Sarstedt)90℃水浴旋轉混合器實驗步驟實驗所需「材料」、「試劑」、「耗材」具體見「其他」1. 寡核苷酸