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    發布時間:2019-03-28 12:04 原文鏈接: RNA的提取和純化實驗

    雖然 FDD 利用了真核 mRNA 的多聚腺苷酸 [poly(A)+] 位點,但并不推薦使用 poly(A)+RNA,因為在反轉錄反應中可能污染寡核苷酸,并因此增加假陽性的概率。所以建議使用總 RNA 做 FDD 分析。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。

    試劑、試劑盒

    氯仿焦碳酸二乙酯乙醇異丙醇苯酚-胍鹽單相溶液磷酸鹽緩沖液

    儀器、耗材

    離心機和轉頭移液器離心管錐形管平板勻漿器

    實驗步驟

    一、材料

    1. 緩沖液、溶液和試劑

    氯仿

    焦碳酸二乙酯(DEPC) 處理過的 H20(GenHimterR105)

    乙醇

    70% 乙醇洗液(用 DEPC 處理過的 H20 配制)

    異丙醇

    苯酚-胍鹽單相溶液(推薦 RNApure,GenHunterP501-P503)

    磷酸鹽緩沖液(PBS)

    2. 離心機和轉頭

    小離心機

    3. 專用設備

    50 ml 錐形管

    1.5 ml 小離心管

    1000ul(原文為 ml。—譯者改)移液器

    100~150 mm 平板

    P10 移液器

    Pdytron 勻漿器(用于從組織中提取 RNA)

    二、方法

    第一步:RNA 提取

    方法 1: 從組織培養物中提取 RNA

    1. 如果細胞貼在瓶壁或平板上,則倒掉培養基,將平板置于冰上。

    2. 如果細胞是懸浮的,旋轉離下細胞,并除去培養基。

    3. 用 10~20 ml 的冷磷酸鹽緩沖液(PBS) 漂洗細胞。

    4. 倒掉 PBS,并用 1000ul 移液器吸去殘留的 PBS。

    5. 每 100~150 mm 平板加入 2 ml 苯酚-胍鹽單相溶液(RNApure),以裂解細胞(搖晃平板使溶液分布均勻)。這個體積足夠裂解 100 萬~1000 萬個細胞。

    6. 將平板放在冰上 10 min。

    7. 將裂解液吸到兩個標記好的 1.5 ml 離心管中。

    方法 2: 從組織中提取 RNA

    1. 在裝有組織的 50 ml 錐形管中,加入至少 2 ml 苯酚-胍鹽單相溶液(RNApure), 并置于冰上。組織和酚溶液的理想比例至少應該是 1:10。

    2. 用 Polytron 勻漿器將組織攪勻,直到組織完全分散為止。

    3. 將管子置于冰上10min。

    4. 取 1ml 裂解液,分裝到標記好的 1.5 ml 離心管中。

    方法 3: 從血液中提取 RNA

    1. 將血液產品離心,并除去血漿。

    2. 按照上面從組織中提取 RNA 的說明逬行操作。

    第二步:RNA 的純化

    1. 每毫升裂解液加入 150ul 氯仿,渦旋混勻 10min。
    本方案可以在此處停止,并將裂解液放置在-80°C

    2. 在 4°C 以最大轉速離心 10min。

    3. 小心地將上清液轉移到一個干凈的、標記好的 1.5 ml 離心管中。

    4. 加入等體積的異丙醇,并在冰上放置 10min,然后劇烈地混勻或渦旋混勻 30s。

    5. 將混合物在 4°C 以最大轉速離心 10min。

    6. 用 1ml 預冷的 70% 乙醇(用 DEPC 處理過的 H20 配制)洗滌 RNA 沉淀,在 4°C最大轉速離心 2 min。

    7. 倒掉乙醇。短暫離心后,用移液器吸去殘留的洗液。

    8. 將 RNA 在 5ulDEPC 處理過的 H20 中重新懸浮。
    注意:如果 RNA 用于任何擴增反應,懸浮液中不要使用 SDS。

    9. 取1ul RNA(用 P10 移液器)測定濃度,用1ml H20 稀釋。在 260nm 下讀數,注意 1OD260=40ug。

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