PLOSGenet：單分子測序技術助力原核生物DNA甲基化研究

　　近日，刊登在國際雜志PLoS Genetics上的一項研究論文中，來自美國能源部聯合基因組研究院的研究人員對230種古細菌和細菌基因組進行了測序，旨在研究DNA甲基化在原核生物中所扮演的關鍵角色。

　　細胞的表觀基因組是基因組DNA特殊剪輯發生改變的一個特殊集合，這些表觀基因組的改變會影響基因組的實際用途，而表觀基因組的產生和變化一般是通過化學修飾而引發的。深入剖析地球微生物表觀基因組的多樣性或可幫助科學家深入理解微生物在地球營養循環中的作用，同時也可以利用基因組的調節系統來進行能量和環境相關領域的研究。

　　DNA甲基化是一種常見的表觀基因組改變，其通常是真核生物用來調節基因表達的一種過程，比如維持特殊基因持續表達等；然而諸如細菌和古細菌等原核生物實際上也存在甲基化的DNA，但DNA甲基化的過程以及其在單細胞有機體中的功能目前研究人員并不清楚。

　　這項研究中，研究人員就對230種細菌和古細菌細胞基因組中的DNA甲基化模式進行了研究，他們在215種（95%）細菌和古細菌中發現了DNA甲基化的證據，而這些研究證據就可以使研究者對促進DNA甲基化的600種酶進行注釋，DNA甲基化的修飾酶是細胞中限制-修飾系統的關鍵部分。

　　通過對表觀遺傳學改變的圖譜進行繪制及特性進行分析，研究人員就可以將靶向基因同環境適應性及代謝活性相聯系起來，對基因表達控制的深入理解或可改善研究人員對眾多細菌和古細菌的鑒定和特性分析；此外本文研究對于后期研究微生物群落同植物及其它微生物之間的相互作用也提供了新的思路和研究依據。