之前,人們一直在猜測Pacific Biosciences可能會推出小型的單分子測序儀,但PacBio從未給出肯定的答復。而在2015年9月的最后一天,PacBio給了人們一個驚喜,突然宣布推出Sequel測序系統。Sequel系統保留了SMRT技術的優點,與現有的PacBio RS II系統相比,通量更高,但試劑成本更低。
Sequel測序系統
Sequel系統的核心是經過重新設計的SMRT Cell,它包含100萬個ZMW(零模式波導),而PacBio RS II只有15萬個。單個聚合酶被固定在ZMW中,以便實時觀察和記錄DNA測序。隨著每個SMRT Cell的通量升高7倍,用戶能夠明顯減少測序的時間和試劑成本,而前期的資金投入大約是之前的一半。Sequel系統的體積和重量大約是PacBio RS II的三分之一。由于它也是基于SMRT技術,故測序流程的許多方面都沒有變化。
PacBio的CEO Michael Hunkapiller博士表示,Sequel系統帶來了SMRT測序的優點,包括長讀取、均一覆蓋和甲基化信息。Hunkapiller博士希望這能帶來毛利率的提升,并更快實現盈利。
同時,他也表示:“我們將繼續支持PacBio RS II的客戶,并不斷引入樣品制備、測序試劑和軟件的改進,以擴展系統的性能。我們預計Sequel系統每年也會有類似的性能改進。此外,Sequel的結構允許通量的進一步擴展,通過改變未來SMRT Cell上ZMW的數量,可以針對特定應用來優化通量和操作成本。”
Sequel系統能夠快速經濟地生成高質量、全基因組的de novo組裝。它也能鑒定各種類型的基因組變異,包括短讀取測序技術無法觸及的復雜區域的變異,同時揭示表觀遺傳的信息。利用該公司的Iso-Seq操作,此系統也能生成全長轉錄組的數據。Sequel系統的通量增加,也促進了SMRT技術在宏基因組學和靶向基因測序中的應用。
Sequel系統是PacBio與羅氏合作開發的,最終目標是制造出供臨床使用的測序系統。根據此項協議,羅氏同意支付給PacBio總共4000萬美元的里程碑付款。到目前為止,PacBio已獲得了2000萬美元,預計在2015年第四季度將獲得剩下的2000萬美元。據羅氏測序部門的負責人Dan Zabrowski介紹,這款測序平臺將作為羅氏測序儀器的基礎,最初用于臨床研究,之后才用于體外診斷。
PacBio計劃第四季度開始在美國限量發售Sequel系統,并在明年年初開始擴大Sequel系統和新SMRT Cell的生產。之后才開始在美國以外的地區發售。部分Sequel儀器將提供給羅氏,以擴展其內部的分析開發計劃。這臺儀器目前僅供科研使用。
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